CAPN9 - CAPN9 - Wikipedia

CAPN9
Белок CAPN9 PDB 1ziv.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCAPN9, GC36, nCL-4, кальпаин 9
Внешние идентификаторыOMIM: 606401 MGI: 1920897 ГомолоГен: 38208 Генные карты: CAPN9
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение CAPN9
Геномное расположение CAPN9
Группа1q42.2Начинать230,747,384 бп[1]
Конец230,802,003 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CAPN9 208063 s в формате fs.png

PBB GE CAPN9 210641 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_006615
NM_016452
NM_001319676

NM_023709

RefSeq (белок)

NP_001306605
NP_006606
NP_057536

NP_076198

Расположение (UCSC)Chr 1: 230,75 - 230,8 МбChr 8: 124,58 - 124,62 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Кальпаин-9 это белок что у людей кодируется CAPN9 ген.[5][6][7]

Кальпаины - это широко распространенное, хорошо сохранившееся семейство кальций-зависимых цистеиновых протеаз. Белки кальпаина представляют собой гетеродимеры, состоящие из инвариантной малой субъединицы и вариабельной большой субъединицы. Большая субъединица содержит домен цистеиновой протеазы, и обе субъединицы обладают доменами связывания кальция. Кальпаины участвуют в нейродегенеративных процессах, поскольку их активация может быть вызвана притоком кальция и окислительным стрессом. Белок, кодируемый этим геном, экспрессируется преимущественно в желудке и тонком кишечнике и может выполнять специализированные функции в пищеварительном тракте. Считается, что этот ген связан с раком желудка. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.[7]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135773 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031981 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ли Х.Дж., Соримачи Х., Чжон С.И., Ишиура С., Судзуки К. (май 1998 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика нового тканеспецифичного кальпаина, преимущественно экспрессируемого в пищеварительном тракте». Биол Хим. 379 (2): 175–184. Дои:10.1515 / bchm.1998.379.2.175. PMID  9524069.
  6. ^ Йошикава Ю., Мукаи Х, Хино Ф, Асада К., Като И. (июль 2000 г.). «Выделение двух новых генов, подавляемых при раке желудка». JPN J Cancer Res. 91 (5): 459–63. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2000.tb00967.x. ЧВК  5926377. PMID  10835488.
  7. ^ а б «Entrez Gene: CAPN9 calpain 9».

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

  • Человек CAPN9 расположение генома и CAPN9 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
  • В МЕРОПЫ онлайн-база данных пептидаз и их ингибиторов: C02.006
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O14815 (Человеческий кальпаин-9 (CAPN9)) в PDBe-KB.