NLRC4 - NLRC4

NLRC4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4KXF
Идентификаторы
Псевдонимы	NLRC4, CARD12, CLAN, CLAN1, CLANA, CLANB, CLANC, CLAND, CLR2.1, IPAF, AIFEC, FCAS4, семейство NLR, домен CARD, содержащий 4, домен CARD семейства NLR, содержащий 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 606831 MGI: 3036243 ГомолоГен: 10924 Генные карты: NLRC4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п22.3 Начните 32,224,453 бп[1] Конец 32,265,732 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 E2 Начните 74,425,438 бп[2] Конец 74,459,142 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • активность гомодимеризации белков • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание ионов магния • активность ингибитора эндопептидазы цистеинового типа, участвующего в апоптотическом процессе • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • внутриклеточный • Комплекс инфламмасом IPAF • ядро клетки Биологический процесс • пироптоз • ингибирование активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • иммунная система • регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • сборка митотического веретена • регулирование передачи сигнала • защитный ответ на бактерию • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB • обнаружение бактерий • активация врожденного иммунного ответа • положительная регуляция апоптотического процесса • воспалительная реакция • гомоолигомеризация белков • активация активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом процессе • апоптотический процесс • убиквитинирование белков • регуляция апоптотического процесса • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	58484	268973
Ансамбль	ENSG00000091106	ENSMUSG00000039193
UniProt	Q9NPP4	Q3UP24
RefSeq (мРНК)	NM_001199138 NM_001199139 NM_001302504 NM_021209	NM_001033367
RefSeq (белок)	NP_001186067 NP_001186068 NP_001289433 NP_067032	NP_001028539
Расположение (UCSC)	Chr 2: 32,22 - 32,27 Мб	Chr 17: 74,43 - 74,46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 4, содержащий CARD домен семейства NLR это белок что у людей кодируется NLRC4 ген.^[5][6]

Структура

Белок NLRC4 высоко консервативен у всех видов млекопитающих. Он гомологичен C. elegans Белок Ced4. Он содержит n-терминал КАРТА домен, центральный нуклеотид связывания /НАХТ домен, и c-концевой повтор, богатый лейцином (LRR ) домен. Он принадлежит к семейству белков NLR, которое включает коактиватор транскрипции. CIITA и канонический белок инфламмасом NLRP3. Усеченный мышиный NLRC4 был первым членом этого семейства, кристаллическая структура которого была решена.^[7]

Функция

NLRC4 лучше всего ассоциируется с запуском формирования воспаление. В отличие от NLRP3, некоторые зависимые от инфламмасомы функции NLRC4 могут осуществляться независимо от каркаса инфламмасом. ASC. Гомологи Ced4 человека включают: APAF1, NOD1 (CARD4) и NOD2 (CARD15). Эти белки имеют не менее 1 N-концевой CARD-домен, за которым следует центрально расположенный нуклеотид-связывающий домен (NBD или NACHT) и C-терминал регуляторный домен, обнаруженный только у млекопитающих, который содержит либо WD40 повторяет или богатые лейцином повторы (LRR). CARD12 является членом семейства Ced4 и может вызывать апоптоз.^[6]

Взаимодействия

NLRC4 был показан взаимодействовать с NAIP (есть один человеческий NAIP, но мыши экспрессируют по крайней мере 4 различных белка NAIP). Взаимодействие NAIP / NLRC4 может определять специфичность лиганда.^[8] NLRC4-зависимая активность инфламмасом активирует CASP1.^[9] При определенных обстоятельствах NLRC4 и NLRP3 могут занимать один и тот же комплекс инфламмасом.^[10]

