Фактор клетки-хозяина C1 - Host cell factor C1

HCFC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4GO6, 4N39, 4N3A, 4Н3Б, 4N3C
Идентификаторы
Псевдонимы	HCFC1, CFF, HCF-1, HCF1, HFC1, MRX3, PPP1R89, VCAF, HCF, фактор клетки-хозяина C1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300019 MGI: 105942 ГомолоГен: 3898 Генные карты: HCFC1
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq28 Начните 153,947,557 бп[1] Конец 153,971,818 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A7,3 | X 37,52 см Начните 73,942,792 бп[2] Конец 73,966,357 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание хроматина • активность гистонацетилтрансферазы (специфическая для H4-K8) • гистонацетилтрансферазная активность (специфическая для H4-K5) • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность гистонацетилтрансферазы (специфическая для H4-K16) • связывание кадгерина • активация связывания фактора транскрипции • связывание с белками, мостик • Последовательно-специфичное связывание двухцепочечной ДНК Сотовый компонент • цитоплазма • Комплекс активаторов транскрипции Ada2 / Gcn5 / Ada3 • мембрана • Комплекс типа САГА • Комплекс Set1C / COMPASS • аксон • тело нейрональной клетки • MLL1 комплекс • дендрит • гистонацетилтрансферазный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • освобождение от вирусной задержки • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • стабилизация белка • митохондриальная организация • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • ацетилирование гистона H4-K5 • положительная регуляция экспрессии генов • положительная регуляция клеточного цикла • клеточный цикл • ацетилирование гистона H4-K16 • GO: 0022415 вирусный процесс • ацетилирование гистона H4-K8 • регуляция сборки белкового комплекса • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • ковалентная модификация хроматина • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • деубиквитинирование белков • вылупление бластоцисты • организация хроматина • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3054	15161
Ансамбль	ENSG00000172534	ENSMUSG00000031386
UniProt	P51610	Q61191
RefSeq (мРНК)	NM_005334	NM_008224
RefSeq (белок)	NP_005325	NP_032250
Расположение (UCSC)	Chr X: 153.95 - 153.97 Мб	Chr X: 73.94 - 73.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор клетки-хозяина 1 (HCFC1, HCF1, или HCF-1), также известен как VP16-дополнительный белок,^[5] это белок что у людей кодируется HCFC1 ген.^[6][7]

Структура

HCF1 является членом высококонсервативного семейства факторов клетки-хозяина и кодирует белок с пятью Кельч повторяет, а фибронектин-подобный мотив, и шесть HCF повторяет, каждый из которых содержит высокоспецифичный сигнал расщепления. Этот ядерный корегулятор транскрипции является протеолитически расщепляется на одном или нескольких из шести возможных участков, в результате чего создается N-концевой цепь и соответствующие C-терминал цепь. Конечная форма этого белка состоит из нековалентно связанных N- и C-концевых цепей, которые взаимодействуют посредством электростатических сил.

Функция

HCF1 участвует в контроле клеточный цикл а также выполнение регулирующих функций во множестве процессов, связанных с транскрипция. Кроме того, работа с модельными организмами указывает на HCF1 как на предполагаемый долголетие определитель.^[8] Альтернативно сращенный описаны варианты, которые кодируют различные изоформы белков; однако не все варианты были полностью охарактеризованы.^[7]

Мутации в этом гене связаны с нарушениями кобаламин метаболизм.^[9]

Взаимодействия

Фактор клетки-хозяина С1 может взаимодействовать с участием:

• BAP1,^[10]
• CREB3,^[11][12]
• ГАБПА,^[13]
• HDAC1,^[14]
• HDAC2,^[14]
• MLL,^[15]
• OGT,^[14]
• PDCD2,^[16]
• POU2F1,^[17][18]
• PPP1CA,^[19]
• SIN3A,^[14][15]
• SP1,^[14][20]
• SUDS3,^[14]
• WDR5,^[14][15] и
• ZBTB17.^[21]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172534 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031386 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Запись GeneCards для HCFC1, http://genecards.org В архиве 2013-10-14 на Wayback Machine
6. Wilson AC, LaMarco K, Peterson MG, Herr W. (июль 1993 г.). «Вспомогательный белок VP16 HCF представляет собой семейство полипептидов, процессируемых из большого белка-предшественника». Ячейка. 74 (1): 115–25. Дои:10.1016/0092-8674(93)90299-6. PMID  8392914.
7. «Ген Entrez: фактор C1 клетки-хозяина HCFC1 (дополнительный белок VP16)».
8. Ли Дж., Эбата А., Донг И, Ризки Дж., Ивата Т., Ли СС (сентябрь 2008 г.). «Caenorhabditis elegans HCF-1 функционирует в поддержании долговечности как регулятор DAF-16». PLoS Биология. 6 (9): e233. Дои:10.1371 / journal.pbio.0060233. ЧВК  2553839. PMID  18828672.
9. Yu HC, Sloan JL, Scharer G, Brebner A, Quintana AM, Achilly NP, Manoli I, Coughlin CR, Geiger EA, Schneck U, Watkins D, Suormala T., Van Hove JL, Fowler B, Baumgartner MR, Rosenblatt DS, Venditti CP, шейх TH (сентябрь 2013 г.). «Х-связанное нарушение кобаламина, вызванное мутациями в корегуляторе транскрипции HCFC1». Американский журнал генетики человека. 93 (3): 506–14. Дои:10.1016 / j.ajhg.2013.07.022. ЧВК  3769968. PMID  24011988.
10. Мачида Ю. Дж., Мачида Ю., Вашишт А. А., Вольшлегель Дж. А., Датта А. (декабрь 2009 г.). «Деубиквитинирующий фермент BAP1 регулирует рост клеток посредством взаимодействия с HCF-1». Журнал биологической химии. 284 (49): 34179–88. Дои:10.1074 / jbc.M109.046755. ЧВК  2797188. PMID  19815555.
11. Лу Р, Ян П., Падмакумар С., Мисра В. (август 1998 г.). «Трансактиватор вируса герпеса VP16 имитирует человеческий основной домен лейциновой молнии, luman, во взаимодействии с HCF». Журнал вирусологии. 72 (8): 6291–7. ЧВК  109766. PMID  9658067.
12. Freiman RN, Herr W. (декабрь 1997 г.). «Вирусная мимикрия: общий способ ассоциации с HCF посредством VP16 и клеточного белка LZIP». Гены и развитие. 11 (23): 3122–7. Дои:10.1101 / gad.11.23.3122. ЧВК  316754. PMID  9389645.
13. Vogel JL, Kristie TM (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции GABP». Журнал EMBO. 19 (4): 683–90. Дои:10.1093 / emboj / 19.4.683. ЧВК  305606. PMID  10675337.
14. Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W (апрель 2003 г.). «Деацетилаза Sin3 человека и связанная с тритораксом Set1 / Ash2 гистон H3-K4 метилтрансфераза селективно связаны вместе фактором пролиферации клеток HCF-1». Гены и развитие. 17 (7): 896–911. Дои:10.1101 / gad.252103. ЧВК  196026. PMID  12670868.
15. Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J, Sanyal M, Aufiero DJ, Kitabayashi I, Herr W, Cleary ML (июль 2004 г.). «Протоонкопротеин лейкемии MLL образует SET1-подобный комплекс гистон-метилтрансферазы с менином для регуляции экспрессии гена Hox». Молекулярная и клеточная биология. 24 (13): 5639–49. Дои:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. ЧВК  480881. PMID  15199122.
16. Scarr RB, Sharp PA (август 2002 г.). «PDCD2 - негативный регулятор HCF-1 (C1)». Онкоген. 21 (34): 5245–54. Дои:10.1038 / sj.onc.1205647. PMID  12149646.
17. La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (январь 1999 г.). «Зависящий от HCF ядерный импорт VP16». Журнал EMBO. 18 (2): 480–9. Дои:10.1093 / emboj / 18.2.480. ЧВК  1171141. PMID  9889203.
18. Кристи TM, Sharp PA (март 1993 г.). «Очистка клеточного фактора С1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-трансиндукции вируса простого герпеса (VP16)». Журнал биологической химии. 268 (9): 6525–34. PMID  8454622.
19. Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (февраль 2000 г.). «Связь активности протеинфосфатазы 1 с комплексом человеческого фактора C1 (HCF)». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (3): 678–86. Дои:10.1093 / nar / 28.3.678. ЧВК  102561. PMID  10637318.
20. Gunther M, Laithier M, Brison O (июль 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, идентифицированный в результате двухгибридного скрининга». Молекулярная и клеточная биохимия. 210 (1–2): 131–42. Дои:10.1023 / А: 1007177623283. PMID  10976766.
21. Пилусо Д., Билан П., Капоне Дж. П. (ноябрь 2002 г.). «Фактор-1 клетки-хозяина взаимодействует и противодействует трансактивации регуляторным фактором клеточного цикла Miz-1». Журнал биологической химии. 277 (48): 46799–808. Дои:10.1074 / jbc.M206226200. PMID  12244100.

