NFYB - NFYB

NFYB
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1N1J, 4AWL, 4CSR
Идентификаторы
Псевдонимы	NFYB, CBF-A, CBF-B, HAP3, NF-YB, бета субъединица ядерного транскрипционного фактора Y
Внешние идентификаторы	OMIM: 189904 MGI: 97317 ГомолоГен: 38149 Генные карты: NFYB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q23.3 Начинать 104,117,086 бп[1] Конец 104,138,241 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 C1 | 10 40,25 см Начинать 82,748,701 бп[2] Конец 82,764,144 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • последовательное связывание ДНК • репрессия связывания фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • белок-ДНК комплекс • нуклеоплазма • CCAAT-связывающий факторный комплекс • ядро клетки • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция процесса биосинтеза холестерина • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4801	18045
Ансамбль	ENSG00000120837	ENSMUSG00000020248
UniProt	P25208	P63139
RefSeq (мРНК)	NM_006166	NM_010914
RefSeq (белок)	NP_006157 NP_006157.1	NP_035044
Расположение (UCSC)	Chr 12: 104.12 - 104.14 Мб	Chr 10: 82,75 - 82,76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица бета-фактора ядерной транскрипции Y это белок что у людей кодируется NFYB ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой одну субъединицу тримерного комплекса, образующего высококонсервативный фактор транскрипции, который с высокой специфичностью связывается с мотивами CCAAT в промоторных областях в различных генах. Этот генный продукт, субъединица B, образует плотный димер с субъединицей C, что является предпосылкой для ассоциации субъединицы A. Полученный тример связывается с ДНК с высокой специфичностью и аффинностью. Каждая субъединица B и C содержит гистоноподобный мотив. Наблюдение за гистоновой природой этих субъединиц подтверждается двумя типами доказательств; выравнивание последовательностей белков и эксперименты с мутантами.^[7]

Взаимодействия

NFYB был показан взаимодействовать с:

• CEBPZ,^[8]
• CNTN2,^[9]
• Мой с,^[10] и
• TBP^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120837 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020248 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ли XY, Маттей М.Г., Залеска-Рутчинска З., Хофт ван Хейсдуйнен Р., Фигероа Ф., Надо Дж., Бенойст С., Матис Д. (март 1992 г.). «Одна субъединица фактора транскрипции NF-Y приближается к основному комплексу гистосовместимости в мышиных и человеческих хромосомах». Геномика. 11 (3): 630–4. Дои:10.1016 / 0888-7543 (91) 90070-У. PMID  1774067.
6. Maity SN, de Crombrugghe B. (июнь 1998 г.). «Роль CCAAT-связывающего белка CBF / NF-Y в транскрипции». Тенденции Biochem Sci. 23 (5): 174–8. Дои:10.1016 / S0968-0004 (98) 01201-8. PMID  9612081.
7. «Ген Entrez: фактор ядерной транскрипции NFYB Y, бета».
8. Имбриано К., Болоньезе Ф, Гуртнер А., Пьяджио Дж., Мантовани Р. (июль 2001 г.). «HSP-CBF является NF-Y-зависимым коактиватором промоторов теплового шока CCAAT-боксов». J. Biol. Chem. 276 (28): 26332–9. Дои:10.1074 / jbc.M101553200. PMID  11306579.
9. Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (март 1997 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y». Мол. Клетка. Биол. 17 (3): 1236–43. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1236. ЧВК  231848. PMID  9032250.
10. Идзуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Исисаки А., Коно К., Фуна К. (апрель 2001 г.). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID  11282029.
11. Беллорини М., Ли Д. К., Дантонель Дж. К., Земзуми К., Рёдер Р. Г., Тора Л., Мантовани Р. (июнь 1997 г.). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми складчатыми мотивами для ассоциации с основными остатками TBP». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (11): 2174–81. Дои:10.1093 / nar / 25.11.2174. ЧВК  146709. PMID  9153318.

