SUDS3 - SUDS3

SUDS3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2N2H, 4ZQA
Идентификаторы
Псевдонимы	SUDS3, SAP45, SDS3, гомолог SDS3, компонент комплекса корепрессора SIN3A
Внешние идентификаторы	OMIM: 608250 MGI: 1919204 ГомолоГен: 15906 Генные карты: SUDS3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.23 Начинать 118,376,555 бп[1] Конец 118,418,033 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начинать 117,091,680 бп[2] Конец 117,116,113 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание гистондеацетилазы • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • активность гистондеацетилазы Сотовый компонент • Sin3 комплекс • нуклеоплазма • Комплекс типа Sin3 • ядро клетки • цитозоль • ядерное тело Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие черной субстанции • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деацетилирование гистонов • апоптотический процесс • ковалентная модификация хроматина • деубиквитинирование белков • организация хроматина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64426	71954
Ансамбль	ENSG00000111707	ENSMUSG00000066900
UniProt	Q9H7L9	Q8BR65
RefSeq (мРНК)	NM_022491	NM_001122666 NM_178622
RefSeq (белок)	NP_071936	NP_001116138 NP_848737
Расположение (UCSC)	Chr 12: 118.38 - 118.42 Мб	Chr 5: 117.09 - 117.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Компонент корепрессорного комплекса гистондеацетилазы Sin3 SDS3 является фермент что у людей кодируется SUDS3 ген.^[5][6]

Функция

SDS3 является субъединицей гистондеацетилазы (см. HDAC1; MIM 601241) -зависимого корепрессорного комплекса SIN3A (MIM 607776) (Fleischer et al., 2003) [предоставлено OMIM]^[6]

Взаимодействия

SUDS3 был показан взаимодействовать с HDAC1,^[5][7] Фактор клетки-хозяина C1,^[8] SIN3B^[5] и SIN3A.^[5][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111707 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000066900 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Алланд Л., Дэвид Дж., Шен-Ли Х, Потес Дж., Мюле Р., Ли ХК, Хоу Х, Чен К., ДеПиньо Р.А. (апрель 2002 г.). «Идентификация Sds3 млекопитающих как неотъемлемого компонента корепрессорного комплекса Sin3 / гистондеацетилазы». Молекулярная и клеточная биология. 22 (8): 2743–50. Дои:10.1128 / MCB.22.8.2743-2750.2002. ЧВК  133736. PMID  11909966.
6. "Ген Entrez: SUDS3 супрессор дефектного гомолога сайленсинга 3 (S. cerevisiae)".
7. Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. ЧВК  164750. PMID  12724404.
8. Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). «Деацетилаза Sin3 человека и связанная с тритораксом гистона H3-K4 метилтрансфераза Set1 / Ash2 селективно связываются вместе фактором пролиферации клеток HCF-1». Гены и развитие. 17 (7): 896–911. Дои:10.1101 / gad.252103. ЧВК  196026. PMID  12670868.

дальнейшее чтение

• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE (май 2003 г.). «Идентификация и характеристика трех новых компонентов корепрессорного комплекса mSin3A». Молекулярная и клеточная биология. 23 (10): 3456–67. Дои:10.1128 / MCB.23.10.3456-3467.2003. ЧВК  164750. PMID  12724404.
• Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). «Деацетилаза Sin3 человека и связанная с тритораксом Set1 / Ash2 гистон H3-K4 метилтрансфераза селективно связаны вместе фактором пролиферации клеток HCF-1». Гены и развитие. 17 (7): 896–911. Дои:10.1101 / gad.252103. ЧВК  196026. PMID  12670868.
• Хаттори А., Окумура К., Нагасе Т., Кикуно Р., Хиросава М., Охара О. (декабрь 2000 г.). «Характеристика длинных клонов кДНК из селезенки взрослого человека». ДНК исследования. 7 (6): 357–66. Дои:10.1093 / dnares / 7.6.357. PMID  11214971.