Циклин Е1 - Cyclin E1

CCNE1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1W98
Идентификаторы
Псевдонимы	CCNE1, CCNE, пциклин E1
Внешние идентификаторы	OMIM: 123837 MGI: 88316 ГомолоГен: 14452 Генные карты: CCNE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q12 Начинать 29,811,991 бп[1] Конец 29,824,312 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B3 | 7 25,35 см Начинать 38,097,984 бп[2] Конец 38,107,534 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • киназная активность • активность регулятора циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание рецепторов андрогенов • связывание протеинкиназы • активность циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • активность протеинкиназы Сотовый компонент • цитозоль • холоферментный комплекс циклинзависимой протеинкиназы • нуклеоплазма • ядро клетки • комплекс циклин E1-CDK2 • цитоплазма • центросома Биологический процесс • сигнальный путь рецептора андрогена • Сигнальный путь Wnt • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • регулирование клеточного цикла • деление клеток • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • фосфорилирование белков • Инициирование репликации ДНК • клеточный цикл • регуляция активности протеинкиназы • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • поддержание теломер • синапсис • организация хромосом, вовлеченная в мейотический клеточный цикл • регуляция локализации клеточного белка • G1 / S переход митотического клеточного цикла • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • регуляция митотического деления ядра • положительное регулирование пролиферации клеток • положительная регуляция клеточного цикла • положительная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла • фазовый переход митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	898	12447
Ансамбль	ENSG00000105173	ENSMUSG00000002068
UniProt	P24864	Q61457
RefSeq (мРНК)	NM_001238 NM_057182 NM_001322259 NM_001322261 NM_001322262	NM_007633
RefSeq (белок)	NP_001229 NP_001309188 NP_001309190 NP_001309191 NP_001309188.1 NP_001309190.1	NP_031659
Расположение (UCSC)	Chr 19: 29.81 - 29.82 Мб	Chr 7: 38,1 - 38,11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

G1 / S-специфический циклин-E1 это белок что у людей кодируется CCNE1 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к очень консервативный семья циклинов, члены которого характеризуются драматической периодичностью обилия белка в клеточном цикле. Циклины действуют как регуляторы CDK. Различные циклины демонстрируют различные паттерны экспрессии и деградации, которые способствуют временной координации каждого из них. митотический мероприятие. Этот циклин образует комплекс и функционирует как регуляторная субъединица CDK2, активность которой требуется для перехода G1 / S клеточного цикла. Этот белок накапливается на границе фаз G1-S и разрушается по мере продвижения клеток через S-фазу. Сверхэкспрессия этого гена наблюдалась во многих опухолях, что приводит к нестабильности хромосом и, таким образом, может способствовать туморогенез. Было обнаружено, что этот белок связан с фосфорилированием белка NPAT (ядерный белок, картированный в локусе ATM) и участвует в нем, который участвует в регулируемой клеточным циклом экспрессии гистонового гена и играет критическую роль в стимулировании прогрессирования клеточного цикла в отсутствие pRB. Были описаны два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта этого гена, которые кодируют разные изоформы. Сообщалось о двух дополнительных вариантах сплайсинга, но подробная информация о нуклеотидной последовательности еще не доступна.^[6]

Взаимодействия

Циклин E1 показал взаимодействовать с:

• CDC25A,^[7][8]
• CDKN1B,^[7][9]
• CUL3^[10]
• Cdk1,^[7][11]
• Циклинзависимая киназа 2,^{[7][9][11][12][13][14]}
• HERC5,^[15]
• P21,^[12]
• Ретинобластомоподобный белок 2,^[7][16] и
• SMARCA4.^[7][17]

