CX3CL1 - CX3CL1

CX3CL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3
Идентификаторы
Псевдонимы	CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, фракталкин, нейротактин, хемокиновый лиганд 1 с мотивом C-X3-C
Внешние идентификаторы	OMIM: 601880 MGI: 1097153 ГомолоГен: 2251 Генные карты: CX3CL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q21 Начинать 57,372,477 бп[1] Конец 57,385,044 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 C5 | 8 46,79 см Начинать 94,772,009 бп[2] Конец 94,782,427 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • хемокиновая активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с хемокиновым рецептором CCR • рецепторное связывание • связывание интегрина • Связывание с хемокиновым рецептором CX3C Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточная область • поверхность клетки • внеклеточный Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • ответ защиты • положительная регуляция воспалительного ответа • хемотаксис моноцитов • цитокин-опосредованный сигнальный путь • хемокин-опосредованный сигнальный путь • ангиогенез, участвующий в заживлении ран • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • лечение раны • хемотаксис лейкоцитов • хемотаксис нейтрофилов • положительная регуляция ангиогенеза • положительное регулирование производства трансформирующего фактора роста бета1 • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточная адгезия • иммунная реакция • клеточный ответ на интерлейкин-1 • активация адгезива лейкоцитов • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на гамма-интерферон • хемотаксис клеток • хемотаксис лимфоцитов • отрицательная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути в отсутствие лиганда • положительная регуляция кальций-независимой межклеточной адгезии • хемотаксис • активация интегрина • отрицательное регулирование миграции клеток • миграция лейкоцитов, участвующая в воспалительной реакции • хемотаксис макрофагов • регуляция рецепторной активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6376	20312
Ансамбль	ENSG00000006210	ENSMUSG00000031778
UniProt	P78423	O35188
RefSeq (мРНК)	NM_002996 NM_001304392	NM_009142
RefSeq (белок)	NP_001291321 NP_002987	NP_033168
Расположение (UCSC)	Chr 16: 57.37 - 57.39 Мб	Chr 8: 94,77 - 94,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фракталкин также известный как хемокин (мотив C-X3-C) лиганд 1 это белок что у человека кодируется CX3CL1 ген.

Функция

Фракталкин - большой цитокин белок из 373 аминокислот, он содержит несколько доменов и является единственным известным членом CX₃C хемокин семья. Он также широко известен под названиями фракталкин (у людей) и нейротактин (у мышей).^[5][6] Структура полипептида CX3CL1 отличается от типичной структуры других хемокинов. Например, интервал характеристики N-концевой цистеины отличается; есть три аминокислоты разделяя исходную пару цистеинов в CX3CL1, ни одного в CC хемокины и только одна промежуточная аминокислота в Хемокины CXC. CX3CL1 продуцируется как длинный белок (у человека из 373 аминокислот) с удлиненным муцин -подобный стебель и хемокиновый домен сверху. Муциноподобный стебель позволяет ему связываться с поверхностью определенных клеток. Однако также наблюдалась растворимая (90 кДа) версия этого хемокина. Растворимый CX3CL1 обладает сильным хемоаттрактным действием Т-клетки и моноциты, в то время как связанный с клетками хемокин способствует прочной адгезии лейкоцитов к активированным эндотелиальным клеткам, где он в первую очередь экспрессируется.^[6] CX3CL1 вызывает свои адгезивные и миграционные функции, взаимодействуя с рецептором хемокинов. CX3CR1.^[7] Его ген расположен у человека хромосома 16 вместе с некоторыми хемокинами CC, известными как CCL17 и CCL22.^[6][8]

