CDX1 - CDX1

CDX1
Идентификаторы
Псевдонимы	CDX1, гомеобокс 1 каудального типа, белок гомеобокс CDX-1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600746 MGI: 88360 ГомолоГен: 1366 Генные карты: CDX1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q32 Начните 150,166,778 бп[1] Конец 150,184,558 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 E1 | 18 34,41 см Начните 61,018,862 бп[2] Конец 61,036,199 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание метил-CpG • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • морфогенез органов животных • развитие многоклеточного организма • процесс спецификации шаблона • костный морфогенез • дифференциация клеток • спецификация передней / задней оси • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция сомитогенеза • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • спецификация переднего / заднего рисунка • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1044	12590
Ансамбль	ENSG00000113722	ENSMUSG00000024619
UniProt	P47902	P18111
RefSeq (мРНК)	NM_001804	NM_009880
RefSeq (белок)	NP_001795	NP_034010
Расположение (UCSC)	Chr 5: 150.17 - 150.18 Мб	Chr 18: 61.02 - 61.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин CDX-1 это белок у людей это кодируется CDX1 ген.^[5][6] CDX1 экспрессируется в развивающихся энтодерма и его экспрессия сохраняется в кишечнике на протяжении всей взрослой жизни.^[7] Экспрессия белка CDX1 варьирует вдоль кишечника, с высокой экспрессией в кишечных криптах и ​​снижением экспрессии вдоль кишечных ворсинок.^[8]

Функция

Этот ген является членом каудальный -связанные с гомеобокс фактор транскрипции семья. Кодируемый ДНК-связывающий белок регулирует специфическую для кишечника экспрессию генов и дифференцировку энтероцитов. Было показано, что он индуцирует экспрессию гена кишечной щелочной фосфатазы и ингибирует транскрипционную активность бета-катенина / Т-клеточного фактора.^[6]

CDX1, как было показано, также играет важную роль в эмбриональном эпикардиальном развитии. Было продемонстрировано, что белки CDX подавляют сердечную дифференцировку как в эмбриональных стволовых клетках рыбок данио, так и у мышей, но общий механизм того, как это происходит, плохо изучен.^[9] Однако было показано, что CDX1 временно экспрессируется в сердце эмбриона через 11,5 дней после полового акта (dpc). Считается, что эта временная экспрессия индуцирует эпикардиальный эпителиально-мезинхимальный переход и, следовательно, собственное сердечно-сосудистое образование. Было показано, что индукция CDX1 низкой дозой вызывала усиленную миграцию и дифференцировку клеток, происходящих из эпикарда, в гладкие мышцы сосудов, тогда как продолжающаяся индукция высокой дозой CDX1 или дефицита CDX1 уменьшала способность этих клеток мигрировать и дифференцироваться в гладкие мышцы за счет действия TGF-β1. Кроме того, индукция CDX1 также изменяет экспрессию транскриптов генов, связанных с клеточными адгезиями для EMT и ангиогенеза.^[10] Следовательно, наряду с его известной ролью в формировании паттерна и дифференцировке кишечника, CDX1, как показано, также важен в развитии эпикарда.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113722 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024619 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Bonner CA, Loftus SK, Wasmuth JJ (июль 1995 г.). «Выделение, характеристика и точная физическая локализация человеческого CDX1, гена гомеобокса каудального типа». Геномика. 28 (2): 206–11. Дои:10.1006 / geno.1995.1132. PMID  8530027.
6. «Ген Entrez: фактор транскрипции 1 гомеобокса каудального типа CDX1».
7. Грейнджер С., Гринюк А., Лонес Д. (2013). «Cdx1 и Cdx2 проявляют транскрипционную специфичность в кишечнике». PLOS ONE. 8 (1): e54757. Дои:10.1371 / journal.pone.0054757. ЧВК  3559873. PMID  23382958.
8. Баркер Н., ван Эс Дж. Х., Койперс Дж., Куяла П., ван ден Борн М., Козийнсен М., Хэгебарт А., Корвинг Дж., Бегтель Х., Петерс П. Дж., Клеверс Х (октябрь 2007 г.). «Идентификация стволовых клеток тонкой и толстой кишки по маркерному гену Lgr5». Природа. 449 (7165): 1003–7. Дои:10.1038 / природа06196. PMID  17934449. S2CID  4349637.
9. Lengerke C, Wingert R, Beeretz M, Grauer M, Schmidt AG, Konantz M, Daley GQ, Davidson AJ (июнь 2011 г.). «Взаимодействие между генами Cdx и ретиноевой кислотой модулирует ранний кардиогенез». Биология развития. 354 (1): 134–42. Дои:10.1016 / j.ydbio.2011.03.027. ЧВК  3502019. PMID  21466798.
10. Чу М., Ван Л., Ван Х, Шен Т, Ян И, Сунь И, Тан Н, Ни Т, Чжу Дж, Почтальон РБ, Ван И (2014). «Новая роль CDX1 в эмбриональном эпикардиальном развитии». PLOS ONE. 9 (7): e103271. Дои:10.1371 / journal.pone.0103271. ЧВК  4113346. PMID  25068460.

