Лимфотоксин бета - Lymphotoxin beta

Информацию о продольном изгибе при кручении см. Изгиб § Боковое скручивание..

LTB
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4MXW
Идентификаторы
Псевдонимы	LTB, TNFC, TNFSF3, p33, лимфотоксин бета, TNLG1C
Внешние идентификаторы	OMIM: 600978 MGI: 104796 ГомолоГен: 1752 Генные карты: LTB
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6п21.33 Начинать 31,580,525 бп[1] Конец 31,582,522 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 B1 | 17 18,59 см Начинать 35,194,439 бп[2] Конец 35,196,320 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рецептора фактора некроза опухоли • цитокиновая активность • рецепторное связывание Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • клеточная мембрана • мембрана • внеклеточный • клеточный компонент Биологический процесс • передача сигналов от клетки к клетке • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • развитие лимфатических узлов • экспрессия гена • иммунная реакция • преобразование сигнала • развитие кожи • регуляция рецепторной активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4050	16994
Ансамбль	ENSG00000223448 ENSG00000238114 ENSG00000236925 ENSG00000231314 ENSG00000204487 ENSG00000236237 ENSG00000227507 ENSG00000206437	ENSMUSG00000024399
UniProt	Q06643	P41155
RefSeq (мРНК)	NM_009588 NM_002341	NM_008518
RefSeq (белок)	NP_002332 NP_033666	NP_032544
Расположение (UCSC)	Chr 6: 31,58 - 31,58 Мб	Chr 17: 35.19 - 35,2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лимфотоксин-бета (LT-beta), также известный как фактор некроза опухоли С (TNF-C) представляет собой белок что у людей кодируется LTB ген.^[5][6][7]

Функция

Лимфотоксин бета - это мембранный белок типа II Семья TNF. Это якорь лимфотоксин-альфа к поверхности клетки за счет образования гетеротримеров. Преобладающая форма на лимфоцит Поверхность представляет собой комплекс лимфотоксин-альфа 1 / бета 2 (например, 1 молекула альфа / 2 молекулы бета), и этот комплекс является первичным лигандом для рецептора лимфотоксина-бета. Минорным комплексом является лимфотоксин-альфа 2 / бета 1. LTB является индуктором системы воспалительного ответа и участвует в нормальном развитии лимфоидной ткани. Изоформа b лимфотоксина-бета неспособна образовывать комплекс с лимфотоксином-альфа, что указывает на то, что функция лимфотоксина-бета не зависит от лимфотоксина-альфа. Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

Точно установлена ​​про-туморогенная функция мембранных LT: у мышей со сверхэкспрессией LTα или LTβ наблюдался повышенный рост опухоли и метастазирование на нескольких моделях рака. Однако в этих исследованиях использовались мыши с полным дефицитом гена LTα, что не позволяло отличить эффекты растворимого LT от ассоциированного с мембраной LT.^[8]

Взаимодействия

LTB был показан взаимодействовать с Лимфотоксин альфа.^[9][10][11]

Рекомендации

1. ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000223448, ENSG00000238114, ENSG00000236925, ENSG00000231314, ENSG00000204487, ENSG00000236237, ENSG00000227507, ENSG00000206437 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024399 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Браунинг Дж. Л., Нгам-эк А., Лоутон П., ДеМаринис Дж., Тизард Р., Чоу Е. П., Хессион С, О'Брин-Греко Б., Фоли С.Ф., Уэр С.Ф. (март 1993 г.). «Лимфотоксин бета, новый член семейства TNF, который образует гетеромерный комплекс с лимфотоксином на поверхности клетки». Клетка. 72 (6): 847–56. Дои:10.1016 / 0092-8674 (93) 90574-А. PMID  7916655. S2CID  28961163.
6. Браунинг Дж. Л., Андролевич М. Дж., Уэр К. Ф. (август 1991 г.). «Лимфотоксин и связанный с ним гликопротеин 33 кДа экспрессируются на поверхности активированной гибридомы Т-клеток человека». Журнал иммунологии. 147 (4): 1230–7. PMID  1714477.
7. «Ген Entrez: бета-лимфотоксин LTB (надсемейство TNF, член 3)».
8. Корнеев, К.В. Атретханы, КН; Друцкая М.С. Гривенников, С.И. Купраш, ДВ; Недоспасов С.А. (январь 2017 г.). «TLR-сигнализация и провоспалительные цитокины как драйверы онкогенеза». Цитокин. 89: 127–135. Дои:10.1016 / j.cyto.2016.01.021. PMID  26854213.
9. Уильямс-Эбботт Л., Уолтер Б.Н., Чунг Т.С., Го С.Р., Портер АГ, Вэр С.Ф. (август 1997 г.). «Субъединица лимфотоксина-альфа (LTalpha) важна для сборки, но не для рецепторной специфичности, закрепленного на мембране гетеротримерного лиганда LTalpha1beta2». Журнал биологической химии. 272 (31): 19451–6. Дои:10.1074 / jbc.272.31.19451. PMID  9235946.
10. Browning JL, Sizing ID, Lawton P, Bourdon PR, Rennert PD, Majeau GR, Ambrose CM, Hession C, Miatkowski K, Griffiths DA, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin CD, Hochman PS (октябрь 1997 г.). «Характеристика комплексов лимфотоксин-альфа бета на поверхности лимфоцитов мышей». Журнал иммунологии. 159 (7): 3288–98. PMID  9317127.
11. Браунинг Дж. Л., Дугас И., Нгам-эк А., Бурдон П. Р., Эренфельс Б. Н., Мятковски К., Зафари М., Ямпалья А. М., Лоутон П., Мейер В. (январь 1995 г.). «Характеристика поверхностных форм лимфотоксина. Использование специфических моноклональных антител и растворимых рецепторов». Журнал иммунологии. 154 (1): 33–46. PMID  7995952.

