NACHT домен - NACHT domain

NACHT домен
Идентификаторы
СимволНАХТ
PfamPF05729
ИнтерПроIPR007111
PROSITEPS50837

В NACHT домен это эволюционно сохраненный белковый домен. Этот NTPase домен находится в апоптоз белки а также тех, кто участвует в MHC транскрипция.[1] Его название отражает некоторые из белков, которые его содержат: NAIP (Апоптоз семейства НЛП белок-ингибитор ), CIITA (то есть C2TA или MHC класс II активатор транскрипции), HET-E (белок локуса несовместимости из Podospora anserina) и TEP1 (то есть TP1 или белок, связанный с теломеразой).

Домен NACHT содержит от 300 до 400 аминокислоты. Это предсказанный нуклеозид-трифосфатаза (NTPase), который находится в животное, грибковый и бактериальный белки. Он находится в ассоциации с другими доменами, такими как CARD домен (ИнтерПро: IPR001315 ), Pyrin домен (ИнтерПро: IPR004020 ), HEAT повторяющийся домен (ИнтерПро: IPR004155 ), WD40 повторить (ИнтерПро: IPR001680 ), богатый лейцином повтор (LRR) или BIR повтор (ИнтерПро: IPR001370 ).[1]

Домен NACHT состоит из семи различных консервативных мотивов, включая специфичную для АТФ / ГТФазу P-петлю, Mg2+-сайт привязки (Мотивы Walker A и B соответственно) и еще пять специфических мотивов. Уникальные особенности домена NACHT включают преобладание «крошечных» остатков (глицин, аланин или серин) непосредственно на С-конце Mg.2+-координирующий аспартат в мотиве Walker B вместо второго кислотного остатка, преобладающего в других NTPases. Второй кислотный остаток обычно находится в NACHT-содержащих белках в двух положениях ниже по течению. Кроме того, дистальный мотив VII содержит консервативный набор полярных, ароматических и гидрофобных остатков, который не наблюдается ни в одном другом семействе NTPase.[1]

Примеры

Белки человека, содержащие этот домен, включают:

Рекомендации

  1. ^ а б c Кунин Э.В., Аравинд Л (май 2000 г.). «Семейство NACHT - новая группа предсказанных NTPаз, участвующих в апоптозе и активации транскрипции MHC». Тенденции в биохимических науках. 25 (5): 223–4. Дои:10.1016 / S0968-0004 (00) 01577-2. PMID  10782090.
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR007111