TADA3L - TADA3L

TADA3
Идентификаторы
Псевдонимы	TADA3, ADA3, NGG1, STAF54, TADA3L, hADA3, транскрипционный адаптер 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602945 MGI: 1915724 ГомолоГен: 4633 Генные карты: TADA3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п25.3 Начните 9,779,860 бп[1] Конец 9,793,011 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • специфическое связывание белкового домена • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • активность гистонацетилтрансферазы • GO: 0001948 связывание с белками • лиганд-зависимое связывание с ядерным рецептором • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность Сотовый компонент • комплекс фактора транскрипции TFTC • внутриклеточный • митотическое веретено • Комплекс активаторов транскрипции Ada2 / Gcn5 / Ada3 • СТАГА комплекс • САГА комплекс • нуклеоплазма • ядро клетки Биологический процесс • регуляция фосфорилирования белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регулирование стабильности белка • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция деацетилирования гистонов • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция деацетилирования тубулина • положительная регуляция экспрессии генов • ацетилирование гистона H3 • сигнальный путь внутриклеточного рецептора эстрогена • деубиквитинирование белков • ацетилирование гистона H4 • GO: 0007067 митотический клеточный цикл Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10474	101206
Ансамбль	ENSG00000171148	ENSMUSG00000048930
UniProt	O75528	Q8R0L9
RefSeq (мРНК)	NM_001278270 NM_006354 NM_133480 NM_133481	NM_133932 NM_001372392 NM_001372393
RefSeq (белок)	NP_001265199 NP_006345 NP_597814	NP_598693 NP_001359321 NP_001359322
Расположение (UCSC)	Chr 3: 9.78 - 9.79 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Транскрипционный адаптер 3-подобный это белок что у людей кодируется TADA3 ген.^[4][5][6] Цитогенетическая локализация: 3p25.3 ^[7]

Функция

Многие ДНК-связывающие белки-активаторы транскрипции увеличивают скорость инициации транскрипции гена, опосредованной РНК-полимеразой II, за счет функционального взаимодействия с общим аппаратом транскрипции, связанным с базальным промотором. Адаптерные белки обычно требуются для этой активации, возможно, для ацетилирования и дестабилизации нуклеосом, тем самым снимая ограничения хроматина на промоторе. Белок, кодируемый этим геном, является адаптером активатора транскрипции и, как было установлено, является частью гистонацетилазного комплекса PCAF. Кроме того, он связывается с белком-супрессором опухолей р53 и необходим для полной активности р53 и р53-опосредованного апоптоза. Для этого гена было найдено по крайней мере четыре альтернативно сплайсированных варианта, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена.^[6]

Взаимодействия

TADA3L был показан взаимодействовать с участием:

• Рецептор ретиноевой кислоты альфа,^[8]
• Ретиноидный рецептор X альфа,^[8]
• TADA2L,^[5][9]
• TAF9,^[10]
• Гомолог белка инициации транскрипции SPT3,^[10] и
• USP5.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171148 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Огрызко В.В., Котани Т., Чжан Х, Шильц Р.Л., Ховард Т., Ян XJ, Ховард Б.Х., Цинь Дж., Накатани И. (июль 1998 г.). «Гистоноподобные TAF в гистонацетилазном комплексе PCAF». Ячейка. 94 (1): 35–44. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81219-2. PMID  9674425. S2CID  18942972.
5. Ван Т., Кобаяши Т., Такимото Р., Денес А.Э., Снайдер Е.Л., эль-Дейри В.С., Брахманн Р.К. (ноябрь 2001 г.). «hADA3 необходим для активности p53». Журнал EMBO. 20 (22): 6404–13. Дои:10.1093 / emboj / 20.22.6404. ЧВК  125723. PMID  11707411.
6. «Ген Entrez: транскрипционный адаптер 3 TADA3L (гомолог NGG1, дрожжевой) -подобный».
7. Сулимова Г., Куценко А., Рахманалиев Е., Удина И., Компанийцев А., Протопопов А., Мойсяк Е., Климов Е., Муравенко О., Зеленин А., Брага Е., Кашуба В., Забаровский Е., Киселев Л. (2002). «Хромосома человека 3: интеграция 60 НеЯ клонирую физическую и генную карту ». Цитогенетические и геномные исследования. 98 (2–3): 177–183. Дои:10.1159/000069814. PMID  12698000. S2CID  41010053.
8. Цзэн М., Кумар А., Мэн Дж., Гао Кью, Димри Дж., Вазер Д., Band H, Band V (ноябрь 2002 г.). «Онкопротеин E6 вируса папилломы человека 16 ингибирует трансактивацию, опосредованную ретиноидным X-рецептором, направляя коактиватор ADA3 человека». Журнал биологической химии. 277 (47): 45611–8. Дои:10.1074 / jbc.M208447200. PMID  12235159.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo». Молекулярная и клеточная биология. 21 (20): 6782–95. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ЧВК  99856. PMID  11564863.

