TFCP2 - TFCP2

TFCP2
Идентификаторы
Псевдонимы	TFCP2, LBP1C, LSF, LSF1D, SEF, TFCP2C, фактор транскрипции CP2
Внешние идентификаторы	OMIM: 189889 MGI: 98509 ГомолоГен: 4134 Генные карты: TFCP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.12-q13.13 Начните 51,093,656 бп[1] Конец 51,173,135 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 F1 | 15 56,33 см Начните 100,498,012 бп[2] Конец 100,552,008 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • связывание с С-концом белка • GO: 0001948 связывание с белками • последовательное связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001158 Связывание с ДНК проксимальной области корового промотора, специфичное для последовательности • связывание фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • нуклеоплазма • цитозоль • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция мРНК с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7024	21422
Ансамбль	ENSG00000135457	ENSMUSG00000009733
UniProt	Q12800	Q9ERA0
RefSeq (мРНК)	NM_005653 NM_001173452 NM_001173453	NM_001289603 NM_033476 NM_001355497
RefSeq (белок)	NP_001166923 NP_001166924 NP_005644	NP_001276532 NP_258437 NP_001342426
Расположение (UCSC)	Chr 12: 51.09 - 51.17 Мб	Chr 15: 100,5 - 100,55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции альфа-глобина CP2 это белок что у людей кодируется TFCP2 ген.^[5][6]

TFCP2 также называют Поздний фактор SV40 (LSF) и вызывается хорошо известным онкогеном AEG-1.^[7] Фактор позднего SV40 (LSF) также действует как онкоген в гепатоцеллюлярная карцинома.^[8] Фактор позднего SV40 (LSF) усиливает ангиогенез транскрипционно активируя матриксную металлопротеиназу-9 (MMP9 ).^[9]

Наряду с его основным онкоген функционировать в гепатоцеллюлярная карцинома (HCC) он играет многогранную роль в химиорезистентности, эпителиально-мезенхимальный переход (ЕМТ), аллергическая реакция, воспаление и Болезнь Альцгеймера.^[8][10] В малая молекула FQI1 (ингибитор фактора хинолинона 1) предотвращает связывание LSF с ДНК HCC, что приводит к гибели клеток HCC.^[8][10][11]

Взаимодействия

TFCP2 показал себя взаимодействовать с участием APBB1^[12] и RNF2.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135457 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000009733 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Swendeman SL, Spielholz C, Jenkins NA, Gilbert DJ, Copeland NG, Sheffery M (апрель 1994). «Характеристика геномной структуры, хромосомного положения, промотора и экспрессии развития фактора транскрипции альфа-глобина CP2». Журнал биологической химии. 269 (15): 11663–71. PMID  8157699.
6. «Ген Entrez: фактор транскрипции TFCP2 CP2».
7. Ю Б.К., Гредлер Р., Вожилла Н., Су З.З., Чен Д., Форсьер Т., Шах К., Саксена Ю., Хансен Ю., Фишер ПБ, Саркар Д. (август 2009 г.). «Идентификация генов устойчивости к 5-фторурацилу». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (31): 12938–43. Bibcode:2009PNAS..10612938Y. Дои:10.1073 / pnas.0901451106. ЧВК  2722317. PMID  19622726.
8. Ю Б.К., Эмдад Л., Гредлер Р., Фуллер С., Думур К.И., Джонс К.Х., Джексон-Кук С., Су З.З., Чен Д., Саксена Ю.Х., Хансен Ю., Фишер П.Б., Саркар Д. (май 2010 г.). «Фактор транскрипции Фактор позднего SV40 (LSF) функционирует как онкоген при гепатоцеллюлярной карциноме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (18): 8357–62. Bibcode:2010PNAS..107.8357Y. Дои:10.1073 / pnas.1000374107. ЧВК  2889542. PMID  20404171.
9. Сантекадур П.К., Гредлер Р., Чен Д., Сиддик А., Шен XN, Дас С.К., Эмдад Л., Фишер П.Б., Саркар Д. (январь 2012 г.). «Фактор позднего SV40 (LSF) усиливает ангиогенез путем активации транскрипции матриксной металлопротеиназы-9 (MMP-9)». Журнал биологической химии. 287 (5): 3425–32. Дои:10.1074 / jbc.M111.298976. ЧВК  3270996. PMID  22167195.
10. Сантекадур П.К., Раджасекаран Д., Сиддик А., Гредлер Р., Чен Д., Шаус С.К., Хансен Ю., Фишер П. Б., Саркар Д. (2012). «Фактор транскрипции LSF: новый онкоген для гепатоцеллюлярной карциномы» (PDF). Am J Cancer Res. 2 (3): 269–285. ЧВК  3365805. PMID  22679558.
11. Грант Т.Дж., Бишоп Дж. А., Кристадор Л. М., Барот Дж., Чин Г. Г., Вудсон С., Кавурис Дж., Сиддик А., Гредлер Р., Шен С. Н., Шерман Дж., Михан Т., Фицджеральд К., Прадхан С., Бриггс Л. А., Эндрюс У. С., Саркар Д. , Schaus SE, Hansen U (март 2012 г.). «Антипролиферативные низкомолекулярные ингибиторы фактора транскрипции LSF выявляют онкогенную зависимость от LSF при гепатоцеллюлярной карциноме». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (12): 4503–8. Bibcode:2012PNAS..109.4503G. Дои:10.1073 / pnas.1121601109. ЧВК  3311344. PMID  22396589. Сложить резюме – Научный кодекс.
12. Замбрано Н., Минополи Дж., Де Кандия П., Руссо Т. (август 1998 г.). «Адаптерный белок Fe65 через свой домен PID1 взаимодействует с фактором транскрипции CP2 / LSF / LBP1». Журнал биологической химии. 273 (32): 20128–33. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20128. PMID  9685356.
13. Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (март 2002 г.). «Связывание белков поликомб RING со специфическими генами-мишенями в комплексе с семейством факторов транскрипции, подобных зернистой головке». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1936–46. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1936-1946.2002. ЧВК  135618. PMID  11865070.

