KDM3B - KDM3B - Wikipedia

KDM3B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4C8D
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM3B, 5qNCA, C5orf7, JMJD1B, NET22, лизиндеметилаза 3B, DIJOS
Внешние идентификаторы	OMIM: 609373 MGI: 1923356 ГомолоГен: 41145 Генные карты: KDM3B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q31.2 Начинать 138,352,685 бп[1] Конец 138,437,028 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность • антиоксидантная активность • активность диоксигеназы • связывание ионов металлов • гистоновая деметилаза активность • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • связывание хроматина с ДНК • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K9) Сотовый компонент • хроматин • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • клеточная детоксикация окислителей • ответ на цисплатин • окислительно-восстановительный процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деметилирование гистона H3-K9 • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51780	277250
Ансамбль	ENSG00000120733	ENSMUSG00000038773
UniProt	Q7LBC6	Q6ZPY7
RefSeq (мРНК)	NM_016604	NM_001081256 NM_029518
RefSeq (белок)	NP_057688	NP_001074725
Расположение (UCSC)	Chr 5: 138,35 - 138,44 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лизин-специфическая деметилаза 3B является фермент что у людей кодируется KDM3B ген.^[4][5] KDM3B принадлежит к альфа-кетоглутарат-зависимая гидроксилаза надсемейство.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120733 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Като М., Като М. (июнь 2004 г.). «Идентификация и характеристика генов семейства JMJD2 in silico». Международный журнал онкологии. 24 (6): 1623–8. Дои:10.3892 / ijo.25.3.759. PMID  15138608.
5. "Entrez Gene: JMJD1B домен jumonji, содержащий 1B".

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК исследования. 9 (3): 99–106. CiteSeerX  10.1.1.500.923. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Диас Нето Е., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С., Брионес М.Р., Нагаи М.А., да Силва В., Заго М.А., Бордин С., Коста Ф.Ф., Голдман Г.Х., Карвалью А.Ф., Мацукума А., Байя Г.С., Симпсон Д.Х., Брунштейн А., де Оливейра П.С., Бучер П., Джонженель К.В., О'Хара М.Дж., Соарес Ф., Брентани Р.Р., Рейс Л.Ф., де Соуза С.Дж., Симпсон А.Дж. (март 2000 г.). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Лай Ф., Годли Л.А., Фернальд А.А., Орелли Б.Дж., Паминтуан Л., Чжао Н., Ле Бо М.М. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование кДНК и геномная структура трех генов, локализованных в полосе хромосомы человека 5q31, кодирующей потенциальные ядерные белки». Геномика. 70 (1): 123–30. Дои:10.1006 / geno.2000.6345. PMID  11087669.
• Лай Ф, Годли Л.А., Джослин Дж., Фернальд А.А., Лю Дж., Эспиноза Р., Чжао Н., Паминтуан Л., Тилль Б.Г., Ларсон Р.А., Цянь З., Ле Бо М.М. (январь 2001 г.). «Карта транскриптов и сравнительный анализ 1,5-мегабайтного обычно удаленного сегмента человеческого 5q31 при злокачественных миелоидных заболеваниях с del (5q)». Геномика. 71 (2): 235–45. Дои:10.1006 / geno.2000.6414. PMID  11161817.
• Ху З., Гомес И., Хорриган С.К., Краварусич Дж., Мар Б., Арбиева З., Чина Б., Фултон Н., Эдассери С., Раза А, Уэстбрук, Калифорния (октябрь 2001 г.). «Новый ядерный белок 5qNCA (LOC51780) является кандидатом на ген супрессора опухоли миелоидного лейкоза на полосе q31 хромосомы 5». Онкоген. 20 (47): 6946–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1204850. PMID  11687974.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Ямане К., Тумазоу К., Цукада Ю., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Вонг Дж., Чжан Ю. (май 2006 г.). «JHDM2A, JmjC-содержащая деметилаза H3K9, способствует активации транскрипции рецептором андрогенов». Клетка. 125 (3): 483–95. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.027. PMID  16603237. S2CID  6643329.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• JMJD1B + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.