дальнейшее чтение

• Мессер Г., Шпенглер Ю., Юнг М.К., Хонольд Г., Бломер К., Папе Г.Р., Ритмюллер Г., Вайс Э.Х. (январь 1991 г.). «Полиморфная структура локуса фактора некроза опухоли (TNF): полиморфизм NcoI в первом интроне гена TNF-бета человека коррелирует с вариантом аминокислоты в положении 26 и сниженным уровнем продукции TNF-бета». Журнал экспериментальной медицины. 173 (1): 209–19. Дои:10.1084 / jem.173.1.209. ЧВК  2118757. PMID  1670638.
• Абрахам LJ, Du DC, Zahedi K, Dawkins RL, Whitehead AS (1991). «Гаплотипические полиморфизмы гена TNFB». Иммуногенетика. 33 (1): 50–3. Дои:10.1007 / BF00211695. PMID  1671667. S2CID  38756894.
• Недвин Г.Е., Нейлор С.Л., Сакагути А.Ю., Смит Д., Джарретт-Недвин Дж., Пенника Д., Геддел Д.В., Грей П.В. (сентябрь 1985 г.). «Гены лимфотоксина и фактора некроза опухолей человека: структура, гомология и хромосомная локализация». Исследования нуклеиновых кислот. 13 (17): 6361–73. Дои:10.1093 / nar / 13.17.6361. ЧВК  321958. PMID  2995927.
• Holzinger I, de Baey A, Messer G, Kick G, Zwierzina H, Weiss EH (1995). «Клонирование и геномная характеристика LST1: нового гена в области человеческого TNF». Иммуногенетика. 42 (5): 315–22. Дои:10.1007 / BF00179392. PMID  7590964. S2CID  19916860.
• Peelman LJ, Chardon P, Nunes M, Renard C, Geffrotin C, Vaiman M, Van Zeveren A, Coppieters W, van de Weghe A, Bouquet Y (март 1995 г.). «Ген BAT1 в MHC кодирует эволюционно консервативную предполагаемую ядерную РНК-геликазу из семейства DEAD». Геномика. 26 (2): 210–8. Дои:10.1016 / 0888-7543 (95) 80203-X. PMID  7601445.
• Браунинг Дж. Л., Дугас И., Нгам-эк А., Бурдон П. Р., Эренфельс Б. Н., Мятковски К., Зафари М., Ямпалья А. М., Лоутон П., Мейер В. (январь 1995 г.). «Характеристика поверхностных форм лимфотоксина. Использование специфических моноклональных антител и растворимых рецепторов». Журнал иммунологии. 154 (1): 33–46. PMID  7995952.
• Альбертелла М.Р., Кэмпбелл Р.Д. (май 1994 г.). «Характеристика нового гена в главном комплексе гистосовместимости человека, который кодирует потенциального нового члена семейства белков I каппа B». Молекулярная генетика человека. 3 (5): 793–9. Дои:10,1093 / чмг / 3.5.793. PMID  8081366.
• Ирис Ф.Дж., Бугелере Л., Приер С., Катерина Д., Примас Дж., Перро В., Юрка Дж., Родригес-Томе П., Клавери Д. М., Дауссет Дж. (Февраль 1993 г.). «Плотная кластеризация Alu и потенциальный новый член семейства каппа B NF в 90-килобазном сегменте HLA класса III». Природа Генетика. 3 (2): 137–45. Дои:10.1038 / ng0293-137. PMID  8499947. S2CID  33041319.
• Накамура Т., Таширо К., Назареа М., Накано Т., Сасаяма С., Хондзё Т. (ноябрь 1995 г.). «КДНК мышиного рецептора лимфотоксина-бета: выделение с помощью ловушки сигнальной последовательности и хромосомного картирования». Геномика. 30 (2): 312–9. Дои:10.1006 / geno.1995.9872. HDL:2433/202166. PMID  8586432.