Клиническое значение

Люди, несущие активирующие мутации в NLRC4, могут развить аутовоспалительный синдром, характеризующийся острой лихорадкой, гепатитом, очень высоким уровнем ферритина в сыворотке и другими признаками, указывающими на Синдром активации макрофагов (MAS). У некоторых пациентов также развился потенциально опасный для жизни энтероколит, который прошел в раннем детстве.^[11][12] У этих пациентов хроническое и необычайное повышение сывороточной Ил-18 обнаружено, в отличие от пациентов с мутациями NLRP3, у которых развиваются Криопирин-ассоциированные периодические синдромы.^[11] В большой японской семье была гораздо более легкая болезнь, связанная с холодовой крапивницей, которая была вызвана доминантно наследуемой мутацией NLRC4.^[13]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000091106 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039193 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Geddes BJ, Wang L, Huang WJ, Lavellee M, Manji GA, Brown M, Jurman M, Cao J, Morgenstern J, Merriam S, Glucksmann MA, DiStefano PS, Bertin J (июнь 2001 г.). «Human CARD12 является новым членом семейства CED4 / Apaf-1, который вызывает апоптоз». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 284 (1): 77–82. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4928. PMID  11374873.
6. «Ген Entrez: семейство NLRC4 NLR, домен CARD, содержащий 4».
7. Ху З, Янь Ц., Лю П, Хуанг З, Ма Р, Чжан Ц., Ван Р, Чжан И, Мартинон Ф, Мяо Д., Дэн Х, Ван Дж, Чанг Дж, Чай Дж (июль 2013 г.). «Кристаллическая структура NLRC4 раскрывает его механизм автоингибирования». Наука. 341 (6142): 172–5. Дои:10.1126 / science.1236381. PMID  23765277. S2CID  12360722.
8. Кофоед Э.М., Вэнс Р. Э. (сентябрь 2011 г.). «Врожденное иммунное распознавание бактериальных лигандов NAIP определяет специфичность инфламмасом». Природа. 477 (7366): 592–5. Дои:10.1038 / природа10394. ЧВК  3184209. PMID  21874021.
9. Дамиано Дж. С., Оливейра В., Валлийский К., Рид Дж. С. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов». Биохимический журнал. 381 (Пт 1): 213–9. Дои:10.1042 / BJ20031506. ЧВК  1133779. PMID  15107016.
10. Ман С.М., Хопкинс Л.Дж., Ньюджент Э., Кокс С., Глюк И.М., Турломусис П., Райт Дж. А., Цикута П., Мони Т.П., Брайант К.Э. (май 2014 г.). «Активация инфламмасом вызывает двойное привлечение NLRC4 и NLRP3 в один и тот же макромолекулярный комплекс» (PDF). Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (20): 7403–8. Дои:10.1073 / pnas.1402911111. ЧВК  4034195. PMID  24803432.
11. Канна С.В., де Хесус А.А., Гуни С., Брукс С.Р., Марреро Б., Лю Й., ДиМаттия М.А., Заал К.Дж., Санчес Г.А., Ким Х., Шапель Д., Пласс Н., Хуанг И., Вилларино А.В., Бьянкотто А., Флейшер Т.А., Дункан Дж. А., О'Ши Дж. Дж., Бенселер С., Гром А., Дэн З., Лаксер Р. М., Гольдбах-Мански Р. (октябрь 2014 г.). «Активирующая мутация инфламмасомы NLRC4 вызывает аутовоспаление с синдромом рецидивирующей активации макрофагов». Природа Генетика. 46 (10): 1140–6. Дои:10.1038 / ng.3089. ЧВК  4177369. PMID  25217959.
12. Romberg N, Al Moussawi K, Nelson-Williams C, Stiegler AL, Loring E, Choi M, Overton J, Meffre E, Khokha MK, Huttner AJ, West B, Podoltsev NA, Boggon TJ, Kazmierczak BI, Lifton RP (октябрь 2014 г.) ). «Мутация NLRC4 вызывает синдром энтероколита и аутовоспаления». Природа Генетика. 46 (10): 1135–9. Дои:10,1038 / нг.3066. ЧВК  4177367. PMID  25217960.
13. Китамура А., Сасаки Ю., Абэ Т., Кано Х., Ясутомо К. (ноябрь 2014 г.). «Унаследованная мутация в NLRC4 вызывает ауто-воспаление у человека и мышей». Журнал экспериментальной медицины. 211 (12): 2385–96. Дои:10.1084 / jem.20141091. ЧВК  4235634. PMID  25385754.

дальнейшее чтение

• Пойет Дж. Л., Сринивасула С. М., Тнани М., Размара М., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Е. С. (июль 2001 г.). «Идентификация Ipaf, белка, активирующего каспазу-1 человека, родственного Apaf-1». Журнал биологической химии. 276 (30): 28309–13. Дои:10.1074 / jbc.C100250200. PMID  11390368.
• Damiano JS, Stehlik C, Pio F, Godzik A, Reed JC (июль 2001 г.). «CLAN, новый человеческий ген, подобный CED-4». Геномика. 75 (1–3): 77–83. Дои:10.1006 / geno.2001.6579. PMID  11472070.
• Fu WN, Bertoni F, Kelsey SM, McElwaine SM, Cotter FE, Newland AC, Jia L (январь 2003 г.). «Роль метилирования ДНК в подавлении белка Apaf-1 при лейкемии человека». Онкоген. 22 (3): 451–5. Дои:10.1038 / sj.onc.1206147. PMID  12545166.
• Агостини Л., Мартинон Ф., Бернс К., МакДермотт М.Ф., Хокинс П.Н., Чопп Дж. (Март 2004 г.). «NALP3 формирует инфламмасому, обрабатывающую IL-1beta, с повышенной активностью при аутовоспалительном заболевании Muckle-Wells». Иммунитет. 20 (3): 319–25. Дои:10.1016 / S1074-7613 (04) 00046-9. PMID  15030775.
• Дамиано Дж. С., Оливейра В., Валлийский К., Рид Дж. С. (июль 2004 г.). «Гетеротипические взаимодействия между доменами NACHT: значение для регуляции врожденных иммунных ответов». Биохимический журнал. 381 (Пт 1): 213–9. Дои:10.1042 / BJ20031506. ЧВК  1133779. PMID  15107016.
• Дамиано Дж. С., Ньюман Р. М., Рид Дж. С. (ноябрь 2004 г.). «Множественные роли CLAN (связанный с каспазой домен рекрутирования, богатый лейцином повтор, и NAIP CIIA HET-E и TP1-содержащий белок) во врожденном иммунном ответе млекопитающих». Журнал иммунологии. 173 (10): 6338–45. Дои:10.4049 / jimmunol.173.10.6338. PMID  15528373.
• Садашивам С., Гупта С., Радха В., Батта К., Кунду Т.К., Сваруп Г. (январь 2005 г.). «Активатор каспазы-1 Ipaf - это индуцируемый p53 ген, участвующий в апоптозе». Онкоген. 24 (4): 627–36. Дои:10.1038 / sj.onc.1208201. PMID  15580302.
• Лю Ц., Ван А., Ван Л., Дорш М., Окаин Т. Д., Сюй И (июнь 2005 г.). «Связывание нуклеотидов с CARD12 и его роль в CARD12-опосредованной активации каспазы-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 331 (4): 1114–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.04.027. PMID  15882992.
• Thalappilly S, Sadasivam S, Radha V, Swarup G (июнь 2006 г.). «Участие каспазы 1 и ее активатора Ipaf перед митохондриальными событиями в апоптозе». Журнал FEBS. 273 (12): 2766–78. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2006.05293.x. PMID  16817903. S2CID  21214841.