TRAF5 - TRAF5 - Wikipedia

TRAF5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4GJH
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF5, MGC: 39780, RNF84, фактор 5, связанный с рецептором TNF
Внешние идентификаторы	OMIM: 602356 MGI: 107548 ГомолоГен: 27079 Генные карты: TRAF5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q32.3 Начинать 211,326,615 бп[1] Конец 211,374,946 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание тиоэстеразы • связывание ионов цинка • GO: 0001948 связывание с белками • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание ионов металлов • идентичное связывание с белками • связывание рецептора фактора некроза опухоли Сотовый компонент • цитозоль • цитоплазматическая сторона плазматической мембраны • центросома • CD40 рецепторный комплекс • цитоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • позитивная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • преобразование сигнала • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7188	22033
Ансамбль	ENSG00000082512	ENSMUSG00000026637
UniProt	O00463	P70191
RefSeq (мРНК)	NM_001033910 NM_004619 NM_145759 NM_001319207	NM_011633
RefSeq (белок)	NP_001029082 NP_001306136 NP_004610 NP_665702	NP_035763
Расположение (UCSC)	Chr 1: 211.33 - 211.37 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор 5, связанный с рецептором TNF это белок что у людей кодируется TRAF5 ген.^[4]

Функция

Белок каркаса, кодируемый этим геном, является членом семейства белков фактора некроза опухоли, ассоциированного с рецептором (TRAF), и содержит домен гомологии меприна и TRAF (MATH), цинковый палец типа RING и два цинковых пальца TRAF-типа. . Белки TRAF связаны и опосредуют передачу сигнала от членов суперсемейства рецепторов TNF. Этот белок является одним из компонентов множественного белкового комплекса, который связывается с цитоплазматическими доменами рецептора фактора некроза опухоли (TNF) и опосредует активацию, индуцированную TNF. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции.^[5]

Взаимодействия

TRAF5 был показан взаимодействовать с:

