FYVE домен - FYVE domain

FYVE цинковый палец
Ранний эндосомный антиген 1 (EEA1 ) димер с липидами.[1]
Идентификаторы
Символ	FYVE
Pfam	PF01363
ИнтерПро	IPR000306
PROSITE	PDOC50178
SCOP2	1vfy / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство	59
Белок OPM	1vfy
CDD	cd00065
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

В молекулярной биологии FYVE домен цинковых пальцев назван в честь четырех богатых цистеином белки: Fab 1 (дрожжевой ортолог PIKfyve ), YOTB, Vac 1 (транспортный белок везикул) и EEA1, в котором он был найден. Связывание доменов FYVE Фосфатидилинозитол 3-фосфат,^[2] в зависимости от координации иона металла и основных аминокислот. Домен FYVE встраивается в клеточные мембраны в зависимости от pH.^[3] Домен FYVE связан с сортировкой вакуолярных белков и функцией эндосом.^[4]

Структура

Домен FYVE состоит из двух небольших бета шпильки (или цинковые суставы), за которыми следует альфа-спираль.^[5] Палец FYVE связывает двоих цинк ионы. Палец FYVE имеет восемь потенциальных цинк-координирующих положений цистеина и характеризуется наличием основных аминокислот вокруг цистеина. Многие члены этого семейства также включают два гистидина в мотив последовательности:

R + HHC + XCG, где + представляет собой заряженный остаток, а X - любой остаток

Палец FYVE конструктивно похож на RING домен и Палец PHD.

Примеры

Смотрите также: FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий

Ниже приводится список белков человека, содержащих этот домен:

• ANKFY1, EEA1, FGD1, FGD2, FGD3, FGD4, FGD5, FGD6, FYCO1, HGS, MTMR3, MTMR4, ПИКФЫВЕ, ПЛЕХФ1, ПЛЕХФ2
• RUFY1, RUFY2, WDF3, WDFY1, WDFY2, WDFY3, ZFYVE1, ZFYVE16, ZFYVE19, ZFYVE20, ZFYVE21, ZFYVE26, ZFYVE27, ZFYVE28, ZFYVE9

Рекомендации

1. Дюма Дж. Дж., Меритью Э., Судхаршан Э. и др. (Ноябрь 2001 г.). «Многовалентное нацеливание на эндосомы с помощью гомодимерного EEA1». Мол. Клетка. 8 (5): 947–58. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00385-9. PMID  11741531.
2. Голлье Дж. М., Симонсен А., Д'Арриго А., Бремнес Б., Стенмарк Н., Осланд Р. (июль 1998 г.). «Пальцы FYVE связывают PtdIns (3) P». Природа. 394 (6692): 432–3. Дои:10.1038/28767. PMID  9697764. S2CID  4385768.
3. He J, Vora M, Haney RM и др. (Сентябрь 2009 г.). «Внедрение домена FYVE в мембрану регулируется pH». Белки. 76 (4): 852–60. Дои:10.1002 / prot.22392. ЧВК  2909462. PMID  19296456.
4. Ливерс SJ, Vanhaesebroeck B, Waterfield MD (апрель 1999 г.). «Передача сигналов через фосфоинозитид-3-киназы: липиды в центре внимания». Curr. Мнение. Cell Biol. 11 (2): 219–25. Дои:10.1016 / S0955-0674 (99) 80029-5. PMID  10209156.
5. Мисра С., Херли Дж. Х. (май 1999 г.). «Кристаллическая структура фосфатидилинозитол-3-фосфат-специфичного мембранно-целевого мотива, домена FYVE Vps27p». Клетка. 97 (5): 657–66. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80776-X. PMID  10367894. S2CID  15448444.

дальнейшее чтение

• Стенмарк Х., Осланд Р., То Б. Х., Д'Арриго А. (сентябрь 1996 г.). «Эндосомная локализация аутоантигена EEA1 опосредована цинк-связывающим пальцем FYVE». J. Biol. Chem. 271 (39): 24048–54. Дои:10.1074 / jbc.271.39.24048. PMID  8798641.
• Стенмарк Х., Осланд Р. (декабрь 1999 г.). «Белки FYVE-finger - эффекторы липида инозита». J. Cell Sci. 112 (Pt 23): 4175–83. PMID  10564636.