РНК, специфичная для малых тельцов Кахаля 20 - Small Cajal body specific RNA 20

РНК, специфичная для малых тельцов Кахаля 20
RF00601.jpg
Идентификаторы
СимволSCARNA20
РфамRF00601
Прочие данные
РНК типГен; мяРНК; snoRNA; скаРНК
Домен (ы)Эукариоты
ИДТИТермин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO: Термин GO должен начинаться с GO:
ТАКТАК: 0000275
PDB структурыPDBe

В молекулярная биология, РНК, специфичная для малых тельцов Кахаля 20 (также известный как scaRNA20 или же ACA66) это малая ядрышковая РНК нашел в Тела Кахала и считается причастным к псевдоуридилирование из U12 минорная сплайсосомная РНК.

scaRNA представляют собой особый класс малые ядрышковые РНК которые локализуются на Тела Кахала и руководить изменением РНК-полимераза II записано сплайсосомный РНК U1, U2, U4, U5 и U12.[1]

ACA66 (SCARNA20) является членом Коробка H / ACA класс snoRNAs, которые направляют сайты модификации уридинов в псевдоуридины. Эта snoRNA была идентифицирована с помощью компьютерного скрининга, а ее экспрессия у мышей экспериментально подтверждена с помощью Нозерн-блот и анализ удлинения праймера.[2]Предполагается, что ACA66 управляет псевдоуридилированием остатка U28 в мяРНК U12.[3]

Рекомендации

  1. ^ Darzacq X, Jády BE, Verheggen C, Kiss AM, Bertrand E, Kiss T (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тельца Кахаля: новый класс управляющих РНК 2'-O-метилирования и псевдоуридилирования». Журнал EMBO. 21 (11): 2746–2756. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2746. ЧВК  126017. PMID  12032087.
  2. ^ Шаттнер П., Барберан-Солер С., Лоу TM (январь 2006 г.). «Вычислительный экран для определения псевдоуридилирования H / ACA РНК млекопитающих». РНК. 12 (1): 15–25. Дои:10.1261 / rna.2210406. ЧВК  1370881. PMID  16373490.
  3. ^ Лестрейд Л., Вебер М.Дж. (январь 2006 г.). "snoRNA-LBME-db, всеобъемлющая база данных человеческих H / ACA и C / D box snoRNAs". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D158–162. CiteSeerX  10.1.1.105.7552. Дои:10.1093 / nar / gkj002. ЧВК  1347365. PMID  16381836.

внешняя ссылка