CCL21 - CCL21 - Wikipedia

CCL21
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2L4N
Идентификаторы
Псевдонимы	CCL21, 6Ckine, CKb9, ECL, SCYA21, SLC, TCA4, хемокиновый лиганд 21 с мотивом C-C
Внешние идентификаторы	OMIM: 602737 MGI: 1349183 ГомолоГен: 2247 Генные карты: CCL21
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п13.3 Начинать 34,709,005 бп[1] Конец 34,710,136 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 A5 | 4 22,81 см Начинать 42,772,860 бп[2] Конец 42,773,993 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • связывание хемокиновых рецепторов • Связывание с хемокиновым рецептором CCR7 • хемокиновая активность • Связывание с хемокиновым рецептором CCR • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • отрицательная регуляция связывания или скатывания лейкоцитов • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль • положительная регуляция рецепторно-опосредованного эндоцитоза • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция подвижности клеток • положительное регулирование полимеризации актиновых филаментов • хемотаксис моноцитов • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 активация активности GTPase • взъерошенная организация • положительное регулирование адгезии клеточного матрикса • хемокин-опосредованный сигнальный путь • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • передача сигналов от клетки к клетке • Костимуляция Т-клеток • созревание клеток • положительное регулирование каскада JNK • хемотаксис дендритных клеток • отрицательная регуляция сборки дендритов дендритных клеток • положительная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы • хемотаксис • ответ на простагландин E • положительное регулирование процессинга и презентации антигенов дендритными клетками • дендритная сборка дендритных клеток • положительная регуляция сборки псевдоподия • адгезия мезангиальной клетки к матрице • положительная регуляция хемотаксиса • клеточный ответ на интерлейкин-1 • иммунная реакция • установление полярности Т-клеток • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • положительная регуляция процесса биосинтеза гликопротеинов • клеточный ответ на гамма-интерферон • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • хемотаксис клеток • хемотаксис лимфоцитов • положительная регуляция хемотаксиса нейтрофилов • положительная регуляция клеточной адгезии, опосредованная интегрином • формирование иммунологического синапса • положительное регулирование сборки филоподия • положительная регуляция миграции Т-клеток • положительная регуляция хемотаксиса миелоидных дендритных клеток • положительная регуляция активности протеинкиназы • воспалительная реакция • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • отрицательная регуляция процесса апоптоза дендритных клеток • положительная регуляция хемотаксиса Т-клеток • хемотаксис нейтрофилов • хемокин (мотив C-C) лиганд 21 сигнальный путь • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточный ответ на хемокин Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6366	18829
Ансамбль	ENSG00000137077	ENSMUSG00000094686
UniProt	O00585	P84444
RefSeq (мРНК)	NM_002989	NM_011124
RefSeq (белок)	NP_002980	NP_001180596 NP_035254
Расположение (UCSC)	Chr 9: 34.71 - 34.71 Мб	Chr 4: 42.77 - 42.77 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хемокин (мотив C-C) лиганд 21 (CCL21) небольшой цитокин принадлежащий ЦК хемокин семья. Этот хемокин также известен как 6Ckine (потому что у него шесть консервативных цистеин остатков вместо четырех цистеинов, типичных для хемокинов), исход-2 и вторичный хемокин лимфоидной ткани (SLC).^[5][6][7] В ген для CCL21 находится на человеческом хромосома 9. CCL21 проявляет свои эффекты, связываясь с поверхностью клетки. хемокиновый рецептор известный как CCR7.^[8]

В лимфатических узлах человека фибробластные ретикулярные клетки (FRC) экспрессируют CCL21 в качестве хемоаттрактанта, направляющего наивные, экспрессирующие CCR7 Т-клетки в зону Т-клеток.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000137077 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000094686 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хедрик Дж. А., Злотник А. (август 1997 г.). «Идентификация и характеристика нового бета-хемокина, содержащего шесть консервативных цистеинов». Журнал иммунологии. 159 (4): 1589–93. PMID  9257816.
6. Hromas R, Kim CH, Klemsz M, Krathwohl M, Fife K, Cooper S, Schnizlein-Bick C, Broxmeyer HE (сентябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика Exodus-2, нового хемокина C-C с уникальным удлинением карбоксильного конца из 37 аминокислот». Журнал иммунологии. 159 (6): 2554–8. PMID  9300671.
7. Нагира М., Имаи Т., Хиешима К., Кусуда Дж., Риданпяя М., Такаги С., Нисимура М., Какизаки М., Номияма Х., Йоши О. (август 1997 г.). «Молекулярное клонирование нового хемокина вторичного лимфоидного тканевого хемокина человека CC, который является мощным хемоаттрактантом для лимфоцитов и отображается на хромосоме 9p13». Журнал биологической химии. 272 (31): 19518–24. Дои:10.1074 / jbc.272.31.19518. PMID  9235955.
8. Ёсида Р., Нагира М., Китаура М., Имагава Н., Имаи Т., Ёси О (март 1998 г.). «Вторичный хемокин лимфоидной ткани является функциональным лигандом для хемокинового рецептора СС CCR7». Журнал биологической химии. 273 (12): 7118–22. Дои:10.1074 / jbc.273.12.7118. PMID  9507024.
9. Мюллер С.Н., Жермен Р.Н. (сентябрь 2009 г.). «Вклад стромальных клеток в гомеостаз и функциональность иммунной системы». Обзоры природы. Иммунология. 9 (9): 618–29. Дои:10.1038 / nri2588. ЧВК  2785037. PMID  19644499.

внешняя ссылка

• Человек CCL21 расположение генома и CCL21 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Нагира М., Имаи Т., Хиешима К., Кусуда Дж., Риданпяя М., Такаги С., Нисимура М., Какизаки М., Номияма Х., Йоши О. (август 1997 г.). «Молекулярное клонирование нового хемокина вторичного лимфоидного тканевого хемокина человека CC, который является мощным хемоаттрактантом для лимфоцитов и отображается на хромосоме 9p13». Журнал биологической химии. 272 (31): 19518–24. Дои:10.1074 / jbc.272.31.19518. PMID  9235955.
• Хедрик Дж. А., Злотник А. (август 1997 г.). «Идентификация и характеристика нового бета-хемокина, содержащего шесть консервативных цистеинов». Журнал иммунологии. 159 (4): 1589–93. PMID  9257816.
• Hromas R, Kim CH, Klemsz M, Krathwohl M, Fife K, Cooper S, Schnizlein-Bick C, Broxmeyer HE (сентябрь 1997 г.). «Выделение и характеристика Exodus-2, нового хемокина C-C с уникальным карбоксильным удлинением из 37 аминокислот». Журнал иммунологии. 159 (6): 2554–8. PMID  9300671.
• Gunn MD, Tangemann K, Tam C, Cyster JG, Rosen SD, Williams LT (январь 1998 г.). «Хемокин, экспрессируемый в лимфоидных венулах с высоким эндотелием, способствует адгезии и хемотаксису наивных Т-лимфоцитов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (1): 258–63. Дои:10.1073 / пнас.95.1.258. ЧВК  18193. PMID  9419363.
• Ёсида Р., Нагира М., Китаура М., Имагава Н., Имаи Т., Ёси О (март 1998 г.). «Вторичный хемокин лимфоидной ткани является функциональным лигандом для CC-хемокинового рецептора CCR7». Журнал биологической химии. 273 (12): 7118–22. Дои:10.1074 / jbc.273.12.7118. PMID  9507024.
• Кэмпбелл Дж. Дж., Боуман Е. П., Мерфи К., Янгман К. Р., Сиани М. А., Томпсон Д. А., Ву Л., Злотник А., Мясник ЕС (май 1998 г.). «6-C-кин (SLC), хемокин, запускающий адгезию лимфоцитов, экспрессируемый высоким эндотелием, является агонистом рецептора MIP-3beta CCR7». Журнал клеточной биологии. 141 (4): 1053–9. Дои:10.1083 / jcb.141.4.1053. ЧВК  2132769. PMID  9585422.
• Jenh CH, Cox MA, Kaminski H, Zhang M, Byrnes H, Fine J, Lundell D, Chou CC, Narula SK, Zavodny PJ (апрель 1999 г.). «Передний край: видовая специфичность передачи сигналов CC-хемокина 6Ckine через хемокиновый рецептор CXC CXCR3: человеческий 6Ckine не является лигандом для рецепторов CXCR3 человека или мыши». Журнал иммунологии. 162 (7): 3765–9. PMID  10201891.
• Gosling J, Dairaghi DJ, Wang Y, Hanley M, Talbot D, Miao Z, Schall TJ (март 2000 г.). «Передний край: идентификация нового хемокинового рецептора, который связывает хемокины, активные для дендритных клеток и Т-клеток, включая ELC, SLC и TECK». Журнал иммунологии. 164 (6): 2851–6. Дои:10.4049 / jimmunol.164.6.2851. PMID  10706668.
