Дельта рецептора, активируемого пролифератором пероксисом - Peroxisome proliferator-activated receptor delta

PPARD
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1GWX, 1Y0S, 2AWH, 2B50, 2BAW, 2ENV, 2GWX, 2J14, 2Q5G, 2XYJ, 2XYW, 2XYX, 2ZNP, 2ZNQ, 3D5F, 3DY6, 3ET2, 3GWX, 3GZ9, 3OZ0, 3PEQ, 3SP9, 3ТКМ
Идентификаторы
Псевдонимы	PPARD, FAAR, NR1C2, NUC1, NUCI, NUCII, PPARB, дельта рецептора, активируемого пролифератором пероксисом
Внешние идентификаторы	OMIM: 600409 MGI: 101884 ГомолоГен: 4544 Генные карты: PPARD
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.31 Начинать 35,342,558 бп[1] Конец 35,428,191 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A3.3 | 17 14,64 см Начинать 28,232,700 бп[2] Конец 28,301,474 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • активность рецепторов стероидных гормонов • связывание жирных кислот • GO: 0001948 связывание с белками • связывание линолевой кислоты • связывание лекарств • активность гетеродимеризации белков • связывание липидов • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • связывание фактора транскрипции • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора • Связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Привязка NF-kappaB • связывание ДНК с последовательностью регуляторной области транскрипции • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • РНК-полимераза II репрессирует связывание фактора транскрипции • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • нуклеоплазма • ядерный хроматин • ядро клетки • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • катаболический процесс жирных кислот • положительное регулирование пролиферации миобластов • положительная регуляция развития эпидермиса • дифференциация клеток • отрицательная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • отрицательная регуляция дифференцировки миобластов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • плацентация • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция миграции клеток гладких мышц • лечение раны • транскрипция мРНК • метаболический процесс холестерина • отрицательная регуляция апоптотического процесса • ответ на глюкозу • ответ на активность • реакция на органическое вещество • производство метаболитов-предшественников и энергии • регулирование дифференцировки жировых клеток • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ответ на витамин А • развитие сердца • адгезия клетки к субстрату • пролиферация кератиноцитов • положительная регуляция экспрессии генов • протеогликановый метаболический процесс • регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция роста клеток • окисление жирных кислот • положительное регулирование пролиферации клеток • метаболический процесс глюкозы • процесс биосинтеза фосфолипидов • отрицательная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • положительная регуляция регенерации тканей скелетных мышц • апоптотический сигнальный путь • метаболический процесс витамина А • положительная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • миграция кератиноцитов • развитие жировой ткани • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция пролиферации сателлитных клеток скелетных мышц • положительное регулирование дифференцировки жировых клеток • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция воспалительного ответа • клеточный ответ на липополисахарид • клеточный ответ на гипоксию • отрицательная регуляция процесса биосинтеза коллагена • положительное регулирование секреции инсулина • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • апоптотический процесс • клеточная пролиферация • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора • оболочка аксонов • децидуализация • транспорт жирных кислот • имплантация эмбриона • отрицательная регуляция транскрипции pri-miRNA с промотора РНК-полимеразы II • липидный обмен • бета-окисление жирных кислот • положительное регулирование диаметра кровеносных сосудов • трансмембранный транспорт глюкозы • метаболический процесс жирных кислот • развитие многоклеточного организма • гормонально-опосредованный сигнальный путь • отрицательное регулирование хранения холестерина • регуляция липидного обмена • ответ на липид • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5467	19015
Ансамбль	ENSG00000112033	ENSMUSG00000002250
UniProt	Q03181	P35396
RefSeq (мРНК)	NM_001171818 NM_001171819 NM_001171820 NM_006238 NM_177435	NM_011145
RefSeq (белок)	NP_001165289 NP_001165290 NP_001165291 NP_006229 NP_803184	NP_035275
Расположение (UCSC)	Chr 6: 35.34 - 35.43 Мб	Chr 17: 28,23 - 28,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рецептор бета, активируемый пролифератором пероксисом или же дельта (PPAR-β или же PPAR-δ), также известный как NR1C2 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа C, член 2) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется PPARD ген.^[5]

Этот ген кодирует член рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR ) семья. Впервые он был обнаружен в Xenopus в 1993 г.^[6]

Функция

PPARδ - это рецептор ядерного гормона который управляет множеством биологических процессов и может быть вовлечен в развитие нескольких хронических заболеваний, включая диабет, ожирение, атеросклероз и рак.^[7][8]