Смотрите также

• Циклин E

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105173 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000002068 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лью DJ, Дулич В., Рид С.И. (октябрь 1991 г.). «Выделение трех новых человеческих циклинов путем восстановления функции циклина G1 (Cln) в дрожжах». Клетка. 66 (6): 1197–206. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90042-В. PMID  1833066. S2CID  12166415.
6. «Энтрез Ген: CCNE1, циклин E1».
7. Шанахан Ф., Сегеззи В., Парри Д., Махони Д., Лис Е. (февраль 1999 г.). «Циклин E связывается с BAF155 и BRG1, компонентами комплекса SWI-SNF млекопитающих, и изменяет способность BRG1 вызывать остановку роста». Мол. Клетка. Биол. 19 (2): 1460–9. Дои:10.1128 / mcb.19.2.1460. ЧВК  116074. PMID  9891079.
8. Сюй X, Берк SP (март 1996). «Роли остатков активного сайта и NH2-концевого домена в катализе и связывании субстрата человеческого Cdc25». J. Biol. Chem. 271 (9): 5118–24. Дои:10.1074 / jbc.271.9.5118. PMID  8617791.
9. Коннор М.К., Котчетков Р., Кариу С., Реш А., Лупетти Р., Бенистон Р.Г., Мельхиор Ф., Хенгст Л., Слингерланд Дж. М. (январь 2003 г.). «CRM1 / Ran-опосредованный ядерный экспорт p27 (Kip1) включает сигнал ядерного экспорта и связывает экспорт и протеолиз p27». Мол. Биол. Клетка. 14 (1): 201–13. Дои:10.1091 / mbc.E02-06-0319. ЧВК  140238. PMID  12529437.
10. Певец JD, Gurian-West M, Clurman B, Робертс JM (сентябрь 1999 г.). «Cullin-3 нацелен на циклин E для убиквитинирования и контролирует S-фазу в клетках млекопитающих». Genes Dev. 13 (18): 2375–87. Дои:10.1101 / gad.13.18.2375. ЧВК  317026. PMID  10500095.
11. Кофф А., Джордано А., Десаи Д., Ямасита К., Харпер Дж. У., Элледж С., Нишимото Т., Морган Д. О., Франза Б. Р., Робертс Дж. М. (сентябрь 1992 г.). «Образование и активация комплекса циклин E-cdk2 во время фазы G1 клеточного цикла человека». Наука. 257 (5077): 1689–94. Дои:10.1126 / science.1388288. PMID  1388288.
12. McKenzie PP, Danks MK, Kriwacki RW, Harris LC (июль 2003 г.). «Дисфункция P21Waf1 / Cip1 в нейробластоме: новый механизм ослабления остановки клеточного цикла G0-G1». Рак Res. 63 (13): 3840–4. PMID  12839982.
13. Майер С., Чжао Дж., Юань Х, Груммт I. (февраль 2004 г.). «mTOR-зависимая активация фактора транскрипции TIF-IA связывает синтез рРНК с доступностью питательных веществ». Genes Dev. 18 (4): 423–34. Дои:10.1101 / gad.285504. ЧВК  359396. PMID  15004009.
14. Будрез А., Бойлленс М., Гроенен П., Ван Эйнде А., Вулстеке В., Ягелло И., Мюррей М., Крайнер А. Р., Стальманс В., Боллен М. (август 2000 г.). «NIPP1-опосредованное взаимодействие протеинфосфатазы-1 с CDC5L, регулятором сплайсинга пре-мРНК и митотического входа». J. Biol. Chem. 275 (33): 25411–7. Дои:10.1074 / jbc.M001676200. PMID  10827081.
15. Мицуи К., Наканиси М., Оцука С., Норвуд Т.Х., Окабаяси К., Миямото К., Танака К., Йошимура А., Оцубо М. (декабрь 1999 г.). «Новый человеческий ген, кодирующий домен HECT и RCC1-подобные повторы, взаимодействует с циклинами и потенциально регулируется белками-супрессорами опухоли». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 266 (1): 115–22. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1777. PMID  10581175.
16. Ли Y, Грэм С., Лейси С., Дункан А.М., Уайт П. (декабрь 1993 г.). «Связанный с аденовирусом Е1А белок 130 кДа кодируется членом семейства генов ретинобластомы и физически взаимодействует с циклинами А и Е». Genes Dev. 7 (12A): 2366–77. Дои:10.1101 / gad.7.12a.2366. PMID  8253383.
17. Вонг А.К., Шанахан Ф., Чен Й, Лиан Л., Ха П, Хендрикс К., Гаффари С., Илиев Д., Пенн Б., Вудленд А.М., Смит Р., Салада Дж., Карилло А., Лайти К., Гупте Дж., Сведлунд Б., Тавтиджан С.В. , Teng DH, Lees E (ноябрь 2000 г.). «BRG1, компонент комплекса SWI-SNF, мутирован во множестве линий опухолевых клеток человека». Рак Res. 60 (21): 6171–7. PMID  11085541.