дальнейшее чтение

• Oehler T, Angel P (декабрь 1992 г.). «Общий промежуточный фактор (p52 / 54), распознающий домены типа« кислых блобов », необходим для активации транскрипции белками Jun». Молекулярная и клеточная биология. 12 (12): 5508–15. Дои:10.1128 / mcb.12.12.5508. ЧВК  360488. PMID  1448082.
• Wilson AC, Peterson MG, Herr W. (октябрь 1995 г.). «Повтор HCF - необычный сигнал протеолитического расщепления». Гены и развитие. 9 (20): 2445–58. Дои:10.1101 / gad.9.20.2445. PMID  7590226.
• Клемм Р.Д., Гудрич Дж. А., Чжоу С., Тьянь Р. (июнь 1995 г.). «Молекулярное клонирование и экспрессия субъединицы 32 кДа человеческого TFIID выявляет взаимодействия с VP16 и TFIIB, которые опосредуют активацию транскрипции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (13): 5788–92. Дои:10.1073 / пнас.92.13.5788. ЧВК  41586. PMID  7597030.
• Frattini A, Faranda S, Redolfi E, Zucchi I, Villa A, Patrosso MC, Strina D, Susani L, Vezzoni P (сентябрь 1994 г.). «Геномная организация человеческого вспомогательного белка VP16, гена домашнего хозяйства (HCFC1), отображающего Xq28». Геномика. 23 (1): 30–5. Дои:10.1006 / geno.1994.1455. PMID  7829097.
• Кристи Т.М., Померанц Дж. Л., Туми Т.С., Родитель С.А., Шарп П.А. (март 1995 г.). «Клеточный фактор C1 комплекса энхансеров вируса простого герпеса представляет собой семейство полипептидов». Журнал биологической химии. 270 (9): 4387–94. Дои:10.1074 / jbc.270.9.4387. PMID  7876203.
• Кристи TM, Sharp PA (март 1993 г.). «Очистка клеточного фактора С1, необходимого для стабильного распознавания гомеодомена Oct-1 фактором альфа-трансиндукции вируса простого герпеса (VP16)». Журнал биологической химии. 268 (9): 6525–34. PMID  8454622.
• Зоппе М., Фраттини А., Фаранда С., Веццони П. (май 1996 г.). «Полная последовательность гена фактора 1 клетки-хозяина (HCFC1) и его промотора: роль фактора транскрипции YY1 в регуляции его экспрессии». Геномика. 34 (1): 85–91. Дои:10.1006 / geno.1996.0244. PMID  8661027.
• Wilson AC, Freiman RN, Goto H, Nishimoto T., Herr W. (октябрь 1997 г.). «VP16 нацелен на амино-концевой домен HCF, участвующий в прогрессировании клеточного цикла». Молекулярная и клеточная биология. 17 (10): 6139–46. Дои:10.1128 / mcb.17.10.6139. ЧВК  232464. PMID  9315674.
• Freiman RN, Herr W. (декабрь 1997 г.). «Вирусная мимикрия: общий способ ассоциации с HCF посредством VP16 и клеточного белка LZIP». Гены и развитие. 11 (23): 3122–7. Дои:10.1101 / gad.11.23.3122. ЧВК  316754. PMID  9389645.
