TBX22 - TBX22

TBX22
Идентификаторы
Псевдонимы	TBX22, ABERS, CLPA, CPX, TBXX, dJ795G23.1, T-box 22, T-box фактор транскрипции 22
Внешние идентификаторы	OMIM: 300307 MGI: 2389465 ГомолоГен: 9666 Генные карты: TBX22
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq21.1 Начинать 80,014,753 бп[1] Конец 80,031,774 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X D | X 47,59 см Начинать 107,667,964 бп[2] Конец 107,688,978 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • ядро клетки Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	50945	245572
Ансамбль	ENSG00000277800 ENSG00000122145	ENSMUSG00000031241
UniProt	Q9Y458	Q8K402
RefSeq (мРНК)	NM_001109878 NM_001109879 NM_001303475 NM_016954	NM_001290747 NM_145224 NM_181319
RefSeq (белок)	NP_001103348 NP_001103349 NP_001290404 NP_058650	NP_001277676 NP_660259 NP_851836
Расположение (UCSC)	Chr X: 80.01 - 80.03 Мб	Chr X: 107.67 - 107.69 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции T-box TBX22 это белок что у людей кодируется TBX22 ген.^[5]

TBX22 является членом филогенетически консервативного семейства белков, которые имеют общий ДНК-связывающий домен, Т-образная коробка. Гены Т-бокса кодируют факторы транскрипции участвует в регуляции процессов развития. Мутации в этом гене были связаны с наследственным Х-сцепленным заболеванием, волчья пасть с анкилоглоссия (язычок), и считается, что он играет важную роль в палатогенезе человека.^[5] Ранее он был сопоставлен с длинным плечом Х-хромосомы, и теперь было продемонстрировано, что мутации в гене TBX22 являются причиной этого синдрома.^[6] Мутации TBX22 также приводят к несиндромальным волчья пасть в некоторых популяциях.^[7]

TBX22 состоит из семи экзонов, охватывающих 8,7 килобаз геномной ДНК в Xq21.1. МРНК TBX22 имеет длину 2099 пар оснований и кодирует белок из 400 аминокислот, содержащий Т-домен в его NH2-концевой области, который имеет уникальную особенность отсутствия 20 аминокислот по сравнению с другими известными Т-доменами.^[8]

Функция

Гены Т-бокса являются членами семейства регуляторов транскрипции, которые содержат область, кодирующую консервативный ДНК-связывающий мотив из примерно 200 аминокислот: Т-домен. Эти гены сгруппированы на основе гомологии, существующей между их продуктами и мышами. Брачьюры (или Т) белок. У человека и мыши к настоящему времени идентифицированы многочисленные гены, содержащие Т-домен, и они картированы по всему геному. Пространственно-временная экспрессия этих генов строго регулируется во время развития как позвоночных, так и беспозвоночных.^[8]

Функциональные исследования показали, что несколько генов Т-бокса участвуют в мезодерма спецификация в развивающемся эмбрионе мыши или Xenopus. У мышей ген Brachyury экспрессируется в ранних клетках мезодермы, и его экспрессия затем ограничивается нотохорда. Белок Brachyury частично связывается в виде димера с 20-нуклеотидом. палиндромный последовательность, узнаваемая ее Т-доменом. В более общем плане было показано, что гены Т-бокса имеют решающее значение во время развития для правильного морфогенез и органогенез. Было показано, что аномальная экспрессия нескольких генов Т-бокса вызывает аномалии развития у мышей, Дрозофила или данио.

Клиническое значение

Мутации TBX22 в двух семьях, по прогнозам, имеют X-сцепленную расщелину неба и анкилоглоссию. Электрофореграммы последовательности геномной ДНК, амплифицированной из экзона 5 (семейство K) и экзона 4 (семейство W), относятся к пораженным (мутантным) самцам и незатронутым (контрольным) самкам. * Представляет сайт варианта последовательности.

У людей два гена Т-бокса участвуют в наследственных заболеваниях: мутации в TBX5 вызывают Синдром Холта – Орама, тогда как мутации в TBX3 вызывают локтево-молочный синдром.^[8]

Мутации в TBX22 вызывают Х-сцепленную расщелину неба и анкилоглоссию.^[9] CPX был описан в небольшом количестве семей, демонстрирующих сильное X-сцепленное менделевское наследование. Расщелина фенотип преимущественно поражает мужчин, у которых наблюдаются вариации от полной расщелины вторичного неба, подслизистой расщелины или раздвоенного язычка до высокого арочного неба. Анкилоглоссия часто наблюдается у пораженных пациентов и женщин-носителей и оказалась полезным индикатором CPX. Временные и пространственные исследования с использованием гибридизации in situ у человека и мыши показали, что TBX22 / Tbx22 экспрессируется в основном на небных полках и языке во время палатогенез, что указывает на специфическую роль TBX22 как в развитии неба, так и языка. Помимо семей с четко определенным X-сцепленным наследованием, мутации TBX22 были идентифицированы в нескольких семьях, где размер родословной и / или семейный анамнез были слишком ограничены, чтобы предсказать способ наследования. В этих случаях установление диагноза в основном основывалось на наличии анкилоглоссии, а также волчьей пасти.^[10]

