CDH6 - CDH6

Для аэропорта в Онтарио, Канада, см. Дели Аэродром.

CDH6
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3LND
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH6, CAD6, KCAD, кадгерин 6
Внешние идентификаторы	OMIM: 603007 MGI: 107435 ГомолоГен: 21027 Генные карты: CDH6
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п13.3 Начните 31,193,686 бп[1] Конец 31,329,146 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 A1 Начните 13,028,701 бп[2] Конец 13,173,675 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание ионов металлов • связывание с белками цитоскелета • активность гомодимеризации белков • связывание кадгерина Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • поверхность клетки • катениновый комплекс Биологический процесс • Notch сигнальный путь • клеточная адгезия • организация стыковки приверженцев • гомофильная клеточная адгезия через молекулы адгезии плазматической мембраны • сборка ячейки-ячейки • кальций-зависимая клеточная адгезия через молекулы клеточной адгезии плазматической мембраны • межклеточная адгезия, опосредованная кадгерином • межклеточная адгезия • клеточный морфогенез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1004	12563
Ансамбль	ENSG00000113361	ENSMUSG00000039385
UniProt	P55285	P97326
RefSeq (мРНК)	NM_004932 NM_001362435	NM_007666
RefSeq (белок)	NP_004923 NP_001349364	NP_031692
Расположение (UCSC)	Chr 5: 31.19 - 31.33 Мб	Chr 15: 13.03 - 13.17 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кадгерин-6 это белок что у людей кодируется CDH6 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует классический тип II. кадгерин из надсемейства кадгеринов. Закодированный мембранный белок зависит от кальция межклеточная адгезия гликопротеин состоит из пяти внеклеточный кадгерин повторяет, а трансмембранный регион и высококонсервативный цитоплазматический хвост. Кадгерины опосредуют межклеточное связывание гомофильным образом, способствуя сортировке гетерогенных типов клеток и поддержанию упорядоченных структур, таких как эпителий. Сильная транскрипционная экспрессия этого гена наблюдалась в клеточных линиях гепатоцеллюлярной и почечной карциномы, что предполагает возможную роль в метастаз и вторжение.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113361 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039385 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Симояма Ю., Гото М., Терасаки Т., Китадзима М., Хирохаши С. (июнь 1995 г.). «Выделение и анализ последовательности комплементарной ДНК кадгерина-6 человека для полной кодирующей последовательности и ее экспрессии в клетках карциномы человека». Рак Res. 55 (10): 2206–11. PMID  7743525.
6. Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина в области хромосомы 5, подверженной частой аллельной потере при карциноме». Геномика. 57 (1): 160–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5717. PMID  10191097.
7. «Ген Entrez: CDH6 кадгерин 6, тип 2, K-кадгерин (почки плода)».

дальнейшее чтение

• Компакт-диск MacCalman, Getsios S, Chen GT (1998). «Кадгерины 2-го типа в эндометрии и плаценте человека: их предполагаемые роли в имплантации человека и плацентации». Являюсь. J. Reprod. Иммунол. 39 (2): 96–107. Дои:10.1111 / j.1600-0897.1998.tb00341.x. PMID  9506208. S2CID  23871813.
• Сузуки С., Сано К., Танихара Х (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: данные о восьми новых кадгеринах в нервной ткани». Cell Regul. 2 (4): 261–70. Дои:10.1091 / mbc.2.4.261. ЧВК  361775. PMID  2059658.
• Пол Р., Юинг К.М., Робинсон Дж. К. и др. (1997). «Кадгерин-6, молекула клеточной адгезии, специфически экспрессируемая в проксимальных почечных канальцах и почечно-клеточной карциноме». Рак Res. 57 (13): 2741–8. PMID  9205085.
• Гетсиос С., Чен Г.Т., Стивенсон М.Д. и др. (1998). «Регулируемая экспрессия кадгерина-6 и кадгерина-11 в железистых эпителиальных и стромальных клетках эндометрия человека». Dev. Dyn. 211 (3): 238–47. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0177 (199803) 211: 3 <238 :: AID-AJA5> 3.0.CO; 2-I. PMID  9520111.
• Креммидиотис Г., Бейкер Э., Кроуфорд Дж. И др. (1998). «Локализация генов кадгерина человека в областях хромосом, демонстрирующих связанную с раком потерю гетерозиготности». Геномика. 49 (3): 467–71. Дои:10.1006 / geno.1998.5281. PMID  9615235.
• Симояма Й., Такеда Х., Йошихара С. и др. (1999). «Биохимическая характеристика и функциональный анализ двух классических кадгеринов типа II, кадгерина-6 и -14, и сравнение с E-кадгерином». J. Biol. Chem. 274 (17): 11987–94. Дои:10.1074 / jbc.274.17.11987. PMID  10207020.
• Симояма Ю., Цудзимото Г., Китадзима М., Натори М. (2001). «Идентификация трех классических кадгеринов II типа и частые гетерофильные взаимодействия между различными подклассами классических кадгеринов II типа». Biochem. J. 349 (Pt 1): 159–67. Дои:10.1042/0264-6021:3490159. ЧВК  1221133. PMID  10861224.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии». J. Proteome Res. 4 (6): 2070–80. Дои:10.1021 / pr0502065. ЧВК  1850943. PMID  16335952.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.

внешняя ссылка

• CDH6 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• CDH6 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.