В мышцах PPAR-β / δ выражение увеличивается при выполнении упражнений, что приводит к увеличению окислительный (сжигание жира) и увеличение волокна типа I.^[9] И PPAR-β / δ, и АМПК агонисты рассматриваются как упражнения миметики.^[10] В жировая ткань PPAR-β / δ увеличивает как окисление, так и разъединение из окислительного фосфорилирования.^[9]

PPARδ может функционировать как интегратор транскрипция подавление и передача сигналов ядерного рецептора. Он активирует транскрипцию множества генов-мишеней, связываясь со специфическими элементами ДНК. Хорошо описано гены-мишени PPARδ включают PDK4, ANGPTL4, PLIN2, и CD36. Выявлено, что экспрессия этого гена повышается в колоректальный рак клетки.^[11] Повышенная экспрессия может подавляться полипозом кишечной палочки аденоматоза (APC ), белок-супрессор опухоли, участвующий в APC /бета-катенин сигнальный путь. Нокаут-исследования на мышах показали роль этого белка в миелинизация из мозолистое тело, эпидермальный пролиферация клеток и глюкоза^[12] и липидный обмен.^[13]

Было показано, что этот белок участвует в дифференцировке, накоплении липидов,^[14] направленное зондирование, поляризация и миграция в кератиноциты.^[15]

Роль в раке

Исследования роли PPARδ в рак дали противоречивые результаты, и нет научный консенсус от того, способствует ли оно образованию рака или предотвращает его.^[16][17] PPARδ способствует ангиогенезу опухоли.^[18]

Фармакология

Было разработано несколько лигандов с высоким сродством к PPARδ, включая GW501516 и GW0742, которые играют важную роль в исследованиях. В одном исследовании с использованием такого лиганда было показано, что агонизм PPARδ изменяет предпочтения организма в отношении топлива с глюкозы на липиды.^[19]

Распределение тканей

PPARδ высоко экспрессируется во многих тканях, включая двоеточие, тонкий кишечник, печень и кератиноциты, а также в сердце, селезенка, скелетные мышцы, легкое, мозг и вилочковая железа.^[20]

Нокаут-исследования

Нокаут-мыши лишенные лиганд-связывающего домена PPARδ, являются жизнеспособными. Однако эти мыши меньше, чем мыши дикого типа. нео и послеродовой. Кроме того, жировые запасы в гонады мутантов меньше. Мутанты также демонстрируют повышенную эпидермальную гиперплазия после индукции с TPA.^[21]

Лиганды

PPARδ активируется в клетке различными жирными кислотами и производными жирных кислот.^[7] Примеры встречающихся в природе жирных кислот, которые связываются с дельта PPAR и активируют их, включают арахидоновая кислота и некоторые члены 15-гидроксикозатетраеновая кислота семейство метаболитов арахидоновой кислоты, включая 15 (S) -HETE, 15 (р) -HETE, и 15-HpETE.^[22] Было идентифицировано несколько синтетических лигандов, которые избирательно связывают PPARδ.