• ASK1,^[6][7]
• CD134,^[8]
• CD30,^[9]
• CD40,^[10][11]
• КЛАССИФИЦИРОВАТЬ^[12][13][14]
• TNFRSF13B,^[15] и
• TNFRSF14.^[16][17]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082512 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Тан XX, Pleasure DE, Ikegaki N (апрель 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и паттерн экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующих лиганды рецепторов протеин-тирозинкиназ, связанных с EPH». Геномика. 41 (1): 17–24. Дои:10.1006 / geno.1997.4615. PMID  9126477.
5. «Ген Entrez: фактор 5, связанный с рецептором TRAF5 TNF».
6. Нишито Х., Сайто М., Мочида Й., Такеда К., Накано Х., Роте М., Миядзоно К., Итиджо Х. (сентябрь 1998 г.). «ASK1 необходим для активации JNK / SAPK с помощью TRAF2». Молекулярная клетка. 2 (3): 389–95. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80283-х. PMID  9774977.
7. Хофлич К.П., Йе В.К., Яо З., Мак Т.В., Вудгетт-младший (октябрь 1999 г.). «Посредничество эффекторных функций фактора, связанного с рецептором TNF, с помощью киназы-1, регулирующей сигнал апоптоза (ASK1)». Онкоген. 18 (42): 5814–20. Дои:10.1038 / sj.onc.1202975. PMID  10523862.
8. Кавамата С., Хори Т., Имура А., Такаори-Кондо А., Учияма Т. (март 1998 г.). «Активация путей передачи сигнала OX40 приводит к активации фактора, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 2 и TRAF5, опосредованной NF-kappaB». Журнал биологической химии. 273 (10): 5808–14. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID  9488716.
9. Айзава С., Накано Х., Исида Т., Хориэ Р., Нагаи М., Ито К., Ягита Х., Окумура К., Иноуэ Дж., Ватанабэ Т. (январь 1997 г.). «Фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 5 и TRAF2, участвуют в CD30-опосредованной активации NFkappaB». Журнал биологической химии. 272 (4): 2042–5. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID  8999898.
10. Цукамото Н., Кобаяши Н., Адзума С., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Февраль 1999 г.). «Два по-разному регулируемые пути активации ядерного фактора kappaB, запускаемые цитоплазматическим хвостом CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (4): 1234–9. Дои:10.1073 / pnas.96.4.1234. ЧВК  15446. PMID  9990007.
11. Исида Т.К., Тодзё Т., Аоки Т., Кобаяши Н., Охиси Т., Ватанабэ Т., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Сентябрь 1996 г.). «TRAF5, новый белок семейства факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, опосредует передачу сигналов CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (18): 9437–42. Дои:10.1073 / пнас.93.18.9437. ЧВК  38446. PMID  8790348.
12. Darnay BG, Haridas V, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (август 1998 г.). «Характеристика внутриклеточного домена активатора рецептора NF-kappaB (RANK). Взаимодействие с факторами, связанными с рецептором фактора некроза опухоли, и активация NF-kappab и N-концевой киназы c-Jun». Журнал биологической химии. 273 (32): 20551–5. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20551. PMID  9685412.
13. Darnay BG, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (март 1999 г.). «Для активации NF-kappaB с помощью RANK требуется фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 6 и киназа, индуцирующая NF-kappaB. Идентификация нового мотива взаимодействия TRAF6». Журнал биологической химии. 274 (12): 7724–31. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7724. PMID  10075662.
14. Галиберт Л., Томецко М.Е., Андерсон Д.М., Косман Д., Дугал В.К. (декабрь 1998 г.). «Участие факторов, ассоциированных с множественными рецепторами фактора некроза опухоли (TNFR), в сигнальных механизмах активатора рецептора NF-kappaB, члена суперсемейства TNFR». Журнал биологической химии. 273 (51): 34120–7. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID  9852070.
15. Xia XZ, Treanor J, Senaldi G, Khare SD, Boone T, Kelley M, Theill LE, Colombero A, Solovyev I, Lee F, McCabe S, Elliott R, Miner K, Hawkins N, Guo J, Stolina M, Yu G , Ван Дж., Делейни Дж., Мэн С.Ю., Бойл В.Дж., Сюй Х. (июль 2000 г.). «TACI представляет собой TRAF-взаимодействующий рецептор для TALL-1, члена семейства факторов некроза опухоли, участвующего в регуляции В-клеток». Журнал экспериментальной медицины. 192 (1): 137–43. Дои:10.1084 / jem.192.1.137. ЧВК  1887716. PMID  10880535.
16. Хсу Х, Соловьев И., Коломберо А., Эллиотт Р., Келли М., Бойл В. Дж. (Май 1997 г.). «ATAR, новый член семейства рецепторов фактора некроза опухолей, передает сигналы через TRAF2 и TRAF5». Журнал биологической химии. 272 (21): 13471–4. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID  9153189.
17. Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». Журнал биологической химии. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.

