IRF3 - IRF3

IRF3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3QU6, 1J2F, 1QWT, 1T2K, 1ZOQ, 2O61, 2O6G, 2PI0, 3A77, 5JEO, 5Джек, 5JER, 5JEM, 5JEL, 5JEJ
Идентификаторы
Псевдонимы	IRF3, entrez: 3661, IIAE7, регуляторный фактор интерферона 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 603734 MGI: 1859179 ГомолоГен: 1208 Генные карты: IRF3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.33 Начинать 49,659,569 бп[1] Конец 49,665,875 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B3 Начинать 44,997,648 бп[2] Конец 45,002,848 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • последовательное связывание ДНК • идентичное связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • цитоплазма • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • апоптотический процесс • позитивная регуляция опосредованного интерфероном сигнального пути I типа • процесс апоптоза макрофагов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • реакция на бактерии • ответ на экзогенную дцРНК • положительное регулирование выработки интерферона-альфа • Сигнальный путь MDA-5 • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • иммунная система • положительная регуляция секреции цитокинов • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на дцРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • TRIF-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов • ответ на липополисахарид • защитный ответ на вирус • сигнальный путь интерферона I типа • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • отрицательная регуляция выработки интерферона I типа • запрограммированная некротическая гибель клеток • GO: 0022415 вирусный процесс • клеточный ответ на липополисахарид • положительное регулирование выработки интерферона I типа • липополисахарид-опосредованный сигнальный путь • положительное регулирование выработки интерферона-бета • врожденная иммунная система • регулирование выработки интерферона I типа • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция защитного ответа на вирус со стороны хозяина • регуляция экспрессии генов • регуляция воспалительного ответа • клеточный ответ на экзогенную дцРНК • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3661	54131
Ансамбль	ENSG00000126456	ENSMUSG00000003184
UniProt	Q14653	P70671
RefSeq (мРНК)	NM_001197122 NM_001197123 NM_001197124 NM_001197125 NM_001197126 NM_001197127 NM_001197128 NM_001571	NM_016849
RefSeq (белок)	NP_001184051 NP_001184052 NP_001184053 NP_001184054 NP_001184055 NP_001184056 NP_001184057 NP_001562 NP_001184053.1 NP_001184056.1 NP_001184057.1	NP_058545
Расположение (UCSC)	Chr 19: 49.66 - 49.67 Мб	Chr 7: 45 - 45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 3, также известный как IRF3, является регуляторный фактор интерферона.^[5]

Функция

IRF3 является членом семейства факторов регуляции транскрипции интерферона (IRF).^[5] IRF3 был первоначально обнаружен как гомолог из IRF1 и IRF2. IRF3 был дополнительно охарактеризован и показал, что он содержит несколько функциональных доменов, включая сигнал ядерного экспорта, a ДНК-связывающий домен, а C-терминал Домен ассоциации IRF и несколько нормативных фосфорилирование места.^[6] IRF3 находится в неактивной цитоплазматической форме, которая при фосфорилировании серина / треонина образует комплекс с CREBBP.^[7] Этот комплекс перемещает к ядру и активирует транскрипцию интерферонов альфа и бета, а также других генов, индуцированных интерфероном.^[8]

IRF3 играет важную роль в врожденная иммунная система ответ на вирусная инфекция.^[9] Агрегированный MAVS было обнаружено, что они активируют димеризацию IRF3.^[10] Исследование 2015 года показывает, что фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF по консервативному мотиву pLxIS привлекает и специфицирует фосфорилирование IRF3 и активацию серин / треонин-протеинкиназой TBK1, тем самым активируя продукцию интерферонов типа I.^[11] Другое исследование показало, что нокауты IRF3 - / - защищают от инфаркта миокарда.^[12] В том же исследовании был идентифицирован IRF3 и IFN-ответ типа I как потенциальная терапевтическая мишень для пост-инфаркт миокарда кардиопротекция.^[12]

Сигнальный путь толл-подобных рецепторов. Пунктирные серые линии представляют неизвестные ассоциации

