Белок, активирующий расщепление SREBP - SREBP cleavage-activating protein

SCAP
Идентификаторы
Псевдонимы	SCAP, entrez: 22937, SREBF chaperone
Внешние идентификаторы	OMIM: 601510 MGI: 2135958 ГомолоГен: 8160 Генные карты: SCAP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.31 Начните 47,413,681 бп[1] Конец 47,477,126 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 F2 | 9 59.91 см Начните 110,333,288 бп[2] Конец 110,384,950 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание холестерина • развернутое связывание с белками • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса • связывание стерола Сотовый компонент • мембрана эндоплазматического ретикулума • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • Мембрана Гольджи • эндоплазматический ретикулум • цитоплазматический пузырек • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • ответ на гипоксию • старение • метаболический процесс холестерина • ответ на инсулин • регулирование процесса биосинтеза жирных кислот • отрицательная регуляция процесса биосинтеза холестерина • стероидный метаболический процесс • липидный обмен • регулирование процесса обмена жирных кислот • Сигнальный путь SREBP • регуляция процесса биосинтеза холестерина • иммунная реакция • клеточный липидный метаболический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	22937	235623
Ансамбль	ENSG00000114650	ENSMUSG00000032485
UniProt	Q12770	Q6GQT6
RefSeq (мРНК)	NM_012235 NM_001320044	NM_001001144 NM_001103162
RefSeq (белок)	NP_001306973 NP_036367	NP_001001144 NP_001096632
Расположение (UCSC)	Chr 3: 47.41 - 47.48 Мб	Chr 9: 110.33 - 110.38 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Стерол-регуляторный элемент-связывающий белок, активирующий расщепление., также известный как Белок, активирующий расщепление SREBP или SCAP это белок что у людей кодируется SCAP ген.^[5][6][7][8]

SCAP содержит стерол-чувствительный домен (SSD) и семь WD домены. В клетках с обедненным холестерином этот белок связывается с белки, связывающие регуляторный элемент стерола (SREBP) и обеспечивает их транспортировку из ER к аппарат Гольджи. Затем SREBP протеолитически расщепляются и стимулируют стерол биосинтез.^[5]

Функция

SCAP - это регуляторный белок, необходимый для протеолитический расщепление белка, связывающего регуляторный элемент стерола (SREBP ). SCAP - это интегральный мембранный белок, расположенный в эндоплазматический ретикулум (ER). Одна из цитозольных областей SCAP содержит гексапептид аминокислотная последовательность MELADL, которая определяет клеточный холестерин. Когда присутствует холестерин, SCAP претерпевает конформационные изменения, которые не позволяют ему активировать SREBP, и синтез холестерина не происходит.^[9]

Структура

Скап имеет 8 трансмембранных доменов и оба N-концевой и C-терминал лицом к лицу цитоплазма. Кроме того, он связывает SREBP серией последовательных повторов WD на своем C-конце.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114650 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032485 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: шаперон SREBF".
6. Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Танака А., Номура Н. (февраль 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. V. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0161-KIAA0200), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 3 (1): 17–24. Дои:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID  8724849.
7. Хуа Х, Нохтурфт А., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С. (ноябрь 1996 г.). «Устойчивость к стеролам в клетках СНО прослежена до точечной мутации в протеине, активирующем расщепление SREBP». Клетка. 87 (3): 415–26. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81362-8. PMID  8898195. S2CID  1963192.
8. Накадзима Т., Хамакубо Т., Кодама Т., Инадзава Дж., Эми М. (1999). «Геномная структура и хромосомное картирование гена белка, активирующего расщепление (SCAP), белка, связывающего человеческий стерол (SREBP)». J. Hum. Genet. 44 (6): 402–7. Дои:10.1007 / с100380050187. PMID  10570913.
9. Sun LP, Seemann J, Goldstein JL, Brown MS (2007). «Стерол-регулируемый транспорт SREBP от эндоплазматического ретикулума к Гольджи: Insig делает сигнал сортировки в Scap недоступным для белков COPII». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (16): 6519–26. Дои:10.1073 / pnas.0700907104. ЧВК  1851663. PMID  17428919.
10. Браун MS, Гольдштейн JL (1999). «Протеолитический путь, контролирующий содержание холестерина в мембранах, клетках и крови». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (20): 11041–8. Дои:10.1073 / пнас.96.20.11041. ЧВК  34238. PMID  10500120.

