GFI1 - GFI1

GFI1
Идентификаторы
Псевдонимы	GFI1, GFI-1, GFI1A, SCN2, ZNF163, независимый от фактора роста 1 репрессор транскрипции
Внешние идентификаторы	OMIM: 600871 MGI: 103170 ГомолоГен: 3854 Генные карты: GFI1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1п22.1 Начните 92,473,043 бп[1] Конец 92,486,925 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 F | 5 52,23 см Начните 107,716,657 бп[2] Конец 107,726,036 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание ионов металлов • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции Сотовый компонент • ядерное тело • ядерная матрица • транскрипционный репрессорный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • положительная регуляция опосредованного интерлейкином-6 сигнального пути • негативная регуляция развития проекции нейронов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция сигнального пути толл-подобных рецепторов • регуляция метилирования гистона H3-K4 • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция процесса биосинтеза витамина D • отрицательная регуляция активности кальцидиол-1-монооксигеназы • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • клеточный ответ на липополисахарид • кроветворение • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2672	14581
Ансамбль	ENSG00000162676	ENSMUSG00000029275
UniProt	Q99684	P70338
RefSeq (мРНК)	NM_001127215 NM_001127216 NM_005263	NM_001267621 NM_010278
RefSeq (белок)	NP_001120687 NP_001120688 NP_005254	NP_001254550 NP_034408
Расположение (UCSC)	Chr 1: 92.47 - 92.49 Мб	Chr 5: 107,72 - 107,73 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинк-пальцевый протеин Gfi-1 транскрипционный репрессор что у людей кодируется GFI1 ген.^[5] Важно нормально кроветворение.^[6]

Взаимодействия

GFI1 показал себя взаимодействовать с участием PIAS3^[7] и RUNX1T1.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162676 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029275 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Белл Д.В., Тагучи Т., Дженкинс Н.А., Гилберт Д.Д., Коупленд Н.Г., Гилкс С.Б., Цвейдлер-Маккей П., Граймс Х.Л., Цихлис П.Н., Теста-младший (июль 1995 г.). «Хромосомная локализация гена GF1, кодирующего новый белок цинкового пальца, выявляет новую синтеническую область между человеком и грызунами». Cytogenet Cell Genet. 70 (3–4): 263–7. Дои:10.1159/000134048. PMID  7789186.
6. «Энтрез Ген: независимый от фактора роста GFI1 1».
7. Rödel B, Tavassoli K, Karsunky H, Schmidt T., Bachmann M, Schaper F, Heinrich P, Shuai K, Elsässer HP, Möröy T. (ноябрь 2000 г.). «Белок цинкового пальца Gfi-1 может усиливать передачу сигналов STAT3, взаимодействуя с ингибитором STAT3 PIAS3». EMBO J. 19 (21): 5845–55. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5845. ЧВК  305799. PMID  11060035.
8. МакГи Л., Брайан Дж., Эллиотт Л., Граймс Х.Л., Казанджян А., Дэвис Дж. Н., Мейерс С. (август 2003 г.). «Gfi-1 прикрепляется к ядерному матриксу, связывается с белками ETO (MTG8) и гистондеацетилазой и репрессирует транскрипцию, используя механизм, чувствительный к TSA». J. Cell. Биохим. 89 (5): 1005–18. Дои:10.1002 / jcb.10548. PMID  12874834.

