NOD-подобный рецептор - NOD-like receptor

В нуклеотид-связывающие рецепторы олигомеризации, подобные домену, или же NOD-подобные рецепторы (NLR) (также известный как рецепторы нуклеотид-связывающих повторов, богатых лейцином),[1] внутриклеточные сенсоры патоген-ассоциированные молекулярные паттерны (PAMP) которые входят в ячейку через фагоцитоз или поры, и молекулярные паттерны, связанные с повреждениями (DAMP) которые связаны с клеточным стрессом. Это типы рецепторы распознавания образов (PRR),[2] и играть ключевую роль в регулировании врожденный иммунный ответ. NLR могут сотрудничать с толл-подобные рецепторы (TLR) и регулируют воспалительные и апоптотический отклик. Они находятся в лимфоциты, макрофаги, дендритные клетки а также в неиммунных клетках, например в эпителий.[3] NLR в высокой степени сохраняются в процессе эволюции. Их гомологи были обнаружены у многих различных видов животных (APAF1 ) [4][5] а также в царстве растений (резистентный к болезням R-белок ).[5]

Структура

NLR содержат 3 домена - центральный НАХТ (NOD или NBD - нуклеотидсвязывающий домен) домена, который является общим для всех NLR, большинство NLR также имеют С-концевой богатый лейцином повтор (LRR) и вариабельный N-концевой домен взаимодействия. Домен NACHT опосредует АТФ-зависимую самоолигомеризацию, а LRR определяет присутствие лиганда. N-концевой домен отвечает за гомотипическое белок-белковое взаимодействие и может состоять из домен найма caspase (КАРТА), Pyrin домен (PYD), кислый трансактивирующий домен или повторы ингибитора бакуловируса (ЗБИ).[3][6]

Номенклатура и система

Названия CATERPILLER, NOD, NALP, PAN, NACHT, PYPAF использовались для описания семейства NLR. Номенклатура унифицирована Комитет по номенклатуре генов HUGO в 2008 году. Семейство было охарактеризовано как NLR для обеспечения описания характеристик семейств - NLR означает нуклеотид-связывающий домен и семейство генов, содержащих богатые лейцином повторы.[7]

Эта система делит NLR на 4 подсемейства в зависимости от типа N-концевого домена:

Существует также дополнительное подсемейство NLRX, которое не имеет значительной гомологии ни с одним N-концевым доменом. Член этого подсемейства NLRX1.[8]

С другой стороны, NLR можно разделить на 3 подсемейства в зависимости от их филогенетических отношений:

Подсемейства NODs

Подсемейство NOD состоит из NOD1, NOD2, NOD3, NOD4 с доменом CARD, CIITA, содержащего домен кислого трансактиватора, и NOD5 без какого-либо N-концевого домена.[9][10]

Сигнализация

Хорошо описанными рецепторами являются NOD1 и NOD2. Распознавание их лигандов способствует олигомеризации домена NACHT и взаимодействию CARD-CARD с CARD-содержащим серин-треонином. киназа RIP2 что приводит к активации RIP2.[11] RIP2 опосредует рекрутирование киназы TAK1, которая фосфорилирует и активирует IκB киназа. Активация киназы IκB приводит к фосфорилированию ингибитора IκB, который высвобождает NF-κB и его ядерная транслокация. Затем NF-κB активирует экспрессию воспалительных цитокинов.[12] Мутации в NOD2 связаны с болезнь Крона [13] или же Синдром Блау.[14]

Лиганды

NOD1 и NOD2 распознают пептидогликан мотивы из бактериальной клетки, состоящей из N-ацетилглюкозамин и N-ацетилмурамовая кислота. Эти сахарные цепи сшиты пептидными цепями, которые могут распознаваться NOD. NOD1 распознает молекулу под названием мезо-диаминопимелиновая кислота (мезо-ДАП) в основном встречается в Грамотрицательные бактерии (Например Helicobacter pylori, Синегнойная палочка ). Белки NOD2 могут воспринимать внутриклеточные мурамиловый дипептид (MDP), типичный для таких бактерий, как Пневмококк или же Микобактерии туберкулеза.[3][10]