дальнейшее чтение

• Lim LC, Swendeman SL, Sheffery M (февраль 1992 г.). «Молекулярное клонирование фактора транскрипции альфа-глобина CP2». Молекулярная и клеточная биология. 12 (2): 828–35. Дои:10.1128 / mcb.12.2.828. ЧВК  364316. PMID  1732747.
• Джейн С. М., Ниенхейс А. В., Каннингем Дж. М. (январь 1995 г.). «Переключение гемоглобина у человека и курицы опосредуется гетеромерным комплексом между повсеместно распространенным фактором транскрипции CP2 и специфическим для развития белком». Журнал EMBO. 14 (1): 97–105. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb06979.x. ЧВК  398056. PMID  7828600.
• Ширра М.К., Чжу К., Хуанг ХК, Паллас Д., Хансен Ю. (август 1994 г.). «Один экзон гена LSF человека включает консервативные области, участвующие в новых мотивах связывания ДНК и димеризации». Молекулярная и клеточная биология. 14 (8): 5076–87. Дои:10.1128 / mcb.14.8.5076. ЧВК  359026. PMID  8035790.
• Юн Дж. Б., Ли Дж., Рёдер Р. Г. (март 1994 г.). «Характеристика семейства родственных клеточных факторов транскрипции, которые могут модулировать транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1 in vitro». Молекулярная и клеточная биология. 14 (3): 1776–85. Дои:10.1128 / mcb.14.3.1776. ЧВК  358535. PMID  8114710.
• Марголис Д.М., Сомасундаран М., Грин М.Р. (февраль 1994 г.). «Фактор транскрипции человека YY1 подавляет транскрипцию вируса иммунодефицита человека типа 1 и продукцию вирионов». Журнал вирусологии. 68 (2): 905–10. Дои:10.1128 / JVI.68.2.905-910.1994. ЧВК  236527. PMID  8289393.
• Каннингем Дж. М., Ванин Е. Ф., Тран Н., Валентайн М., Джейн С. М. (ноябрь 1995 г.). «Человеческий фактор транскрипции CP2 (TFCP2), компонент селекторного белка на стадии гамма-глобина человека, картируется в области 12q13 хромосомы и находится в пределах 250 т.п.н. от гена NF-E2». Геномика. 30 (2): 398–9. PMID  8586452.
• Ромерио Ф., Габриэль М.Н., Марголис Д.М. (декабрь 1997 г.). «Подавление вируса иммунодефицита человека типа 1 за счет нового взаимодействия человеческих факторов YY1 и LSF». Журнал вирусологии. 71 (12): 9375–82. Дои:10.1128 / JVI.71.12.9375-9382.1997. ЧВК  230241. PMID  9371597.
• Замбрано Н., Минополи Дж., Де Кандия П., Руссо Т. (август 1998 г.). «Адаптерный белок Fe65 через свой домен PID1 взаимодействует с фактором транскрипции CP2 / LSF / LBP1». Журнал биологической химии. 273 (32): 20128–33. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20128. PMID  9685356.
• Бинг З., Редди С.А., Рен Й, Цинь Дж., Ляо В.С. (август 1999 г.). «Очистка и характеристика сывороточного фактора усиления амилоида A3». Журнал биологической химии. 274 (35): 24649–56. Дои:10.1074 / jbc.274.35.24649. PMID  10455131.
