ATP2A3 - ATP2A3

ATP2A3
Идентификаторы
Псевдонимы	ATP2A3, SERCA3, АТФаза саркоплазматический / эндоплазматический ретикулум Транспортирующий Ca2 + 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 601929 MGI: 1194503 ГомолоГен: 69131 Генные карты: ATP2A3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17p13.2 Начните 3,923,870 бп[1] Конец 3,964,464 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B4 Начните 72,961,169 бп[2] Конец 72,993,044 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • кальций-транспортная активность АТФазы • связывание ионов металлов • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0036442 водород-экспортирующая активность АТФазы, фосфорилирующий механизм Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • не мембрана • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • саркоплазматический ретикулум • мембрана с плотной трубчатой ​​сеткой тромбоцитов • эндоплазматический ретикулум • ядро клетки • мембрана саркоплазматического ретикулума Биологический процесс • регуляция сердечной проводимости • ионный транспорт • трансмембранный перенос ионов • трансмембранный транспорт ионов кальция • транспорт ионов кальция • клеточный гомеостаз ионов кальция • трансмембранный перенос ионов водорода Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	489	53313
Ансамбль	ENSG00000074370	ENSMUSG00000020788
UniProt	Q93084	Q64518
RefSeq (мРНК)	NM_005173 NM_174953 NM_174954 NM_174955 NM_174956 NM_174957 NM_174958	NM_001163336 NM_001163337 NM_016745
RefSeq (белок)	NP_005164 NP_777613 NP_777614 NP_777615 NP_777616 NP_777617 NP_777618	NP_001156808 NP_001156809 NP_058025
Расположение (UCSC)	Chr 17: 3.92 - 3.96 Мб	Chr 11: 72.96 - 72.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальциевая АТФаза 3 саркоплазматического / эндоплазматического ретикулума является фермент что в люди кодируется ATP2A3 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует один из SERCA Ca²⁺-АТФазы, которые представляют собой внутриклеточные насосы, расположенные в саркоплазматический или эндоплазматическая сеть ячеек. Экспрессия SERCA3 первоначально описывалась как немышечная, но недавно наблюдалась у кардиомиоцит. Этот фермент катализирует гидролиз АТФ в сочетании с транслокацией кальций от цитозоль в саркоплазматический ретикулум просвет, и участвует в секвестрации кальция, связанной с мышечным возбуждением и сокращением. Альтернативный сплайсинг приводит к 6 вариантам транскрипта, кодирующим различные изоформы с именами от SERCA3a до SERCA3f.^[6]

Рак

Наблюдалось, что ген ATP2A3 постепенно подавляется в Вирус папилломы человека -положительный опухолевые кератиноциты происходит из шейки матки предопухолевые поражения на разных уровнях злокачественности.^[7] По этой причине ATP2A3, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером шейки матки. предопухолевые поражения прогрессия.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000074370 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020788 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Dode L, Wuytack F, Kools PF, Baba-Aissa F, Raeymaekers L, Brike F, van de Ven WJ, Casteels R (ноябрь 1996 г.). "клонирование кДНК, экспрессия и хромосомная локализация человеческого сарко / эндоплазматического ретикулума Са²⁺-Ген АТФазы 3 ". Biochem J. 318 (2): 689–99. Дои:10.1042 / bj3180689. ЧВК  1217674. PMID  8809064.
6. "Ген Entrez: ATP2A3 ATPase, Ca ++ транспорт, повсеместно".
7. Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (апрель 2015 г.). «Изменения экспрессии генов при прогрессировании неоплазии шейки матки, выявленные с помощью микроматричного анализа неопластических кератиноцитов шейки матки». J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. Дои:10.1002 / jcp.24808. PMID  25205602. S2CID  24986454.

