CCL19 - CCL19

CCL19
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2MP1
Идентификаторы
Псевдонимы	CCL19, CKb11, ELC, MIP-3b, MIP3B, SCYA19, хемокиновый лиганд с мотивом C-C 19
Внешние идентификаторы	OMIM: 602227 MGI: 5434459 ГомолоГен: 4569 Генные карты: CCL19
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п13.3 Начинать 34,689,570 бп[1] Конец 34,691,276 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 A5 | 4 Начинать 42,070,757 бп[2] Конец 42,072,779 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание с хемокиновым рецептором CCR10 • цитокиновая активность • связывание хемокиновых рецепторов • Связывание с хемокиновым рецептором CCR7 • хемокиновая активность • Связывание с хемокиновым рецептором CCR • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная область • внутриклеточный • внеклеточный Биологический процесс • высвобождение секвестрированного иона кальция в цитозоль • положительная регуляция рецепторно-опосредованного эндоцитоза • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • положительная регуляция подвижности клеток • положительная регуляция сборки дендритов дендритных клеток • активация активности киназы JUN • положительная регуляция продукции интерлейкина-12 • регулировка сборки проекции клеток • хемотаксис моноцитов • положительная регуляция дифференцировки Т-хелперов 1 клетки • хемокин-опосредованный сигнальный путь • реакция на оксид азота • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • Костимуляция Т-клеток • ответ на вирус • клеточный гомеостаз ионов кальция • созревание клеток • миелоидный хемотаксис дендритных клеток • положительное регулирование каскада JNK • хемотаксис дендритных клеток • положительная регуляция активности фосфатидилинозитол-3-киназы • хемотаксис • сотовая связь • положительная регуляция эндоцитоза • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • ответ на простагландин E • положительное регулирование процессинга и презентации антигенов дендритными клетками • положительная регуляция хемотаксиса • клеточный ответ на интерлейкин-1 • положительное регулирование пролиферации Т-клеток • иммунная реакция • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • установление полярности Т-клеток • положительная регуляция процесса биосинтеза гликопротеинов • клеточный ответ на гамма-интерферон • положительное регулирование выработки фактора некроза опухоли • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • хемотаксис лимфоцитов • положительная регуляция хемотаксиса нейтрофилов • воспалительная реакция • формирование иммунологического синапса • зрелая обычная дифференцировка дендритных клеток • положительная регуляция активности протеинкиназы • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • отрицательная регуляция процесса апоптоза дендритных клеток • цитокин-опосредованный сигнальный путь • положительная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • хемотаксис нейтрофилов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6363	100861647
Ансамбль	ENSG00000172724	ENSMUSG00000118633
UniProt	Q99731	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_006274	XM_006538413
RefSeq (белок)	NP_006265	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 9: 34.69 - 34.69 Мб	Chr 4: 42.07 - 42.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хемокин (мотив C-C) лиганд 19 (CCL19) - это белок что у людей кодируется CCL19 ген.^[5][6]

Этот ген является одним из нескольких генов цитокинов СС, сгруппированных на p-плече хромосомы 9. Цитокины представляют собой семейство секретируемых белков, участвующих в иммунорегуляторных и воспалительных процессах. Цитокины СС представляют собой белки, характеризующиеся двумя соседними цистеинами. Цитокин, кодируемый этим геном, может играть роль в нормальной рециркуляции лимфоцитов и хоминге. Он также играет важную роль в перемещении Т-клеток в тимус и миграции Т-клеток и В-клеток во вторичные лимфоидные органы. Он специфически связывается с хемокиновым рецептором CCR7.^[6]