дальнейшее чтение

• Ваджант Х., Хенклер Ф., Шойрих П. (июнь 2001 г.). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: скаффолдные молекулы для рецепторов цитокинов, киназ и их регуляторов». Сотовая связь. 13 (6): 389–400. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00160-7. PMID  11384837.
• Брэдли Дж. Р., Побер Дж. С. (октябрь 2001 г.). «Факторы, ассоциированные с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF)». Онкоген. 20 (44): 6482–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1204788. PMID  11607847.
• Накано Х., Осима Х., Чунг В., Уильямс-Эбботт Л., Уэр С.Ф., Ягита Х., Окумура К. (июнь 1996 г.). «TRAF5, активатор NF-kappaB и предполагаемый преобразователь сигнала для рецептора лимфотоксина-бета». Журнал биологической химии. 271 (25): 14661–4. Дои:10.1074 / jbc.271.25.14661. PMID  8663299.
• Исида Т.К., Тодзё Т., Аоки Т., Кобаяши Н., Охиси Т., Ватанабэ Т., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Сентябрь 1996 г.). «TRAF5, новый белок семейства факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, опосредует передачу сигналов CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (18): 9437–42. Дои:10.1073 / пнас.93.18.9437. ЧВК  38446. PMID  8790348.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Айзава С., Накано Х., Исида Т., Хориэ Р., Нагаи М., Ито К., Ягита Х., Окумура К., Иноуэ Дж., Ватанабэ Т. (январь 1997 г.). «Фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 5 и TRAF2, участвуют в CD30-опосредованной активации NFkappaB». Журнал биологической химии. 272 (4): 2042–5. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID  8999898.
• Хсу Х, Соловьев И., Коломберо А., Эллиотт Р., Келли М., Бойл В. Дж. (Май 1997 г.). «ATAR, новый член семейства рецепторов фактора некроза опухолей, передает сигналы через TRAF2 и TRAF5». Журнал биологической химии. 272 (21): 13471–4. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID  9153189.
• Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». Журнал биологической химии. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.
• Накано Х., Шиндо М., Ямада К., Йошида М.С., Санти С.М., Уэр С.Ф., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Ягита Х., Коупленд, Северная Каролина, Окумура К. (май 1997 г.). «Фактор 5, связанный с рецептором TNF человека (TRAF5): клонирование кДНК, экспрессия и отнесение гена TRAF5 к хромосоме 1q32». Геномика. 42 (1): 26–32. Дои:10.1006 / geno.1997.4697. PMID  9177772.
• Song HY, Régnier CH, Kirschning CJ, Goeddel DV, Rothe M (сентябрь 1997 г.). «Каскады киназ, опосредованных фактором некроза опухоли (TNF): бифуркация путей ядерного фактора-kappaB и c-jun N-концевой киназы (JNK / SAPK) в факторах 2, связанных с рецептором TNF». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (18): 9792–6. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9792. ЧВК  23270. PMID  9275204.
• Кавамата С., Хори Т., Имура А., Такаори-Кондо А., Учияма Т. (март 1998 г.). «Активация путей передачи сигнала OX40 приводит к активации фактора, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 2 и TRAF5, опосредованной NF-kappaB». Журнал биологической химии. 273 (10): 5808–14. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID  9488716.
• Мидзусима С., Фудзита М., Исида Т., Адзума С., Като К., Хираи М., Оцука М., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Январь 1998 г.). «Клонирование и характеристика кДНК, кодирующей человеческий гомолог фактора 5, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF5)». Ген. 207 (2): 135–40. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00616-1. PMID  9511754.
• Акиба Х., Накано Х., Нишинака С., Шиндо М., Кобата Т., Ацута М., Моримото С., Уэр С.Ф., Малинин Н.Л., Уоллах Д., Ягита Х., Окумура К. (май 1998 г.). «CD27, член суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей, активирует NF-kappaB и стресс-активируемую протеинкиназу / N-концевую киназу c-Jun через TRAF2, TRAF5 и киназу, индуцирующую NF-kappaB». Журнал биологической химии. 273 (21): 13353–8. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13353. PMID  9582383.
• McCarthy JV, Ni J, Dixit VM (июль 1998 г.). «RIP2 представляет собой новую киназу, активирующую NF-kappaB и вызывающую гибель клеток». Журнал биологической химии. 273 (27): 16968–75. Дои:10.1074 / jbc.273.27.16968. PMID  9642260.
• Пуллен С.С., Миллер Г.Г., Эвердин Д.С., Данг Т.Т., Круте Дж.Дж., Кери М.Р. (август 1998 г.). «Взаимодействия фактора, связанного с рецептором фактора некроза опухоли CD40 (TRAF): регуляция передачи сигналов CD40 через множество сайтов связывания TRAF и гетероолигомеризацию TRAF». Биохимия. 37 (34): 11836–45. Дои:10.1021 / bi981067q. PMID  9718306.
• Вонг Б.Р., Джозиен Р., Ли С.Ю., Вологодская М., Штейнман Р.М., Чой Й. (октябрь 1998 г.). «Семейство сигнальных преобразователей TRAF опосредует активацию NF-kappaB рецептором TRANCE». Журнал биологической химии. 273 (43): 28355–9. Дои:10.1074 / jbc.273.43.28355. PMID  9774460.
• Нишито Х., Сайто М., Мочида Й., Такеда К., Накано Х., Роте М., Миядзоно К., Ичидзё Х. (сентябрь 1998 г.). «ASK1 необходим для активации JNK / SAPK с помощью TRAF2». Молекулярная клетка. 2 (3): 389–95. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80283-X. PMID  9774977.
• Цукамото Н., Кобаяши Н., Адзума С., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Февраль 1999 г.). «Два по-разному регулируемые пути активации ядерного фактора kappaB, запускаемые цитоплазматическим хвостом CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (4): 1234–9. Дои:10.1073 / pnas.96.4.1234. ЧВК  15446. PMID  9990007.