дальнейшее чтение

• Гилкс CB, Bear SE, Grimes HL, Tsichlis PN (1993). «Прогрессирование интерлейкин-2 (IL-2) -зависимых линий Т-клеточной лимфомы крысы до IL-2-независимого роста после активации гена (Gfi-1), кодирующего новый белок цинкового пальца». Мол. Cell. Биол. 13 (3): 1759–68. Дои:10.1128 / MCB.13.3.1759. ЧВК  359488. PMID  8441411.
• Цвейдлер-Маккей П.А., Граймс Х.Л., Флубахер М.М., Цихлис П.Н. (1996). «Gfi-1 кодирует ядерный белок цинкового пальца, который связывает ДНК и действует как репрессор транскрипции». Мол. Cell. Биол. 16 (8): 4024–34. Дои:10.1128 / MCB.16.8.4024. ЧВК  231398. PMID  8754800.
• Робертс Т., Коуэлл Дж. К. (1997). «Клонирование гена Gfi-1 человека и его картирование в области 1p22 хромосомы». Онкоген. 14 (8): 1003–5. Дои:10.1038 / sj.onc.1200910. PMID  9051000.
• Rödel B, Tavassoli K, Karsunky H, Schmidt T., Bachmann M, Schaper F, Heinrich P, Shuai K, Elsässer HP, Möröy T. (2000). «Белок цинкового пальца Gfi-1 может усиливать передачу сигналов STAT3, взаимодействуя с ингибитором STAT3 PIAS3». EMBO J. 19 (21): 5845–55. Дои:10.1093 / emboj / 19.21.5845. ЧВК  305799. PMID  11060035.
• Осава М., Ямагути Т., Накамура Ю., Канеко С., Онодера М., Савада К., Джегалиан А., Ву Х., Накаучи Х., Ивама А. (2002). «Расширение эритроидов, опосредованное белком цинкового пальца Gfi-1B: роль в нормальном кроветворении». Кровь. 100 (8): 2769–77. Дои:10.1182 / кровь-2002-01-0182. PMID  12351384.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фермер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С. П, Прейндж С., Раха С.С., Локеллано Н.А., Питерс Дж. Дж., Абрамсон Р. Д., Муллахи С. Дж., Босак С. А., МакЭван П. Дж., МакКернан К. Дж., Малек Дж. А., Гунаратне П. Х., Ричардс С., Уорли К. К., Хейл С., Гарсия А. М., Гей Л. Дж., Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (2003 ). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Человек RE, Ли Ф.К., Дуан З., Бенсон К.Ф., Векслер Дж., Пападаки Х.А., Элиопулос Г., Кауфман С., Бертолоне С.Дж., Накамото Б., Папаяннопулу Т., Граймс Х.Л., Хорвиц М. (2003). «Мутации в протоонкогене GFI1 вызывают нейтропению человека и мишень ELA2». Nat. Genet. 34 (3): 308–12. Дои:10,1038 / ng1170. ЧВК  2832179. PMID  12778173.
• МакГи Л., Брайан Дж., Эллиотт Л., Граймс Х.Л., Казанджян А., Дэвис Дж. Н., Мейерс С. (2003). «Gfi-1 прикрепляется к ядерному матриксу, связывается с белками ETO (MTG8) и гистондеацетилазой и репрессирует транскрипцию, используя механизм, чувствительный к TSA». J. Cell. Биохим. 89 (5): 1005–18. Дои:10.1002 / jcb.10548. PMID  12874834.
• Доан Л.Л., Портер С.Д., Дуан З., Флубахер М.М., Монтойя Д., Цихлис П.Н., Хорвиц М., Гилкс С.Б., Граймс Х.Л. (2004). «Направленная репрессия транскрипции Gfi1 с помощью GFI1 и GFI1B в лимфоидных клетках». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (8): 2508–19. Дои:10.1093 / нар / гх570. ЧВК  419458. PMID  15131254.
• Двиведи П.П., Андерсон PH, Омдал Дж.Л., Граймс Х.Л., Моррис Х.А., Мэй Б.К. (2005). «Идентификация фактора роста-независимого-1 (GFI1) в качестве репрессора экспрессии гена 25-гидроксивитамин D 1-альфа-гидроксилазы (CYP27B1) в клетках рака простаты человека». Endocr. Relat. Рак. 12 (2): 351–65. Дои:10.1677 / erc.1.00920. PMID  15947108.
• Дуан З., Заребски А., Монтойя-Дуранго Д., Граймс Х.Л., Хорвиц М. (2005). «Gfi1 координирует эпигенетическую репрессию p21Cip / WAF1 за счет привлечения гистон-лизин-метилтрансферазы G9a и гистон-деацетилазы 1». Мол. Cell. Биол. 25 (23): 10338–51. Дои:10.1128 / MCB.25.23.10338-10351.2005. ЧВК  1291230. PMID  16287849.
• Marteijn JA, van der Meer LT, Van Emst L, de Witte T, Jansen JH, van der Reijden BA (2007). «Уменьшение протеасомной деградации приводит к накоплению белка Gfi1 в моноцитах». Кровь. 109 (1): 100–8. Дои:10.1182 / кровь-2006-02-003590. PMID  16888099.
• Двиведи П.П., Андерсон PH, Тилли В.Д., Мэй Б.К., Моррис HA (2007). «Роль онкопротеина, независимого от фактора роста-1 (GFI1) в репрессии 25-гидроксивитамин D 1альфа-гидроксилазы (CYP27B1): сравнительный анализ рака простаты и клеток почек человека». J. Steroid Biochem. Мол. Биол. 103 (3–5): 742–6. Дои:10.1016 / j.jsbmb.2006.12.014. PMID  17207994. S2CID  30600875.
• Накадзава Ю., Сузуки М., Манабе Н., Ямада Т., Кихара-Негиси Ф., Сакураи Т., Тенен Д.Г., Ивама А., Мочизуки М., Оикава Т. (2007). «Совместное взаимодействие между факторами транскрипции ETS1 и GFI1 в подавлении экспрессии гена Bax». Онкоген. 26 (24): 3541–50. Дои:10.1038 / sj.onc.1210140. PMID  17213822.
• Кханна-Гупта А., Сун Х., Зибелло Т, Ли Х.М., Даль Р., Боксер Л.А., Берлинер Н. (2007). «Независимость от фактора роста-1 (Gfi-1) играет роль в опосредовании дефицита специфических гранул (SGD) у пациента, у которого отсутствует инактивирующая ген мутация в гене C / EBPϵ». Кровь. 109 (10): 4181–90. Дои:10.1182 / кровь-2005-05-022004. ЧВК  1885490. PMID  17244686.
• Marteijn JA, van der Meer LT, van Emst L, van Reijmersdal S, Wissink W, de Witte T, Jansen JH, Van der Reijden BA (2007). «Убиквитинирование Gfi1 и протеасомная деградация ингибируются убиквитинлигазой Triad1». Кровь. 110 (9): 3128–35. Дои:10.1182 / кровь-2006-11-058602. PMID  17646546.

внешние ссылки

• GFI1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.