• Utans U, Quist WC, McManus BM, Wilson JE, Arceci RJ, Wallace AF, Russell ME (май 1996 г.). «Воспалительная фабрика аллотрансплантата-1. Чувствительная к цитокину молекула макрофага, экспрессируемая в трансплантированных сердцах человека». Трансплантация. 61 (9): 1387–92. Дои:10.1097/00007890-199605150-00018. PMID  8629302.
• Nalabolu SR, Shukla H, Nallur G, Parimoo S, Weissman SM (январь 1996 г.). «Гены в области 220 т.п.н., охватывающей кластер TNF в MHC человека». Геномика. 31 (2): 215–22. Дои:10.1006 / geno.1996.0034. PMID  8824804.
• Лахам Н., Ван Данне Ф., Абрахам Л.Дж., Фарругия В., Бендтцен К., Бреннеке С.П., Райс Г.Е. (апрель 1997 г.). «Фактор некроза опухоли-бета при беременности и родах у человека». Журнал репродуктивной иммунологии. 33 (1): 53–69. Дои:10.1016 / S0165-0378 (97) 01012-7. PMID  9185077.
• Warzocha K, Renard N, Charlot C, Bienvenu J, Coiffier B, Salles G (сентябрь 1997 г.). «Идентификация двух изоформ лимфотоксина бета, экспрессируемых в линиях лимфоидных клеток человека и неходжкинских лимфомах». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 238 (2): 273–6. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7277. PMID  9299492.
• Browning JL, Sizing ID, Lawton P, Bourdon PR, Rennert PD, Majeau GR, Ambrose CM, Hession C, Miatkowski K, Griffiths DA, Ngam-ek A, Meier W, Benjamin CD, Hochman PS (октябрь 1997 г.). «Характеристика комплексов лимфотоксин-альфа бета на поверхности лимфоцитов мышей». Журнал иммунологии. 159 (7): 3288–98. PMID  9317127.
• de Baey A, Fellerhoff B, Maier S, Martinozzi S, Weidle U, Weiss EH (ноябрь 1997 г.). «Сложный паттерн экспрессии гена LST1 области TNF посредством дифференциальной регуляции, инициации и альтернативного сплайсинга». Геномика. 45 (3): 591–600. Дои:10.1006 / geno.1997.4963. PMID  9367684.
• Шиина Т., Тамия Г., Ока А., Ямагата Т., Ямагата Н., Киккава Е., Гото К., Мизуки Н., Ватанабэ К., Фукузуми Ю., Тагучи С., Сугавара К., Оно А., Чен Л., Ямадзаки М., Таширо Х, Андо А. , Икемура Т., Кимура М., Иноко Х. (февраль 1998 г.). «Анализ нуклеотидного секвенирования 146-килобазного сегмента вокруг генов IkBL и MICA на центромерном конце области HLA класса I». Геномика. 47 (3): 372–82. Дои:10.1006 / geno.1997.5114. PMID  9480751.
• Бодор Дж., Хабенер Дж. Ф. (апрель 1998 г.). «Роль репрессора транскрипции ICER в опосредованном циклическим AMP ослаблении экспрессии генов цитокинов в тимоцитах человека». Журнал биологической химии. 273 (16): 9544–51. Дои:10.1074 / jbc.273.16.9544. PMID  9545284.
• Невилл MJ, Кэмпбелл RD (апрель 1999 г.). «Новый член суперсемейства Ig и субъединица V-АТФазы G являются одними из предсказанных продуктов новых генов, близких к локусу TNF в человеческом MHC». Журнал иммунологии. 162 (8): 4745–54. PMID  10202016.