CXCL10 - CXCL10

CXCL10
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1O80, 1LV9, 1O7Y, 1O7Z
Идентификаторы
Псевдонимы	CXCL10, C7, IFI10, INP10, IP-10, SCYB10, crg-2, gIP-10, mob-1, хемокиновый лиганд 10 мотива C-X-C, хемокин 10 мотива C-X-C
Внешние идентификаторы	OMIM: 147310 MGI: 1352450 ГомолоГен: 1203 Генные карты: CXCL10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.1 Начинать 76,021,118 бп[1] Конец 76,023,497 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 E2 | 5 46,57 см Начинать 92,346,638 бп[2] Конец 92,348,889 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • связывание гепарина • Связывание с хемокиновым рецептором CXCR3 • хемокиновая активность • GO: 0001948 связывание с белками • активность регулятора цАМФ-зависимой протеинкиназы • рецепторное связывание • хемоаттрактантная активность Сотовый компонент • внеклеточная область • внешняя сторона плазматической мембраны • внеклеточный • внутриклеточный Биологический процесс • регуляция морфогенеза эндотелиальной трубки • отрицательная регуляция дифференцировки миобластов • клеточный ответ на тепло • ответ на витамин D • положительное регулирование миграции клеток • Хемотаксис Т-клеток • хемокин-опосредованный сигнальный путь • передача сигналов от клетки к клетке • ответ на вирус • развитие мышечных органов • положительная регуляция хемотаксиса моноцитов • положительное регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль • активация эндотелиальных клеток • положительная регуляция передачи сигналов с помощью цАМФ • регуляция хемотаксиса Т-клеток • Циркуляция крови • хемотаксис • положительная регуляция хемотаксиса лейкоцитов • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • ответ на липополисахарид • отрицательная регуляция слияния миобластов • защитный ответ на вирус • регулирование пролиферации клеток • иммунная реакция • положительное регулирование пролиферации клеток • ответ на слуховой раздражитель • отрицательная регуляция ангиогенеза • реакция на холод • клеточный ответ на липополисахарид • реакция на гамма-излучение • положительная регуляция миграции Т-клеток • преобразование сигнала • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция активности протеинкиназы • ответ защиты • воспалительная реакция • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • цитокин-опосредованный сигнальный путь • Путь передачи сигналов рецептора, активирующего аденилатциклазу, сопряженного с G-белком • реакция на бактерии • хемотаксис нейтрофилов • хемотаксис лейкоцитов • положительный хемотаксис • регуляция апоптотического процесса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3627	15945
Ансамбль	ENSG00000169245	ENSMUSG00000034855
UniProt	P02778	P17515
RefSeq (мРНК)	NM_001565	NM_021274
RefSeq (белок)	NP_001556	NP_067249
Расположение (UCSC)	Chr 4: 76.02 - 76.02 Мб	Chr 5: 92.35 - 92.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хемокиновый лиганд с мотивом C-X-C 10 (CXCL10), также известный как Интерферон гамма-индуцированный белок 10 (IP-10) или малоиндуцибельный цитокин B10 составляет 8,7 кДа белок что у людей кодируется CXCL10 ген.^[5][6] Хемокин 10 с мотивом C-X-C представляет собой небольшой цитокин принадлежащий CXC хемокин семья.

Ген

Ген CXCL10 находится у человека. хромосома 4 в кластере среди нескольких других хемокинов CXC.^[7]

Функция

CXCL10 секретируется несколькими типами клеток в ответ на IFN-γ. Эти типы клеток включают моноциты, эндотелиальные клетки и фибробласты.^[5] CXCL10 приписывают несколько ролей, таких как химиоаттракция для моноциты /макрофаги, Т-клетки, NK-клетки, и дендритные клетки, продвижение Т-клетка прилипание к эндотелиальные клетки, противоопухолевое действие и ингибирование Костный мозг образование колонии и ангиогенез.^[8][9]

Этот хемокин проявляет свои эффекты, связываясь с поверхностью клетки. хемокиновый рецептор CXCR3.^[10]

Структура

Трехмерная кристаллическая структура этого хемокина была определена в 3 различных условиях с разрешением до 1,92 Å.^[11] В Банк данных белков коды доступа для структур CXCL10: 1лв9​, 1o7y, И 1o80​.

