CCL20 - CCL20

CCL20
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2JYO, 1М8А, 2HCI
Идентификаторы
Псевдонимы	CCL20, CKb4, Exodus, LARC, MIP-3-альфа, MIP-3a, MIP3A, SCYA20, ST38, хемокиновый лиганд (мотив C-C) 20, лиганд хемокина C-C мотива 20
Внешние идентификаторы	OMIM: 601960 MGI: 1329031 ГомолоГен: 3375 Генные карты: CCL20
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q36.3 Начинать 227,805,739 бп[1] Конец 227,817,564 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 C5 | 1 42,69 см Начинать 83,116,766 бп[2] Конец 83,119,167 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с хемокиновым рецептором CCR6 • хемокиновая активность • Связывание с хемокиновым рецептором CCR Сотовый компонент • внеклеточная область • внутриклеточный • внеклеточный Биологический процесс • хемотаксис моноцитов • положительная регуляция миграции Т-клеток • хемотаксис нейтрофилов • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • положительная регуляция процесса биосинтеза синтазы оксида азота • защитный ответ на бактерию • передача сигналов от клетки к клетке • хемотаксис лимфоцитов • лечение раны • клеточный ответ на липотейхоевую кислоту • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • клеточный ответ на органическое вещество • хемокин-опосредованный сигнальный путь • клеточный ответ на интерлейкин-1 • клеточный ответ на гамма-интерферон • преобразование сигнала • иммунная реакция • клеточный ответ на липополисахарид • хемотаксис • кальций-опосредованная передача сигналов с использованием внутриклеточного источника кальция • хемотаксис клеток • Миграция Т-клеток • миграция тимоцитов • воспалительная реакция • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • цитокин-опосредованный сигнальный путь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6364	20297
Ансамбль	ENSG00000115009	ENSMUSG00000026166
UniProt	P78556	O89093
RefSeq (мРНК)	NM_004591 NM_001130046	NM_001159738 NM_016960
RefSeq (белок)	NP_001123518 NP_004582	NP_001153210 NP_058656
Расположение (UCSC)	Chr 2: 227,81 - 227,82 Мб	Chr 1: 83.12 - 83.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хемокин (мотив C-C) лиганд 20 (CCL20) или хемокин, регулируемый активацией печени (LARC) или Макрофагальный воспалительный белок-3 (MIP3A) небольшой цитокин принадлежащий ЦК хемокин семья. Это сильно хемотаксический за лимфоциты и слабо привлекает нейтрофилы.^[5] CCL20 участвует в образовании и функционировании слизистая оболочка лимфоидные ткани с помощью химиотерапии лимфоциты и дендритные клетки навстречу эпителиальные клетки окружающие эти ткани. CCL20 оказывает влияние на свои клетки-мишени путем связывания и активации хемокиновый рецептор CCR6.^[6]

Ген экспрессия CCL20 может быть индуцирована микробный такие факторы как липополисахарид (ЛПС) и воспалительные цитокины, такие как фактор некроза опухоли и интерферон-γ, и регулируется Ил-10.^[7] CCL20 экспрессируется в нескольких тканях, причем наибольшая экспрессия наблюдается в периферической крови. лимфоциты, лимфатический узел, печень, приложение, и плод легкое и более низкие уровни в тимусе, яичках, простате и кишечнике.^[5][8] Ген CCL20 (scya20) находится на хромосоме 2 у человека.^[9]

Недавнее исследование ^[10] на животной модели рассеянного склероза, известной как экспериментальный аутоиммунный энцефалит (EAE), продемонстрировали, что региональная нервная активация может создавать «ворота» для патогенных CD4 + T-клеток для входа в ЦНС за счет увеличения экспрессии CCL20, особенно в L5. Стимуляция сенсорного нерва, вызванная использованием мышц ног или электрической стимуляцией, как в Arima et al., 2012, активирует симпатические нейроны, аксоны которых проходят через ганглии задних корешков, содержащие тела клеток стимулированного афферентного сенсорного нерва. Активность симпатических нейронов активирует усилитель IL-6, что приводит к повышенной региональной экспрессии CCL20 и последующему накоплению патогенных CD4 + Т-клеток на том же уровне спинного мозга. Было обнаружено, что экспрессия CCL20 зависит от активации усилителя IL-6, которая зависит от NF-κB и STAT3 активация. Это исследование предоставляет доказательства критической роли CCL20 в аутоиммунном патогенезе центральной нервной системы.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115009 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026166 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Хиэшима К., Имаи Т., Опденаккер Дж., Ван Дамм Дж., Кусуда Дж., Тей Х., Сакаки Й., Такацуки К., Миура Р., Йоши О, Номияма Х (1997). «Молекулярное клонирование нового человеческого хемокина CC печени и хемокина, регулируемого активацией (LARC), экспрессированного в печени. Хемотаксическая активность лимфоцитов и локализация гена на хромосоме 2». J. Biol. Chem. 272 (9): 5846–5853. Дои:10.1074 / jbc.272.9.5846. PMID  9038201.
6. Баба М., Имаи Т., Нисимура М., Какизаки М., Такаги С., Хиешима К., Номияма Х., Йоши О. (1997). «Идентификация CCR6, специфического рецептора нового лимфоцит-направленного CC хемокина LARC». J. Biol. Chem. 272 (23): 14893–14898. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14893. PMID  9169459.
7. Schutyser E, Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Conings R, Put W., Wuyts A, Proost P, Van Damme J (2000). «Регулируемое производство и молекулярное разнообразие печени человека и регулируемый активацией хемокин / макрофагальный воспалительный белок-3 альфа из нормальных и трансформированных клеток». J. Immunol. 165 (8): 4470–7. Дои:10.4049 / jimmunol.165.8.4470. PMID  11035086.
8. Росси Д.Л., Викари А.П., Франц-Бэкон К., МакКланахан Т.К., Злотник А. (1997). «Идентификация с помощью биоинформатики двух новых провоспалительных хемокинов человека макрофагов: MIP-3alpha и MIP-3beta». J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID  9013939.
9. Нельсон Р.Т., Бойд Дж., Глэдью Р.П., Паради Т., Томас Р., Каннингем А.С., Лира П., Бриссетт У.Х., Хейс Л., Хеймс Л.М., Неот К.С., Макколл С.Р. (2001). «Геномная организация CC-хемокина mip-3alpha / CCL20 / larc / exodus / SCYA20, показывающая структуру гена, варианты сплайсинга и локализацию хромосомы». Геномика. 73 (1): 28–37. Дои:10.1006 / geno.2001.6482. PMID  11352563.
10. Региональная нейронная активация определяет путь для аутореактивных Т-клеток через гематоэнцефалический барьер | автор = Арима, Ясунобу; Харада, Масая; Камимура, Дайсуке; Пак, Джин-Хэн; Кавано, Фуминори; Yull, Fiona E .; Кавамото, Тадафуми; Ивакура, Ёитиро; Бец, Ульрих А.К .; Маркес, Габриэль; Блэквелл, Тимоти С .; Охира, Ёсинобу; Хирано, Тошио; Мураками, Масааки | Cell doi: 10.1016 / j.cell.2012.01.022 (том 148, выпуск 3, стр. 447 - 457)

