TBPL1 - TBPL1

TBPL1
Идентификаторы
Псевдонимы	TBPL1, MGC: 8389, MGC: 9620, STUD, TLF, TLP, TRF2, белок, связывающий TATA-бокс, такой как 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605521 MGI: 1339946 ГомолоГен: 3577 Генные карты: TBPL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q23.2 Начинать 133,952,170 бп[1] Конец 133,990,432 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 A3 Начинать 22,703,879 бп[2] Конец 22,731,938 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II • Связывание с ДНК регуляторной области РНК-полимеразы III • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание фактора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIIA • ядро клетки • комплекс фактора транскрипции TFIIIB • комплекс регуляторов транскрипции • комплекс фактора транскрипции TFIID Биологический процесс • дифференциация ядра сперматид • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • сборка акросомы • Процесс биосинтеза дТТФ • транскрипция, ДНК-шаблон • сперматогенез • ДНК-шаблонная транскрипция, инициация • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Сборка комплекса преинициации транскрипции РНК-полимеразы III Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9519	237336
Ансамбль	ENSG00000028839	ENSMUSG00000071359
UniProt	P62380 Q7Z6T9	P62340
RefSeq (мРНК)	NM_004865 NM_001253676	NM_011603
RefSeq (белок)	NP_001240605 NP_004856	NP_035733
Расположение (UCSC)	Chr 6: 133.95 - 133.99 Мб	Chr 10: 22,7 - 22,73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ТАТА-бокс-связывающий белок-подобный белок 1 это белок что у людей кодируется TBPL1 ген.^[5][6][7][8]

Функция

Для инициации транскрипции РНК-полимеразой II требуется активность более 70 полипептидов. Белком, который координирует эти активности, является фактор транскрипции IID (TFIID), который связывается с коровым промотором для правильного позиционирования полимеразы, служит каркасом для сборки остатка транскрипционного комплекса и действует как канал для регуляторных сигналов. TFIID состоит из TATA-связывающего белка (TBP) и группы эволюционно консервативных белков, известных как TBP-ассоциированные факторы или TAF. TAF могут участвовать в базальной транскрипции, служить коактиваторами, участвовать в распознавании промоторов или модифицировать общие факторы транскрипции (GTF) для облегчения сборки комплекса и инициации транскрипции. Этот ген кодирует белок, который выполняет ту же функцию, что и TBP, и заменяет TBP на некоторых промоторах, которые не распознаются TFIID. Это важно для спермиогенеза и, как полагают, важно для экспрессии генов, регулируемых в процессе развития.^[8]

Взаимодействия

TBPL1 был показан взаимодействовать с GTF2A1.^[9][10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000028839 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000071359 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Обаяси Т., Кисимото Т., Макино Ю., Шимада М., Накадай Т., Аоки Т., Кавата Т., Нива С., Тамура Т. (февраль 1999 г.). «Выделение кДНК, картирование хромосом и экспрессия человеческого ТВР-подобного белка». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 255 (1): 137–42. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0159. PMID  10082669.
6. Rabenstein MD, Zhou S, Lis JT, Tjian R (апрель 1999 г.). «ТАТА-бокс-связывающий белок (ТВР), фактор 2 (TRF2), третий член семейства ТВР». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (9): 4791–6. Bibcode:1999PNAS ... 96.4791R. Дои:10.1073 / пнас.96.9.4791. ЧВК  21770. PMID  10220372.
7. Чонг Дж. А., Моран М. М., Тайхманн М., Качмарек Дж. С., Рёдер Р., Клэпхэм Д. Э. (апрель 2005 г.). «TATA-связывающий белок (TBP) -подобный фактор (TLF) является функциональным регулятором транскрипции: реципрокная регуляция генов нейрофиброматоза 1 типа и c-fos с помощью TLF / TRF2 и TBP». Молекулярная и клеточная биология. 25 (7): 2632–43. Дои:10.1128 / MCB.25.7.2632-2643.2005. ЧВК  1061635. PMID  15767669.
8. «Энтрез Ген: TBPL1, подобный TBP 1».
9. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
10. Тайхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Человеческий фактор-2, связанный с ТАТА-связывающим белком (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (24): 13720–5. Bibcode:1999PNAS ... 9613720T. Дои:10.1073 / пнас.96.24.13720. ЧВК  24131. PMID  10570139.

дальнейшее чтение

• Обаяси Т., Макино Ю., Тамура Т.А. (февраль 1999 г.). «Идентификация мышиного TBP-подобного белка (TLP), отдаленно связанного с фактором, связанным с TBP дрозофилы». Исследования нуклеиновых кислот. 27 (3): 750–5. Дои:10.1093 / nar / 27.3.750. ЧВК  148243. PMID  9889269.
• Тейхманн М., Ван З., Мартинес Э., Тьернберг А., Чжан Д., Фоллмер Ф., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (ноябрь 1999 г.). «Человеческий фактор-2, связанный с ТАТА-связывающим белком (hTRF2), стабильно связывается с hTFIIA в клетках HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (24): 13720–5. Bibcode:1999PNAS ... 9613720T. Дои:10.1073 / пнас.96.24.13720. ЧВК  24131. PMID  10570139.
• Мартианов И., Бранкорсини С., Гансмюллер А., Парвинен М., Дэвидсон И., Сассоне-Корси П. (февраль 2002 г.). «Отличительные функции TBP и TLF / TRF2 во время сперматогенеза: потребность TLF для образования гетерохроматического хромоцентра в гаплоидных круглых сперматидах». Разработка. 129 (4): 945–55. PMID  11861477.
• Киффер-Квон П., Мартианов И., Дэвидсон И. (октябрь 2004 г.). «Клеточно-специфическая ядрышковая локализация фактора 2, связанного с ТВР». Молекулярная биология клетки. 15 (10): 4356–68. Дои:10.1091 / mbc.E04-02-0138. ЧВК  519132. PMID  15269281.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка

• TBPL1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.