FGD3 - FGD3

FGD3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2COC
Идентификаторы
Псевдонимы	FGD3, ZFYVE5, FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 617554 MGI: 1353657 ГомолоГен: 22925 Генные карты: FGD3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.31 Начинать 92,947,523 бп[1] Конец 93,036,236 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 A5 | 13 25,18 см Начинать 49,261,554 бп[2] Конец 49,320,311 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • небольшое связывание GTPase • Активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Rho • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • взъерошить • цитоскелет • ламеллиподиум Биологический процесс • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • сборка филоподиума • организация цитоскелета • регулировка формы клеток • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция передачи сигнала белка Rho • регуляция передачи сигнала, опосредованного малой GTPase • организация актинового цитоскелета • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	89846	30938
Ансамбль	ENSG00000127084	ENSMUSG00000037946
UniProt	Q5JSP0	O88842
RefSeq (мРНК)	NM_001083536 NM_001286993 NM_033086 NM_001369951 NM_001369952	NM_015759
RefSeq (белок)	NP_001077005 NP_001273922 NP_149077 NP_001356880 NP_001356881 NP_001077005.1 NP_149077.2	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 9: 92.95 - 93.04 Мб	Chr 13: 49.26 - 49.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

FYVE, RhoGEF и белок 3, содержащий домен PH это белок что у людей кодируется FGD3 ген.^[5][6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127084 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037946 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т., Кикуно Р., Хиросава М., Охара О. (февраль 2001 г.). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». ДНК Res. 7 (6): 357–66. Дои:10.1093 / dnares / 7.6.357. PMID  11214971.
6. «Ген Entrez: FGD3 FYVE, RhoGEF и домен PH, содержащий 3».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Пастерис Н.Г., Нагата К., Холл А, Горски Ю.Л. (2000). «Выделение, характеристика и картирование мышиного гена Fgd3, нового гомолога гена фасциогенитальной дисплазии (FGD1; синдром Аарскога)». Ген. 242 (1–2): 237–47. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00518-1. PMID  10721717.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Делаге V, Жакье А., Хамадуш Т. и др. (2007). «Мутации в FGD4, кодирующем фактор обмена Rho GDP / GTP FRABIN, вызывают аутосомно-рецессивный тип 4H Шарко-Мари-Тута». Являюсь. J. Hum. Genet. 81 (1): 1–16. Дои:10.1086/518428. ЧВК  1950914. PMID  17564959.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого FYVE, RhoGEF и белка 3, содержащего домен PH (FGD3)