Было продемонстрировано, что TBX22 вносит значительный вклад в распространенность волчьей пасти, по крайней мере, в бразильской и североамериканской когортах.^[8] На сегодняшний день зарегистрировано 10 различных мутаций TBX22 у пациентов с ХП и / или анкилоглоссией.^[11] К ним относятся небольшие удаления / вставки, бессмыслица, склейка сайтов, сдвиг фрейма и несмысленные изменения.^[7]

Рекомендации

1. ENSG00000122145 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000277800, ENSG00000122145 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031241 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: TBX22 T-box 22".
6. Брейбрук С., Дудни К., Марсано А.С. и др. (2001). «Ген фактора транскрипции Т-бокса TBX22 мутирован в Х-сцепленной волчьей пасти и анкилоглоссии». Nat. Genet. 29 (2): 179–83. Дои:10,1038 / ng730. PMID  11559848. S2CID  28939959.
7. Suphapeetiporn K, Tongkobpetch S, Siriwan P, Shotelersuk V (2008). «Мутации TBX22 - частая причина несиндромальной волчьей пасти у населения Таиланда». Clin. Genet. 72 (5): 478–83. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2007.00891.x. PMID  17868388. S2CID  2244618.
8. Ложье-Анфосси Ф, Виллар Л (2000). «Молекулярная характеристика нового гена Т-бокса человека (ТВХ22), расположенного в xq21.1, кодирующего белок, содержащий усеченный Т-домен». Ген. 255 (2): 289–96. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00326-7. PMID  11024289.
9. Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (март 2011 г.). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Nat. Преподобный Жене. 12 (3): 167–78. Дои:10.1038 / nrg2933. ЧВК  3086810. PMID  21331089.
10. Марсано А.С., Дудни К., Брейбрук С. и др. (2004). «Мутации TBX22 - частая причина волчьей пасти». J. Med. Genet. 41 (1): 68–74. Дои:10.1136 / jmg.2003.010868. ЧВК  1757272. PMID  14729838.
11. Онлайн-менделевское наследование в человеке (OMIM): T-BOX 22; TBX22 - 300307

дальнейшее чтение

• Ложье-Анфосси Ф, Виллар Л (2000). «Молекулярная характеристика нового гена Т-бокса человека (ТВХ22), расположенного в xq21.1, кодирующего белок, содержащий усеченный Т-домен». Ген. 255 (2): 289–96. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00326-7. PMID  11024289.
• Брейбрук С., Дудни К., Марсано А.С. и др. (2001). «Ген фактора транскрипции Т-бокса TBX22 мутирован в Х-сцепленной волчьей пасти и анкилоглоссии». Nat. Genet. 29 (2): 179–83. Дои:10,1038 / ng730. PMID  11559848. S2CID  28939959.
• Олдред М.А. (2002). «Расщелина губы и неба: новые генетические ключи». Тенденции в молекулярной медицине. 7 (12): 539–40. Дои:10.1016 / S1471-4914 (01) 02223-7. PMID  11733204.
• Брейбрук С., Лисго С., Дудни К. и др. (2003). «Черепно-лицевая экспрессия человеческого и мышиного TBX22 коррелирует с волчьей пастью и фенотипом анкилоглоссии, наблюдаемым у пациентов с CPX». Гм. Мол. Genet. 11 (22): 2793–804. Дои:10.1093 / hmg / 11.22.2793. PMID  12374769.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Марсано А.С., Дудни К., Брейбрук С. и др. (2004). «Мутации TBX22 - частая причина волчьей пасти». J. Med. Genet. 41 (1): 68–74. Дои:10.1136 / jmg.2003.010868. ЧВК  1757272. PMID  14729838.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Bibcode:2005Натура.434..325р. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Андреу А.М., Поус Э., Джонс М.С. и др. (2007). «Миссенс-мутации TBX22, обнаруженные у пациентов с Х-сцепленной волчьей пастью, влияют на связывание ДНК, сумоилирование и репрессию транскрипции». Являюсь. J. Hum. Genet. 81 (4): 700–12. Дои:10.1086/521033. ЧВК  2227921. PMID  17846996.
• Suphapeetiporn K, Tongkobpetch S, Siriwan P, Shotelersuk V (2008). «Мутации TBX22 - частая причина несиндромальной волчьей пасти у населения Таиланда». Clin. Genet. 72 (5): 478–83. Дои:10.1111 / j.1399-0004.2007.00891.x. PMID  17868388. S2CID  2244618.

внешняя ссылка

• TBX22 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• WikiGenes TBX22
• TBX22 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• TBX22 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.