CCL17 - CCL17

CCL17
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1NR2, 1NR4
Идентификаторы
Псевдонимы	CCL17, A-152E5.3, ABCD-2, SCYA17, TARC, хемокиновый лиганд с мотивом C-C 17
Внешние идентификаторы	OMIM: 601520 MGI: 1329039 ГомолоГен: 2246 Генные карты: CCL17
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q21 Начинать 57,404,767 бп[1] Конец 57,416,063 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 C5 | 8 46,85 см Начинать 94,810,453 бп[2] Конец 94,812,036 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • Связывание с хемокиновым рецептором CCR • рецепторное связывание • хемокиновая активность • Связывание с хемокиновым рецептором CCR4 • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора, сопряженного с G-белком • отрицательная регуляция дифференцировки миобластов • хемотаксис моноцитов • хемокин-опосредованный сигнальный путь • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • передача сигналов от клетки к клетке • хемотаксис нейтрофилов • развитие многоклеточного организма • хемотаксис • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • клеточный ответ на интерлейкин-1 • иммунная реакция • положительная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • клеточный ответ на гамма-интерферон • хемотаксис лимфоцитов • воспалительная реакция • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • регуляция рецепторной активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6361	20295
Ансамбль	ENSG00000102970	ENSMUSG00000031780
UniProt	Q92583	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_002987	NM_011332
RefSeq (белок)	NP_002978	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 16: 57,4 - 57,42 Мб	Chr 8: 94,81 - 94,81 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Хемокин (мотив C-C) лиганд 17 (CCL17) (также известный как TARC) - небольшой цитокин принадлежащий ЦК хемокин семейство также известно как тимус и хемокин, регулируемый активацией (TARC). CCL17 конститутивно экспрессируется в тимусе, но только временно в тимусе. фитогемагглютинин -стимулированный мононуклеарные клетки периферической крови.^[5] Этот хемокин специфически связывает и индуцирует хемотаксис в Т-клетки и проявляет свои эффекты, взаимодействуя с рецептором хемокина CCR4.^[5][6] Ген CCL17 расположен на хромосома 16, у людей, наряду с другими хемокинами, называемыми CCL22 и CX3CL1.^[7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102970 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031780 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Имаи Т., Ёсида Т., Баба М., Нисимура М., Какизаки М., Ёси О (1996). «Молекулярное клонирование нового Т-клеточного CC-хемокина, экспрессированного в тимусе с помощью ловушки сигнальной последовательности с использованием вектора вируса Эпштейна-Барра». J. Biol. Chem. 271 (35): 21514–21. Дои:10.1074 / jbc.271.35.21514. PMID  8702936.
6. Имаи Т., Баба М., Нисимура М., Какизаки М., Такаги С., Йоши О (1997). «Т-клеточный CC-хемокин TARC является высокоспецифичным биологическим лигандом для CC-хемокинового рецептора 4». J. Biol. Chem. 272 (23): 15036–42. Дои:10.1074 / jbc.272.23.15036. PMID  9169480.
7. Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж., Миура Р., Каллен Д.Ф., Йоши О. (1997). «Отнесение человеческого гена хемокина CC TARC (SCYA17) к хромосоме 16q13». Геномика. 40 (1): 211–3. Дои:10.1006 / geno.1996.4552. PMID  9070951.
8. Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж., Миура Р., Каллен Д.Ф., Йоши О. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–1. Дои:10.1159/000015000. PMID  9691168. S2CID  46851784.

дальнейшее чтение

• Саэки Х, Тамаки К. (2006). «Тимус и хемокин, регулируемый активацией (TARC) / CCL17 и кожные заболевания». J. Dermatol. Наука. 43 (2): 75–84. Дои:10.1016 / j.jdermsci.2006.06.002. PMID  16859899.
• Имаи Т., Йошида Т., Баба М. и др. (1996). «Молекулярное клонирование нового Т-клеточного CC-хемокина, экспрессированного в тимусе с помощью ловушки сигнальной последовательности с использованием вектора вируса Эпштейна-Барра». J. Biol. Chem. 271 (35): 21514–21. Дои:10.1074 / jbc.271.35.21514. PMID  8702936.
• Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж. И др. (1997). «Отнесение человеческого гена хемокина CC TARC (SCYA17) к хромосоме 16q13». Геномика. 40 (1): 211–3. Дои:10.1006 / geno.1996.4552. PMID  9070951.
• Имаи Т., Баба М., Нисимура М. и др. (1997). «Т-клеточный CC-хемокин TARC является высокоспецифичным биологическим лигандом для CC-хемокинового рецептора 4». J. Biol. Chem. 272 (23): 15036–42. Дои:10.1074 / jbc.272.23.15036. PMID  9169480.
• Имаи Т., Чантри Д., Рапорт С.Дж. и др. (1998). «Хемокин, полученный из макрофагов, является функциональным лигандом для хемокинового рецептора 4 CC». J. Biol. Chem. 273 (3): 1764–8. Дои:10.1074 / jbc.273.3.1764. PMID  9430724.
• Бернардини Дж., Хедрик Дж., Соццани С. и др. (1998). «Идентификация CC-хемокинов TARC и макрофагального воспалительного белка-1 бета в качестве новых функциональных лигандов для рецептора CCR8». Евро. J. Immunol. 28 (2): 582–8. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199802) 28:02 <582 :: AID-IMMU582> 3.0.CO; 2-A. PMID  9521068.
• Номияма Х., Имаи Т., Кусуда Дж. И др. (1998). «Человеческие хемокины фракталкин (SCYD1), MDC (SCYA22) и TARC (SCYA17) сгруппированы на хромосоме 16q13». Cytogenet. Cell Genet. 81 (1): 10–1. Дои:10.1159/000015000. PMID  9691168. S2CID  46851784.
• Струйф С., Проост П., Соццани С. и др. (1998). «Повышенная анти-ВИЧ-1 активность и измененная хемотаксическая активность хемокина, производного от макрофагов с NH2-концом (MDC), подразумевают наличие дополнительного рецептора MDC». J. Immunol. 161 (6): 2672–5. PMID  9743322.
• Лофтус Б.Дж., Ким Ю.Дж., Снеддон В.П. и др. (1999). «Дупликации генома и другие особенности в 12 Mb последовательности ДНК из хромосомы 16p и 16q человека». Геномика. 60 (3): 295–308. Дои:10.1006 / geno.1999.5927. PMID  10493829.
• Гарлиси К.Г., Сяо Х., Тиан Ф. и др. (1999). «Назначение пар хемокин-хемокиновый рецептор: TARC и MIP-1 бета не являются лигандами для человеческого CC-хемокинового рецептора 8». Евро. J. Immunol. 29 (10): 3210–5. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199910) 29:10 <3210 :: AID-IMMU3210> 3.0.CO; 2-W. PMID  10540332.
• Диас Нето Э., Корреа Р.Г., Верджовски-Алмейда С. и др. (2000). «Секвенирование человеческого транскриптома с использованием тегов последовательности, экспрессируемой ORF». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (7): 3491–6. Дои:10.1073 / pnas.97.7.3491. ЧВК  16267. PMID  10737800.
• Ghia P, Transidico P, Veiga JP и др. (2001). «Хемоаттрактанты MDC и TARC секретируются предшественниками злокачественных В-клеток после лигирования CD40 и поддерживают миграцию лейкемических Т-клеток». Кровь. 98 (3): 533–40. Дои:10.1182 / кровь.V98.3.533. PMID  11468146.
• Морита А., Кикуока С., Хорикава Т. и др. (2002). «Оценка концентраций тимуса человека и регулируемых активацией хемокинов в крови с использованием нового сэндвич-ELISA на основе моноклональных антител». Clin. Чим. Acta. 322 (1–2): 67–75. Дои:10.1016 / S0009-8981 (02) 00131-6. PMID  12104083.
• Басу С., Шефер TM, Гош М. и др. (2003). «Молекулярное клонирование и секвенирование 25 различных кДНК хемокинов макака-резуса показывает эволюционную консервативность среди семейств хемокинов C, CC, CXC и CX3C». Цитокин. 18 (3): 140–8. Дои:10.1006 / cyto.2002.0875. PMID  12126650.
• Д'Амброзио Д., Альбанези С., Ланг Р. и др. (2002). «Количественные различия в вовлечении хемокиновых рецепторов создают разнообразие интегрин-зависимой адгезии лимфоцитов». J. Immunol. 169 (5): 2303–12. Дои:10.4049 / jimmunol.169.5.2303. PMID  12193695.
• Мацумото Н., Мукаэ Х., Накамура-Учияма Ф. и др. (2002). «Повышенные уровни тимуса и регулируемого активацией хемокина (TARC) в образцах плеврального выпота от пациентов, инфицированных Paragonimus westermani». Clin. Exp. Иммунол. 130 (2): 314–8. Дои:10.1046 / j.1365-2249.2002.01985.x. ЧВК  1906524. PMID  12390321.
• Чжэн X, Накамура К., Тодзё М. и др. (2003). «TGF-beta1-опосредованная регуляция тимуса и регулируемый активацией синтез и секреция хемокинов (TARC / CCL17) клетками HaCaT, совместно стимулированными TNF-альфа и IFN-гамма». J. Dermatol. Наука. 30 (2): 154–60. Дои:10.1016 / S0923-1811 (02) 00071-3. PMID  12413771.
• Какинума Т., Накамура К., Вакугава М. и др. (2003). «IL-4, но не IL-13, модулирует TARC (тимус и хемокин, регулируемый активацией) / CCL17 и IP-10 (интерферон-индуцированный белок 10kDA) / высвобождение CXCL10 TNF-альфа и IFN-гамма в клеточной линии HaCaT. ". Цитокин. 20 (1): 1–6. Дои:10.1006 / cyto.2002.1965. PMID  12441140.
• Uchida T, Suto H, Ra C и др. (2003). «Предпочтительная экспрессия хемокина типа T (h) 2 и его рецептора при атопическом дерматите». Int. Иммунол. 14 (12): 1431–8. Дои:10.1093 / intimm / dxf109. PMID  12456591.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Джонс, К. (1 февраля 2013 г.). «Сывороточные CD163 и TARC как биомаркеры реакции на заболевание при классической лимфоме Ходжкина». Clin Cancer Res. 19 (3): 731–42. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-12-2693. PMID  23224400.

внешняя ссылка

• Человек CCL17 расположение генома и CCL17 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.