Хемокиновый (мотив C-C) лиганд 19 (CCL19) представляет собой небольшой цитокин принадлежащий ЦК хемокин семья, которая также известна как Хемокин лиганда EBI1 (ELC) и макрофагальный воспалительный белок-3-бета (MIP-3-beta). CCL19 обильно экспрессируется в вилочковая железа и лимфатический узел, с умеренным уровнем в трахея и двоеточие и низкий уровень в желудке, тонкий кишечник, легкое, почка и селезенка.^[7] Ген CCL19 находится на человеческом хромосома 9.^[8] Этот хемокин оказывает свое действие на свои клетки-мишени за счет связывания с рецептором хемокина. хемокиновый рецептор CCR7.^[7] Он привлекает определенные клетки иммунная система, включая дендритные клетки и антиген В-клетки,^[9][10] CCR7 + Т-клетки центральной памяти.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172724 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000118633 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ёсида Р., Имаи Т., Хиешима К., Кусуда Дж., Баба М., Китаура М., Нисимура М., Какидзаки М., Номияма Х., Йоши О. (июль 1997 г.). «Молекулярное клонирование нового хемокина EBI1-лиганда CC человека, который является специфическим функциональным лигандом для EBI1, CCR7». J Biol Chem. 272 (21): 13803–9. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID  9153236.
6. «Ген Entrez: хемокин CCL19 (мотив C-C) лиганд 19».
7. Йошида Р., Имаи Т., Хиешима К., Кусуда Дж., Баба М., Китаура М., Нисимура М., Какидзаки М., Номияма Х., Йоши О. (1997). «Молекулярное клонирование нового хемокина EBI1-лиганда CC человека, который является специфическим функциональным лигандом для EBI1, CCR7». J. Biol. Chem. 272 (21): 13803–9. Дои:10.1074 / jbc.272.21.13803. PMID  9153236.
8. Росси Д.Л., Викари А.П., Франц-Бэкон К., МакКланахан Т.К., Злотник А. (1997). «Идентификация с помощью биоинформатики двух новых провоспалительных хемокинов человека макрофагов: MIP-3alpha и MIP-3beta». J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID  9013939.
9. Роббиани Д.Ф., Финч Р.А., Джегер Д., Мюллер В.А., Сарторелли А.С., Рэндольф Г.Дж. (2000). «Переносчик лейкотриена C (4) MRP1 регулирует CCL19 (MIP-3beta, ELC) -зависимую мобилизацию дендритных клеток в лимфатические узлы». Клетка. 103 (5): 757–68. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00179-3. PMID  11114332. S2CID  15592251.
10. Рейф К., Экланд Э. Х., Ол Л., Накано Х., Липп М., Фёрстер Р., Цистер Дж. Г. (2002). «Сбалансированная реакция на хемоаттрактанты из соседних зон определяет положение В-клеток». Природа. 416 (6876): 94–9. Дои:10.1038 / 416094a. PMID  11882900. S2CID  4403093.
11. Бромли С.К., Томас С.Ю., Блеск AD (2005). «Хемокиновый рецептор CCR7 направляет выход Т-клеток из периферических тканей и вход в афферентные лимфатические сосуды». Nat. Иммунол. 6 (9): 895–901. Дои:10.1038 / ni1240. PMID  16116469. S2CID  443455.

