ZFYVE1 - ZFYVE1

ZFYVE1
Идентификаторы
Псевдонимы	ZFYVE1, DFCP1, PPP1R172, SR3, TAFF1, ZNFN2A1, цинковый палец типа FYVE, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605471 MGI: 3026685 ГомолоГен: 10945 Генные карты: ZFYVE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.2 Начинать 72,969,451 бп[1] Конец 73,027,131 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 D1 Начинать 83,546,558 бп[2] Конец 83,597,222 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов цинка • Связывание 1-фосфатидилинозита • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • связывание ионов металлов • связывание фосфатидилинозитол-3,4-бисфосфата Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • аутофагосома • Сайт контакта мембраны ER-митохондрии • Стек Гольджи • аппарат Гольджи • внешний компонент мембраны омегасомы • эндоплазматический ретикулум • мембрана • преаутофагосомная структура • омегазом Биологический процесс • отрицательная регуляция активности фосфатазы • клеточный ответ на голодание • макроавтофагия Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	53349	217695
Ансамбль	ENSG00000165861	ENSMUSG00000042628
UniProt	Q9HBF4	Q810J8
RefSeq (мРНК)	NM_001281734 NM_001281735 NM_021260 NM_178441	NM_183154 NM_001359166 NM_001359167 NM_001359168
RefSeq (белок)	NP_001268663 NP_001268664 NP_067083 NP_848535	NP_898977 NP_001346095 NP_001346096 NP_001346097
Расположение (UCSC)	Chr 14: 72.97 - 73.03 Мб	Chr 12: 83,55 - 83,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цинковый палец, содержащий домен FYVE 1 это белок что у людей кодируется ZFYVE1 ген.^[5][6][7]

В FYVE домен опосредует набор белков, участвующих в мембранная торговля и клеточная сигнализация к фосфатидилинозитол 3-фосфат (PtdIns (3) P) -содержащие мембраны. Этот ген кодирует белок, содержащий два цинк -связывание доменов FYVE в тандеме. Этот белок демонстрирует преимущественно Гольджи, эндоплазматический ретикулум и везикулярное распространение.Альтернативно сращивание варианты расшифровки были обнаружены для этого гена, и они кодируют два изоформы с разными размерами.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000165861 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042628 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Дерубейс А.Р., Янг М.Ф., Цзя Л., Роби П.Г., Фишер Л.В. (ноябрь 2000 г.). «Двойной FYVE-содержащий белок 1 (DFCP1): выделение, клонирование и характеристика нового пальцевого белка FYVE из библиотеки кДНК костного мозга человека» (PDF). Ген. 255 (2): 195–203. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00303-6. PMID  11024279.
6. Cheung PC, Trinkle-Mulcahy L, Cohen P, Lucocq JM (март 2001 г.). «Характеристика нового фосфатидилинозитол-3-фосфат-связывающего белка, содержащего два пальца FYVE в тандеме, нацеленного на Гольджи». Biochem J. 355 (Pt 1): 113–21. Дои:10.1042/0264-6021:3550113. ЧВК  1221718. PMID  11256955.
7. «Ген Entrez: цинковый палец ZFYVE1, домен FYVE, содержащий 1».

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Кикуно Р., Накаяма М. и др. (2001). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XVIII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 7 (4): 273–81. Дои:10.1093 / dnares / 7.4.271. PMID  10997877.
• Ридли Ш., Ктистакис Н., Дэвидсон К. и др. (2002). «FENS-1 и DFCP1 представляют собой белки, содержащие домен FYVE, с различными функциями в эндосомном компартменте и компартменте Гольджи». J. Cell Sci. 114 (Pt 22): 3991–4000. PMID  11739631.
• Кругманн С., Андерсон К.Э., Ридли С.Х. и др. (2002). «Идентификация ARAP3, нового эффектора PI3K, регулирующего как Arf, так и Rho GTPases, путем селективного захвата на аффинных матрицах фосфоинозитидов». Мол. Клетка. 9 (1): 95–108. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00434-3. PMID  11804589.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хайлиг Р., Эккенберг Р., Пети Дж. Л. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 14 человека». Природа. 421 (6923): 601–7. Дои:10.1038 / природа01348. PMID  12508121.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ван Д., Гонг И, Цинь В. и др. (2004). «Крупномасштабный скрининг трансфекции кДНК генов, связанных с развитием и прогрессированием рака». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (44): 15724–9. Дои:10.1073 / pnas.0404089101. ЧВК  524842. PMID  15498874.