TRAF5 - TRAF5 - Wikipedia

TRAF5
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыTRAF5, MGC: 39780, RNF84, фактор 5, связанный с рецептором TNF
Внешние идентификаторыOMIM: 602356 MGI: 107548 ГомолоГен: 27079 Генные карты: TRAF5
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение TRAF5
Геномное расположение TRAF5
Группа1q32.3Начинать211,326,615 бп[1]
Конец211,374,946 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRAF5 204352 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001033910
NM_004619
NM_145759
NM_001319207

NM_011633

RefSeq (белок)

NP_001029082
NP_001306136
NP_004610
NP_665702

NP_035763

Расположение (UCSC)Chr 1: 211.33 - 211.37 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Фактор 5, связанный с рецептором TNF это белок что у людей кодируется TRAF5 ген.[4]

Функция

Белок каркаса, кодируемый этим геном, является членом семейства белков фактора некроза опухоли, ассоциированного с рецептором (TRAF), и содержит домен гомологии меприна и TRAF (MATH), цинковый палец типа RING и два цинковых пальца TRAF-типа. . Белки TRAF связаны и опосредуют передачу сигнала от членов суперсемейства рецепторов TNF. Этот белок является одним из компонентов множественного белкового комплекса, который связывается с цитоплазматическими доменами рецептора фактора некроза опухоли (TNF) и опосредует активацию, индуцированную TNF. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции.[5]

Взаимодействия

TRAF5 был показан взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082512 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Тан XX, Pleasure DE, Ikegaki N (апрель 1997 г.). «Клонирование кДНК, хромосомная локализация и паттерн экспрессии EPLG8, нового члена семейства генов EPLG, кодирующих лиганды рецепторов протеин-тирозинкиназ, связанных с EPH». Геномика. 41 (1): 17–24. Дои:10.1006 / geno.1997.4615. PMID  9126477.
  5. ^ «Ген Entrez: фактор 5, связанный с рецептором TRAF5 TNF».
  6. ^ Нишито Х., Сайто М., Мочида Й., Такеда К., Накано Х., Роте М., Миядзоно К., Итиджо Х. (сентябрь 1998 г.). «ASK1 необходим для активации JNK / SAPK с помощью TRAF2». Молекулярная клетка. 2 (3): 389–95. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 80283-х. PMID  9774977.
  7. ^ Хофлич К.П., Йе В.К., Яо З., Мак Т.В., Вудгетт-младший (октябрь 1999 г.). «Посредничество эффекторных функций фактора, связанного с рецептором TNF, с помощью киназы-1, регулирующей сигнал апоптоза (ASK1)». Онкоген. 18 (42): 5814–20. Дои:10.1038 / sj.onc.1202975. PMID  10523862.
  8. ^ Кавамата С., Хори Т., Имура А., Такаори-Кондо А., Учияма Т. (март 1998 г.). «Активация путей передачи сигнала OX40 приводит к активации фактора, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 2 и TRAF5, опосредованной NF-kappaB». Журнал биологической химии. 273 (10): 5808–14. Дои:10.1074 / jbc.273.10.5808. PMID  9488716.
  9. ^ Айзава С., Накано Х., Исида Т., Хориэ Р., Нагаи М., Ито К., Ягита Х., Окумура К., Иноуэ Дж., Ватанабэ Т. (январь 1997 г.). «Фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 5 и TRAF2, участвуют в CD30-опосредованной активации NFkappaB». Журнал биологической химии. 272 (4): 2042–5. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2042. PMID  8999898.
  10. ^ Цукамото Н., Кобаяши Н., Адзума С., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Февраль 1999 г.). «Два по-разному регулируемые пути активации ядерного фактора kappaB, запускаемые цитоплазматическим хвостом CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (4): 1234–9. Дои:10.1073 / pnas.96.4.1234. ЧВК  15446. PMID  9990007.
  11. ^ Исида Т.К., Тодзё Т., Аоки Т., Кобаяши Н., Охиси Т., Ватанабэ Т., Ямамото Т., Иноуэ Дж. (Сентябрь 1996 г.). «TRAF5, новый белок семейства факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, опосредует передачу сигналов CD40». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 93 (18): 9437–42. Дои:10.1073 / пнас.93.18.9437. ЧВК  38446. PMID  8790348.
  12. ^ Darnay BG, Haridas V, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (август 1998 г.). «Характеристика внутриклеточного домена активатора рецептора NF-kappaB (RANK). Взаимодействие с факторами, связанными с рецептором фактора некроза опухоли, и активация NF-kappab и N-концевой киназы c-Jun». Журнал биологической химии. 273 (32): 20551–5. Дои:10.1074 / jbc.273.32.20551. PMID  9685412.
  13. ^ Darnay BG, Ni J, Moore PA, Aggarwal BB (март 1999 г.). «Для активации NF-kappaB с помощью RANK требуется фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 6 и киназа, индуцирующая NF-kappaB. Идентификация нового мотива взаимодействия TRAF6». Журнал биологической химии. 274 (12): 7724–31. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7724. PMID  10075662.
  14. ^ Галиберт Л., Томецко М.Е., Андерсон Д.М., Косман Д., Дугал В.К. (декабрь 1998 г.). «Участие факторов, ассоциированных с множественными рецепторами фактора некроза опухоли (TNFR), в сигнальных механизмах активатора рецептора NF-kappaB, члена суперсемейства TNFR». Журнал биологической химии. 273 (51): 34120–7. Дои:10.1074 / jbc.273.51.34120. PMID  9852070.
  15. ^ Xia XZ, Treanor J, Senaldi G, Khare SD, Boone T, Kelley M, Theill LE, Colombero A, Solovyev I, Lee F, McCabe S, Elliott R, Miner K, Hawkins N, Guo J, Stolina M, Yu G , Ван Дж., Делейни Дж., Мэн С.Ю., Бойл В.Дж., Сюй Х. (июль 2000 г.). «TACI представляет собой TRAF-взаимодействующий рецептор для TALL-1, члена семейства факторов некроза опухоли, участвующего в регуляции В-клеток». Журнал экспериментальной медицины. 192 (1): 137–43. Дои:10.1084 / jem.192.1.137. ЧВК  1887716. PMID  10880535.
  16. ^ Хсу Х, Соловьев И., Коломберо А., Эллиотт Р., Келли М., Бойл В. Дж. (Май 1997 г.). «ATAR, новый член семейства рецепторов фактора некроза опухолей, передает сигналы через TRAF2 и TRAF5». Журнал биологической химии. 272 (21): 13471–4. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13471. PMID  9153189.
  17. ^ Marsters SA, Ayres TM, Skubatch M, Gray CL, Rothe M, Ashkenazi A (май 1997 г.). «Медиатор проникновения вируса герпеса, член семейства рецепторов фактора некроза опухоли (TNFR), взаимодействует с членами семейства факторов, связанных с TNFR, и активирует факторы транскрипции NF-kappaB и AP-1». Журнал биологической химии. 272 (22): 14029–32. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14029. PMID  9162022.

дальнейшее чтение