SYBL1 - SYBL1

VAMP7
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	2DMW
Идентификаторы
Псевдонимы	VAMP7, SYBL1, TI-VAMP, TIVAMP, VAMP-7, мембранный белок, связанный с везикулами 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 300053 MGI: 1096399 ГомолоГен: 4121 Генные карты: VAMP7
Расположение гена (человек)
Chr.	Х-хромосома (человек)
Конец	155,943,769 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Привязка SNARE; • Активность рецептора SNAP; • связывание синтаксина; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• внеклеточная экзосома; • транспортная везикула; • псевдоподия; • цитоплазма; • мембрана транспортных везикул; • синапс; • неотъемлемый компонент мембраны; • сеть транс-Гольджи; • мембрана азурофильных гранул; • аппарат Гольджи; • соединение клеток; • альфа-гранула тромбоцитов; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • ламеллиподиум; • апикальная часть клетки; • проекция нейрона; • мембрана; • поверхность клетки; • мембрана фагоцитарных везикул; • эндоплазматический ретикулум; • перинуклеарная область цитоплазмы; • мембрана эндоплазматического ретикулума; • секреторная гранула; • секреторная мембрана гранул; • лизосома; • цитоплазматический пузырек; • мембрана поздней эндосомы; • эндосома; • фагоцитарный пузырек; • клеточная мембрана; • лизосомальная мембрана; • Комплекс SNARE; • мембрана везикул, покрытая клатрином; • синаптический пузырек; • неотъемлемый компонент мембраны синаптических пузырьков; • моховое волокно гиппокампа к синапсу CA3;
Биологический процесс	• GO: 0000046 Созревание аутофагосомы; • транспорт везикул по микротрубочкам; • слияние пузырьков с помощью аппарата Гольджи; • Гольджи к транспорту белков плазматической мембраны; • положительная регуляция секреции гистамина тучными клетками; • Комплексная сборка SNARE; • экзоцитоз, регулируемый ионами кальция; • транспорт триглицеридов; • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт; • пост-Гольджи-опосредованный везикулами транспорт; • регулирование доставки белка к вакуолярной мембране; • экзоцитоз; • естественная дегрануляция клеток-киллеров; • фагоцитоз, поглощение; • транспорт белка; • транспорт от эндосомы к лизосомам; • положительная регуляция морфогенеза дендритов; • слияние пузырьков; • везикулярный транспорт; • дегрануляция нейтрофилов; • дегрануляция эозинофилов; • эндоцитоз; • мембранная организация; • транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6845
	20955
	ENSG00000124333
	ENSMUSG00000051412
	P51809
	P70280
	NM_001145149; NM_001185183; NM_005638
	NM_001302138; NM_011515
	NP_001138621; NP_001172112; NP_005629
	NP_001289067; NP_035645; NP_001346080
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Синаптобревин -подобный белок 1 (SYBL1), также известен как мембранный белок, связанный с пузырьками 7 (VAMP7), это белок что у людей кодируется VAMP7, или SYBL1, ген.^[4]^[5]^[6]

Функция

SYBL1 - это трансмембранный белок, который входит в состав рецептора белка прикрепления растворимого N-этилмалеимид-чувствительного фактора (SNARE ) семья. SYBL1 локализуется слишком поздно эндосомы и лизосомы и участвует в слиянии транспорта пузырьки к их целевым мембранам.^[6]

Взаимодействия

SYBL1 показал взаимодействовать с участием SNAP23^[7]^[8] и AP3D1.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124333 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Д'Эспозито М., Чиккодикола А., Джанфранческо Ф., Эспозито Т., Флагиелло Л., Маццарелла Р., Шлессинджер Д., Д'Урсо М. (июль 1996 г.). «Синаптобревин-подобный ген в псевдоавтосомной области Xq28 подвергается X-инактивации». Nat. Genet. 13 (2): 227–9. Дои:10.1038 / ng0696-227. PMID 8640232.
^ Филиппини Ф., Росси В., Галли Т., Будильон А., Д'Урсо М., Д'Эспозито М. (июль 2001 г.). «Longins: новое эволюционно законсервированное семейство VAMP, разделяющее новый домен SNARE». Trends Biochem. Наука. 26 (7): 407–9. Дои:10.1016 / S0968-0004 (01) 01861-8. PMID 11440841.
^ ^а ^б «Энтрез Ген: SYBL1, подобный синаптобревину 1».
^ ^а ^б Мартинес-Арка С., Радж Р., Вакка М., Рапосо Дж., Камонис Дж., Про-Жильярдо В., Давиет Л., Формстехер Е., Гамбург А., Филиппини Ф., Д'Эспозито М., Галли Т. (июль 2003 г.). «Двойной механизм, контролирующий локализацию и функцию экзоцитарных v-SNARE». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (15): 9011–6. Дои:10.1073 / pnas.1431910100. ЧВК 166429. PMID 12853575.
^ Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапосо Дж., Тиан Дж. М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (июнь 1998 г.). «Новый мембранный белок, нечувствительный к столбняку, нечувствительный к везикулам, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток». Мол. Биол. Ячейка. 9 (6): 1437–48. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1437. ЧВК 25366. PMID 9614185.

дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапосо Дж., Тиан Дж. М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (1998). «Новый мембранный белок, нечувствительный к столбняку, нечувствительный к везикулам, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток». Мол. Биол. Ячейка. 9 (6): 1437–48. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1437. ЧВК 25366. PMID 9614185.
Адвани Р.Дж., Ян Б., Прекерис Р., Ли К.С., Клумперман Дж., Шеллер Р.Х. (1999). «VAMP-7 опосредует везикулярный транспорт от эндосом к лизосомам». J. Cell Biol. 146 (4): 765–76. Дои:10.1083 / jcb.146.4.765. ЧВК 2156136. PMID 10459012.
Matarazzo MR, Cuccurese M, Strazzullo M, Vacca M, Curci A, Miano MG, Cocchia M, Mercadante G, Torino A, D'Urso M, Ciccodicola A, D'Esposito M (1999). «Структура и экспрессия гена SYBL1 человека и мыши». Ген. 240 (1): 233–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00375-3. PMID 10564831.
Ciccodicola A, D'Esposito M, Esposito T, Gianfrancesco F, Migliaccio C, Miano MG, Matarazzo MR, Vacca M, Franzè A, Cuccurese M, Cocchia M, Curci A, Terracciano A, Torino A, Cocchia S, Mercadante G, Pannone E, Archidiacono N, Rocchi M, Schlessinger D, D'Urso M (2000). «Дифференциально регулируемые и эволюционирующие гены в полностью секвенированной псевдоавтосомной области Xq / Yq». Гм. Мол. Genet. 9 (3): 395–401. Дои:10,1093 / hmg / 9.3.395. PMID 10655549.
Уорд Д.М., Певснер Дж., Скаллион М.А., Вон М., Каплан Дж. (2000). «Синтаксин 7 и VAMP-7 представляют собой растворимые рецепторы белка прикрепления фактора, чувствительного к N-этилмалеимиду, необходимые для позднего слияния эндосома-лизосома и гомотипического лизосомы в альвеолярных макрофагах». Мол. Биол. Ячейка. 11 (7): 2327–33. Дои:10.1091 / mbc.11.7.2327. ЧВК 14922. PMID 10888671.
Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2000). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК 310948. PMID 11076863.
Антонин В., Холройд С., Фасшауэр Д., Пабст С., Фон Моллард Г.Ф., Ян Р. (2000). «Комплекс SNARE, опосредующий слияние поздних эндосом, определяет консервативные свойства структуры и функции SNARE». EMBO J. 19 (23): 6453–64. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6453. ЧВК 305878. PMID 11101518.
Уэйд Н., Брайант Н.Дж., Коннолли Л.М., Симпсон Р.Дж., Лузио Дж.П., Пайпер Р.К., Джеймс Д.Е. (2001). «Комплексы синтаксина 7 с взаимодействующим с хвостом Vps10p мыши 1b, синтаксином 6, ассоциированным с пузырьками мембранным белком (VAMP) 8 и VAMP7 в клетках меланомы b16». J. Biol. Chem. 276 (23): 19820–7. Дои:10.1074 / jbc.M010838200. PMID 11278762.
Антонин В., Фасшауэр Д., Беккер С., Ян Р., Шнайдер Т.Р. (2002). «Кристаллическая структура эндосомного комплекса SNARE раскрывает общие структурные принципы всех SNARE». Nat. Struct. Биол. 9 (2): 107–11. Дои:10.1038 / nsb746. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-F459-F. PMID 11786915.
Müller DJ, Schulze TG, Jahnes E, Cichon S, Krauss H, Kesper K, Held T, Maier W., Propping P, Nöthen MM, Rietschel M (2002). «Связь между полиморфизмом в псевдоавтосомном X-сцепленном гене SYBL1 и биполярным аффективным расстройством». Am. J. Med. Genet. 114 (1): 74–8. Дои:10.1002 / ajmg.10115. PMID 11840509.
Богданович А., Беннетт Н., Киффер С., Луваги М., Морио Т., Гарин Дж., Сатре М., Брукерт Ф. (2002). «Синтаксин 7, синтаксин 8, Vti1 и VAMP7 (ассоциированный с везикулами мембранный белок 7) образуют активный комплекс SNARE для раннего слияния макропиноцитарных компартментов в Dictyostelium discoideum». Biochem. J. 368 (Чт 1): 29–39. Дои:10.1042 / BJ20020845. ЧВК 1222979. PMID 12175335.
Матараццо М.Р., Де Бонис М.Л., Грегори Р.И., Вакка М., Хансен Р.С., Меркаданте Г., Д'Урсо М., Фейл Р., Д'Эспозито М. (2002). «Аллельная инактивация псевдоавтосомного гена SYBL1 контролируется эпигенетическими механизмами, общими для X- и Y-хромосом». Гм. Мол. Genet. 11 (25): 3191–8. Дои:10,1093 / чмг / 11,25,3191. PMID 12444103.
Мартинес-Арка С., Радж Р., Вакка М., Рапосо Дж., Камонис Дж., Про-Жильярдо В., Давиет Л., Формстехер Е., Гамбург А., Филиппини Ф., Д'Эспозито М., Галли Т. (2003). «Двойной механизм, контролирующий локализацию и функцию экзоцитарных v-SNARE». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (15): 9011–6. Дои:10.1073 / pnas.1431910100. ЧВК 166429. PMID 12853575.
Ди Лева Ф., Ферранте М.И., Демарчи Ф., Каравелли А., Матараццо М.Р., Джакка М., Д'Урсо М., Д'Эспозито М., Франце А. (2004). «Базальная транскрипция человеческого синаптобревин-подобного гена 1 регулируется посредством взаимодействия факторов активации транскрипции гена селеноцистеиновой тРНК - факторов цинкового пальца 143 с эволюционно консервативными цис-элементами». J. Biol. Chem. 279 (9): 7734–9. Дои:10.1074 / jbc.M308140200. PMID 14672948.
Рао С.К., Хюин С., Про-Жильярдо В., Галли Т., Эндрюс Н.В. (2004). «Идентификация SNARE, участвующих в лизосомном экзоцитозе, регулируемом синаптотагмином VII». J. Biol. Chem. 279 (19): 20471–9. Дои:10.1074 / jbc.M400798200. PMID 14993220.

внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: P51809 (Ассоциированный с пузырьками мембранный белок 7) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.

Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000124333 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid8640232-4] Д'Эспозито М., Чиккодикола А., Джанфранческо Ф., Эспозито Т., Флагиелло Л., Маццарелла Р., Шлессинджер Д., Д'Урсо М. (июль 1996 г.). «Синаптобревин-подобный ген в псевдоавтосомной области Xq28 подвергается X-инактивации». Nat. Genet. 13 (2): 227–9. Дои:10.1038 / ng0696-227. PMID 8640232.

[pmid11440841-5] Филиппини Ф., Росси В., Галли Т., Будильон А., Д'Урсо М., Д'Эспозито М. (июль 2001 г.). «Longins: новое эволюционно законсервированное семейство VAMP, разделяющее новый домен SNARE». Trends Biochem. Наука. 26 (7): 407–9. Дои:10.1016 / S0968-0004 (01) 01861-8. PMID 11440841.

[entrez-6] а ^б «Энтрез Ген: SYBL1, подобный синаптобревину 1».

[pmid12853575-7] а ^б Мартинес-Арка С., Радж Р., Вакка М., Рапосо Дж., Камонис Дж., Про-Жильярдо В., Давиет Л., Формстехер Е., Гамбург А., Филиппини Ф., Д'Эспозито М., Галли Т. (июль 2003 г.). «Двойной механизм, контролирующий локализацию и функцию экзоцитарных v-SNARE». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (15): 9011–6. Дои:10.1073 / pnas.1431910100. ЧВК 166429. PMID 12853575.

[pmid9614185-8] Галли Т., Захрауи А., Вайдьянатан В.В., Рапосо Дж., Тиан Дж. М., Карин М., Ниманн Х., Лувард Д. (июнь 1998 г.). «Новый мембранный белок, нечувствительный к столбняку, нечувствительный к везикулам, в комплексах SNARE апикальной плазматической мембраны эпителиальных клеток». Мол. Биол. Ячейка. 9 (6): 1437–48. Дои:10.1091 / mbc.9.6.1437. ЧВК 25366. PMID 9614185.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]