SYTL4 - SYTL4

SYTL4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2CSZ, 3FDW
Идентификаторы
Псевдонимы	SYTL4, SLP4, синаптотагмин типа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 300723 MGI: 1351606 ГомолоГен: 8454 Генные карты: SYTL4
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq22.1 Начните 100,674,491 бп[1] Конец 100,732,123 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X E3 Начните 133,936,385 бп[2] Конец 133,981,812 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • клатриновое связывание • связывание ионов металлов • Связывание Rab GTPase • GO: 0001948 связывание с белками • кальций-зависимое связывание фосфолипидов • связывание синтаксина • связывание фосфолипидов • связывание с белками семейства нейрексинов Сотовый компонент • эндосома • экзоцитарный пузырь • мембрана • мембрана транспортных везикул • секреторная гранула • нуклеоплазма • цитоплазматический пузырек • пресинапс • внешний компонент мембраны • центр организации микротрубочек • цитозоль • клеточная мембрана • мембрана альфа-гранул тромбоцитов • синапс Биологический процесс • отрицательная регуляция секреции инсулина • мультивезикулярный путь сортировки тела • положительное регулирование секреции белка • положительная регуляция экзоцитоза • внутриклеточный транспорт белка • экзоцитоз • слияние пузырьков • регуляция кальций-зависимого экзоцитоза • регулируемый ионами кальция экзоцитоз нейромедиатора • дегрануляция тромбоцитов • восстановление плазматической мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	94121	27359
Ансамбль	ENSG00000102362	ENSMUSG00000031255
UniProt	Q96C24	Q9R0Q1
RefSeq (мРНК)	NM_001129896 NM_001174068 NM_080737	NM_001290717 NM_001290718 NM_001290719 NM_013757
RefSeq (белок)	NP_001123368 NP_001167539 NP_542775 NP_001357089 NP_001357090 NP_001357091 NP_001357092 NP_001357093 NP_001357094 NP_001357095 NP_001357096 NP_001357097 NP_001357098	NP_001277646 NP_001277647 NP_001277648 NP_038785
Расположение (UCSC)	Chr X: 100.67 - 100.73 Мб	Chr X: 133.94 - 133.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синаптотагмин-подобный белок 4 это белок что у людей кодируется SYTL4 ген.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102362 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031255 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Энтреза: SYTL4, подобный синаптотагмину 4 (грануфилин-а)».

дальнейшее чтение

• Ван Дж, Такеучи Т., Йокота Х, Идзуми Т. (1999). «Новый рабфилин-3-подобный белок связывается с инсулин-содержащими гранулами в бета-клетках поджелудочной железы». J. Biol. Chem. 274 (40): 28542–8. Дои:10.1074 / jbc.274.40.28542. PMID  10497219.
• Курода TS, Фукуда М, Арига Х, Микошиба К (2002). «Домен гомологии Slp синаптотагмин-подобных белков 1-4 и Slac2 функционирует как новый связывающий домен Rab27A». J. Biol. Chem. 277 (11): 9212–8. Дои:10.1074 / jbc.M112414200. PMID  11773082.
• Йи З, Йокота Х, Тории С. и др. (2002). «Комплекс Rab27a / грануфилин регулирует экзоцитоз инсулинсодержащих гранул с плотным ядром». Мол. Cell. Биол. 22 (6): 1858–67. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1858-1867.2002. ЧВК  135591. PMID  11865063.
• Чжао С., Тории С., Йокота-Хашимото Х. и др. (2002). «Участие Rab27b в регулируемой секреции гормонов гипофиза». Эндокринология. 143 (5): 1817–24. Дои:10.1210 / en.143.5.1817. PMID  11956164.
• Torii S, Zhao S, Yi Z и др. (2002). «Грануфилин модулирует экзоцитоз секреторных гранул посредством взаимодействия с синтаксином 1a». Мол. Cell. Биол. 22 (15): 5518–26. Дои:10.1128 / MCB.22.15.5518-5526.2002. ЧВК  133943. PMID  12101244.
• Фукуда М., Канно Э., Саегуса С. и др. (2002). «Slp4-a / грануфилин-a регулирует экзоцитоз везикул с плотным ядром в клетках PC12». J. Biol. Chem. 277 (42): 39673–8. Дои:10.1074 / jbc.M205349200. PMID  12176990.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Фукуда М (2003). «Slp4-a / грануфилин-a ингибирует экзоцитоз везикул с плотным ядром посредством взаимодействия с GDP-связанной формой Rab27A в клетках PC12». J. Biol. Chem. 278 (17): 15390–6. Дои:10.1074 / jbc.M213090200. PMID  12590134.
• Геваерт К., Геталс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ciufo LF, Barclay JW, Burgoyne RD, Morgan A (2005). «Munc18-1 регулирует ранние и поздние стадии экзоцитоза через синтаксин-независимые белковые взаимодействия». Мол. Биол. Ячейка. 16 (2): 470–82. Дои:10.1091 / mbc.E04-08-0685. ЧВК  545880. PMID  15563604.
• Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК  2665286. PMID  15772651.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Plaisance V, Abderrahmani A, Perret-Menoud V и др. (2006). «МикроРНК-9 контролирует экспрессию грануфилина / Slp4 и секреторный ответ инсулин-продуцирующих клеток». J. Biol. Chem. 281 (37): 26932–42. Дои:10.1074 / jbc.M601225200. PMID  16831872.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.