Агонисты

• GW501516
• GW0742^[23]
• Телмисартан

Взаимодействия

Дельта рецептора, активируемого пролифератором пероксисом, может взаимодействовать с HDAC3^[24][25] и NCOR2.^[25]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112033 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002250 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шмидт А., Эндо Н., Рутледж С.Дж., Фогель Р., Шинар Д., Родан Г.А. (1992). «Идентификация нового члена суперсемейства рецепторов стероидных гормонов, который активируется пролифератором пероксисом и жирными кислотами». Мол. Эндокринол. 6 (10): 1634–41. Дои:10.1210 / me.6.10.1634. PMID  1333051.
6. Крей Г., Келлер Х., Махфуди А., Медин Дж., Озато К., Драйер С., Вали В. (1993). «Рецепторы, активируемые пролифератором пероксисом Xenopus: геномная организация, распознавание элемента ответа, образование гетеродимера с рецептором ретиноида X и активация жирными кислотами». J Стероид Биохим Мол Биол. 47 (1–6): 65–73. Дои:10.1016/0960-0760(93)90058-5. PMID  8274443. S2CID  25098754.
7. Бергер Дж, Моллер Д.Е. (2002). «Механизмы действия PPAR». Анну. Преподобный Мед. 53: 409–35. Дои:10.1146 / annurev.med.53.082901.104018. PMID  11818483.
8. Файги Дж. Н., Гельман Л., Михалик Л., Десвернь Б., Вали В. (2006). «От молекулярного действия к физиологическим результатам: рецепторы, активируемые пролифератором пероксисом, являются ядерными рецепторами на перекрестке ключевых клеточных функций». Прог. Липидный Res. 45 (2): 120–59. Дои:10.1016 / j.plipres.2005.12.002. PMID  16476485.
9. Наркар В.А., Даунс М., Ю.Р.Т., Эмблер Э., Ван Й.X, Банайо Э., Михайлова М.М., Нельсон М.К., Зоу Й., Джугилон Х., Кан Х., Шоу Р.Дж., Эванс Р.М. «Интегративный и системный подходы к оценке функции PPARβ / δ (PPARD)». Сигнализация ядерного рецептора. 13: eoo1. Дои:10.1621 / № 13001. ЧВК  4419664. PMID  25945080.
10. Джордано Аттианезе GM, Desvergne B (2008). «Агонисты AMPK и PPARdelta являются миметиками упражнений». Клетка. 134 (3): 405–415. Дои:10.1016 / j.cell.2008.06.051. ЧВК  2706130. PMID  18674809.
11. Такаяма О, Ямамото Х, Дамдинсурен Б., Сугита Й, Нган С.Й., Сюй Х, Цуджино Т., Такемаса И., Икеда М., Сэкимото М., Мацуура Н., Монден М. (2006). «Экспрессия PPARδ в многоступенчатом канцерогенезе толстой кишки: последствия морфологии злокачественного рака». Br. J. Рак. 95 (7): 889–95. Дои:10.1038 / sj.bjc.6603343. ЧВК  2360534. PMID  16969348.
12. Ли Ч., Олсон П., Хевенер А., Мель И., Чонг Л. В., Олефски Дж. М., Гонсалес Ф. Дж., Хэм Дж., Канг Х., Питерс Дж. М., Эванс Р. М. (2006). «PPARδ регулирует метаболизм глюкозы и чувствительность к инсулину». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (9): 3444–9. Bibcode:2006ПНАС..103.3444Л. Дои:10.1073 / pnas.0511253103. ЧВК  1413918. PMID  16492734.
13. "Энтрез Ген: дельта рецептора, активируемого пролифератором пероксисом PPARD".
14. Schmuth M, Haqq CM, Cairns WJ, Holder JC, Dorsam S, Chang S, Lau P, Fowler AJ, Chuang G, Moser AH, Brown BE, Mao-Qiang M, Uchida Y, Schoonjans K, Auwerx J, Chambon P, Уилсон TM, Элиас PM, Файнгольд KR (апрель 2004 г.). «Рецептор, активируемый пролифератором пероксисом (PPAR) -бета / дельта, стимулирует дифференцировку и накопление липидов в кератиноцитах». J. Invest. Дерматол. 122 (4): 971–83. Дои:10.1111 / j.0022-202X.2004.22412.x. PMID  15102088.
15. Тан Н.С., Икре Дж., Монтагнер А., Бордье-тен-Хеггелер Б., Вали В., Михалик Л. (октябрь 2007 г.). "Рецептор ядерного гормона, активированный пролифератором пероксисом, рецептор β / δ потенцирует клеточный хемотактизм, поляризацию и миграцию". Мол. Клетка. Биол. 27 (20): 7161–75. Дои:10.1128 / MCB.00436-07. ЧВК  2168901. PMID  17682064.
16. Татибана К., Ямасаки Д., Ишимото К., Дои Т. (2008). «Роль PPAR в раке». PPAR Res. 2008: 1–15. Дои:10.1155/2008/102737. ЧВК  2435221. PMID  18584037.
17. Петерс Дж. М., Шах Ю. М., Гонсалес Ф. Дж. (Март 2012 г.). «Роль рецепторов, активируемых пролифератором пероксисом, в канцерогенезе и химиопрофилактике». Nat. Преподобный Рак. 12 (3): 181–95. Дои:10.1038 / nrc3214. ЧВК  3322353. PMID  22318237.
18. Вагнер, Кай-Дитрих (12 декабря 2019 г.). «Настройки Open AccessArticle Сосудистый PPARβ / δ способствует ангиогенезу и прогрессированию опухоли». Клетки. 8 (12): 1623. Дои:10.3390 / ячеек8121623. ЧВК  6952835. PMID  31842402.
19. Брунмайр Б., Станик К., Дериг Дж., Сёч З., Штадльбауэр К., Мариан В., Грас Ф., Андервальд С., Ноль Х., Вальдхаусл В., Фюрнсинн С. (ноябрь 2006 г.). «Активация PPAR-δ в изолированных скелетных мышцах крысы переключает предпочтение топлива с глюкозы на жирные кислоты». Диабетология. 49 (11): 2713–22. Дои:10.1007 / s00125-006-0357-6. PMID  16960684.
20. Girroir EE, Hollingshead HE, He P, Zhu B, Perdew GH, Peters JM (июль 2008 г.). «Количественные образцы экспрессии белка рецептора-β / δ, активируемого пролифератором пероксисом (PPARβ / δ), у мышей». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 371 (3): 456–61. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.086. ЧВК  2586836. PMID  18442472.
21. Петерс Дж. М., Ли С. С., Ли В., Уорд Дж. М., Гаврилова О., Эверетт С., Райтман М. Л., Хадсон Л. Д., Гонсалес Ф. Дж. (1993). «Рост, жировые, мозговые и кожные изменения в результате целенаправленного нарушения рецептора β (δ), активируемого пролифератором пероксисом мыши». Mol Cell Biol. 20 (14): 5119–28. Дои:10.1128 / MCB.20.14.5119-5128.2000. ЧВК  85961. PMID  10866668.
22. Мол. Pharmacol. 77: 171-184, 2010 г.
23. ван дер Вин Дж. Н., Круит Дж. К., Хавинга Р., Баллер Дж. Ф., Чимини Дж., Леставел С., Стэлс Б., Гроот П. Х., Гроен А. К., Койперс Ф. (март 2005 г.). «Снижение всасывания холестерина при активации PPAR-δ совпадает со снижением экспрессии NPC1L1 в кишечнике». J. Lipid Res. 46 (3): 526–34. Дои:10.1194 / мл. M400400-JLR200. PMID  15604518.
24. Франко П.Дж., Ли Дж., Вэй Л.Н. (август 2003 г.). «Взаимодействие ядерных рецепторов ДНК-связывающих доменов цинкового пальца с гистондеацетилазой». Мол. Клетка. Эндокринол. 206 (1–2): 1–12. Дои:10.1016 / S0303-7207 (03) 00254-5. PMID  12943985. S2CID  19487189.
25. Ши Ю., Хон М., Эванс Р.М. (март 2002 г.). «Рецептор, активируемый пролифератором пероксисом δ, интегратор репрессии транскрипции и передачи сигналов ядерного рецептора». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (5): 2613–8. Bibcode:2002PNAS ... 99.2613S. Дои:10.1073 / pnas.052707099. ЧВК  122396. PMID  11867749.