Взаимодействия

IRF3 был показан взаимодействовать с IRF7.^[13]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126456 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003184 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хискотт Дж., Питха П., Генин П., Нгуен Х., Хейлброк С., Мамане Й., Алгарте М., Лин Р. (1999). «Запуск интерферонового ответа: роль фактора транскрипции IRF-3». J. Интерферон цитокин Res. 19 (1): 1–13. Дои:10.1089/107999099314360. PMID  10048763.
6. Лин Р., Хейлбрук С., Генин П., Питха П.М., Хискотт Дж. (Февраль 1999 г.). «Существенная роль фактора регуляции интерферона 3 в прямой активации транскрипции хемокинов RANTES». Mol Cell Biol. 19 (2): 959–66. Дои:10.1128 / MCB.19.2.959. ЧВК  116027. PMID  9891032.
7. Йонеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Интерферон цитокин Res. 22 (1): 73–6. Дои:10.1089/107999002753452674. PMID  11846977.
8. "Энтрез Ген: фактор регуляции интерферона 3 IRF3".
9. Коллинз С.Е., Нойс Р.С., Моссман К.Л. (февраль 2004 г.). «Врожденный клеточный ответ на проникновение вирусной частицы требует IRF3, но не репликации вируса». J Virol. 78 (4): 1706–17. Дои:10.1128 / JVI.78.4.1706-1717.2004. ЧВК  369475. PMID  14747536.
10. Хоу Ф, Сун Л., Чжэн Х, Скауг Б., Цзян QX, Чен ЗДж (5 августа 2011 г.). «MAVS формирует функциональные прионоподобные агрегаты для активации и распространения противовирусного врожденного иммунного ответа». Клетка. 146 (3): 448–61. Дои:10.1016 / j.cell.2011.06.041. ЧВК  3179916. PMID  21782231.
11. Лю С., Цай X, Ву Дж, Конг Q, Чен Х, Ли Т, Ду Ф, Рен Дж, Ву И, Гришин Н. и Чен З. Дж. (13 марта 2015 г.). «Фосфорилирование адаптерных белков врожденного иммунитета MAVS, STING и TRIF вызывает активацию IRF3». Наука. 347 (6227): ааа2630. Дои:10.1126 / science.aaa2630. PMID  25636800.
12. King KR, Aguirre AD, Ye YX, Sun Y, Roh JD, Ng Jr RP, Kohler RH, Arlauckas SP, Iwamoto Y, Savol A, Sadreyev RI, Kelly M, Fitzgibbons TP, Fitzgerald KA, Mitchison T, Libby P, Nahrendorf M, Weissleder R (6 ноября, 2017). «Интерфероны IRF3 и типа I вызывают фатальный ответ на инфаркт миокарда». Природа Медицина. 23 (12): 1481–1487. Дои:10,1038 / нм.4428. ЧВК  6477926. PMID  29106401.
13. Au WC, Yeow WS, Pitha PM (февраль 2001 г.). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология. 280 (2): 273–82. Дои:10.1006 / viro.2000.0782. PMID  11162841.

