HSF4 - HSF4 - Wikipedia

HSF4
Идентификаторы
Псевдонимы	HSF4, CTM, CTRCT5, фактор транскрипции теплового шока 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 602438 MGI: 1347058 ГомолоГен: 100128 Генные карты: HSF4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q22.1 Начинать 67,164,681 бп[1] Конец 67,169,945 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 D3 Начинать 105,269,801 бп[2] Конец 105,275,845 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание протеинфосфатазы • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • ядерное пятнышко Биологический процесс • развитие глаз • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие клеток • деметилирование гистона H3-K9 • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • гомотримеризация белков • положительное регулирование дифференцировки клеток • положительное регулирование пролиферации клеток • развитие глаз по типу камеры • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гомоолигомеризация белков • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • визуальное восприятие • клеточный ответ на тепло • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II в ответ на тепловой стресс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3299	26386
Ансамбль	ENSG00000102878	ENSMUSG00000033249
UniProt	Q9ULV5	Q9R0L1
RefSeq (мРНК)	NM_001538 NM_001040667 NM_001374674 NM_001374675	NM_001256042 NM_001256044 NM_011939
RefSeq (белок)	NP_001035757 NP_001529 NP_001361603 NP_001361604	NP_001242971 NP_001242973 NP_036069
Расположение (UCSC)	Chr 16: 67.16 - 67.17 Мб	Chr 8: 105,27 - 105,28 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок фактора теплового шока 4 это белок что у людей кодируется HSF4 ген.^[5][6][7][8]

Факторы транскрипции теплового шока (HSF) активируют гены ответа на тепловой шок в условиях жары или других стрессов. HSF4 лишен карбоксиконцевого гидрофобного повтора, который является общим для всех HSF позвоночных, и предполагается, что он участвует в негативной регуляции активности связывания ДНК. Были описаны два альтернативно сплайсированных транскрипта, кодирующих разные изоформы и обладающих разной транскрипционной активностью.^[8]

Смотрите также

• Фактор теплового удара

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102878 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033249 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Накаи А., Танабе М., Кавазо Ю., Инадзава Дж., Моримото Р.И., Нагата К. (январь 1997 г.). «HSF4, новый член семейства факторов теплового шока человека, который не обладает свойствами активатора транскрипции». Mol Cell Biol. 17 (1): 469–81. Дои:10.1128 / mcb.17.1.469. ЧВК  231772. PMID  8972228.
6. Tanabe M, Sasai N, Nagata K, Liu XD, Liu PC, Thiele DJ, Nakai A (ноябрь 1999 г.). «HSF4 млекопитающих генерирует как активатор, так и репрессор генов теплового шока путем альтернативного сплайсинга». J Biol Chem. 274 (39): 27845–56. Дои:10.1074 / jbc.274.39.27845. PMID  10488131.
7. Бу Л, Цзинь И, Ши И, Чу Р, Бан А, Эйберг Х, Андрес Л, Цзян Х, Чжэн Г, Цянь М, Цуй Б, Ся И, Лю Дж, Ху Л, Чжао Г, Хайден М.Р., Конг Х (Июнь 2002 г.). «Мутантный ДНК-связывающий домен HSF4 связан с аутосомно-доминантной пластинчатой ​​и катарактой Марнера». Нат Жене. 31 (3): 276–8. Дои:10,1038 / ng921. PMID  12089525. S2CID  27368940.
8. «Ген Entrez: фактор транскрипции теплового шока HSF4 4».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование транскриптома человека с помощью меток последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.3491D. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Smaoui N, Beltaief O, BenHamed S и др. (2004). «Гомозиготная мутация сплайсинга в гене HSF4 связана с аутосомно-рецессивной врожденной катарактой». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 45 (8): 2716–21. Дои:10.1167 / iovs.03-1370. PMID  15277496.
• Сомасундарам Т., Бхат С.П. (2004). «Экспрессия факторов теплового шока, обусловленная развитием: исключительная экспрессия HSF4 в постнатальном хрусталике и его специфическое взаимодействие с промотором теплового шока альфа-В-кристаллином». J. Biol. Chem. 279 (43): 44497–503. Дои:10.1074 / jbc.M405813200. PMID  15308659.
• Форшью Т., Джонсон К.А., Халик С. и др. (2005). «Гетерогенность локуса в аутосомно-рецессивных врожденных катарактах: связь с мутациями 9q и HSF4 зародышевой линии». Гм. Genet. 117 (5): 452–9. Дои:10.1007 / s00439-005-1309-9. PMID  15959809. S2CID  21135251.
• О Дж. Х., Ян Дж., Хан И и др. (2006). «Транскриптомный анализ рака желудка человека». Мамм. Геном. 16 (12): 942–54. Дои:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID  16341674. S2CID  69278.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Ту Н, Ху Й, Мивечи Н. Ф. (2006). «Фактор транскрипции теплового шока (Hsf) -4b рекрутирует Brg1 во время фазы G1 клеточного цикла и регулирует экспрессию белков теплового шока». J. Cell. Биохим. 98 (6): 1528–42. Дои:10.1002 / jcb.20865. PMID  16552721. S2CID  36553127.
• Ke T, Wang QK, Ji B и др. (2006). «Новая мутация HSF4 вызывает врожденную полную белую катаракту в китайской семье». Являюсь. J. Ophthalmol. 142 (2): 298–303. Дои:10.1016 / j.ajo.2006.03.056. PMID  16876512.

внешняя ссылка

• HSF4 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.