дальнейшее чтение

• Чонг Х.С. и др. (2009). «Регулирование эпителиально-мезенхимальной передачи сигналов IL-1 с помощью PPARβ / δ имеет важное значение для гомеостаза кожи и заживления ран». J. Cell Biol. 184 (6): 817–831. Дои:10.1083 / jcb.200809028. ЧВК  2699156. PMID  19307598.
• Тан Н.С. и др. (2005). «Генетические или трансформирующие изменения, вызванные фактором роста-бета-1, в экспрессии бета / дельта-рецепторов, активируемых пролифератором эпидермальных пероксисом, определяют кинетику заживления ран». J. Biol. Chem. 280 (18): 18163–18170. Дои:10.1074 / jbc.M412829200. PMID  15708854.
• Тан Н.С. и др. (2004). «Важная роль Smad3 в ингибировании вызванной воспалением экспрессии PPARβ / δ». EMBO J. 23 (21): 4211–4221. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600437. ЧВК  524401. PMID  15470497.
• Ди-Пуи Н; и другие. (2002). «Антиапоптотическая роль PPARbeta в кератиноцитах через транскрипционный контроль пути передачи сигналов Akt1». Мол. Клетка. 10 (4): 721–733. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00646-9. PMID  12419217.
• Тан Н.С. и др. (2001). «Важнейшие роли PPARβ / δ в ответе кератиноцитов на воспаление». Genes Dev. 15 (24): 3263–3277. Дои:10.1101 / gad.207501. ЧВК  312855. PMID  11751632.
• Михалик Л. и др. (2001). «Нарушение заживления кожных ран у мышей с мутантным рецептором пероксисом, активируемым пролифератором (PPAR) α и PPARβ». J. Cell Biol. 154 (4): 799–814. Дои:10.1083 / jcb.200011148. ЧВК  2196455. PMID  11514592.

внешняя ссылка

• PPAR + дельта в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.