• Coull JJ, Romerio F, Sun JM, Volker JL, Galvin KM, Davie JR, Shi Y, Hansen U, Margolis DM (август 2000 г.). «Человеческие факторы YY1 и LSF репрессируют длинный терминальный повтор вируса иммунодефицита человека типа 1 за счет привлечения гистондеацетилазы 1». Журнал вирусологии. 74 (15): 6790–9. Дои:10.1128 / JVI.74.15.6790-6799.2000. ЧВК  112196. PMID  10888618.
• Чжоу В., Клустон Д.Р., Ван Х, Черрути Л., Каннингем Дж.М., Джейн С.М. (октябрь 2000 г.). «Индукция экспрессии гена глобина плода человека новым эритроидным фактором, NF-E4». Молекулярная и клеточная биология. 20 (20): 7662–72. Дои:10.1128 / MCB.20.20.7662-7672.2000. ЧВК  86334. PMID  11003662.
• Родда С., Шарма С., Шерер М., Чепмен Г., Ратиен П. (февраль 2001 г.). «CRTR-1, онтогенетически регулируемый репрессор транскрипции, относящийся к семейству факторов транскрипции CP2». Журнал биологической химии. 276 (5): 3324–32. Дои:10.1074 / jbc.M008167200. PMID  11073954.
• Чжэн Дж. Б., Чжоу Ю. Х., Мэйти Т., Ляо В. С., Сондерс Г. Ф. (октябрь 2001 г.). «Активация гена PAX6 человека через энхансер экзона 1 факторами транскрипции SEF и Sp1». Исследования нуклеиновых кислот. 29 (19): 4070–8. Дои:10.1093 / nar / 29.2.e6. ЧВК  60230. PMID  11574690.
• Tuckfield A, Clouston DR, Wilanowski TM, Zhao LL, Cunningham JM, Jane SM (март 2002 г.). «Связывание белков поликомб RING со специфическими генами-мишенями в комплексе с семейством факторов транскрипции, подобных зернистой головке». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1936–46. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1936-1946.2002. ЧВК  135618. PMID  11865070.
• He G, Margolis DM (май 2002 г.). «Противорегуляция деацетилирования хроматина и оккупации гистондеацетилазы на интегрированном промоторе вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) репрессором ВИЧ-1 YY1 и активатором ВИЧ-1 Tat». Молекулярная и клеточная биология. 22 (9): 2965–73. Дои:10.1128 / MCB.22.9.2965-2973.2002. ЧВК  133763. PMID  11940654.
• Петерс Л.М., Андерсон Д.В., Гриффит А.Дж., Грундфаст К.М., Сан-Агустин Т.Б., Мадео А.С., Фридман Т.Б., Морелл Р.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Мутация фактора транскрипции TFCP2L3 вызывает прогрессирующую аутосомно-доминантную тугоухость, DFNA28». Молекулярная генетика человека. 11 (23): 2877–85. Дои:10.1093 / hmg / 11.23.2877. PMID  12393799.
• Luedecking-Zimmer E, DeKosky ST, Nebes R, Kamboh MI (февраль 2003 г.). «Связь полиморфизма фактора транскрипции 3 'UTR LBP-1c / CP2 / LSF с болезнью Альцгеймера с поздним началом». Американский журнал медицинской генетики, часть B. 117B (1): 114–7. Дои:10.1002 / ajmg.b.10026. PMID  12555245. S2CID  24087609.
• Чэ Дж. Х., Ким К. Г. (февраль 2003 г.). «Связывание CP2 с промотором необходимо для усиления транскрипции генов глобина в эритроидных клетках». Молекулы и клетки. 15 (1): 40–7. PMID  12661759.