дальнейшее чтение

• Матоба Р., Окубо К., Хори Н. и др. (1994). «Добавление информации о 5'-кодировании в 3'-направленную библиотеку кДНК улучшает анализ экспрессии генов». Ген. 146 (2): 199–207. Дои:10.1016/0378-1119(94)90293-3. PMID  8076819.
• Росси Д.Л., Викари А.П., Франц-Бэкон К. и др. (1997). «Идентификация посредством биоинформатики двух новых провоспалительных хемокинов человека макрофагов: MIP-3alpha и MIP-3beta». J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID  9013939.
• Хиешима К., Имаи Т., Опденаккер Г. и др. (1997). «Молекулярное клонирование нового человеческого хемокина CC печени и хемокина, регулируемого активацией (LARC), экспрессированного в печени. Хемотаксическая активность лимфоцитов и локализация гена на хромосоме 2». J. Biol. Chem. 272 (9): 5846–5853. Дои:10.1074 / jbc.272.9.5846. PMID  9038201.
• Хромас Р., Грей П.В., Чантри Д. и др. (1997). «Клонирование и характеристика исхода, новый бета-хемокин». Кровь. 89 (9): 3315–22. PMID  9129037.
• Баба М., Имаи Т., Нисимура М. и др. (1997). «Идентификация CCR6, специфического рецептора нового лимфоцит-направленного CC хемокина LARC». J. Biol. Chem. 272 (23): 14893–14898. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14893. PMID  9169459.
• Ляо Ф., Алдерсон Р., Су Дж. И др. (1997). «STRL22 представляет собой рецептор CC-хемокина MIP-3alpha». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 236 (1): 212–217. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6936. PMID  9223454.
• Power CA, Church DJ, Meyer A и др. (1997). «Клонирование и характеристика специфического рецептора нового CC-хемокина MIP-3alpha из дендритных клеток легких». J. Exp. Med. 186 (6): 825–835. Дои:10.1084 / jem.186.6.825. ЧВК  2199050. PMID  9294137.
• Танака Ю., Имаи Т., Баба М. и др. (1999). «Селективная экспрессия печени и регулируемых активацией хемокинов (LARC) в кишечном эпителии мышей и людей». Евро. J. Immunol. 29 (2): 633–642. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199902) 29:02 <633 :: AID-IMMU633> 3.0.CO; 2-I. PMID  10064080.
• Ян Д., Ховард О. М., Чен К., Оппенгейм Дж. Дж. (1999). «Передний край: незрелые дендритные клетки, полученные из моноцитов в присутствии TGF-бета 1, экспрессируют функциональный C-C хемокиновый рецептор 6». J. Immunol. 163 (4): 1737–41. PMID  10438902.
• Ян Д., Чертов О., Быковская С.Н. и др. (1999). «Бета-дефенсины: соединение врожденного и адаптивного иммунитета через дендритные и Т-клеточные CCR6». Наука. 286 (5439): 525–528. Дои:10.1126 / science.286.5439.525. PMID  10521347.
• Charbonnier AS, Kohrgruber N, Kriehuber E, et al. (2000). «Макрофагальный воспалительный белок 3альфа участвует в конститутивном перемещении эпидермальных клеток Лангерганса». J. Exp. Med. 190 (12): 1755–1768. Дои:10.1084 / jem.190.12.1755. ЧВК  2195721. PMID  10601351.
• Schutyser E, Struyf S, Menten P, et al. (2000). «Регулируемое производство и молекулярное разнообразие печени человека и регулируемый активацией хемокин / макрофагальный воспалительный белок-3 альфа из нормальных и трансформированных клеток». J. Immunol. 165 (8): 4470–7. Дои:10.4049 / jimmunol.165.8.4470. PMID  11035086.
• Хиросе Дж., Кавасима Х., Йоши О и др. (2001). «Версикан взаимодействует с хемокинами и модулирует клеточные реакции». J. Biol. Chem. 276 (7): 5228–5234. Дои:10.1074 / jbc.M007542200. PMID  11083865.
• Накаяма Т., Фудзисава Р., Ямада Х. и др. (2001). «Индуцируемая экспрессия CC-хемокина, регулируемого печенью и активацией хемокина (LARC) / макрофагального воспалительного белка (MIP) -3 альфа / CCL20 эпидермальными кератиноцитами и его роль в атопическом дерматите». Int. Иммунол. 13 (1): 95–103. Дои:10.1093 / intimm / 13.1.95. PMID  11133838.
• Нельсон Р.Т., Бойд Дж., Глэдью Р.П. и др. (2001). «Геномная организация CC-хемокина mip-3alpha / CCL20 / larc / exodus / SCYA20, показывающая структуру гена, варианты сплайсинга и локализацию хромосомы». Геномика. 73 (1): 28–37. Дои:10.1006 / geno.2001.6482. PMID  11352563.
• Тохьяма М., Ширакара Й., Ямасаки К. и др. (2001). «Дифференцированные кератиноциты ответственны за регулируемое TNF-альфа производство макрофагами воспалительного белка 3alpha / CCL20, мощного хемокина для клеток Лангерганса». J. Dermatol. Наука. 27 (2): 130–139. Дои:10.1016 / S0923-1811 (01) 00127-X. PMID  11532377.
• Джаннини С.Л., Хуберт П., Дойен Дж. И др. (2002). «Влияние микросреды эпителия слизистой оболочки на клетки Лангерганса: последствия для развития плоскоклеточных интраэпителиальных поражений шейки матки». Int. J. Рак. 97 (5): 654–659. Дои:10.1002 / ijc.10084. PMID  11807793. S2CID  24940837.
• Casamayor-Pallejà M, Mondière P, Verschelde C и др. (2002). «Лигирование BCR последовательно перепрограммирует В-клетки для миграции в Т-зону и В-клеточный фолликул». Кровь. 99 (6): 1913–1921. Дои:10.1182 / кровь.V99.6.1913. PMID  11877260.
• Шмут М., Нейер С., Райнер С. и др. (2002). «Экспрессия C-C хемокина MIP-3 alpha / CCL20 в эпидермисе человека с нарушенной функцией барьера проницаемости». Exp. Дерматол. 11 (2): 135–142. Дои:10.1034 / j.1600-0625.2002.110205.x. PMID  11994140. S2CID  40953753.
• Ляо Ф., Сиракава А.К., Фоли Дж. Ф. и др. (2002). «Человеческие В-клетки становятся высокочувствительными к макрофагам-воспалительному белку-3 альфа / CC хемокин-лиганд-20 после клеточной активации без изменений в экспрессии CCR6 или связывании лиганда». J. Immunol. 168 (10): 4871–80. Дои:10.4049 / jimmunol.168.10.4871. PMID  11994436.

внешняя ссылка

• Человек CCL20 расположение генома и CCL20 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.