дальнейшее чтение

• Вебер С., Коенен Р. Р. (2006). «Тонкая настройка ответов лейкоцитов: к взаимодействию хемокинов»'". Тенденции Иммунол. 27 (6): 268–73. Дои:10.1016 / j.it.2006.04.002. PMID  16678487.
• Росси Д.Л., Викари А.П., Франц-Бэкон К. и др. (1997). «Идентификация посредством биоинформатики двух новых провоспалительных хемокинов человека макрофагов: MIP-3alpha и MIP-3beta». J. Immunol. 158 (3): 1033–6. PMID  9013939.
• Нагира М., Имаи Т., Хиешима К. и др. (1997). «Молекулярное клонирование нового хемокина вторичного лимфоидного тканевого хемокина человека CC, который является мощным хемоаттрактантом для лимфоцитов и отображается на хромосоме 9p13». J. Biol. Chem. 272 (31): 19518–24. Дои:10.1074 / jbc.272.31.19518. PMID  9235955.
• Kim CH, Pelus LM, White JR и др. (1998). «Хемокин CK бета-11 / макрофагальный воспалительный белок-3 бета / лиганд EBI1 является эффективным хемоаттрактантом для Т- и В-клеток». J. Immunol. 160 (5): 2418–24. PMID  9498785.
• Янагихара С., Комура Э., Нагафуне Дж. И др. (1998). «EBI1 / CCR7 - это новый член хемокинового рецептора дендритных клеток, который активируется при созревании». J. Immunol. 161 (6): 3096–102. PMID  9743376.
• Gosling J, Dairaghi DJ, Wang Y и др. (2000). «Передний край: идентификация нового хемокинового рецептора, который связывает хемокины, активные для дендритных клеток и Т-клеток, включая ELC, SLC и TECK». J. Immunol. 164 (6): 2851–6. Дои:10.4049 / jimmunol.164.6.2851. PMID  10706668.
• Аннунциато Ф., Романьани П., Косми Л. и др. (2000). «Хемокин, полученный из макрофагов, и хемокин с лигандом EBI1 привлекают тимоциты человека на разных стадиях развития и продуцируются отдельными подмножествами медуллярных эпителиальных клеток: возможные последствия для негативного отбора». J. Immunol. 165 (1): 238–46. Дои:10.4049 / jimmunol.165.1.238. PMID  10861057.
• Уэно Т., Хара К., Уиллис М.С. и др. (2002). «Роль лигандов CCR7 в эмиграции вновь образованных Т-лимфоцитов из тимуса новорожденных». Иммунитет. 16 (2): 205–18. Дои:10.1016 / S1074-7613 (02) 00267-4. PMID  11869682.
• Филлипс Р., Агер А (2002). «Активация рецепторов CXCL12 (SDF-1), чувствительных к коклюшному токсину, опосредует трансэндотелиальную миграцию Т-лимфоцитов через высокие эндотелиальные клетки лимфатических узлов». Евро. J. Immunol. 32 (3): 837–47. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200203) 32: 3 <837 :: AID-IMMU837> 3.0.CO; 2-Q. PMID  11870628.
• Тиль К.Дж., Лин К., Зузель М., Коули Дж. К. (2002). «Хемокиновый рецептор CCR7 и интегрин альфа4 важны для миграции клеток хронического лимфоцитарного лейкоза в лимфатические узлы». Кровь. 99 (8): 2977–84. Дои:10.1182 / кровь.V99.8.2977. PMID  11929789.
• Таунсон Дж. Р., Ниббс Р. Дж. (2002). «Характеристика мышиного CCX-CKR, рецептора для привлекающих лимфоциты хемокинов TECK / mCCL25, SLC / mCCL21 и MIP-3beta / mCCL19: сравнение с человеческим CCX-CKR». Евро. J. Immunol. 32 (5): 1230–41. Дои:10.1002 / 1521-4141 (200205) 32: 5 <1230 :: AID-IMMU1230> 3.0.CO; 2-L. PMID  11981810.
• Пейдж G, Лебек S, Miossec P (2002). «Анатомическая локализация незрелых и зрелых дендритных клеток в эктопическом лимфоидном органе: корреляция с селективной экспрессией хемокинов в ревматоидном синовиуме». J. Immunol. 168 (10): 5333–41. Дои:10.4049 / jimmunol.168.10.5333. PMID  11994492.
• Катоу Ф., Отани Х., Накаяма Т. и др. (2003). «Дифференциальная экспрессия CCL19 с помощью DC-Lamp + зрелых дендритных клеток в лимфатических узлах человека по сравнению с хронически воспаленной кожей». Дж. Патол. 199 (1): 98–106. Дои:10.1002 / путь.1255. PMID  12474232. S2CID  25424987.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scandella E, Men Y, Legler DF и др. (2004). «Для инициируемой CCL19 / CCL21 передачи сигнала и миграции дендритных клеток требуется простагландин E2». Кровь. 103 (5): 1595–601. Дои:10.1182 / кровь-2003-05-1643. PMID  14592837.
• Corcione A, Arduino N, Ferretti E и др. (2004). «CCL19 и CXCL12 запускают хемотаксис in vitro В-клеток лимфомы из клеток мантии человека». Clin. Рак Res. 10 (3): 964–71. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-1182-3. PMID  14871974.
• Дайкоку Н., Китая К., Накаяма Т. и др. (2004). «Экспрессия макрофагального воспалительного белка-3beta в эндометрии человека в течение менструального цикла». Fertil. Стерил. 81 Дополнение 1: 876–81. Дои:10.1016 / j.fertnstert.2003.09.036. PMID  15019823.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Паолетти С., Петкович В., Себастьяни С. и др. (2005). «Богатая хемокинами среда сильно увеличивает миграцию и активность лейкоцитов». Кровь. 105 (9): 3405–12. Дои:10.1182 / кровь-2004-04-1648. PMID  15546958.

внешняя ссылка

• Человек CCL19 расположение генома и CCL19 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.