TAL1 - TAL1

TAL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YPA, 2 ГПБ
Идентификаторы
Псевдонимы	TAL1, SCL, TCL5, bHLHa17, tal-1, Т-клеточный острый лимфоцитарный лейкоз 1, TAL, фактор транскрипции bHLH 1, фактор дифференцировки эритроидов
Внешние идентификаторы	OMIM: 187040 MGI: 98480 ГомолоГен: 2400 Генные карты: TAL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п33 Начинать 47,216,290 бп[1] Конец 47,232,220 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 D1 | 4 52,73 см Начинать 115,056,426 бп[2] Конец 115,071,755 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • активность димеризации белков • Связывание фактора транскрипции РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание гистондеацетилазы • связывание хроматина • связывание ДНК с последовательностью регуляторной области транскрипции • Переплет электронного ящика • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание ферментов • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • гистондеацетилазный комплекс • комплекс регуляторов транскрипции • ядерный хроматин • Lsd1 / 2 комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • развитие мегакариоцитов • дифференцировка мегакариоцитов • миелоидная дифференцировка клеток • обязательство клеточной судьбы • дифференциация клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция дифференцировки тучных клеток • дифференцировка нейронов ассоциации спинного мозга • положительная регуляция сборки белкового комплекса • двигательное поведение • положительная регуляция дифференцировки эритроцитов • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция поддержания популяции стволовых клеток • образование тромбоцитов • положительная регуляция митотического клеточного цикла • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • генерация нейронов • дифференцировка базофилов • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • регулирование пролиферации клеток • дифференцировка гемопоэтических стволовых клеток • преданность судьбе астроцита • ангиогенез • дифференциация нейронов • эмбриональный гемопоэз • положительная регуляция сборки или разборки хроматина • дифференцировка эритроцитов • окончательный гемопоэз • регуляция дифференцировки миелоидных клеток • положительная регуляция деления клеток • дифференцировка клеток гемангиобластов • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • созревание эритроцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток • кроветворение • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция дифференцировки эритроцитов • положительная регуляция активности протеинтирозинкиназы • положительная регуляция активности рецепторов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6886	21349
Ансамбль	ENSG00000162367	ENSMUSG00000028717
UniProt	P17542	P22091
RefSeq (мРНК)	NM_001287347 NM_001290403 NM_001290404 NM_001290405 NM_001290406 NM_003189	NM_011527 NM_001287388
RefSeq (белок)	NP_001274276 NP_001277332 NP_001277333 NP_001277334 NP_001277335 NP_003180	NP_001274317 NP_035657
Расположение (UCSC)	Chr 1: 47,22 - 47,23 Мб	Chr 4: 115.06 - 115.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Т-клеточный белок острого лимфоцитарного лейкоза 1 (т.е. TAL1, но также называется лейкоз стволовых клеток / острый лейкоз Т-клеток 1 [т.е. SCL / TAL1]) является белок что у людей кодируется TAL1 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый TAL1, представляет собой основная спираль-петля-спираль фактор транскрипции.

Взаимодействия

TAL1 был показан взаимодействовать с:

• CBFA2T3,^[7]
• EP300,^[8]
• GATA1,^[7][9]
• LDB1,^[7]
• LMO1,^[10][11]
• LMO2,^{[7][9][10][11]}
• SIN3A,^[12]
• Фактор транскрипции Sp1,^[13] и
• TCF3.^[7][14]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162367 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028717 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фингер Л.Р., Каган Дж., Кристофер Дж., Курцберг Дж., Хершфилд М.С., Новелл П.С., Кроче С.М. (август 1989 г.). «Вовлечение гена TCL5 на хромосоме 1 человека в Т-клеточный лейкоз и меланому». Proc Natl Acad Sci U S A. 86 (13): 5039–43. Дои:10.1073 / pnas.86.13.5039. ЧВК  297552. PMID  2740341.
6. «Энтрез Ген: TAL1 Т-клеточный острый лимфоцитарный лейкоз 1».
7. Goardon N, Lambert JA, Rodriguez P, Nissaire P, Herblot S, Thibault P, Dumenil D, Strouboulis J, Romeo PH, Hoang T (январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза». EMBO J. 25 (2): 357–66. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600934. ЧВК  1383517. PMID  16407974.
8. Хуан С., Цю Ю., Штейн Р. В., Брандт С. Дж. (Сентябрь 1999 г.). «p300 действует как транскрипционный коактиватор онкобелка TAL1 / SCL». Онкоген. 18 (35): 4958–67. Дои:10.1038 / sj.onc.1202889. PMID  10490830.
9. Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (октябрь 1995 г.). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (21): 9585–9. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9585. ЧВК  40846. PMID  7568177.
10. Валге-Арчер В.Е., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (август 1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (18): 8617–21. Дои:10.1073 / пнас.91.18.8617. ЧВК  44657. PMID  8078932.
11. Wadman I., Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (октябрь 1994). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека». EMBO J. 13 (20): 4831–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. ЧВК  395422. PMID  7957052.
12. Хуанг С., Брандт С.Дж. (март 2000 г.). «mSin3A регулирует дифференцировку мышиных эритролейкозных клеток посредством ассоциации с фактором транскрипции TAL1 (или SCL)». Мол. Клетка. Биол. 20 (6): 2248–59. Дои:10.1128 / mcb.20.6.2248-2259.2000. ЧВК  110841. PMID  10688671.
13. Lécuyer E, Herblot S, Saint-Denis M, Martin R, Begley CG, Porcher C, Orkin SH, Hoang T (октябрь 2002 г.). «Комплекс SCL регулирует экспрессию c-kit в гемопоэтических клетках посредством функционального взаимодействия с Sp1». Кровь. 100 (7): 2430–40. Дои:10.1182 / кровь-2002-02-0568. PMID  12239153.
14. Хсу Х.Л., Вадман И., Баер Р. (апрель 1994 г.). «Формирование in vivo комплексов между полипептидами TAL1 и E2A лейкозных Т-клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (8): 3181–5. Дои:10.1073 / pnas.91.8.3181. ЧВК  43539. PMID  8159721.