дальнейшее чтение

• Акита Х (2003). «[Прогностическое значение измененной экспрессии регуляторов клеточного цикла при раке легких]». Ниппон Риншо. 60. Дополнение 5: 267–71. PMID  12101670.
• Mazumder S, DuPree EL, Almasan A (2004). «Двойная роль циклина E в пролиферации клеток и апоптозе может служить мишенью для лечения рака». Текущие мишени противораковых препаратов. 4 (1): 65–75. Дои:10.2174/1568009043481669. ЧВК  1307511. PMID  14965268.
• Hinds PW, Mittnacht S, Dulic V, Arnold A, Reed SI, Weinberg RA (1992). «Регулирование функций белка ретинобластомы путем эктопической экспрессии человеческих циклинов». Клетка. 70 (6): 993–1006. Дои:10.1016 / 0092-8674 (92) 90249-С. PMID  1388095. S2CID  30799229.
• Кофф А., Джордано А., Десаи Д., Ямасита К., Харпер Дж. У., Элледж С., Нишимото Т., Морган Д. О., Франза Б. Р., Робертс Дж. М. (1992). «Формирование и активация комплекса циклин E-cdk2 во время фазы G1 клеточного цикла человека». Наука. 257 (5077): 1689–94. Дои:10.1126 / science.1388288. PMID  1388288.
• Кофф А, Кросс Ф, Фишер А, Шумахер Дж, Легеллек К., Филипп М, Робертс Дж. М. (1991). «Циклин E человека, новый циклин, который взаимодействует с двумя членами семейства генов CDC2». Клетка. 66 (6): 1217–28. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90044-У. PMID  1833068. S2CID  38910227.
• Деметрик Д.Д., Мацумото С., Ханнон Г.Дж., Окамото К., Сюн Й., Чжан Х., Пляж Д.Х. (1995). «Хромосомное картирование генов белков клеточного цикла человека циклина C (CCNC), циклина E (CCNE), p21 (CDKN1) и KAP (CDKN3)». Cytogenet. Cell Genet. 69 (3–4): 190–2. Дои:10.1159/000133960. PMID  7698009.
• Оцубо М., Теодорас А.М., Шумахер Дж., Робертс Дж. М., Пагано М. (1995). «Циклин E человека, ядерный белок, необходимый для фазового перехода G1-S». Мол. Клетка. Биол. 15 (5): 2612–24. Дои:10.1128 / mcb.15.5.2612. ЧВК  230491. PMID  7739542.
• Шитье А, Ренике В., Бюргер С., Функ М., Мюллер Р. (1994). «Альтернативный сплайсинг человеческого циклина E.». J. Cell Sci. 107. (Pt 2): 581–8. PMID  8207080.
• Дайсон Н., Дембски М., Фаттей А., Нгву С., Юэн М., Хелин К. (1993). «Анализ p107-ассоциированных белков: p107 ассоциирует с формой E2F, которая отличается от pRB-ассоциированного E2F-1». Дж. Вирол. 67 (12): 7641–7. Дои:10.1128 / JVI.67.12.7641-7647.1993. ЧВК  238233. PMID  8230483.
• Ли Y, Грэм С., Лейси С., Дункан А.М., Уайт П. (1994). «Связанный с аденовирусом Е1А белок 130 кДа кодируется членом семейства генов ретинобластомы и физически взаимодействует с циклинами А и Е.» Genes Dev. 7 (12A): 2366–77. Дои:10.1101 / gad.7.12a.2366. PMID  8253383.
• Сюй X, Берк SP (1996). «Роли остатков активного сайта и NH2-концевого домена в катализе и связывании субстрата человеческого Cdc25». J. Biol. Chem. 271 (9): 5118–24. Дои:10.1074 / jbc.271.9.5118. PMID  8617791.
• Отани К., ДеГрегори Дж., Невинс-младший (1996). «Регулирование гена циклина E с помощью фактора транскрипции E2F1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (26): 12146–50. Дои:10.1073 / пнас.92.26.12146. ЧВК  40313. PMID  8618861.
• Гэн Й., Итон Э. Н., Пикон М., Робертс Дж. М., Лундберг А. С., Гиффорд А., Сардет С., Вайнберг Р. А. (1996). «Регулирование транскрипции циклина E E2Fs и белком ретинобластомы». Онкоген. 12 (6): 1173–80. PMID  8649818.
• Пун Р.Й., Цзян В., Тойосима Н., Хантер Т. (1996). «Циклинзависимые киназы инактивируются комбинацией фосфорилирования p21 и Thr-14 / Tyr-15 после УФ-индуцированного повреждения ДНК». J. Biol. Chem. 271 (22): 13283–91. Дои:10.1074 / jbc.271.22.13283. PMID  8662825.
• Чен Дж, Саха П., Корнблут С., Динлахт Б.Д., Датта А. (1996). «Циклин-связывающие мотивы необходимы для функции p21CIP1». Мол. Клетка. Биол. 16 (9): 4673–82. Дои:10.1128 / MCB.16.9.4673. ЧВК  231467. PMID  8756624.
• Ли Х, Лахти Дж. М., Валентайн М., Сайто М., Рид С. И., Посмотрите AT, Кидд VJ (1997). «Молекулярное клонирование и хромосомная локализация генов циклина C человека (CCNC) и циклина E (CCNE): делеция гена CCNC в опухолях человека». Геномика. 32 (2): 253–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0112. PMID  8833152.
• Вон К.А., Рид С.И. (1996). «Активация циклина E / CDK2 связана с сайт-специфическим аутофосфорилированием и убиквитин-зависимой деградацией циклина E.» EMBO J. 15 (16): 4182–93. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00793.x. ЧВК  452142. PMID  8861947.
• Sala A, Kundu M, Casella I, Engelhard A, Calabretta B, Grasso L, Paggi MG, Giordano A, Watson RJ, Khalili K, Peschle C (1997). «Активация человеческого B-MYB циклинами». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (2): 532–6. Дои:10.1073 / пнас.94.2.532. ЧВК  19547. PMID  9012818.
• Мумберг Д., Вик М., Бюргер К., Хаас К., Функ М., Мюллер Р. (1997). «Циклин ЕТ, новый вариант сплайсинга человеческого циклина Е с уникальным паттерном экспрессии во время прогрессии и дифференцировки клеточного цикла». Нуклеиновые кислоты Res. 25 (11): 2098–105. Дои:10.1093 / nar / 25.11.2098. ЧВК  146711. PMID  9153308.