дальнейшее чтение

• Lloberas J, Soler C, Celada A (1998). «Механизмы репрессии гена I-A бета главного комплекса гистосовместимости». Иммунобиология. 198 (1–3): 249–63. Дои:10.1016 / s0171-2985 (97) 80045-9. PMID  9442396.
• Мантовани Р. (1999). «Молекулярная биология CCAAT-связывающего фактора NF-Y». Ген. 239 (1): 15–27. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00368-6. PMID  10571030.
• Ли XY, Мантовани Р., Хоофт ван Хейсдуйнен Р., Андре I, Бенуа С., Матис Д. (1992). «Эволюционная вариация CCAAT-связывающего фактора транскрипции NF-Y». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (5): 1087–91. Дои:10.1093 / nar / 20.5.1087. ЧВК  312095. PMID  1549471.
• Ли XY, Хоофт ван Хейсдуйнен Р., Мантовани Р., Бенойст С., Матис Д. (1992). «Интрон-экзонная организация генов NF-Y. Тканевый сплайсинг модифицирует домен активации». J. Biol. Chem. 267 (13): 8984–90. PMID  1577736.
• Льоберас Дж., Маки Р.А., Селада А. (1995). «Подавление экспрессии бета-гена основного комплекса гистосовместимости I-A белками dbpA и dbpB (mYB-1)». Мол. Клетка. Биол. 15 (9): 5092–9. Дои:10.1128 / mcb.15.9.5092. ЧВК  230756. PMID  7651426.
• Чанг Ц.Ф., Лю CJ (1994). «CCAAT-связывающий белок тимидинкиназы человека представляет собой NF-Y, экспрессия A-субъединицы которого зависит от сыворотки крови в диплоидных фибробластах IMR-90 человека». J. Biol. Chem. 269 (27): 17893–8. PMID  8027044.
• Мантовани Р., Ли XY, Пессара У., Хоофт ван Хуисйдуйнен Р., Бенуа С., Матис Д. (1994). «Доминирующие отрицательные аналоги НФ-Я». J. Biol. Chem. 269 (32): 20340–6. PMID  8051128.
• Pise-Masison CA, Dittmer J, Clemens KE, Brady JN (1997). «Физическое и функциональное взаимодействие между человеческим Т-клеточным лимфотропным вирусом 1 типа Tax1 и CCAAT-связывающим белком NF-Y». Мол. Клетка. Биол. 17 (3): 1236–43. Дои:10.1128 / mcb.17.3.1236. ЧВК  231848. PMID  9032250.
• Беллорини М., Ли Д.К., Дантонель Дж. К., Земзуми К., Рёдер Р. Г., Тора Л., Мантовани Р. (1997). «CCAAT, связывающий взаимодействия NF-Y-TBP: NF-YB и NF-YC требуют коротких доменов, соседних с их гистоновыми складчатыми мотивами для ассоциации с основными остатками TBP». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (11): 2174–81. Дои:10.1093 / nar / 25.11.2174. ЧВК  146709. PMID  9153318.
• Карри Р.А. (1998). «Функциональное взаимодействие между доменом тримеризации ДНК-связывающей субъединицы NF-Y и белком группы высокой подвижности HMG-I (Y)». J. Biol. Chem. 272 (49): 30880–8. Дои:10.1074 / jbc.272.49.30880. PMID  9388234.
• Карри Р.А. (1998). «NF-Y связан с гистоновыми ацетилтрансферазами GCN5 и P / CAF». J. Biol. Chem. 273 (3): 1430–4. Дои:10.1074 / jbc.273.3.1430. PMID  9430679.
• Карри Р.А. (1998). «Биохимическая характеристика комплекса факторов транскрипции NF-Y во время развития В-лимфоцитов». J. Biol. Chem. 273 (29): 18220–9. Дои:10.1074 / jbc.273.29.18220. PMID  9660784.
• Bemark M, Olsson H, Heinegård D, Leanderson T (1998). «Очистка и характеристика связывания белка с промотором каппа SP6. Возможная роль фактора связывания CArG-бокса-A в транскрипции каппа». J. Biol. Chem. 273 (30): 18881–90. Дои:10.1074 / jbc.273.30.18881. PMID  9668064.
• Faniello MC, Bevilacqua MA, Condorelli G, de Crombrugghe B, Maity SN, Avvedimento VE, Cimino F, Costanzo F (1999). «Субъединица B СААТ-связывающего фактора NFY связывает центральный сегмент Соактиватора p300». J. Biol. Chem. 274 (12): 7623–6. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7623. PMID  10075648.
• Хак С.Б., Мастернак К., Каммербауэр С., Янзен С., Райт В., Штаймле В. (2000). «Богатые лейцином повторы CIITA контролируют ядерную локализацию, рекрутирование in vivo в энхансому главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса II и трансактивацию гена MHC класса II». Мол. Клетка. Биол. 20 (20): 7716–25. Дои:10.1128 / MCB.20.20.7716-7725.2000. ЧВК  86349. PMID  11003667.
• Лян Ф., Шауфеле Ф., Гарднер Д.Г. (2001). «Функциональное взаимодействие NF-Y и Sp1 необходимо для транскрипции гена рецептора натрийуретического пептида типа А». J. Biol. Chem. 276 (2): 1516–22. Дои:10.1074 / jbc.M006350200. PMID  11022037.
• Идзуми Х., Моландер С., Пенн Л.З., Исисаки А., Коно К., Фуна К. (2001). «Механизм репрессии транскрипции c-Myc на бета-рецепторе PDGF». J. Cell Sci. 114 (Pt 8): 1533–44. PMID  11282029.

внешняя ссылка

• NFYB + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• FactorBook NF-YB

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.