Фракталкин обычно обнаруживается по всему мозгу, особенно в нервных клетках, и его рецептор, как известно, присутствует на клетках микроглии. Также было обнаружено, что он необходим для миграции клеток микроглии.^[9] CX3CL1 также активируется в гиппокамп в течение короткого временного окна после пространственное обучение, целью которых может быть регулирование опосредованного глутаматом тонуса нейротрансмиссии. Это указывает на возможную роль хемокина в процессе защитной пластичности синаптическое масштабирование.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000006210 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031778 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пан Й., Ллойд С., Чжоу Х., Долич С., Дидс Дж., Гонсало Дж. А., Ват Дж, Госселин М., Ма Дж., Дюссо Б., Вульф Е., Альперин Дж., Калпеппер Дж., Гутьеррес-Рамос Дж. К., Gearing D (1997). «Нейротактин, заякоренный в мембране хемокин, активируемый при воспалении мозга». Природа. 387 (6633): 611–617. Дои:10.1038/42491. PMID  9177350. S2CID  4307876.
6. Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Дж., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа. 385 (6617): 640–644. Дои:10.1038 / 385640a0. PMID  9024663. S2CID  4322166.
7. Имаи Т., Хиэшима К., Хаскелл С., Баба М., Нагира М., Нисимура М., Какизаки М., Такаги С., Номияма Х, Шалл Т. Дж., Йоши О. (1997). «Идентификация и молекулярная характеристика фракталкинового рецептора CX3CR1, который опосредует миграцию и адгезию лейкоцитов». Клетка. 91 (4): 521–530. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80438-9. PMID  9390561. S2CID  17281691.
8. Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж., Миура Р., Каллен Д.Ф., Йоши О. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–11. Дои:10.1159/000015000. PMID  9691168. S2CID  46851784.
9. Maciejewski-Lenoir, D .; Chen, S .; Feng, L .; Maki, R .; Бэкон, К. Б. (1999-08-01). «Характеристика фракталкина в клетках мозга крыс: миграционные и активационные сигналы для микроглии, экспрессирующей CX3CR-1». Журнал иммунологии. 163 (3): 1628–1635. ISSN  0022-1767. PMID  10415068.
10. Шеридан Г.К., Вдович А., Пикеринг М., Уоттерс О., Халли П., О'Салливан Н.К., Муни С., О'Коннелл Д.Дж., О'Коннор Д.Дж., Мерфи К.Дж. (2014). «CX3CL1 активируется в гиппокампе крыс во время связанной с памятью синаптической пластичности». Front Cell Neurosci. 8: 233. Дои:10.3389 / fncel.2014.00233. ЧВК  4130185. PMID  25161610.

