SYCP3 - SYCP3

SYCP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4CPC
Идентификаторы
Псевдонимы	SYCP3, COR1, SCP3, SPGF4, RPRGL4, синаптонемный комплексный белок 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 604759 MGI: 109542 ГомолоГен: 7964 Генные карты: SYCP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q23.2 Начните 101,728,648 бп[1] Конец 101,739,472 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 C1 Начните 88,459,569 бп[2] Конец 88,473,236 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК Сотовый компонент • ядро клетки • хромосома • синаптонемный комплекс • боковой элемент • хромосома, центромерная область Биологический процесс • клеточный цикл • мужской мейоз I • сперматогенез, обмен хромосомных белков • деление клеток • GO: 0007126 мейотический клеточный цикл • сперматогенез • развитие сперматид Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	50511	20962
Ансамбль	ENSG00000139351	ENSMUSG00000020059
UniProt	Q8IZU3	P70281
RefSeq (мРНК)	NM_001177948 NM_001177949 NM_153694	NM_011517
RefSeq (белок)	NP_001171419 NP_001171420 NP_710161	NP_035647
Расположение (UCSC)	Chr 12: 101,73 - 101,74 Мб	Chr 10: 88.46 - 88.47 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синаптонемный комплексный белок 3 это белок что у людей кодируется SYCP3 ген.^[5][6][7] Это компонент синаптонемный комплекс образуются между гомологичными хромосомами во время профаза из мейоз.^[8]

Семья Джин

XLR / SYCP3 / FAM9 домен Идентификаторы Символ Cor1 Pfam PF04803 ИнтерПро IPR006888 CATH 4cpc Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

SYCP3 также известен как COR1. Он содержит консервативный домен coiled-coil, который также находится в FAM9 (FAM9A, FAM9B ) семейство белков, обнаруженных на Х-хромосоме человека.^[5]

Несколько SYCP3-подобных белков обнаружены на половых хромосомах мышей. Им присваиваются имена, начинающиеся с Slx или Sly, в зависимости от хромосомы, с которой они связаны. Slx / Slxl1 и Sly являются неофункционализированными генами, которые оказывают противоположное влияние на экспрессию генов и эпигенетические модификации, и каждый ген снижает жизнеспособность и подвижность (через веретено связывание) сперматозоидов, содержащих другую половую хромосому, изменяя соотношение полов в свою пользу.^[9] Со временем они дублируются, чтобы уравновесить эффекты друг друга.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000139351 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020059 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Мартинес-Гарай И., Яблонка С., Сутажова М., Штойернагель П., Гал А., Куче К. (сентябрь 2002 г.). «Новое семейство генов (FAM9) низкокопийных повторов в Xp22.3, экспрессируемых исключительно в семенниках: последствия для рекомбинации в этой области». Геномика. 80 (3): 259–67. Дои:10.1006 / geno.2002.6834. PMID  12213195.
6. Мэллон А.М., Платцер М., Бейт Р., Глёкнер Г., Ботчерби М.Р., Нордзик Г. и др. (Июнь 2000 г.). «Сравнительный анализ последовательности генома области Bpa / Str у мышей и человека». Геномные исследования. 10 (6): 758–75. Дои:10.1101 / гр.10.6.758. ЧВК  310879. PMID  10854409.
7. «Ген Entrez: синаптонемный комплексный белок 3 SYCP3».
8. Сюрьянен Дж. Л., Пеллегрини Л., Дэвис О. Р. (июнь 2014 г.). «Молекулярная модель роли SYCP3 в организации мейотических хромосом». eLife. 3. Дои:10.7554 / eLife.02963. ЧВК  4102245. PMID  24950965.
9. Коккет Дж., Эллис П.Дж., Махадеваайя С.К., Аффара Н.А., Вайман Д., Бургойн П.С. (сентябрь 2012 г.). «Генетическая основа постмейотического внутригеномного конфликта X и Y хромосомы у мышей». PLOS Genetics. 8 (9): e1002900. Дои:10.1371 / journal.pgen.1002900. ЧВК  3441658. PMID  23028340.
10. Крюгер А.Н., Брогли М.А., Хейзинга Дж. Л., Кидд Дж. М., де Рой Д. Г., Ху Ю. С., Мюллер Дж. Л. (октябрь 2019 г.). «Неофункционализированное семейство X-связанных ампликонных генов необходимо для мужской фертильности и равного соотношения полов у мышей». Текущая биология. 29 (21): 3699–3706.e5. Дои:10.1016 / j.cub.2019.08.057. ЧВК  7012382. PMID  31630956.