дальнейшее чтение

• Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). «Роль факторов регуляции интерферона (IRF) в вирусной передаче сигналов и регуляции роста клеток». Биохимия. 80 (8–9): 651–8. Дои:10.1016 / S0300-9084 (99) 80018-2. PMID  9865487.
• Йонеяма М., Сухара В., Фудзита Т. (2002). «Контроль активации IRF-3 путем фосфорилирования». J. Интерферон цитокин Res. 22 (1): 73–6. Дои:10.1089/107999002753452674. PMID  11846977.
• Au WC, Мур PA, Lowther W., Juang YT, Pitha PM (1996). «Идентификация члена семейства факторов регуляции интерферона, который связывается с элементом ответа, стимулированным интерфероном, и активирует экспрессию генов, индуцированных интерфероном». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (25): 11657–61. Дои:10.1073 / пнас.92.25.11657. ЧВК  40461. PMID  8524823.
• Йонеяма М., Сухара В., Фукухара И., Фукуда М., Нисида Е., Фудзита Т. (1998). «Прямой запуск системы интерферона типа I вирусной инфекцией: активация комплекса факторов транскрипции, содержащего IRF-3 и CBP / p300». EMBO J. 17 (4): 1087–95. Дои:10.1093 / emboj / 17.4.1087. ЧВК  1170457. PMID  9463386.
• Weaver BK, Kumar KP, Reich NC (1998). «Интерферон-регуляторный фактор 3 и CREB-связывающий белок / p300 представляют собой субъединицы двухцепочечного РНК-активированного фактора транскрипции DRAF1». Мол. Клетка. Биол. 18 (3): 1359–68. Дои:10.1128 / MCB.18.3.1359. ЧВК  108849. PMID  9488451.
• Лин Р., Хейлбрук С., Питха П.М., Хискотт Дж. (1998). «Вирус-зависимое фосфорилирование фактора транскрипции IRF-3 регулирует ядерную транслокацию, потенциал трансактивации и деградацию, опосредованную протеасомами». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2986–96. Дои:10.1128 / MCB.18.5.2986. ЧВК  110678. PMID  9566918.
• Ронко Л.В., Карпова А.Ю., Видаль М., Хоули П.М. (1998). «Онкобелок Е6 вируса папилломы человека 16 связывается с регуляторным фактором-3 интерферона и ингибирует его транскрипционную активность». Genes Dev. 12 (13): 2061–72. Дои:10.1101 / gad.12.13.2061. ЧВК  316980. PMID  9649509.
• Беллингхэм Дж., Грегори-Эванс К., Грегори-Эванс С.Ю. (1999). «Картирование человеческого фактора регуляции интерферона 3 (IRF3) на хромосоме 19q13.3-13.4 с помощью внутригенного полиморфного маркера». Анналы генетики человека. 62 (Пт 3): 231–4. Дои:10.1046 / j.1469-1809.1998.6230231.x. PMID  9803267. S2CID  46070705.
• Лоутер WJ, Мур PA, Картер KC, Pitha PM (1999). «Клонирование и функциональный анализ человеческого промотора IRF-3». ДНК клетки биол. 18 (9): 685–92. Дои:10.1089/104454999314962. PMID  10492399.
• Ким Т., Ким Т., Сон Й.Х., Мин И.М., Йим Дж., Ким Т.К. (1999). «Активация фактора регуляции интерферона 3 в ответ на ДНК-повреждающие агенты». J. Biol. Chem. 274 (43): 30686–9. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30686. PMID  10521456.
• Кумар КП, Макбрайд К.М., Уивер Б.К., Дингуолл К., Рейх, Северная Каролина (2000). «Регулируемая ядерно-цитоплазматическая локализация фактора регуляции интерферона 3, субъединицы фактора 1, активируемого двухцепочечной РНК». Мол. Клетка. Биол. 20 (11): 4159–68. Дои:10.1128 / MCB.20.11.4159-4168.2000. ЧВК  85785. PMID  10805757.
• Сухара В., Йонеяма М., Ивамура Т., Йошимура С., Тамура К., Намики Н., Аймото С., Фудзита Т. (2000). «Анализ вирус-индуцированных гомомерных и гетеромерных белковых ассоциаций между IRF-3 и коактиватором CBP / p300». J. Biochem. 128 (2): 301–7. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022753. PMID  10920266.
• Слуга MJ, ten Oever B, LePage C, Conti L, Gessani S, Julkunen I, Lin R, Hiscott J (2001). «Идентификация отдельных сигнальных путей, ведущих к фосфорилированию фактора регуляции интерферона 3». J. Biol. Chem. 276 (1): 355–63. Дои:10.1074 / jbc.M007790200. PMID  11035028.
• Смит Э.Дж., Мари I, Пракаш А., Гарсия-Састре А., Леви Д.Е. (2001). «Фосфорилирование IRF3 и IRF7 в инфицированных вирусом клетках не требует двухцепочечной РНК-зависимой протеинкиназы R или Ikappa B киназы, но блокируется белком E3L вируса осповакцины». J. Biol. Chem. 276 (12): 8951–7. Дои:10.1074 / jbc.M008717200. PMID  11124948.
• Au WC, Yeow WS, Pitha PM (2001). «Анализ функциональных доменов фактора регуляции интерферона 7 и его связь с IRF-3». Вирусология. 280 (2): 273–82. Дои:10.1006 / viro.2000.0782. PMID  11162841.
• Барнс Б.Дж., Мур PA, Pitha PM (2001). «Вирус-специфическая активация нового фактора регуляции интерферона, IRF-5, приводит к индукции различных генов интерферона альфа». J. Biol. Chem. 276 (26): 23382–90. Дои:10.1074 / jbc.M101216200. PMID  11303025.
• Mach CM, Hargrove BW, Kunkel GR (2002). «Белок-активатор гена малой РНК, фактор, связывающий гомологию постоктамера SphI / фактор активации транскрипции гена тРНК селеноцистеина, стимулирует транскрипцию гена фактора-3 регулирующего фактора интерферона человека». J. Biol. Chem. 277 (7): 4853–8. Дои:10.1074 / jbc.M108308200. PMID  11724783.
• Морин П., Браганса Дж., Банду М.Т., Лин Р., Хискотт Дж., Доли Дж., Сивас А (2002). «Предпочтительные сайты связывания для факторов регуляции интерферона 3 и 7, участвующих в транскрипции гена интерферона-А». J. Mol. Биол. 316 (5): 1009–22. Дои:10.1006 / jmbi.2001.5401. PMID  11884139.
• Данг О, Наварро Л., Андерсон К., Дэвид М. (2004). «Передний край: летальный токсин сибирской язвы ингибирует активацию IFN-регуляторного фактора 3 липополисахаридом». Журнал иммунологии. 172 (2): 747–51. Дои:10.4049 / jimmunol.172.2.747. PMID  14707042.

внешняя ссылка

• Интерферон + Регулятор + Фактор-3 в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook IRF3