Подсемейства NLRPs и IPAF

Подсемейство NLRP содержит NLRP1-NLRP14, которые характеризуются наличием домена PYD. Подсемейство IPAF состоит из двух членов - IPAF с доменом CARD и NAIP с доменом BIR.[9][10]

Сигнализация

Подсемейства NLRP и IPAF участвуют в формировании воспаление. Инфламмасома лучше всего охарактеризована: NLRP3, активация через PAMPs или же DAMPs приводит к олигомеризации.[9] Пириновый домен NLR связывается с адаптерным белком. ASC (PYCARD) через взаимодействие PYD-PYD. ASC содержит домены PYD и CARD и связывает NLR с неактивной формой каспаза 1 через домен CARD.[15] Все эти белок-белковые взаимодействия образуют комплекс, называемый инфламмасомой. Агрегация прокаспазы-1 вызывает авторасщепление и образование активного фермента. Каспаза-1 важна для протеолитической обработки провоспалительных цитокинов. ИЛ-1β и Ил-18.[9][10]Мутации NLRP3 ответственны за аутовоспалительное заболевание. семейный холодовой аутовоспалительный синдром или же Синдром Макла-Уэллса.[16][17]

Лиганды

Существует три хорошо охарактеризованных инфламмасомы - NLRP1, NLRP3 и IPAF. Формирование инфламмасомы NLRP3 может быть активировано PAMPs такие как микробные токсины (например, альфа-токсин Золотистый стафилококк ) или целые патогены, например грибковые микроорганизмы албиканс, Saccharomyces cerevisiae, Сендайский вирус, Грипп. NLRP3 распознает также DAMPs которые указывают на стресс в клетке. Опасной молекулой может быть внеклеточный АТФ, внеклеточная глюкоза, кристаллы мононатрия урата (MSU), дигидрата пирофосфата кальция (CPPD), квасцы, холестерин или раздражители окружающей среды - кремнезем, асбест, УФ облучение и раздражители кожи. Присутствие этих молекул вызывает образование ROS и K + отток. NLRP1 распознает летальный токсин из бацилла сибирской язвы и мурамиловый дипептид. IPAF чувствует флагеллин из Сальмонелла тифимуриум, Синегнойная палочка, Listeria monocytogenes.[3][9][10]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Махла, Ранджит (2013). «Подслащенные PAMP: роль сахарных комплексов PAMP в врожденном иммунитете и биологии вакцины». Фронт Иммунол. 4: 248. Дои:10.3389 / fimmu.2013.00248. ЧВК  3759294. PMID  24032031.
  2. ^ Махла Р.С., Редди М.С., Прасад Д.В., Кумар Х. (сентябрь 2013 г.). «Подслащенные PAMP: роль сахарных комплексов PAMP в врожденном иммунитете и биологии вакцины». Границы иммунологии. 4: 248. Дои:10.3389 / fimmu.2013.00248. ЧВК  3759294. PMID  24032031.
  3. ^ а б c d Франки Л., Уорнер Н., Виани К., Нуньес Г. (2009). «Функция Nod-подобных рецепторов в распознавании микробов и защите хозяина». Иммунол Рев. 227 (1): 106–28. Дои:10.1111 / j.1600-065X.2008.00734.x. ЧВК  2679989. PMID  19120480.
  4. ^ Огура Ю., Инохара Н., Бенито А., Чен Ф. Ф., Ямаока С., Нуньес Г. (2001). «Nod2, член семейства Nod1 / Apaf-1, который ограничен моноцитами и активирует NF-kappaB». J Biol Chem. 276 (7): 4812–8. Дои:10.1074 / jbc.M008072200. PMID  11087742.
  5. ^ а б Инохара Н., Огура Ю., Чен Ф.Ф., Муто А., Нуньес Г. (2001). «Человеческий Nod1 придает чувствительность к бактериальным липополисахаридам». J Biol Chem. 276 (4): 2551–4. Дои:10.1074 / jbc.M009728200. PMID  11058605.
