Синергин гамма - Synergin gamma

SYNRG
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2MX7
Идентификаторы
Псевдонимы	SYNRG, AP1GBP1, SYNG, синергин, гамма, синергин гамма
Внешние идентификаторы	OMIM: 607291 MGI: 1354742 ГомолоГен: 105680 Генные карты: SYNRG
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q12 Начинать 37,514,807 бп[1] Конец 37,609,472 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 С Начинать 83,964,428 бп[2] Конец 84,044,578 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • Адаптерный комплекс АП-1 • аппарат Гольджи • мембрана Биологический процесс • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • эндоцитоз Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11276	217030
Ансамбль	ENSG00000275066 ENSG00000274047	ENSMUSG00000034940
UniProt	Q9UMZ2	Q5SV85
RefSeq (мРНК)	NM_001163544 NM_001163545 NM_001163546 NM_001163547 NM_007247 NM_080550 NM_198882	NM_001115009 NM_194341
RefSeq (белок)	NP_001157016 NP_001157017 NP_001157018 NP_001157019 NP_009178 NP_542117 NP_942583	NP_919322
Расположение (UCSC)	Chr 17: 37,51 - 37,61 Мб	Chr 11: 83.96 - 84.04 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Синергин гамма также известный как Гамма-связывающий белок 1 субъединицы AP1 (AP1GBP1) это белок что у людей кодируется SYNRG ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, который взаимодействует с гамма-субъединицей AP1. клатрин-адаптерный комплекс. Комплекс AP1 расположен на сеть транс-Гольджи и связывает специфические белки с везикулами, покрытыми клатрином. Этот кодируемый белок может действовать, связывая комплекс AP1 с другими белками. Для этого гена были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, которые кодируют разные изоформы.^[6]

Взаимодействия

AP1GBP1 был показан взаимодействовать с AP1G1^[7][8] и SCAMP1.^[9]

Рекомендации

1. ENSG00000274047 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034940 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пейдж Л.Дж., Соуэрби П.Дж., Луи В.В., Робинсон М.С. (октябрь 1999 г.). «Гамма-синергин: белок, содержащий домен EH, который взаимодействует с гамма-адаптином». J. Cell Biol. 146 (5): 993–1004. Дои:10.1083 / jcb.146.5.993. ЧВК  2169493. PMID  10477754.
6. «Ген Entrez: AP1GBP1, AP1, гамма-субъединица связывающий белок 1».
7. Ноги Т., Сиба Й, Кавасаки М., Сиба Т., Мацугаки Н., Игараси Н., Сузуки М., Като Р., Такацу Х., Накаяма К., Вакацуки С. (июль 2002 г.). «Структурная основа для рекрутирования дополнительных белков с помощью гамма-адаптина уха». Nat. Struct. Биол. 9 (7): 527–31. Дои:10.1038 / nsb808. PMID  12042876. S2CID  42630285.
8. Такацу Х., Йошино К., Накаяма К. (май 2000 г.). «Адаптерный домен гомологии уха гамма консервативен в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 271 (3): 719–25. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID  10814529.
9. Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (апрель 2000 г.). «Функция SCAMP1 в эндоцитозе». J. Biol. Chem. 275 (17): 12752–6. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID  10777571.

дальнейшее чтение

• Пейрард М., Парвенех С., Лагеркранц С., Экман М., Франссон И., Сален С., Думански Дж. П. (1998). «Клонирование, паттерн экспрессии и хромосомная принадлежность к 16q23 гена гамма-адаптина человека (ADTG)». Геномика. 50 (2): 275–80. Дои:10.1006 / geno.1998.5289. PMID  9653655.
• Херст Дж, Луи В.В., Брайт Н.А., Тотти Н., Матрос М.Н., Робинсон М.С. (2000). «Семейство белков с гамма-адаптином и доменами VHS, которые облегчают перенос между сетью транс-Гольджи и вакуолью / лизосомой». J. Cell Biol. 149 (1): 67–80. Дои:10.1083 / jcb.149.1.67. ЧВК  2175106. PMID  10747088.
• Фернандес-Чакон Р., Ахирилоаи М., Янц Р., Альбанези Дж. П., Зюдхоф ТК (2000). «Функция SCAMP1 в эндоцитозе». J. Biol. Chem. 275 (17): 12752–6. Дои:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID  10777571.
• Такацу Х, Ёсино К., Накаяма К. (2000). «Адаптерный домен гомологии уха гамма консервативен в белках гамма-адаптина и GGA, которые взаимодействуют с гамма-синергином». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 271 (3): 719–25. Дои:10.1006 / bbrc.2000.2700. PMID  10814529.
• Ноги Т., Сиба И., Кавасаки М., Сиба Т., Мацугаки Н., Игараси Н., Сузуки М., Като Р., Такацу Н., Накаяма К., Вакацуки С. (2002). «Структурная основа для рекрутирования дополнительных белков с помощью гамма-адаптина уха». Nat. Struct. Биол. 9 (7): 527–31. Дои:10.1038 / nsb808. PMID  12042876. S2CID  42630285.
• Кент Х.М., МакМахон Х.Т., Эванс PR, Бенмера А, Оуэн Д.Д. (2002). «Домен придатка гамма-адаптина: структура и сайт связывания для Eps15 и гамма-синергина». Структура. 10 (8): 1139–48. Дои:10.1016 / S0969-2126 (02) 00801-8. PMID  12176391.
• Миллс И.Г., Прэфке Г.Дж., Валлис И., Питер Б.Дж., Олесен Л.Е., Галлоп Д.Л., Батлер П.Дж., Эванс П.Р., МакМахон Х.Т. (2003). «EpsinR: белок, взаимодействующий с AP1 / клатрином, участвующий в переносе везикул». J. Cell Biol. 160 (2): 213–22. Дои:10.1083 / jcb.200208023. ЧВК  2172650. PMID  12538641.
• Луи У.В., Коллинз Б.М., Херст Дж., Пестрый А., Миллар С., Шу П., Оуэн Д.Д., Робинсон М.С. (2003). «Партнеры связывания для COOH-концевых доменов отростков GGA и гамма-адаптина». Мол. Биол. Клетка. 14 (6): 2385–98. Дои:10.1091 / mbc.E02-11-0735. ЧВК  194887. PMID  12808037.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Херст Дж, Борнер Г.Х., Харбор М., Робинсон М.С. (2005). «Комплекс афтифилин / р200 / гамма-синергин». Мол. Биол. Клетка. 16 (5): 2554–65. Дои:10.1091 / mbc.E04-12-1077. ЧВК  1087257. PMID  15758025.
• Теос А.С., Тенза Д., Мартина Дж. А., Хурбейн И., Педен А. А., Свидерская Е. В., Стюарт А., Робинсон М. С., Беннетт Д. Ф., Катлер Д. Ф., Бонифачино Дж. С., Маркс М. С., Рапосо Г. (2005). «Функции адаптерного белка (AP) -3 и AP-1 в сортировке тирозиназы от эндосом до меланосом». Мол. Биол. Клетка. 16 (11): 5356–72. Дои:10.1091 / mbc.E05-07-0626. ЧВК  1266432. PMID  16162817.