• Лу Р, Ян П., Падмакумар С., Мисра В. (август 1998 г.). «Трансактиватор вируса герпеса VP16 имитирует человеческий основной домен лейциновой молнии, luman, во взаимодействии с HCF». Журнал вирусологии. 72 (8): 6291–7. ЧВК  109766. PMID  9658067.
• Ge H, Si Y, Roeder RG (ноябрь 1998 г.). «Выделение кДНК, кодирующих новые коактиваторы транскрипции p52 и p75, выявляет альтернативный регуляторный механизм активации транскрипции». Журнал EMBO. 17 (22): 6723–9. Дои:10.1093 / emboj / 17.22.6723. ЧВК  1171017. PMID  9822615.
• La Boissière S, Hughes T, O'Hare P (январь 1999 г.). «Зависящий от HCF ядерный импорт VP16». Журнал EMBO. 18 (2): 480–9. Дои:10.1093 / emboj / 18.2.480. ЧВК  1171141. PMID  9889203.
• Лу Р., Мисра В. (январь 2000 г.). «Возможная роль люмана, клеточного гомолога вируса простого герпеса VP16 (транс-индуцирующий фактор альфа-гена), в латентном периоде вируса герпеса». Журнал вирусологии. 74 (2): 934–43. Дои:10.1128 / JVI.74.2.934-943.2000. ЧВК  111614. PMID  10623756.
• Махаджан СС, Уилсон А.С. (февраль 2000 г.). «Мутации фактора 1 клетки-хозяина отделяют его роль в пролиферации клеток от рекрутирования VP16 и LZIP». Молекулярная и клеточная биология. 20 (3): 919–28. Дои:10.1128 / MCB.20.3.919-928.2000. ЧВК  85209. PMID  10629049.
• Ajuh PM, Browne GJ, Hawkes NA, Cohen PT, Roberts SG, Lamond AI (февраль 2000 г.). «Связь активности протеинфосфатазы 1 с комплексом человеческого фактора C1 (HCF)». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (3): 678–86. Дои:10.1093 / nar / 28.3.678. ЧВК  102561. PMID  10637318.
• Vogel JL, Kristie TM (февраль 2000 г.). «Новый коактиватор C1 (HCF) координирует образование мультипротеинового энхансера и опосредует активацию транскрипции с помощью GABP». Журнал EMBO. 19 (4): 683–90. Дои:10.1093 / emboj / 19.4.683. ЧВК  305606. PMID  10675337.
• Скарр Р.Б., Смит М.Р., Беддалл М., Шарп, Пенсильвания (май 2000 г.). «Новый 50-килодальтонный фрагмент фактора 1 (C1) клетки-хозяина в клетках G (0)». Молекулярная и клеточная биология. 20 (10): 3568–75. Дои:10.1128 / MCB.20.10.3568-3575.2000. ЧВК  85649. PMID  10779346.
• Чой Й, Асада С., Уэсуги М. (май 2000 г.). «Дивергентные hTAFII31-связывающие мотивы, скрытые в доменах активации». Журнал биологической химии. 275 (21): 15912–6. Дои:10.1074 / jbc.275.21.15912. PMID  10821850.
• Лу Р, Мисра В (июнь 2000 г.). «Zhangfei: второй клеточный белок взаимодействует с дополнительным фактором вируса простого герпеса HCF аналогично Luman и VP16». Исследования нуклеиновых кислот. 28 (12): 2446–54. Дои:10.1093 / nar / 28.12.2446. ЧВК  102720. PMID  10871379.