SYNJ2BP - SYNJ2BP

SYNJ2BP
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ENO, 2JIK, 2JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	SYNJ2BP, ARIP2, OMP25, белок, связывающий синаптоянин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 609411 MGI: 1344347 ГомолоГен: 10161 Генные карты: SYNJ2BP
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.2 Начинать 70,366,499 бп[1] Конец 70,417,090 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с С-концом белка • связывание ионотропного рецептора глутамата Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • митохондриальная наружная мембрана • мембрана • митохондрия • неотъемлемый компонент внешней мембраны митохондрий • ионотропный рецепторный комплекс глутамата • базолатеральная плазматическая мембрана • соединение клеток • нервномышечное соединение • проекция нейрона • постсинаптическая плотностная мембрана Биологический процесс • отрицательная регуляция миграции эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция ангиогенеза • регуляция сигнального пути Notch • отрицательная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • отрицательная регуляция прорастающего ангиогенеза • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • нацеливание на белок • Передача сигнала белка Rho • регуляция эндоцитоза • внутриклеточное распределение митохондрий • химическая синаптическая передача • кластеризация рецепторов • установление или поддержание апикальной / базальной полярности эпителиальных клеток • локализация рецептора в синапсе • межклеточная адгезия Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55333	24071
Ансамбль	ENSG00000213463	ENSMUSG00000090935
UniProt	P57105	Q9D6K5
RefSeq (мРНК)	NM_018373	NM_025292 NM_001309814
RefSeq (белок)	NP_060843	NP_001296776 NP_001296777 NP_001296743 NP_079568
Расположение (UCSC)	Chr 14: 70,37 - 70,42 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синаптоянин-2-связывающий белок это белок что у людей кодируется SYNJ2BP ген.^[4][5]

Взаимодействия

SYNJ2BP был показан взаимодействовать с:

• ACVR2A,^[4][6]
• ACVR2B,^[4]
• LRP1,^[7] и
• LRP2.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000213463 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Мацудзаки Т., Ханаи С., Киши Х, Лю З., Бао И, Кикучи А., Цучида К., Сугино Х (май 2002 г.). «Регулирование эндоцитоза рецепторов активина типа II с помощью нового белка PDZ через Ral / Ral-связывающий белок 1-зависимый путь». Журнал биологической химии. 277 (21): 19008–18. Дои:10.1074 / jbc.M112472200. PMID  11882656.
5. «Ген Entrez: SYNJ2BP синаптоянин 2 связывающий белок».
6. Tsuchida K, Nakatani M, Matsuzaki T., Yamakawa N, Liu Z, Bao Y, Arai KY, Murakami T., Takehara Y, Kurisaki A, Sugino H (октябрь 2004 г.). «Новые факторы в регуляции передачи сигналов активина». Молекулярная и клеточная эндокринология. 225 (1–2): 1–8. Дои:10.1016 / j.mce.2004.02.006. PMID  15451561.
7. Gotthardt M, Trommsdorff M, Nevitt MF, Shelton J, Richardson JA, Stockinger W, Nimpf J, Herz J (август 2000 г.). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольным адаптером и белками каркаса предполагает различные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов». Журнал биологической химии. 275 (33): 25616–24. Дои:10.1074 / jbc.M000955200. PMID  10827173.

дальнейшее чтение

• Nemoto Y, De Camilli P (июнь 1999 г.). «Привлечение альтернативно сплайсированной формы синаптоянина 2 в митохондрии путем взаимодействия с доменом PDZ белка внешней мембраны митохондрий». Журнал EMBO. 18 (11): 2991–3006. Дои:10.1093 / emboj / 18.11.2991. ЧВК  1171381. PMID  10357812.
• Gotthardt M, Trommsdorff M, Nevitt MF, Shelton J, Richardson JA, Stockinger W, Nimpf J, Herz J (август 2000 г.). «Взаимодействие семейства генов рецепторов липопротеинов низкой плотности с цитозольным адаптером и белками каркаса предполагает различные биологические функции в клеточной коммуникации и передаче сигналов». Журнал биологической химии. 275 (33): 25616–24. Дои:10.1074 / jbc.M000955200. PMID  10827173.
• Вайнс А., Шварц К., Фаул С., Барисони Л., Линке В.А., Мундель П. (октябрь 2001 г.). «Дифференциация и стресс-зависимое перераспределение ядерной цитоплазмы миоподина, нового связывающего актин белка». Журнал клеточной биологии. 155 (3): 393–404. Дои:10.1083 / jcb.200012039. ЧВК  2150840. PMID  11673475.
• Лин Ф, Ю. Ю., Вудс Дж., Чипли К., Гудинг Б., Финкельштейн П., Дир Р., Крилл Д., Бечич М. Дж., Михалопулос Г., Финкельштейн С., Луо Дж. Х. (ноябрь 2001 г.). «Миоподин, гомолог синаптоподина, часто удаляется при инвазивном раке простаты». Американский журнал патологии. 159 (5): 1603–12. Дои:10.1016 / S0002-9440 (10) 63006-4. ЧВК  3277320. PMID  11696420.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Tsuchida K, Nakatani M, Matsuzaki T., Yamakawa N, Liu Z, Bao Y, Arai KY, Murakami T., Takehara Y, Kurisaki A, Sugino H (октябрь 2004 г.). «Новые факторы в регуляции передачи сигналов активина». Молекулярная и клеточная эндокринология. 225 (1–2): 1–8. Дои:10.1016 / j.mce.2004.02.006. PMID  15451561.