Биомаркеры

CXCL9, CXCL10 и CXCL11 оказались действительными биомаркерами для развития сердечной недостаточности и дисфункции левого желудочка, что указывает на патофизиологическую связь между уровнями этих хемокинов и развитием неблагоприятного ремоделирования сердца.^[12][13]

Клиническое значение

Базовые уровни CXCL10 в плазме до лечения повышены у пациентов, хронически инфицированных вирусом гепатита С (HCV) генотипов 1 или 4, у которых не достигается устойчивый вирусный ответ (УВО) после завершения противовирусной терапии.^[14][15] CXCL10 в плазме зеркально отражается внутрипеченочной мРНК CXCL10, и оба поразительно предсказывают первые дни элиминации РНК HCV («снижение первой фазы») во время терапии интерфероном / рибавирином для всех генотипов HCV.^[16] Это также относится к пациентам с коинфекцией ВИЧ, у которых уровни IP-10 перед лечением ниже 150 пг / мл позволяют прогнозировать благоприятный ответ и, таким образом, могут быть полезны для поощрения этих трудно поддающихся лечению пациентов к началу терапии.^[17] Возбудитель Лейшмания основной использует протеазу GP63, которая расщепляет CXCL10, вовлекая CXCL10 в механизмы защиты хозяина от некоторых внутриклеточных патогенов, таких как Лейшмания.^[18]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000169245 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034855 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Блеск AD, Unkeless JC, Ravetch JV (1985). «Гамма-интерферон транскрипционно регулирует ген раннего ответа, содержащий гомологию с белками тромбоцитов». Природа. 315 (6021): 672–6. Дои:10.1038 / 315672a0. PMID  3925348. S2CID  4358066.
6. Lustre AD, Jhanwar SC, Chaganti RS, Kersey JH, Ravetch JV (май 1987 г.). «Интерферон-индуцируемый ген отображается на хромосомную полосу, связанную с (4; 11) транслокацией в клетках острого лейкоза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 84 (9): 2868–71. Дои:10.1073 / пнас.84.9.2868. ЧВК  304761. PMID  2437586.
7. О'Донован Н., Гэлвин М., Морган Дж. Г. (1999). «Физическое картирование хемокинового локуса CXC на хромосоме 4 человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 84 (1–2): 39–42. Дои:10.1159/000015209. PMID  10343098. S2CID  8087808.
8. Dufour JH, Dziejman M, Liu MT, Leung JH, Lane TE, Lustre AD (апрель 2002 г.). «Мыши с дефицитом IFN-гамма-индуцируемого белка 10 (IP-10; CXCL10) обнаруживают роль IP-10 в генерации и транспортировке эффекторных Т-клеток». Журнал иммунологии. 168 (7): 3195–204. Дои:10.4049 / jimmunol.168.7.3195. PMID  11907072.
9. Ангиолилло А.Л., Сгадари С., Тауб Д.Д., Ляо Ф., Фарбер Дж. М., Махешвари С. и др. (Июль 1995 г.). «Человеческий интерферон-индуцируемый белок 10 является мощным ингибитором ангиогенеза in vivo». Журнал экспериментальной медицины. 182 (1): 155–62. Дои:10.1084 / jem.182.1.155. ЧВК  2192108. PMID  7540647.
10. Стенд V, Кайзер Д.В., Кампхуис М.Б., Кларк-Льюис И., Сайкс Б.Д. (август 2002 г.). «CXCR3-связывающий хемокин IP-10 / CXCL10: структура и рецепторные взаимодействия». Биохимия. 41 (33): 10418–25. Дои:10.1021 / bi026020q. PMID  12173928.
11. Swaminathan GJ, Holloway DE, Colvin RA, Campanella GK, Papageorgiou AC, Lustre AD, Acharya KR (май 2003 г.). «Кристаллические структуры олигомерных форм хемокина IP-10 / CXCL10». Структура. 11 (5): 521–32. Дои:10.1016 / S0969-2126 (03) 00070-4. PMID  12737818.
