BZIP домен - BZIP domain

Эта статья про белковый домен. Для алгоритма сжатия см. Bzip2.

фактор транскрипции bZIP
CREB.png
CREB (вверху) - это фактор транскрипции способный связать ДНК через домен bZIP (внизу) и регулирующий экспрессия гена.
Идентификаторы
СимволbZIP_1
PfamPF00170
ИнтерПроIPR011616
PROSITEPDOC00036
SCOP21ysa / Объем / СУПФАМ
CDDcd14686
Мембранома235

В Основной домен лейциновой молнии (bZIP домен) встречается во многих ДНК связывание эукариотических белков. Одна часть домена содержит область, которая обеспечивает свойства связывания ДНК, специфичные для последовательности, и лейциновая молния это необходимо для удержания вместе (димеризации) двух областей связывания ДНК. Область связывания ДНК включает ряд основных аминокислот, таких как аргинин и лизин. Белки, содержащие этот домен, являются факторы транскрипции.[1][2]

факторы транскрипции bZIP

Факторы транскрипции bZIP обнаружены у всех эукариот и образуют одно из крупнейших семейств димеризующихся ТФ.[3][4] Эволюционное исследование 2008 года показало, что 4 гена bZIP кодируются геномом самый последний общий предок всех растений.[5] Взаимодействия между факторами транскрипции bZIP многочисленны и сложны. [6][7][3] и играют важную роль в развитии рака[8] в эпителиальных тканях синтез стероидных гормонов клетками эндокринных тканей,[9] факторы, влияющие на репродуктивные функции,[10] и ряд других явлений, влияющих на здоровье человека.

bZIP домен, содержащий белки

  • АП-1 фос /июн гетеродимер, который образует фактор транскрипции
  • Июн-B фактор транскрипции
  • CREB фактор транскрипции элемента ответа цАМФ
  • Фактор транскрипции OPAQUE2 (O2) гена зеина массой 22 кДа, который кодирует класс запасных белков в эндосперм кукурузы (Зеа Мейс) ядра
  • NFE2L2 или Nrf2
  • Bzip Maf факторы транскрипции

Белки человека, содержащие этот домен

ATF1; ATF2; ATF4; ATF5; ATF6; ATF7; BACH1; BACH2;BATF; BATF2; CEBPA; CEBPB; CEBPD; CEBPE; CEBPG; CEBPZ; CREB1; CREB3; CREB3L1; CREB3L2; CREB3L3; CREB3L4;CREB5; CREBL1; CREM; E4BP4; FOSL1; FOSL2; ИЮНЬ; JUNB; JUND; MAFA; MAFB;NFE2; NFE2L2; NFE2L3; SNFT; XBP1

Рекомендации

  1. ^ Элленбергер Т (1994). «Получение контроля в распознавании ДНК: структуры основной области лейциновой молнии и основных областей спирали-петли-спирали ДНК-связывающих доменов». Curr. Мнение. Struct. Биол. 4 (1): 12–21. Дои:10.1016 / S0959-440X (94) 90054-X.
  2. ^ Херст ХК (1995). «Факторы транскрипции 1: белки bZIP». Белковый профиль. 2 (2): 101–68. PMID  7780801.
  3. ^ а б Amoutzias, G.D .; Veron, A. S .; Weiner, J .; Робинсон-Рехави, М .; Bornberg-Bauer, E .; Оливер, С.Г .; Робертсон, Д. Л. (2007-03-01). «Один миллиард лет эволюции фактора транскрипции bZIP: сохранение и изменение димеризации и специфичности сайтов связывания ДНК». Молекулярная биология и эволюция. 24 (3): 827–835. Дои:10.1093 / molbev / msl211. ISSN  0737-4038. PMID  17194801.
  4. ^ Amoutzias, Grigoris D .; Робертсон, Дэвид Л .; Ван де Пер, Ив; Оливер, Стивен Г. (01.05.2008). «Выбери себе партнеров: димеризация в факторах транскрипции эукариот». Тенденции в биохимических науках. 33 (5): 220–229. Дои:10.1016 / j.tibs.2008.02.002. ISSN  0968-0004. PMID  18406148.
  5. ^ Корреа Л.Г., Риано-Пачон Д.М., Шраго К.Г., душ Сантуш Р.В., Мюллер-Робер Б., Винсент М. (2008). Шиу С. (ред.). «Роль факторов транскрипции bZIP в эволюции зеленых растений: адаптивные особенности, возникающие из четырех генов-основателей». PLOS ONE. 3 (8): e2944. Дои:10.1371 / journal.pone.0002944. ЧВК  2492810. PMID  18698409.
  6. ^ Винсон, Чарльз; Ачарья, Аша; Тапаровски, Элизабет Дж. (01.01.2006). «Расшифровка взаимодействий фактора транскрипции B-ZIP in vitro и in vivo». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1759 (1–2): 4–12. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2005.12.005. ISSN  0006-3002. PMID  16580748.
  7. ^ Newman, John R. S .; Китинг, Эми Э. (27.06.2003). «Всесторонняя идентификация человеческих взаимодействий bZIP с массивами спиральных катушек». Наука. 300 (5628): 2097–2101. Дои:10.1126 / science.1084648. ISSN  1095-9203. PMID  12805554. S2CID  36715183.
  8. ^ Влахопулос С.А., Логотети С., Микас Д., Гиарика А., Горгулис В., Зумпурлис В. (апрель 2008 г.). «Роль АТФ-2 в онкогенезе». BioEssays. 30 (4): 314–27. Дои:10.1002 / bies.20734. PMID  18348191. S2CID  678541.
  9. ^ Манна П.Р., Дайсон М.Т., Юбанк Д.В., Кларк Б.Дж., Лалли Э., Сассоне-Корси П., Зелезник А.Дж., Stocco DM (январь 2002 г.). «Регуляция стероидогенеза и стероидогенного острого регуляторного белка членом семейства белков, связывающих элемент ответа цАМФ». Мол. Эндокринол. 16 (1): 184–99. Дои:10.1210 / me.16.1.184. PMID  11773448.
  10. ^ Хоар С., Копленд Дж. А., Вуд Т. Г., Дженг Ю. Дж., Избан М. Г., Солофф М. С. (май 1999 г.). «Идентификация сайта связывания GABP альфа / бета, участвующего в индукции экспрессии гена рецептора окситоцина в клетках груди человека, потенцирование c-Fos / c-Jun». Эндокринология. 140 (5): 2268–79. Дои:10.1210 / en.140.5.2268. PMID  10218980.

внешняя ссылка