Фактор транскрипции 2 bhlh семейства HES - Hes family bhlh transcription factor 2
HES2 Идентификаторы Псевдонимы HES2 , bHLHb40, фактор транскрипции bHLH семейства hes 2Внешние идентификаторы OMIM: 609970 MGI: 1098624 ГомолоГен: 22455 Генные карты: HES2 Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 E2 | 4 82,92 см Начните 152,158,867 бп [2] Конец 152,162,469 бп [2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание двухцепочечной ДНК • связывание фактора транскрипции • активность димеризации белков • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • последовательное связывание ДНК • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сомитогенез • Notch сигнальный путь • дифференциация клеток • регуляция нейрогенеза • спецификация переднего / заднего рисунка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи Виды Человек Мышь Entrez Ансамбль UniProt RefSeq (мРНК) RefSeq (белок) Расположение (UCSC) Chr 1: 6.41 - 6.42 Мб Chr 4: 152.16 - 152.16 Мб PubMed поиск[3] [4] Викиданные
Фактор транскрипции bHLH семейства Hes 2 это белок что у человека кодируется HES2 ген .[5]
использованная литература
дальнейшее чтение
Нисимура М., Исака Ф., Ишибаши М., Томита К., Цуда Х., Наканиши С., Кагеяма Р. (апрель 1998 г.). «Структура, хромосомный локус и промотор мышиного гена Hes2, гомолога Drosophila hairy и энхансера расщепления». Геномика . 49 (1): 69–75. Дои :10.1006 / geno.1998.5213 . PMID 9570950 . Като М., Като М. (август 2004 г.). «Идентификация и характеристика человеческих генов HES2, HES3 и HES5 in silico». Международный журнал онкологии . 25 (2): 529–34. Дои :10.3892 / ijo.25.2.529 . PMID 15254753 . Като М., Като М. (август 2007 г.). «Интегративный геномный анализ семейства HES / HEY: Notch-независимая транскрипция HES1, HES3 в недифференцированных ES-клетках и Notch-зависимая транскрипция HES1, HES5, HEY1, HEY2, HEYL в тканях плода, взрослых тканях или при раке» . Международный журнал онкологии . 31 (2): 461–6. Дои :10.3892 / ijo.31.2.461 . PMID 17611704 .
(1) Базовые домены
(1.1) Базовая лейциновая молния (bZIP )(1.2) Основная спираль-петля-спираль (bHLH )
Группа А Группа B Группа C bHLH-PAS Группа D Группа E Группа F bHLH-COE
(1.3) bHLH-ZIP (1.4) НФ-1 (1.5) RF-X (1.6) Базовая спираль-пролет-спираль (bHSH)
(2) Цинковый палец ДНК-связывающие домены
(2.1) Ядерный рецептор (Cys4 )
подсемейство 1 подсемейство 2 подсемейство 3 подсемейство 4 подсемейство 5 подсемейство 6 подсемейство 0
(2.2) Другой Cys4 (2.3) Cys2 Его2 (2.4) Cys6 (2.5) Чередующийся состав (2.6) WRKY
(4) Факторы β-каркаса с малыми контактами канавок
(0) Другие факторы транскрипции
смотрите также дефицит фактора транскрипции / корегулятора