TRAF4 - TRAF4

TRAF4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2EOD, 2YUC, 3ZJB, 4K8U, 4М4Э
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF4, CART1, MLN62, RNF83, фактор 4, связанный с рецептором TNF
Внешние идентификаторы	OMIM: 602464 MGI: 1202880 ГомолоГен: 3173 Генные карты: TRAF4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 28,744,005 бп[1] Конец 28,750,956 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание домена WW • связывание тиоэстеразы • связывание рецептора фактора некроза опухоли • связывание протеинкиназы • связывание убиквитин-протеин-лигазы • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • двухклеточное плотное соединение • клеточная мембрана • соединение клеток • перинуклеарная область цитоплазмы • цитоскелет • ядро клетки • макромолекулярный комплекс • внутриклеточный Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • активация активности киназы, индуцирующей NF-kappaB • положительное регулирование каскада JNK • положительное регулирование активности гомодимеризации белков • дыхательный газообмен • развитие многоклеточного организма • развитие дыхательной трубки • преобразование сигнала • положительная регуляция активности протеинкиназы • апоптотический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9618	22032
Ансамбль	ENSG00000076604	ENSMUSG00000017386
UniProt	Q9BUZ4	Q61382
RefSeq (мРНК)	NM_004295 NM_145751	NM_009423
RefSeq (белок)	NP_004286	NP_033449
Расположение (UCSC)	Chr 17: 28.74 - 28.75 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор 4, связанный с рецептором TNF (TRAF4), также известный как Кольцо пальца белка 83 (RNF83) - это белок что у людей кодируется TRAF4 ген.^[4][5][6]

TRAF4 является членом семейства факторов, связанных с рецептором TNF (TRAF), семейства каркасные белки.^[7] Белки TRAF соединяются ИЛ-1Р / Платные и Рецепторы TNF с сигнальными факторами, которые приводят к активации NF-κB и митоген-активированные протеинкиназы. Однако не известно, что TRAF4 взаимодействует с рецепторами TNF, и его клеточные функции не совсем понятны.^[8]

Белковые взаимодействия

Было показано, что TRAF4 взаимодействует с рецептор нейротрофина, стр.75 (NTR / NTSR1),^[9][10] и отрицательно регулируют индуцированную NTR гибель клеток и активацию NF-каппа B. Было обнаружено, что этот белок связывается с p47phox, цитозольный регуляторный фактор, включенный в мультибелковый комплекс, известный как НАД (Ф) Н оксидаза. Таким образом, считается, что этот белок участвует в окислительной активации MAPK8 / JNK. Альтернативно сплайсированные варианты транскриптов наблюдались, но была определена полноразмерная природа только одного.^[6]

Недавний отчет показывает, что TRAF4 связывается с NOD-подобными рецепторами NOD1 и NOD2 и специфически ингибирует активацию NF-κB активированным комплексом NOD2-RIP2 ^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000076604 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Regnier CH, Tomasetto C, Moog-Lutz C, Chenard MP, Wendling C, Basset P, Rio MC (декабрь 1995 г.). «Присутствие нового консервативного домена в CART1, новом члене семейства белков, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, который экспрессируется в карциноме молочной железы». J Biol Chem. 270 (43): 25715–21. Дои:10.1074 / jbc.270.43.25715. PMID  7592751.
5. Tomasetto C, Regnier C, Moog-Lutz C, Mattei MG, Chenard MP, Lidereau R, Basset P, Rio MC (январь 1996 г.). «Идентификация четырех новых человеческих генов, амплифицированных и сверхэкспрессированных в карциноме груди и локализованных в области q11-q21.3 хромосомы 17». Геномика. 28 (3): 367–76. Дои:10.1006 / geno.1995.1163. PMID  7490069.
6. «Ген Entrez: фактор 4, связанный с рецептором TRAF4 TNF».
7. Ваджант Х, Хенклер Ф, Шойрих П. (июнь 2001 г.). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: скаффолдные молекулы для рецепторов цитокинов, киназ и их регуляторов». Cell. Сигнал. 13 (6): 389–400. Дои:10.1016 / S0898-6568 (01) 00160-7. PMID  11384837.
8. Кединджер V, Рио MC (2007). «TRAF4, уникальный член семьи». Adv. Exp. Med. Биол. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 597: 60–71. Дои:10.1007/978-0-387-70630-6_5. ISBN  978-0-387-70629-0. PMID  17633017.
9. Йе Х, Мелен П., Рабизаде С., Ван Арсдейл Т., Чжан Х., Шин Х, Ван Дж. Дж., Лео Е., Сапата Дж., Хаузер, Калифорния, Рид Дж. К., Бредесен, ДЕ (октябрь 1999 г.). «Белки семейства TRAF взаимодействуют с общим рецептором нейротрофина и модулируют индукцию апоптоза». J. Biol. Chem. 274 (42): 30202–8. Дои:10.1074 / jbc.274.42.30202. PMID  10514511.
10. Krajewska M, Krajewski S, Zapata JM, Van Arsdale T, Gascoyne RD, Berern K, McFadden D, Shabaik A, Hugh J, Reynolds A, Clevenger CV, Reed JC (июнь 1998 г.). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого человека, плода и опухоли». Am. Дж. Патол. 152 (6): 1549–61. ЧВК  1858434. PMID  9626059.
11. Маринис Дж. М., Гомер К. Р., Макдональд С., Эбботт Д. В. (2011). «Новый мотив в белке восприимчивости к болезни Крона, NOD2, позволяет TRAF4 подавлять врожденные иммунные ответы». J. Biol. Chem. 286 (3): 1938–1950. Дои:10.1074 / jbc.M110.189308. ЧВК  3023490. PMID  21097508.