дальнейшее чтение

• Синдром Тричера Коллинза Колла; Диксон, Джилл; Эдвардс, Сара Дж .; Гладвин, Аманда Дж .; Диксон, Майкл Дж .; Лофтус, Стейси К .; Боннер, Синтия А .; Копривникар, Кэтрин; Васмут, Джон Дж. (Февраль 1996 г.). «Позиционное клонирование гена, участвующего в патогенезе синдрома Тричера Коллинза. Совместная группа по синдрому Тричера Коллинза». Природа Генетика. 12 (2): 130–6. Дои:10.1038 / ng0296-130. PMID  8563749. S2CID  34312227.
• Mallo GV, Rechreche H, Frigerio JM, Rocha D, Zweibaum A, Lacasa M, Jordan BR, Dusetti NJ, Dagorn JC, Iovanna JL (февраль 1997 г.). «Молекулярное клонирование, секвенирование и экспрессия мРНК, кодирующей гомеобокс Cdx1 и Cdx2 человека. Подавление экспрессии мРНК Cdx1 и Cdx2 во время колоректального канцерогенеза». Международный журнал рака. 74 (1): 35–44. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19970220) 74: 1 <35 :: AID-IJC7> 3.0.CO; 2-1. PMID  9036867.
• Мизошита Т., Инада К., Цукамото Т., Кодера Ю., Ямамура Ю., Хираи Т., Като Т., Джох Т., Ито М., Татэмацу М. (2002). «Экспрессия мРНК Cdx1 и Cdx2 и важность этой экспрессии для дифференцировки в слизистой оболочке желудочно-кишечного тракта человека - с особым акцентом на участие в кишечной метаплазии желудка человека». Рак желудка. 4 (4): 185–91. Дои:10.1007 / PL00011741. PMID  11846061.
• Suh ER, Ha CS, Rankin EB, Toyota M, Traber PG (сентябрь 2002 г.). «Метилирование ДНК подавляет экспрессию гена CDX1 в клеточных линиях колоректального рака». Журнал биологической химии. 277 (39): 35795–800. Дои:10.1074 / jbc.M205567200. PMID  12124393.
• Domon-Dell C, Schneider A, Moucadel V, Guerin E, Guenot D, Aguillon S, Duluc I, Martin E, Iovanna J, Launay JF, Duclos B, Chenard MP, Meyer C, Oudet P, Kedinger M, Gaub MP, Фройнд Дж. Н. (сентябрь 2003 г.). «Ген гомеобокса Cdx1 во время прогрессирования рака толстой кишки у человека». Онкоген. 22 (39): 7913–21. Дои:10.1038 / sj.onc.1206756. PMID  12970739.
• Вонг Н.А., Бриттон М.П., ​​Чой Г.С., Стэнтон Т.К., Бикнелл, округ Колумбия, Уилдинг Д.Л., Бодмер В.Ф. (январь 2004 г.). «Потеря экспрессии CDX1 при колоректальной карциноме: метилирование промотора, мутации и анализ потери гетерозиготности 37 клеточных линий». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (2): 574–9. Дои:10.1073 / pnas.0307190101. ЧВК  327189. PMID  14704280.
• Ранкин Е.Б., Сюй В., Сильберг Д.Г., Су Е. (май 2004 г.). «Предполагаемые кишечно-специфические энхансеры, расположенные в 5'-последовательности гена CDX1, регулируют экспрессию CDX1 в кишечнике». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени. 286 (5): G872–80. Дои:10.1152 / ajpgi.00326.2003. PMID  14715525.
• Беланд М., Пилон Н., Хоул М., О К., Сильвестр Дж. Р., Принос П., Лонес Д. (июнь 2004 г.). «Ауторегуляция Cdx1 регулируется новым транскрипционным комплексом Cdx1-LEF1». Молекулярная и клеточная биология. 24 (11): 5028–38. Дои:10.1128 / MCB.24.11.5028-5038.2004. ЧВК  416402. PMID  15143193.
• Гуо Р.Дж., Хуанг Э., Эзаки Т., Патель Н., Синклер К., Ву Дж., Кляйн П., Сух Э.Р., Линч Д.П. (август 2004 г.). «Cdx1 ингибирует пролиферацию клеток рака толстой кишки человека за счет снижения транскрипционной активности бета-катенина / Т-клеточного фактора». Журнал биологической химии. 279 (35): 36865–75. Дои:10.1074 / jbc.M405213200. PMID  15215241.
• Альхури Ф., Мало М.С., Мозумдер М., Мостафа Г., Ходин Р.А. (август 2005 г.). «Дифференциальная регуляция экспрессии гена кишечной щелочной фосфатазы с помощью Cdx1 и Cdx2». Американский журнал физиологии. Физиология желудочно-кишечного тракта и печени. 289 (2): G285–90. Дои:10.1152 / ajpgi.00037.2005. PMID  15774940.
• Вонг Н.А., Уилдинг Дж., Бартлетт С., Лю Ю., Уоррен Б. Ф., Пирис Дж., Мейнард Н., Маршалл Р., Бодмер В. Ф. (май 2005 г.). «CDX1 - важный молекулярный медиатор метаплазии Барретта». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (21): 7565–70. Дои:10.1073 / pnas.0502031102. ЧВК  1140438. PMID  15894614.

внешняя ссылка

• Человек CDX1 расположение генома и CDX1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• CDX1 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.