ШЕСТЬ4 - SIX4 - Wikipedia
ШЕСТЬ4 |
---|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | ШЕСТЬ4, AREC3, SIX homeobox 4 |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM: 606342 MGI: 106034 ГомолоГен: 69089 Генные карты: ШЕСТЬ4 |
---|
|
|
Генная онтология |
---|
Молекулярная функция | • последовательное связывание ДНК • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции
|
---|
Сотовый компонент | • цитоплазма • ядро клетки • комплекс регуляторов транскрипции
|
---|
Биологический процесс | • развитие языка • развитие тройничного ганглия • саркомерная организация • генерация нейронов • регуляция удлинения ветвей, участвующих в ветвлении зачатка мочеточника • отрицательная регуляция апоптотического процесса • положительная регуляция ветвления, участвующая в морфогенезе зачатка мочеточника • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие многоклеточного организма • отрицательная регуляция дифференцировки сателлитных клеток • развитие глоточной системы • морфогенез анатомической структуры • морфогенез эмбриональной скелетной системы • морфогенез внутреннего уха • развитие миотома • грибовидный морфогенез сосочка • дифференциация волокон скелетных мышц • положительная регуляция образования зачатка мочеточника • регуляция экспрессии генов • морфогенез эмбрионального черепного скелета • развитие анатомической структуры • регуляция синаптического роста в нервно-мышечном соединении • формирование обонятельной плакоды • миграция миобластов • развитие тимуса • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция пролиферации эпителиальных клеток • развитие метанефрической мезенхимы • определение мужского пола • развитие скелетной мышечной ткани • отрицательная регуляция апоптотического процесса нейронов • регулирование локализации белка • дифференциация мужского пола • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие мужских гонад • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • локализация белка в ядре
|
---|
Источники:Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Расположение (UCSC) | Chr 14: 60,71 - 60,72 Мб | Chr 12: 73.1 - 73.11 Мб |
---|
PubMed поиск | [3] | [4] |
---|
Викиданные |
|
Гомеобокс протеин SIX4 это белок что у людей кодируется ШЕСТЬ4 ген.[5][6][7]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100625 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034460 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Gallardo ME, Lopez-Rios J, Fernaud-Espinosa I, Granadino B, Sanz R, Ramos C, Ayuso C, Seller MJ, Brunner HG, Bovolenta P, Rodriguez de Cordoba S (ноябрь 1999 г.). «Геномное клонирование и характеристика гена гомеобокса человека SIX6 выявляет кластер из SIX генов в хромосоме 14 и связывает гемизиготность SIX6 с двусторонней анофтальмией и аномалиями гипофиза». Геномика. 61 (1): 82–91. Дои:10.1006 / geno.1999.5916. PMID 10512683.
- ^ Одзаки Х., Ямада К., Кобаяси М., Асакава С., Миносима С., Симидзу Н., Кадзитани М., Каваками К. (май 2000 г.). «Структура и картирование хромосом человеческих генов SIX4 и мыши Six4». Cytogenet Cell Genet. 87 (1–2): 108–12. Дои:10.1159/000015407. PMID 10640827. S2CID 28013542.
- ^ «Ген Entrez: гомолог 4 гомеобокса sine oculis SIX4 (Drosophila)».
дальнейшее чтение
- Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Лопес-Риос Дж., Тессмар К., Лоосли Ф. и др. (2003). «Активность Six3 и Six6 регулируется членами семейства граучо». Разработка. 130 (1): 185–95. Дои:10.1242 / dev.00185. PMID 12441302.
- Икеда К., Ватанабе И, Ото Х, Каваками К. (2002). «Молекулярное взаимодействие и синергетическая активация промотора белками Six, Eya и Dach, опосредованная связывающим белком CREB». Мол. Клетка. Биол. 22 (19): 6759–66. Дои:10.1128 / MCB.22.19.6759-6766.2002. ЧВК 134036. PMID 12215533.
- Вентилятор X, Brass LF, Poncz M и др. (2000). «Альфа-субъединицы Gz и Gi взаимодействуют с глазами в отсутствие кофактора транскрипции Eya2, предотвращая его взаимодействие с шестью классами гомеодомен-содержащих белков». J. Biol. Chem. 275 (41): 32129–34. Дои:10.1074 / jbc.M004577200. PMID 10906137.
- Каваками К., Ото Х., Икеда К., Рёдер Р.Г. (1996). «Структура, функция и экспрессия мышиного гомеобокса AREC3, гомолога продукта гена Drosophila sine oculis, и участие в развитии». Нуклеиновые кислоты Res. 24 (2): 303–10. Дои:10.1093 / nar / 24.2.303. ЧВК 145635. PMID 8628654.
|
---|
(1) Базовые домены |
---|
(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP ) | |
---|
(1.2) Базовая спираль-петля-спираль (bHLH ) | Группа А | |
---|
Группа B | |
---|
Группа C bHLH-PAS | |
---|
Группа D | |
---|
Группа E | |
---|
Группа F bHLH-COE | |
---|
|
---|
(1.3) bHLH-ZIP | |
---|
(1.4) НФ-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены |
---|
(2.1) Ядерный рецептор (Cys4) | подсемейство 1 | |
---|
подсемейство 2 | |
---|
подсемейство 3 | |
---|
подсемейство 4 | |
---|
подсемейство 5 | |
---|
подсемейство 6 | |
---|
подсемейство 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Другой Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2Его2 | |
---|
(2.4) Cys6 | |
---|
(2.5) Чередующийся состав | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
|
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок |
---|
|
|
(0) Другие факторы транскрипции |
---|
|
|
смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора |