TNFSF18 - TNFSF18

TNFSF18
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Q1M, 2R30, 2R32, 3B93, 3B94
Идентификаторы
Псевдонимы	TNFSF18, AITRL, GITRL, TL6, hGITRL, TNLG2A, член суперсемейства фактора некроза опухоли 18, член суперсемейства TNF 18
Внешние идентификаторы	OMIM: 603898 MGI: 2673064 ГомолоГен: 3732 Генные карты: TNFSF18
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.1 Начинать 173,039,960 бп[1] Конец 173,050,963 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H2.1 | 1 69,75 см Начинать 161,494,655 бп[2] Конец 161,505,290 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитокиновая активность • рецепторное связывание • GO: 0001948 связывание с белками • суперсемейное связывание рецепторов фактора некроза опухолей • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • клеточная мембрана • внеклеточный • поверхность клетки Биологический процесс • адаптивный иммунный ответ • положительная регуляция миграции лейкоцитов • иммунная система • передача сигналов от клетки к клетке • отрицательная регуляция апоптотического процесса • преобразование сигнала • положительная регуляция фосфорилирования тирозина белка STAT • регуляция рецепторной активности • Пролиферация Т-клеток, участвующих в иммунном ответе • сигнальный путь, опосредованный фактором некроза опухоли • регулирование пролиферации Т-клеток • положительная регуляция клеточной адгезии • положительная регуляция активности фактора транскрипции NF-kappaB Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8995	240873
Ансамбль	ENSG00000120337	ENSMUSG00000066755
UniProt	Q9UNG2	Q7TS55
RefSeq (мРНК)	NM_005092	NM_183391
RefSeq (белок)	NP_005083	NP_899247
Расположение (UCSC)	Chr 1: 173.04 - 173.05 Мб	Chr 1: 161.49 - 161.51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Член суперсемейства лиганд фактора некроза опухоли 18 это белок что у людей кодируется TNFSF18 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой цитокин что принадлежит фактор некроза опухоли (TNF) лигандное семейство. Этот цитокин представляет собой лиганд для рецептора TNFRSF18 / AITR / GITR. Было показано, что он может модулировать Т-лимфоцит выживаемость в периферических тканях. Этот цитокин также экспрессируется в эндотелиальные клетки, и считается важным для взаимодействия между Т-лимфоцитами и эндотелиальными клетками.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000120337 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066755 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Kwon B, Yu KY, Ni J, Yu GL, Jang IK, Kim YJ, Xing L, Liu D, Wang SX, Kwon BS (март 1999 г.). «Идентификация нового индуцируемого активацией белка суперсемейства рецепторов фактора некроза опухолей и его лиганда». J Biol Chem. 274 (10): 6056–61. Дои:10.1074 / jbc.274.10.6056. PMID  10037686.
6. Герни А.Л., Марстерс С.А., Хуанг Р.М., Питти Р.М., Марк Д.Т., Болдуин Д.Т., Грей А.М., Дауд А.Д., Браш А.Д., Хелденс А.Д., Шоу А.Д., Годдард А.Д., Вуд В.И., Бейкер КП, Годовски П.Дж., Ашкенази А. (апрель 1999 г.) ). «Идентификация нового члена семейства факторов некроза опухолей и его рецептора, человеческого ортолога мышиного GITR». Curr Biol. 9 (4): 215–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (99) 80093-1. PMID  10074428.
7. «Ген Entrez: суперсемейство фактора некроза опухоли TNFSF18 (лиганд), член 18».

дальнейшее чтение

• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретных белков (SPDI), широкомасштабное усилие по идентификации новых секретируемых человеком и трансмембранных белков: оценка биоинформатики». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
• Yu KY, Kim HS, Song SY и др. (2003). «Идентификация лиганда глюкокортикоид-индуцированного рецептора фактора некроза опухоли, конститутивно экспрессируемого в дендритных клетках». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 310 (2): 433–8. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.09.024. PMID  14521928.
• Ким Б.Дж., Ли З., Фарисс Р.Н. и др. (2004). «Конститутивная и цитокин-индуцированная экспрессия лиганда GITR на пигментном эпителии сетчатки человека и фоторецепторах». Вкладывать деньги. Офтальмол. Vis. Наука. 45 (9): 3170–6. Дои:10.1167 / iovs.03-0919. PMID  15326137.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Нарделли Б., Зарицкая Л., МакОлифф В. и др. (2006). «Остеостат / фактор некроза опухоли 18 суперсемейства ингибирует остеокластогенез и селективно экспрессируется эндотелиальными клетками сосудов». Эндокринология. 147 (1): 70–8. Дои:10.1210 / en.2005-0518. PMID  16179414.
• Hanabuchi S, Watanabe N, Wang YH и др. (2006). «Предендритные плазматические клетки человека активируют NK-клетки через рецептор-лиганд фактора некроза опухоли, индуцированный глюкокортикоидами (GITRL)». Кровь. 107 (9): 3617–23. Дои:10.1182 / кровь-2005-08-3419. PMID  16397134.
• Махеш С.П., Ли З., Лю Б. и др. (2006). «Экспрессия лиганда GITR отменяет иммуносупрессивную функцию глазной ткани и дифференцированно модулирует воспалительные цитокины и хемокины». Евро. J. Immunol. 36 (8): 2128–38. Дои:10.1002 / eji.200635893. PMID  16874737.
• Баумгартнер-Нильсен Дж., Вестергаард С., Теструп-Педерсен К. и др. (2006). «Глюкокортикоид-индуцированный рецептор фактора некроза опухоли (GITR) и его лиганд (GITRL) при атопическом дерматите». Acta Derm. Венереол. 86 (5): 393–8. Дои:10.2340/00015555-0118. PMID  16955181.
• Бальц К.М., Круш М., Брингманн А. и др. (2007). «Иммуноредактирование рака с помощью лиганда GITR (глюкокортикоид-индуцированный TNF-родственный белок) у людей: взаимодействия NK-клетки / опухолевые клетки». FASEB J. 21 (10): 2442–54. Дои:10.1096 / fj.06-7724com. PMID  17360848.
• Tuyaerts S, Van Meirvenne S, Bonehill A, et al. (2007). «Экспрессия человеческого GITRL на миелоидных дендритных клетках усиливает их иммуностимулирующую функцию, но не отменяет подавляющего действия CD4 + CD25 + регуляторных Т-клеток». J. Leukoc. Биол. 82 (1): 93–105. Дои:10.1189 / jlb.0906568. PMID  17449724.
• Бэ Э.М., Ким В.Дж., Сук К. и др. (2007). «Обратная передача сигналов, инициированная GITRL, индуцирует активацию NF-kappaB через ERK при воспалительной активации макрофагов». Мол. Иммунол. 45 (2): 523–33. Дои:10.1016 / j.molimm.2007.05.013. PMID  17602748.
• Ким Ю.С., Юнг Х.В., Чой Дж. И др. (2007). «Экспрессия AITR и лиганда AITR у больных раком груди». Онкол. Представитель. 18 (5): 1189–94. Дои:10.3892 / или 18.5.1189. PMID  17914571.