дальнейшее чтение

• Брэдли Дж. Р., Побер Дж. С. (2001). «Факторы, ассоциированные с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF)». Онкоген. 20 (44): 6482–91. Дои:10.1038 / sj.onc.1204788. PMID  11607847.
• Masson R, Régnier CH, Chenard MP, et al. (1998). «Паттерн экспрессии фактора 4, ассоциированного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF4), во время развития мышей». Мех. Dev. 71 (1–2): 187–91. Дои:10.1016 / S0925-4773 (97) 00192-5. PMID  9507120. S2CID  13877166.
• Сапата Дж. М., Павловски К., Хаас Э. и др. (2001). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли». J. Biol. Chem. 276 (26): 24242–52. Дои:10.1074 / jbc.M100354200. PMID  11279055.
• Ренье Ч., Массон Р., Кединджер В. и др. (2002). «Нарушение закрытия нервной трубки, пороки развития осевого скелета и разрыв трахеального кольца у мышей с дефицитом TRAF4». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (8): 5585–90. Дои:10.1073 / pnas.052124799. ЧВК  122813. PMID  11943846.
• Xu YC, Wu RF, Gu Y и др. (2002). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun». J. Biol. Chem. 277 (31): 28051–7. Дои:10.1074 / jbc.M202665200. PMID  12023963.
• Глаунер Х., Зигмунд Д., Мотеджадед Х. и др. (2002). «Внутриклеточная локализация и регуляция транскрипции фактора 4 фактора некроза опухоли (TNF), связанного с рецептором (TRAF4)». Евро. J. Biochem. 269 (19): 4819–29. Дои:10.1046 / j.1432-1033.2002.03180.x. PMID  12354113.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Сакс Дж. К., Эль-Дейри В. С. (2003). «Идентификация и характеристика цитоплазматического белка TRAF4 как проапоптотического гена, регулируемого р53». J. Biol. Chem. 278 (38): 36435–44. Дои:10.1074 / jbc.M303191200. PMID  12788948.
• Fleckenstein DS, Dirks WG, Drexler HG, Quentmeier H (2003). «Фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 4, представляет собой новый партнер связывания для серин / треонинкиназы p70S6». Лейк. Res. 27 (8): 687–94. Дои:10.1016 / S0145-2126 (02) 00325-9. PMID  12801526.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ма Б.Ю., Миколайчак С.А., Данеш А. и др. (2005). «Экспрессия и регуляторная роль гетеродимера OX40 и 4-1BB в активированных Т-клетках человека». Кровь. 106 (6): 2002–10. Дои:10.1182 / кровь-2004-04-1622. PMID  15941918.
• Такешита Ф., Исии К.Дж., Кобияма К. и др. (2005). «TRAF4 действует как глушитель в TLR-опосредованной передаче сигналов через ассоциацию с TRAF6 и TRIF». Евро. J. Immunol. 35 (8): 2477–85. Дои:10.1002 / eji.200526151. PMID  16052631.
• Абелл А.Н., Джонсон Г.Л. (2006). «MEKK4 является эффектором эмбрионального TRAF4 для активации JNK». J. Biol. Chem. 280 (43): 35793–6. Дои:10.1074 / jbc.C500260200. PMID  16157600.