  6. ^ Шоу М.Х., Реймер Т., Ким Ю.Г., Нуньес Г. (2008). «NOD-подобные рецепторы (NLR): настоящие внутриклеточные микробные сенсоры». Курр Опин Иммунол. 20 (4): 377–82. Дои:10.1016 / j.coi.2008.06.001. ЧВК  2572576. PMID  18585455.
  7. ^ а б Ting JP, Lovering RC, Alnemri ES, Bertin J, Boss JM, Davis BK и др. (2008). «Семейство генов NLR: стандартная номенклатура». Иммунитет. 28 (3): 285–7. Дои:10.1016 / j.immuni.2008.02.005. ЧВК  2630772. PMID  18341998.
  8. ^ Tattoli I, Carneiro LA, Jéhanno M, Magalhaes JG, Shu Y, Philpott DJ и др. (2008). «NLRX1 представляет собой митохондриальный NOD-подобный рецептор, который усиливает пути NF-kappaB и JNK, индуцируя продукцию активных форм кислорода». EMBO Rep. 9 (3): 293–300. Дои:10.1038 / sj.embor.7401161. ЧВК  2267388. PMID  18219313.
  9. ^ а б c d е ж Шредер К., Чопп Дж. (2010). «Инфламмасомы». Клетка. 140 (6): 821–32. Дои:10.1016 / j.cell.2010.01.040. PMID  20303873.
  10. ^ а б c d е Чен Дж., Шоу М. Х., Ким Ю. Г., Нуньез Г. (2009). «NOD-подобные рецепторы: роль в врожденном иммунитете и воспалительных заболеваниях». Анну Рев Патол. 4: 365–98. Дои:10.1146 / annurev.pathol.4.110807.092239. PMID  18928408.
  11. ^ Пак Дж. Х., Ким Ю. Г., Макдональд С., Каннеганти Т. Д., Хасегава М., Боди-Малапель М. и др. (2007). «RICK / RIP2 опосредует врожденные иммунные ответы, индуцированные через Nod1 и Nod2, но не через TLR». J Immunol. 178 (4): 2380–6. Дои:10.4049 / jimmunol.178.4.2380. PMID  17277144.
  12. ^ Hasegawa M, Fujimoto Y, Lucas PC, Nakano H, Fukase K, Núñez G и др. (2008). «Критическая роль полиубиквитинирования RICK / RIP2 в Nod-индуцированной активации NF-kappaB». EMBO J. 27 (2): 373–83. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601962. ЧВК  2234345. PMID  18079694.
  13. ^ Канто Э., Рикар Э., Бускетс Д., Монфорт Д., Гарсия-Планелла Э., Гонсалес Д. и др. (2007). «Влияние полиморфизма домена 1 олигомеризации нуклеотидов (NOD1) и мутантных аллелей NOD2 на фенотип болезни Крона». Мир Дж Гастроэнтерол. 13 (41): 5446–53. Дои:10.3748 / wjg.v13.i41.5446. ЧВК  4171278. PMID  17907287.
  14. ^ Окафудзи И., Нисикомори Р., Канадзава Н., Камбе Н., Фудзисава А., Ямадзаки С. и др. (2009). «Роль генотипа NOD2 в клиническом фенотипе синдрома Блау и раннем саркоидозе». Ревматоидный артрит. 60 (1): 242–50. Дои:10.1002 / арт.24134. HDL:2433/124253. PMID  19116920.
  15. ^ Шринивасула С.М., Пойет Дж.Л., Размара М., Датта П., Чжан З., Алнемри Е.С. (2002). «Белок ASC PYRIN-CARD является активирующим адаптером для каспазы-1». J Biol Chem. 277 (24): 21119–22. Дои:10.1074 / jbc.C200179200. PMID  11967258.
  16. ^ Хоффман HM, Мюллер JL, Broide DH, Wanderer AA, Kolodner RD (2001). «Мутация нового гена, кодирующего предполагаемый пириноподобный белок, вызывает семейный холодовой аутовоспалительный синдром и синдром Макл-Уэллса». Нат Жене. 29 (3): 301–5. Дои:10,1038 / ng756. ЧВК  4322000. PMID  11687797.
  17. ^ Кубота Т., Коике Р. (2007). «[Биологические и клинические аспекты синдрома Макл-Уэллса]». Нихон Риншо Менеки Гаккай Кайши. 30 (2): 114–22. Дои:10.2177 / jsci.30.114. PMID  17473514.

внешняя ссылка