внешняя ссылка

• Человек CX3CL1 расположение генома и CX3CL1 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Базан Дж. Ф., Бэкон К. Б., Хардиман Дж., Ван В., Су К., Росси Д., Гривз Д. Р., Злотник А., Шалл Т. Дж. (1997). «Новый класс мембраносвязанных хемокинов с мотивом CX3C». Природа. 385 (6617): 640–4. Дои:10.1038 / 385640a0. PMID  9024663. S2CID  4322166.
• Combadiere C, Salzwedel K, Smith ED, Tiffany HL, Berger EA, Murphy PM (1998). «Идентификация CX3CR1. Хемотаксический рецептор фракталкина хемокина CX3C человека и корецептор слияния для ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 273 (37): 23799–804. Дои:10.1074 / jbc.273.37.23799. PMID  9726990.
• Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Бушелл Т.Дж., Грей П.В., Миллер Р.Дж. (1998). «Хемокины регулируют нейрональную передачу сигналов в гиппокампе и нейротоксичность gp120». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (24): 14500–5. Дои:10.1073 / пнас.95.24.14500. ЧВК  24402. PMID  9826729.
• Mizoue LS, Bazan JF, Johnson EC, Handel TM (1999). «Структура раствора и динамика хемокинового домена CX3C фракталкина и его взаимодействие с N-концевым фрагментом CX3CR1». Биохимия. 38 (5): 1402–14. Дои:10.1021 / bi9820614. PMID  9931005.
• Пападопулос Э.Дж., Сассетти К., Саеки Х., Ямада Н., Кавамура Т., Фитцхью Д.Д., Сараф М.А., Шалл Т., Блаувельт А., Розен С.Д., Хванг ST (1999). «Фракталкин, хемокин CX3C, экспрессируется дендритными клетками и активируется при созревании дендритных клеток». Евро. J. Immunol. 29 (8): 2551–9. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199908) 29:08 <2551 :: AID-IMMU2551> 3.0.CO; 2-T. PMID  10458770.
• Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П., Калуш Ф., Брэндон Р., Фурманн Дж., Мейсон Т., Кросби М.Л., Барнстед М., Кронин Л., Деслаттес Мейс А., Цао Y, Сюй RX, Канг Х.Л., Митчелл С., Эйхлер Э. ПК, Вентер Дж. К., Адамс Мэриленд (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID  10493829.
• Тонг Н., Перри С.В., Чжан К., Джеймс Х.Дж., Го Х., Брукс А., Бал Х., Киннер С.А., Файн С., Эпштейн Л.Г., Дайраги Д., Шалл Т.Дж., Гендельман Х.Э., Дьюхерст С., Акционер Л.Р., Гелбард Х.А. (2000) . «Экспрессия нейронального фракталкина при энцефалите ВИЧ-1: роль в рекрутировании макрофагов и нейропротекции в центральной нервной системе». J. Immunol. 164 (3): 1333–9. Дои:10.4049 / jimmunol.164.3.1333. PMID  10640747. S2CID  20616076.
• Фор С., Мейер Л., Костальола Д., Ваненсберг С., Генин Э, Отран Б., Дельфрэсси Дж. Ф., Макдермотт Д. Х., Мерфи П. М., Дебре П., Теодору И., Комбадьер С. (2000). «Быстрое развитие СПИДа у ВИЧ + людей со структурным вариантом хемокинового рецептора CX3CR1». Наука. 287 (5461): 2274–7. Дои:10.1126 / science.287.5461.2274. PMID  10731151.
• Гувер Д.М., Мизуэ Л.С., Гендель Т.М., Любковски Дж. (2000). «Кристаллическая структура хемокинового домена фракталкина демонстрирует новое четвертичное расположение». J. Biol. Chem. 275 (30): 23187–93. Дои:10.1074 / jbc.M002584200. PMID  10770945. S2CID  38835823.
• Меуччи О., Фататис А., Симен А.А., Миллер Р.Дж. (2000). «Экспрессия хемокиновых рецепторов CX3CR1 на нейронах и их роль в выживании нейронов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (14): 8075–80. Дои:10.1073 / pnas.090017497. ЧВК  16672. PMID  10869418.
• Пападопулос Э.Дж., Фитцхью Д.Д., Ткачик С., Гилфиллан А.М., Сассетти С., Меткалф Д.Д., Хванг ST (2000). «Тучные клетки мигрируют, но не дегранулируют в ответ на фракталкин, связанный с мембраной хемокин, конститутивно экспрессируемый в различных клетках кожи». Евро. J. Immunol. 30 (8): 2355–61. Дои:10.1002 / 1521-4141 (2000) 30: 8 <2355 :: AID-IMMU2355> 3.0.CO; 2- #. PMID  10940926.
• Лукас А.Д., Чедвик Н., Уоррен Б.Ф., Джуэлл Д.П., Гордон С., Паури Ф., Гривз Д.Р. (2001). «Трансмембранная форма фракталкина хемокина CX3CL1 экспрессируется преимущественно эпителиальными клетками in vivo». Являюсь. Дж. Патол. 158 (3): 855–66. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 64034-5. ЧВК  1850344. PMID  11238035.
• Гартон К.Дж., Гоф П.Дж., Блобель С.П., Мерфи Дж., Гривз Д.Р., Демпси П.Дж., Рейнс Е.В. (2001). «Фермент, превращающий альфа-фактор некроза опухоли (ADAM17), опосредует расщепление и выделение фракталкина (CX3CL1)». J. Biol. Chem. 276 (41): 37993–8001. Дои:10.1074 / jbc.M106434200. PMID  11495925.
• Умехара Х., Блум Э.Т., Окадзаки Т., Нагано Й., Йоши О, Имаи Т. (2004). «Фракталкин в биологии сосудов: от фундаментальных исследований к клиническому заболеванию». Артериосклер. Тромб. Васк. Биол. 24 (1): 34–40. Дои:10.1161 / 01.ATV.0000095360.62479.1F. PMID  12969992. S2CID  6183022.
• Умэхара Х, Танака М, Саваки Т, Джин З. X, Хуанг Ч. Р., Донг Л, Каванами Т, Карасава Х, Масаки И, Фукусима Т, Хиросе Й, Окадзаки Т (2006). «Фракталкин при ревматоидном артрите и родственных ему состояниях». Мод Ревматол. 16 (3): 124–30. Дои:10.1007 / s10165-006-0471-9. PMID  16767549. S2CID  10199059.