внешние ссылки

• Человек ATP2A3 расположение генома и ATP2A3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Wuytack F, Papp B, Verboomen H и др. (1994). "Сарко / эндоплазматический ретикулум Са²⁺-ATPase 3-типа Ca²⁺ pump экспрессируется в тромбоцитах, лимфоидных клетках и тучных клетках ». J. Biol. Chem. 269 (2): 1410–6. PMID  8288608.
• Dode L, De Greef C, Mountian I и др. (1998). "Структура сарко / эндоплазматического ретикулума человека Ca²⁺-Ген АТФазы 3. Анализ промотора и альтернативный сплайсинг пре-мРНК SERCA3 ». J. Biol. Chem. 273 (22): 13982–94. Дои:10.1074 / jbc.273.22.13982. PMID  9593748.
• Поч Э., Лич С., Снейп С. и др. (1999). «Функциональная характеристика альтернативно сплайсированных транскриптов SERCA3 человека». Am. J. Physiol. 275 (6, часть 1): C1449–58. Дои:10.1152 / ajpcell.1998.275.6.C1449. PMID  9843705.
• Мартин V, Бреду Р., Корвазье Э. и др. (2002). "Три новых сарко / эндоплазматического ретикулума Ca²⁺-ATPase (SERCA) 3 изоформы. Экспрессия, регуляция и функция мембран семейства SERCA3 ». J. Biol. Chem. 277 (27): 24442–52. Дои:10.1074 / jbc.M202011200. PMID  11956212.
• Gélébart P, Kovács T, Brouland JP и др. (2002). «Экспрессия эндомембранных кальциевых насосов в клетках рака толстой кишки и желудка. Индукция экспрессии SERCA3 во время дифференцировки». J. Biol. Chem. 277 (29): 26310–20. Дои:10.1074 / jbc.M201747200. PMID  11986315.
• Доде Л., Вилсен Б., Ван Баелен К. и др. (2003). "Вскрытие функциональных различий между сарко (эндо) плазматическим ретикулумом Ca²⁺-ATPase (SERCA) 1 и изоформы 3 по данным стационарного и временного кинетического анализа ». J. Biol. Chem. 277 (47): 45579–91. Дои:10.1074 / jbc.M207778200. PMID  12207029.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Хьюстон R (2003). «Продольные срезы незафиксированной мышцы». Биотехника и гистохимия. 77 (4): 229–30. PMID  12503734.
• Борге П.Д., Вольф Б.А. (2003). «Субстрат рецептора инсулина 1, регуляция кальциевой АТФазы 3 саркоэндоплазматического ретикулума в инсулин-секретирующих бета-клетках». J. Biol. Chem. 278 (13): 11359–68. Дои:10.1074 / jbc.M209521200. PMID  12524443.
• Чандрасекера С.П., Литтон Дж. (2003). «Ингибирование человеческого SERCA3 с помощью PL / IM430. Молекулярный анализ взаимодействия». J. Biol. Chem. 278 (14): 12482–8. Дои:10.1074 / jbc.M212745200. PMID  12540840.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Бобе Р., Бреду Р., Корвазье Э. и др. (2004). «Идентификация, экспрессия, функция и локализация новой (шестой) изоформы сарко / эндоплазматического ретикулума человека Ca»²⁺Ген АТФазы 3 ". J. Biol. Chem. 279 (23): 24297–306. Дои:10.1074 / jbc.M314286200. PMID  15028735.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Бруланд Дж. П., Гелебарт П., Ковач Т. и др. (2005). «Утрата экспрессии АТФазы 3 транспорта кальция в сарко / эндоплазматическом ретикулуме является ранним событием во время многоступенчатого процесса канцерогенеза толстой кишки». Am. Дж. Патол. 167 (1): 233–42. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 62968-9. ЧВК  1603437. PMID  15972967.
• Адри Л., Павойн С., Липская Л. и др. (2006). "Транскрипция Са саркоплазматического / эндоплазматического ретикулума²⁺-Ген АТФазы типа 3, ATP2A3, регулируется путем кальциневрина / NFAT в эндотелиальных клетках ». Biochem. J. 394 (Pt 1): 27–33. Дои:10.1042 / BJ20051387. ЧВК  1385999. PMID  16250893.
• Вуттон LL, Микеланджели Ф (2006). «Влияние мутации фенилаланина 256 на валин на чувствительность саркоплазматического / эндоплазматического ретикулума Ca²⁺ АТФаза (SERCA) Ca²⁺ перекачивать изоформы 1, 2 и 3 в тапсигаргин и другие ингибиторы ». J. Biol. Chem. 281 (11): 6970–6. Дои:10.1074 / jbc.M510978200. PMID  16410239.
• Шабан С., Корвазье Э., Бреду Р. и др. (2006). "Сарко / эндоплазматический ретикулум Са²⁺Изоформы АТФазы типа 3 (SERCA3b и SERCA3f): разные роли в клеточной адгезии и стрессе ER ». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 345 (4): 1377–85. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.05.054. PMID  16725111.
• Бреду Р., Корвазье Э., Далли С. и др. (2006). "Тромбоциты человека Ca²⁺-АТФазы: новые маркеры дифференцировки клеток при идиопатическом сколиозе ». Тромбоциты. 17 (6): 421–33. Дои:10.1080/09537100600758719. PMID  16973504. S2CID  24473757.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.