IFNK - IFNK

IFNK
Идентификаторы
Псевдонимы	IFNK, IFNT1, INFE1, интерферон каппа
Внешние идентификаторы	OMIM: 615326 MGI: 2683287 ГомолоГен: 36384 Генные карты: IFNK
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п21.2 Начинать 27,524,314 бп[1] Конец 27,526,498 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A5 Начинать 35,152,056 бп[2] Конец 35,154,005 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • связывание рецептора интерферона типа I • связывание цитокиновых рецепторов Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • активация естественных клеток-киллеров, участвующих в иммунном ответе • Дифференцировка В-клеток • ответ защиты • ответ на вирус • активация естественных клеток-киллеров • Пролиферация В-клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • гуморальный иммунный ответ • адаптивный иммунный ответ • положительное регулирование фосфорилирования пептидил-серина белка STAT • защитный ответ на вирус • ответ на экзогенную дцРНК • отрицательное регулирование пролиферации клеток • цитокин-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция врожденного иммунного ответа • Активация Т-клеток, участвующих в иммунном ответе • регуляция рецепторной активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	56832	387510
Ансамбль	ENSG00000147896	ENSMUSG00000042993
UniProt	Q9P0W0	Q7TSL0
RefSeq (мРНК)	NM_020124	NM_199157
RefSeq (белок)	NP_064509	NP_954608
Расположение (UCSC)	Chr 9: 27,52 - 27,53 Мб	Chr 4: 35.15 - 35.15 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Интерферон каппа, также известный как IFN-каппа, это белок что у людей кодируется IFNK ген.^[5][6][7]

Функция

IFN-каппа является представителем I типа интерферон семья. Интерфероны типа I представляют собой группу родственных гликопротеинов, которые играют важную роль в защите хозяина от вирусных инфекций. Этот белок выражается в кератиноциты и ген находится на хромосоме 9, рядом с кластером интерферона типа I.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147896 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042993 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Джин: интерферон».
6. Лафлер Д.В., Нарделли Б., Царева Т., Мазер Д., Фенг П., Семенюк М., Тейлор К., Бюргин М., Шиншилла Д., Рошке В., Чен Г., Рубен С.М., Пита П.М., Коулман Т.А., Мур П.А. (октябрь 2001 г.). «Интерферон-каппа, новый интерферон типа I, экспрессируемый в кератиноцитах человека». J. Biol. Chem. 276 (43): 39765–71. Дои:10.1074 / jbc.M102502200. PMID  11514542.
7. Нарделли Б., Зарицкая Л., Семенюк М., Чо Ю. Х., Лафлер Д. В., Шах Д., Ульрих С., Джироломони Г., Альбанези С., Мур П. А. (ноябрь 2002 г.). «Регулирующий эффект IFN-kappa, нового IFN типа I, на продукцию цитокинов клетками врожденной иммунной системы». J. Immunol. 169 (9): 4822–30. Дои:10.4049 / jimmunol.169.9.4822. PMID  12391192.

3. Противовирусная активность временно экспрессируемого IFN-каппа является клеточно-ассоциированной. Буонтемпо, П.Дж., Джубин, Р.Г., Буонтемпо, К.А., Вагнер, Н.Э., Рейес, Г.Р., Баруди, Б.М. J. Interferon Cytokine Res. (2006) [Pubmed]

дальнейшее чтение

• Лю Ч., Батливалла Ф., Ли В. и др. (2008). «Полногеномное ассоциативное сканирование выявляет кандидатные полиморфизмы, связанные с дифференциальным ответом на лечение анти-TNF при ревматоидном артрите». Мол. Med. 14 (9–10): 575–81. Дои:10.2119 / 2008-00056.Liu. ЧВК  2443997. PMID  18615156.
• ДеКарло К.А., Северини А., Эдлер Л. и др. (2010). «IFN-º, новый IFN типа I, не обнаруживается в ВПЧ-положительных кератиноцитах шейки матки человека». Лаборатория. Вкладывать деньги. 90 (10): 1482–91. Дои:10.1038 / labinvest.2010.95. PMID  20479716.
• Сильва Л.К., Блэнтон Р.Э., Паррадо А.Р. и др. (2010). «Геморрагическая лихорадка денге связана с полиморфизмом в JAK1». Евро. J. Hum. Genet. 18 (11): 1221–7. Дои:10.1038 / ejhg.2010.98. ЧВК  2950898. PMID  20588308.
• Ян XR, Liang X, Pfeiffer RM и др. (2010). «Ассоциации вариантов 9p21 с фенотипами кожной злокачественной меланомы, невусов и пигментации в семьях, подверженных меланоме, с мутациями CDKN2A и без них». Fam. Рак. 9 (4): 625–33. Дои:10.1007 / s10689-010-9356-3. ЧВК  3233727. PMID  20574843.
• Феррейра Р.К., Пан-Хаммарстрём К., Грэм Р.Р. и др. (2010). «Ассоциация IFIH1 и других аллелей риска аутоиммунитета с селективным дефицитом IgA». Nat. Genet. 42 (9): 777–80. Дои:10,1038 / нг.644. PMID  20694011. S2CID  205356843.
• Лааксовирта Х., Пеуралинна Т., Шимик Дж. С. и др. (2010). «Хромосома 9p21 при боковом амиотрофическом склерозе в Финляндии: исследование ассоциации на уровне всего генома». Ланцет Нейрол. 9 (10): 978–85. Дои:10.1016 / S1474-4422 (10) 70184-8. ЧВК  2965392. PMID  20801718.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Ринкон-Ороско Б., Халек Г., Розенбергер С. и др. (2009). «Эпигенетическое подавление интерферона-каппа в клетках, положительных по вирусу папилломы человека 16». Рак Res. 69 (22): 8718–25. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-0550. PMID  19887612.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2004). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• ван Эс М.А., Велдинк Дж. Х., Сарис К. Г. и др. (2009). «Полногеномное исследование ассоциации определяет 19p13.3 (UNC13A) и 9p21.2 как локусы восприимчивости к спорадическому боковому амиотрофическому склерозу». Nat. Genet. 41 (10): 1083–7. Дои:10,1038 / нг.442. PMID  19734901. S2CID  8659710.
• Harley IT, Niewold TB, Stormont RM и др. (2010). «Роль генетической изменчивости около интерферона-каппа при системной красной волчанке». J. Biomed. Биотехнология. 2010: 1–11. Дои:10.1155/2010/706825. ЧВК  2914299. PMID  20706608.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.