12. Алтара Р., Гу Ю.М., Струйкер-Будье Х.А., Тийс Л., Стэссен Я.А., Бланкестейн В.М. (2015). «Дисфункция левого желудочка и лиганды CXCR3 при гипертонии: от экспериментов на животных к пилотному исследованию на популяционном уровне». PLOS ONE. 10 (10): e0141394. Дои:10.1371 / journal.pone.0141394. ЧВК  4624781. PMID  26506526.
13. Altara R, Manca M, Hessel MH, Gu Y, van Vark LC, Akkerhuis KM и др. (Август 2016 г.). «CXCL10 - это циркулирующий воспалительный маркер у пациентов с тяжелой сердечной недостаточностью: пилотное исследование». Журнал кардиоваскулярных трансляционных исследований. 9 (4): 302–14. Дои:10.1007 / s12265-016-9703-3. PMID  27271043. S2CID  41188765.
14. Romero AI, Lagging M, Westin J, Dhillon AP, Dustin LB, Pawlotsky JM и др. (Октябрь 2006 г.). «Интерферон (ИФН) -индуцируемый гамма-белок-10: связь с гистологическими результатами, вирусной кинетикой и исходом во время лечения пегилированным IFN-альфа 2a и рибавирином при хронической инфекции вируса гепатита С». Журнал инфекционных болезней. 194 (7): 895–903. Дои:10.1086/507307. PMID  16960776.
15. Lagging M, Romero AI, Westin J, Norkrans G, Dhillon AP, Pawlotsky JM и др. (Декабрь 2006 г.). «IP-10 предсказывает вирусный ответ и терапевтический результат у трудно поддающихся лечению пациентов с инфекцией HCV генотипа 1». Гепатология. 44 (6): 1617–25. Дои:10.1002 / hep.21407. PMID  17133471. S2CID  27733803.
16. Askarieh G, Alsiö A, Pugnale P, Negro F, Ferrari C, Neumann AU и др. (Май 2010 г.). «Системный и внутрипеченочный интерферон-гамма-индуцируемый белок 10 кДа прогнозирует снижение первой фазы РНК вируса гепатита С и общий вирусный ответ на терапию при хроническом гепатите С». Гепатология. 51 (5): 1523–30. Дои:10.1002 / hep.23509. PMID  20186843. S2CID  205873437.
17. Falconer K, Askarieh G, Weis N, Hellstrand K, Alaeus A, Lagging M (декабрь 2010 г.). «IP-10 предсказывает первую фазу снижения РНК ВГС и общий вирусный ответ на терапию у пациентов, коинфицированных хронической вирусной инфекцией гепатита С и ВИЧ». Скандинавский журнал инфекционных болезней. 42 (11–12): 896–901. Дои:10.3109/00365548.2010.498019. PMID  20608766. S2CID  28542340.
18. Антония А.Л., Гиббс К.Д., Трахейр Э.Д., Питтман К.Дж., Мартин А.Т., Шотт Б.Х. и др. (2019). «Уклонение патогена от ответа на хемокин посредством подавления CXCL10». Границы клеточной и инфекционной микробиологии. 9: 280. Дои:10.3389 / fcimb.2019.00280. ЧВК  6693555. PMID  31440475.

внешняя ссылка

• Человек C7 расположение генома и C7 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Человек CXCL10 расположение генома и CXCL10 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P02778 (Хемокин 10 с мотивом C-X-C) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Фарбер Дж. М. (март 1997 г.). «Mig и IP-10: хемокины CXC, нацеленные на лимфоциты». Журнал биологии лейкоцитов. 61 (3): 246–57. Дои:10.1002 / jlb.61.3.246. PMID  9060447. S2CID  14935171.
• Невилл Л.Ф., Матьяк Г., Багасра О. (сентябрь 1997 г.). «Иммунобиология интерферон-гамма-индуцируемого белка 10 кДа (IP-10): нового плейотропного члена суперсемейства хемокинов C-X-C». Отзывы о цитокинах и факторах роста. 8 (3): 207–19. Дои:10.1016 / S1359-6101 (97) 00015-4. PMID  9462486.