дальнейшее чтение

• Юань Л., Лю Дж. Дж., Чжао Дж., Брунделл Э., Данехольт Б., Хёг С. (январь 2000 г.). «Ген SCP3 мыши необходим для сборки синаптонемного комплекса, синапсиса хромосом и мужской фертильности». Молекулярная клетка. 5 (1): 73–83. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80404-9. PMID  10678170.
• Сузуки Х., Фукуниси Ю., Кагава И., Сайто Р., Ода Х, Эндо Т. и др. (Октябрь 2001 г.). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши». Геномные исследования. 11 (10): 1758–65. Дои:10.1101 / гр.180101. ЧВК  311163. PMID  11591653.
• Ли Дж., Иваи Т., Йокота Т., Ямасита М. (июль 2003 г.). «Избирательная потеря во времени и пространстве белка Rec8 из мейотических хромосом во время мейоза млекопитающих». Журнал клеточной науки. 116 (Pt 13): 2781–90. Дои:10.1242 / jcs.00495. PMID  12759374.
• Миямото Т., Хасуике С., Йогев Л., Мадуро М. Р., Исикава М., Вестфаль Г., Лэмб Д. ​​Д. (ноябрь 2003 г.). «Азооспермия у пациентов, гетерозиготных по мутации в SYCP3». Ланцет. 362 (9397): 1714–9. Дои:10.1016 / S0140-6736 (03) 14845-3. PMID  14643120. S2CID  44513816.
• de Boer P, Giele M, Lock MT, de Rooij DG, Giltay J, Hochstenbach R, te Velde ER (2004). «Кинетика мейоза у самцов с азооспермией: совместный гистологический и цитологический подход». Цитогенетические и геномные исследования. 105 (1): 36–46. Дои:10.1159/000078007. HDL:1874/11543. PMID  15218256. S2CID  26325415.
• Стоуфф К., Лиссенс В., Турне Х, Ван Штайртегем А., Либаерс I (октябрь 2005 г.). «Мутации SYCP3 редко встречаются у пациентов с азооспермией». Фертильность и бесплодие. 84 (4): 1019–20. Дои:10.1016 / j.fertnstert.2005.04.033. PMID  16213863.
• Аараби М., Модарресси М.Х., Солтангхораи Х., Бехджати Р., Амирджаннати Н., Ахонди М.М. (август 2006 г.). «Тестикулярная экспрессия рибонуклеиновой кислоты синаптонемного комплекса белка 3 (SYCP3) у 110 пациентов с необструктивной азооспермией». Фертильность и бесплодие. 86 (2): 325–31. Дои:10.1016 / j.fertnstert.2005.12.070. PMID  16824523.
• Сапкота Г., Ноккарт М., Аларкон С., Монтальво Е., Бриванлу А. Х., Массаге Дж. (Декабрь 2006 г.). «Дефосфорилирование линкерных областей Smad1 и Smad2 / 3 малыми фосфатазами С-концевого домена имеет различные результаты для костного морфогенетического белка и трансформирующих путей фактора роста бета». Журнал биологической химии. 281 (52): 40412–9. Дои:10.1074 / jbc.M610172200. PMID  17085434.
• Мартинес Дж., Бонаш С., Карвахаль А., Бассас Л., Ларриба С. (октябрь 2007 г.). «Мутации SYCP3 редки у бесплодных испанских мужчин с задержкой мейоза». Фертильность и бесплодие. 88 (4): 988–9. Дои:10.1016 / j.fertnstert.2006.11.163. PMID  17434513.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8IZU3 (Белок 3 синаптонемного комплекса человека) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P70281 (Белок 3 синаптонемного комплекса мыши) на PDBe-KB.