HIVEP1 - HIVEP1

HIVEP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1BBO, 4ZNF
Идентификаторы
Псевдонимы	HIVEP1, CIRIP, CRYBP1, GAAP, MBP-1, PRDII-BF1, Schnurri-1, ZAS1, ZNF40, ZNF40A, связывающий белок 1 энхансера вируса иммунодефицита человека I типа, цинковый палец 1 HIVEP
Внешние идентификаторы	OMIM: 194540 MGI: 96100 ГомолоГен: 1596 Генные карты: HIVEP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п24.1 Начните 12,008,762 бп[1] Конец 12,164,999 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A4 | 13 20,72 см Начните 42,052,021 бп[2] Конец 42,192,537 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • митохондрия • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное тело Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • преобразование сигнала • транскрипция, ДНК-шаблон • BMP сигнальный путь • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3096	110521
Ансамбль	ENSG00000095951	ENSMUSG00000021366
UniProt	P15822	Q03172
RefSeq (мРНК)	NM_002114	NM_007772
RefSeq (белок)	NP_002105	NP_031798
Расположение (UCSC)	Chr 6: 12.01 - 12.16 Мб	Chr 13: 42.05 - 42.19 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинк палец протеин 40 это белок что у людей кодируется HIVEP1 ген.^[5][6]

Члены семейства ZAS, такие как ZAS1 (HIVEP1), представляют собой большие белки, которые содержат домен ZAS, модульную структуру белка, состоящую из пары цинковых пальцев C2H2 с богатой кислотой областью и последовательностью, богатой серином / треонином. Эти белки связывают специфические последовательности ДНК, включая мотив каппа-B (GGGACTTTCC), в промоторных и энхансерных областях нескольких генов и вирусов, включая вирус иммунодефицита человека (ВИЧ). Гены ZAS охватывают более 150 т.п.н. и содержат не менее 10 экзонов, один из которых длиннее 5,5 т.п.н. (Allen and Wu, 2004). [Предоставлено OMIM]^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095951 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021366 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гейнор Р.Б., Мухардт С., Дип А., Мохандас Т.К., Спаркс Р.С., Лусис А.Дж. (июль 1991 г.). «Локализация ДНК-связывающего белка цинкового пальца ВИЧ-EP1 / MBP-1 / PRDII-BF1 на хромосоме 6p22.3-p24 человека». Геномика. 9 (4): 758–61. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90371-К. PMID  2037300.
6. «Ген Entrez: белок 1, усиливающий связывание вируса иммунодефицита человека типа I HIVEP1».

дальнейшее чтение

• Омичински JG, Clore GM, Robien M, et al. (1992). «Структура раствора с высоким разрешением двойного цинкового пальца Cys2His2 из человеческого энхансер-связывающего белка MBP-1». Биохимия. 31 (16): 3907–17. Дои:10.1021 / bi00131a004. PMID  1567844.
• Накамура Т., Донован Д.М., Хамада К. и др. (1990). «Регулирование гена альфа-А-кристаллина мыши: выделение кДНК, кодирующей белок, который связывается с мотивом цис-последовательности, общим с геном класса I главного комплекса гистосовместимости и другими генами». Мол. Cell. Биол. 10 (7): 3700–8. Дои:10.1128 / mcb.10.7.3700. ЧВК  360816. PMID  1694016.
• Muchardt C, Seeler JS, Nirula A, et al. (1992). «Регулирование функции усилителя вируса иммунодефицита человека продуктами генов PRDII-BF1 и c-rel». Дж. Вирол. 66 (1): 244–50. Дои:10.1128 / JVI.66.1.244-250.1992. ЧВК  238281. PMID  1727488.
• Вентилятор CM, Маниатис Т (1990). «ДНК-связывающий белок, содержащий два широко разделенных мотива« цинковые пальцы », которые распознают одну и ту же последовательность ДНК». Genes Dev. 4 (1): 29–42. Дои:10.1101 / gad.4.1.29. PMID  2106471.
• Болдуин А.С., Леклер К.П., Сингх Х., Шарп П.А. (1990). «Большой белок, содержащий домены цинковых пальцев, связывается со связанными элементами последовательностей в энхансерах главного комплекса гистосовместимости класса I и генов каппа-иммуноглобулинов». Мол. Cell. Биол. 10 (4): 1406–14. Дои:10.1128 / mcb.10.4.1406. ЧВК  362243. PMID  2108316.
• Омичинский JG, Clore GM, Appella E, et al. (1991). «Трехмерная структура с высоким разрешением одного цинкового пальца из человеческого белка, связывающего энхансер, в растворе». Биохимия. 29 (40): 9324–34. Дои:10.1021 / bi00492a004. PMID  2248949.
• Маэкава Т., Сакура Х, Судо Т., Исии С. (1989). «Предполагаемая металлическая пальцевая структура белка, связывающего энхансер вируса иммунодефицита человека типа 1, HIV-EP1». J. Biol. Chem. 264 (25): 14591–3. PMID  2504707.
• Оцука М., Фудзита М., Аоки Т. и др. (1995). «Новые хелаторы цинка с двойной активностью в ингибировании сайт-связывающих белков каппа B HIV-EP1 и NF-каппа B». J. Med. Chem. 38 (17): 3264–70. Дои:10.1021 / jm00017a011. PMID  7650680.
• Seeler JS, Muchardt C, Suessle A, Gaynor RB (1994). «Фактор транскрипции PRDII-BF1 активирует экспрессию гена вируса иммунодефицита человека типа 1». Дж. Вирол. 68 (2): 1002–9. Дои:10.1128 / JVI.68.2.1002-1009.1994. ЧВК  236538. PMID  8289330.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Виссмюллер С., Косиан Т., Вольф М. и др. (2006). «Домен группы с высокой подвижностью белков Sox взаимодействует с ДНК-связывающими доменами многих факторов транскрипции». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (6): 1735–44. Дои:10.1093 / нар / gkl105. ЧВК  1421504. PMID  16582099.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.

внешняя ссылка

• HIVEP1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.