дальнейшее чтение

• Грин А.Р., Бегли К.Г. (1993). «SCL и родственные гемопоэтические факторы транскрипции спираль-петля-спираль». Int. J. Клонирование клеток. 10 (5): 269–76. Дои:10.1002 / шток.5530100504. PMID  1453013.
• Aplan PD, Lombardi DP, Reaman GH, Sather HN, Hammond GD, Kirsch IR (1992). «Вовлечение предполагаемого фактора транскрипции гемопоэза SCL в Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз». Кровь. 79 (5): 1327–33. Дои:10.1182 / blood.V79.5.1327.1327. PMID  1311214.
• Аплан П.Д., Накахара К., Оркин С.Х., Кирш И.Р. (1992). «Продукт гена SCL: положительный регулятор дифференцировки эритроидов». EMBO J. 11 (11): 4073–81. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05500.x. ЧВК  556917. PMID  1396592.
• Гольдфарб А.Н., Гуэли С., Микельсон Д., Гринберг Дж. М. (1992). «Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз - связанный ген SCL / tal кодирует 42-килодонный ядерный фосфопротеин». Кровь. 80 (11): 2858–66. Дои:10.1182 / blood.V80.11.2858.bloodjournal80112858. PMID  1450410.
• Бернар О., Лекойнт Н., Жонво П., Суйри М., Мошоффе М., Бергер Р., Ларсен К.Дж., Матье-Махул Д. (1991). «Две сайт-специфические делеции и транслокация t (1; 14), ограниченная острыми лейкозами Т-клеток человека, нарушает 5'-часть гена tal-1». Онкоген. 6 (8): 1477–88. PMID  1886719.
• Бернар О, Гульельми П., Жонво П., Шериф Д., Гиссельбрехт С., Мошоф М., Бергер Р., Ларсен С.Дж., Матье-Махул Д. (1991). «Два различных механизма активации гена SCL при t (1; 14) транслокации Т-клеточных лейкозов». Гены Хромосомы Рак. 1 (3): 194–208. Дои:10.1002 / gcc.2870010303. PMID  1964581.
• Чен Q, Ян CY, Цан JT, Xia Y, Ragab AH, Peiper SC, Carroll A, Baer R (1990). «Кодирующие последовательности гена tal-1 нарушены транслокацией хромосом при лейкемии Т-клеток человека». J. Exp. Med. 172 (5): 1403–8. Дои:10.1084 / jem.172.5.1403. ЧВК  2188666. PMID  2230650.
• Аплан П.Д., Бегли К.Г., Бертнесс В., Нуссмайер М., Эскерра А., Колиган Дж., Кирш И.Р. (1991). «Ген SCL образован из локуса транскрипционной сложности». Мол. Клетка. Биол. 10 (12): 6426–35. Дои:10.1128 / mcb.10.12.6426. ЧВК  362919. PMID  2247063.
• Чен К., Ченг Дж. Т., Таси Л. Х., Шнайдер Н., Бьюкенен Дж., Кэрролл А., Крист В., Озанн Б., Сицилиано М. Дж., Баер Р. (1990). «Ген tal подвергается хромосомной транслокации при Т-клеточном лейкозе и потенциально кодирует белок спираль-петля-спираль». EMBO J. 9 (2): 415–24. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1990.tb08126.x. ЧВК  551682. PMID  2303035.
• Бегли К.Г., Аплан П.Д., Деннинг С.М., Хейнс Б.Ф., Вальдманн Т.А., Кирш И.Р. (1990). «Ген SCL экспрессируется во время раннего гематопоэза и кодирует связанный с дифференцировкой ДНК-связывающий мотив». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 86 (24): 10128–32. Дои:10.1073 / пнас.86.24.10128. ЧВК  298658. PMID  2602361.
• Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (1995). «Ассоциация факторов транскрипции эритроидов: комплексы с участием белка LIM RBTN2 и белка цинкового пальца GATA1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (21): 9585–9. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9585. ЧВК  40846. PMID  7568177.
• Pulford K, Lecointe N, Leroy-Viard K, Jones M, Mathieu-Mahul D, Mason DY (1995). «Экспрессия белков TAL-1 в тканях человека». Кровь. 85 (3): 675–84. Дои:10.1182 / blood.V85.3.675.bloodjournal853675. PMID  7833471.
• Вадман И., Ли Дж., Баш Р.О., Форстер А., Осада Х., Кролик Т.Х., Баер Р. (1994). «Специфическая ассоциация in vivo между белками bHLH и LIM, участвующими в лейкемии Т-клеток человека». EMBO J. 13 (20): 4831–9. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06809.x. ЧВК  395422. PMID  7957052.
• Валге-Арчер В.Э., Осада Х., Уоррен А.Дж., Форстер А., Ли Дж., Баер Р., Кролик Т.Х. (1994). «Белок LIM RBTN2 и основной белок спираль-петля-спираль TAL1 присутствуют в комплексе в эритроидных клетках». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (18): 8617–21. Дои:10.1073 / пнас.91.18.8617. ЧВК  44657. PMID  8078932.
• Cross MA, Heyworth CM, Murrell AM, Bockamp EO, Dexter TM, Green AR (1994). «Экспрессия ограниченных по клонам факторов транскрипции предшествует клоноспецифической дифференцировке в мультипотентной линии гемопоэтических клеток-предшественников». Онкоген. 9 (10): 3013–6. PMID  8084606.
• Сюй Х.Л., Вадман И., Баер Р. (1994). «Формирование in vivo комплексов между полипептидами TAL1 и E2A лейкозных Т-клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (8): 3181–5. Дои:10.1073 / pnas.91.8.3181. ЧВК  43539. PMID  8159721.
• Hwang LY, Siegelman M, Davis L, Oppenheimer-Marks N, Baer R (1993). «Экспрессия протоонкогена TAL1 в культивируемых эндотелиальных клетках и кровеносных сосудах селезенки». Онкоген. 8 (11): 3043–6. PMID  8414504.
• Ченг Дж. Т., Кобб М. Х., Баер Р. (1993). «Фосфорилирование онкопротеина TAL1 с помощью протеинкиназы ERK1, регулируемой внеклеточными сигналами». Мол. Клетка. Биол. 13 (2): 801–8. Дои:10.1128 / mcb.13.2.801. ЧВК  358963. PMID  8423803.

внешняя ссылка

• TAL1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook TAL1