дальнейшее чтение

• Ле Хеллар С., Тайзен Ф.М., Хаберхаузен М. и др. (2009). «Связь между индуцированным инсулином геном 2 (INSIG2) и увеличением веса в немецкой выборке пациентов с шизофренией, леченных антипсихотиками: нарушение липогенеза, контролируемого SREBP, при побочных эффектах метаболизма, связанных с лекарствами?». Мол. Психиатрия. 14 (3): 308–17. Дои:10.1038 / sj.mp.4002133. PMID  18195716.
• McGeachie M, Ramoni RL, Mychaleckyj JC, et al. (2009). «Интегративная прогностическая модель кальцификации коронарных артерий при атеросклерозе». Тираж. 120 (24): 2448–54. Дои:10.1161 / CIRCULATIONAHA.109.865501. ЧВК  2810344. PMID  19948975.
• Friedlander Y, Schwartz SM, Durst R, et al. (2008). «Изоформы SREBP-2 и SCAP и риск раннего инфаркта миокарда». Атеросклероз. 196 (2): 896–904. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2007.02.006. PMID  17383658.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2005). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Джавитт Н.Б. (2002). «Холестерин, гидроксихолестерины и желчные кислоты». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 292 (5): 1147–53. Дои:10.1006 / bbrc.2001.2013. PMID  11969205.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Ли Дж. Н., Гонг И, Чжан Икс, Е Дж (2006). «Протеасомная деградация убиквитинированных белков Insig определяется по остаткам серина, фланкирующим убиквитинированные лизины». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (13): 4958–63. Дои:10.1073 / pnas.0600422103. ЧВК  1405624. PMID  16549805.
• Лу И, Долле М.Э, Имхольц С. и др. (2008). «Множественные генетические варианты по пути-кандидату влияют на концентрацию холестерина липопротеинов высокой плотности в плазме». J. Lipid Res. 49 (12): 2582–9. Дои:10.1194 / мл. M800232-JLR200. PMID  18660489.
• Сучанек М, Радзиковска А, Тиле С (2005). «Фото-лейцин и фото-метионин позволяют идентифицировать белок-белковые взаимодействия в живых клетках». Nat. Методы. 2 (4): 261–7. Дои:10.1038 / nmeth752. PMID  15782218.
• Ирисава М., Иноуэ Дж., Одзава Н. и др. (2009). «Стерол-чувствительный мембранный белок эндоплазматического ретикулума (ER) TRC8 препятствует транспорту ER в Гольджи белка-2, связывающего регуляторный элемент стерола (SREBP-2) / белка, активируемого расщеплением SREBP, и снижает расщепление SREBP-2». J. Biol. Chem. 284 (42): 28995–9004. Дои:10.1074 / jbc.M109.041376. ЧВК  2781446. PMID  19706601.
• Ян Л.Х., Чен Д.Ф. (2007). «[Влияние TNF альфа на экспрессию SCAP и содержание триглицеридов в культивируемых стеатотических гепатоцитах]». Чжунхуа Ган Цзанг Бинг За Чжи. 15 (10): 767–70. PMID  17963605.
• Воора Д., Шах С.Х., Рид С.Р. и др. (2008). «Фармакогенетические предикторы снижения холестерина липопротеидов низкой плотности, опосредованного статинами, и ответ на дозу». Circ Cardiovasc Genet. 1 (2): 100–6. Дои:10.1161 / CIRCGENETICS.108.795013. ЧВК  2995295. PMID  20031551.
• Fan YM, Karhunen PJ, Levula M, et al. (2008). «Экспрессия фактора транскрипции, связывающего регуляторный элемент стерола (SREBF) 2 и белка, активирующего расщепление SREBF (SCAP), в атероме человека и ассоциация их аллельных вариантов с внезапной сердечной смертью». Тромб J. 6: 17. Дои:10.1186/1477-9560-6-17. ЧВК  2645360. PMID  19116028.
• Vasseur F, Caeyseele T, Barat-Houari M, et al. (2010). «Соответствие двух множественных аналитических подходов демонстрирует, что взаимодействие между гаплотипами ИМТ и ADIPOQ является детерминантом холестерина ЛПНП в общей французской популяции». J. Hum. Genet. 55 (4): 227–31. Дои:10.1038 / jhg.2010.10. PMID  20186155.
• Дерст Р., Янсен А., Эрез Г. и др. (2006). «Дискретный и комбинированный эффект изоформ SREBP-2 и SCAP в контроле липидов плазмы у пациентов с семейной гиперхолестеринемией». Атеросклероз. 189 (2): 443–50. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2006.01.001. PMID  16466730.
• Лю X, Li Y, Lu X и ​​др. (2010). «Взаимодействие между генетическими вариантами пути, связанного с активацией SREBP2, на риск ишемической болезни сердца в китайской ханьской популяции». Атеросклероз. 208 (2): 421–6. Дои:10.1016 / j.atherosclerosis.2009.08.011. PMID  19740467.
• Чен С.Н., Чилингироглу М., Тодд Дж. И др. (2009). «Кандидатный генетический анализ липопротеидов-холестерина высокой плотности в плазме крови и степени тяжести коронарного атеросклероза». BMC Med. Genet. 10: 111. Дои:10.1186/1471-2350-10-111. ЧВК  2775733. PMID  19878569.
• Ли Дж. Н., Чжан Х, Ферамиско Дж. Д. и др. (2008). «Ненасыщенные жирные кислоты ингибируют протеасомную деградацию Insig-1 на стадии постубиквитинирования». J. Biol. Chem. 283 (48): 33772–83. Дои:10.1074 / jbc.M806108200. ЧВК  2586246. PMID  18835813.
• Ниеминен Т., Матинхейкки Дж., Ненонен А. и др. (2007). «Взаимосвязь полиморфизма белка активации расщепления белка, связывающего регуляторный элемент стерола, и полиморфизма гена аполипопротеина Е с метаболическими изменениями во время снижения веса». Метаб. Clin. Опыт. 56 (7): 876–80. Дои:10.1016 / j.metabol.2007.02.003. PMID  17570245.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.