• Аннунциато Ф., Романьани П., Косми Л., Белтрам С., Штайнер Б. Х., Лазцери Е., Рапорт С. Джей, Галли Дж., Манетти Р., Мавилия С., Ванини В., Чантри Д., Магги Е., Романьани С. (июль 2000 г.). «Хемокин, полученный из макрофагов, и хемокин с лигандом EBI1 привлекают тимоциты человека на разных стадиях развития и продуцируются различными подмножествами медуллярных эпителиальных клеток: возможные последствия для негативного отбора». Журнал иммунологии. 165 (1): 238–46. Дои:10.4049 / jimmunol.165.1.238. PMID  10861057.
• Хиросе Дж., Кавасима Х., Йоши О, Таширо К., Миясака М. (февраль 2001 г.). «Версикан взаимодействует с хемокинами и модулирует клеточные реакции». Журнал биологической химии. 276 (7): 5228–34. Дои:10.1074 / jbc.M007542200. PMID  11083865.
• Тиль К.Дж., Лин К., Зузель М., Коули Дж.С. (апрель 2002 г.). «Хемокиновый рецептор CCR7 и интегрин альфа4 важны для миграции клеток хронического лимфоцитарного лейкоза в лимфатические узлы». Кровь. 99 (8): 2977–84. Дои:10.1182 / кровь.V99.8.2977. PMID  11929789.
• Грант А.Дж., Годдард С., Ахмед-Чоудхури Дж., Рейнольдс Дж., Джексон Д.Г., Брискин М., Ву Л., Хюбшер С.Г., Адамс Д.Х. (апрель 2002 г.). «Печеночная экспрессия вторичного лимфоидного хемокина (CCL21) способствует развитию портальной лимфоидной ткани при хроническом воспалительном заболевании печени». Американский журнал патологии. 160 (4): 1445–55. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 62570-9. ЧВК  1867219. PMID  11943728.
• Банас Б., Вёрнле М., Бергер Т., Нельсон П.Дж., Коэн С.Д., Кретцлер М., Пфирстингер Дж., Мак М., Липп М., Грёне Х.Д., Шлёндорф Д. (май 2002 г.). «Роль SLC / CCL21 и CCR7 в почках человека для мезангиальной пролиферации, миграции, апоптоза и тканевого гомеостаза». Журнал иммунологии. 168 (9): 4301–7. Дои:10.4049 / jimmunol.168.9.4301. PMID  11970971.
• Кристоферсон К.В., Худ А.Ф., Трэверс Дж. Б., Рэмси Х., Хромас Р.А. (февраль 2003 г.). «Эндотелиальная индукция Т-клеточного хемокина CCL21 при Т-клеточных аутоиммунных заболеваниях». Кровь. 101 (3): 801–6. Дои:10.1182 / кровь-2002-05-1586. PMID  12393410.
• Штейн СП, Сориано С.Ф., М'рини С., Номбела-Арриета С., де Буитраго Г.Г., Родригес-Фраде Дж. М., Мелладо М., Жирар Дж. П., Мартинес-А. С. (январь 2003 г.). «CCR7-опосредованный физиологический хоминг лимфоцитов включает активацию пути тирозинкиназы». Кровь. 101 (1): 38–44. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0841. PMID  12393730.
• Вольф М., Кларк-Льюис I, Бури С., Ланген Х., Лис М., Маццучелли Л. (апрель 2003 г.). «Катепсин D специфически расщепляет хемокины макрофагальный воспалительный белок-1 альфа, макрофагальный воспалительный белок-1 бета и SLC, которые экспрессируются при раке груди человека». Американский журнал патологии. 162 (4): 1183–90. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63914-4. ЧВК  1851240. PMID  12651610.
• Weninger W, Carlsen HS, Goodarzi M, Moazed F, Crowley MA, Baekkevold ES, Cavanagh LL, von Andrian UH (май 2003 г.). «Наивное привлечение Т-клеток к нелимфоидным тканям: роль экспрессируемого эндотелием CC-хемокинового лиганда 21 в аутоиммунных заболеваниях и лимфоидном новообразовании». Журнал иммунологии. 170 (9): 4638–48. Дои:10.4049 / jimmunol.170.9.4638. PMID  12707342.
• Нагакубо Д., Мурай Т., Танака Т., Усуи Т., Мацумото М., Секигучи К., Миясака М. (июль 2003 г.). «Высокосекреторный белок эндотелиальной венулы, mac25 / ангиомодулин, взаимодействует с множеством молекул, связанных с венулой высокого эндотелия, включая хемокины». Журнал иммунологии. 171 (2): 553–61. Дои:10.4049 / jimmunol.171.2.553. PMID  12847218.