дальнейшее чтение

• Struhl K, Moqtaderi Z (июль 1998 г.). «TAF в шляпе». Ячейка. 94 (1): 1–4. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81213-1. PMID  9674419. S2CID  14869072.
• Brand M, Yamamoto K, Staub A, Tora L (июнь 1999 г.). «Идентификация субъединиц комплекса, не содержащего TATA-связывающего белка, содержащего TAFII, предполагает их роль в ацетилировании нуклеосом и передаче сигнала». Журнал биологической химии. 274 (26): 18285–9. Дои:10.1074 / jbc.274.26.18285. PMID  10373431.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Brand M, Moggs JG, Oulad-Abdelghani M, Lejeune F, Dilworth FJ, Stevenin J, Almouzni G, Tora L (июнь 2001 г.). «Поврежденный УФ излучением ДНК-связывающий белок в комплексе TFTC связывает распознавание повреждений ДНК с ацетилированием нуклеосом». Журнал EMBO. 20 (12): 3187–96. Дои:10.1093 / emboj / 20.12.3187. ЧВК  150203. PMID  11406595.
• Мартинес Э., Палхан В.Б., Тьернберг А., Лимар Э.С., Гампер А.М., Кунду Т.К., Чайт Б.Т., Рёдер Р.Г. (октябрь 2001 г.). «Комплекс STAGA человека представляет собой коактиватор транскрипции, ацетилирующий хроматин, который взаимодействует с факторами сплайсинга пре-мРНК и факторами связывания повреждений ДНК in vivo». Молекулярная и клеточная биология. 21 (20): 6782–95. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6782-6795.2001. ЧВК  99856. PMID  11564863.
• Benecke A, Gaudon C, Garnier JM, vom Baur E, Chambon P, Losson R (июнь 2002 г.). «ADA3-содержащие комплексы связываются с альфа-рецептором эстрогена». Исследования нуклеиновых кислот. 30 (11): 2508–14. Дои:10.1093 / nar / 30.11.2508. ЧВК  117179. PMID  12034840.
• Кумар А., Чжао Ю., Мэн Г., Цзэн М., Сринивасан С., Дельмолино Л. М., Гао К., Димри Г., Вебер Г. Ф., Вазер Д. Е., Группа H, Группа V (август 2002 г.). «Онкопротеин Е6 вируса папилломы человека инактивирует транскрипционный коактиватор ADA3 человека». Молекулярная и клеточная биология. 22 (16): 5801–12. Дои:10.1128 / MCB.22.16.5801-5812.2002. ЧВК  133989. PMID  12138191.
• Цзэн М., Кумар А., Мэн Дж., Гао Кью, Димри Дж., Вазер Д., Band H, Band V (ноябрь 2002 г.). «Онкопротеин E6 вируса папилломы человека 16 ингибирует трансактивацию, опосредованную ретиноидным X-рецептором, направляя коактиватор ADA3 человека». Журнал биологической химии. 277 (47): 45611–8. Дои:10.1074 / jbc.M208447200. PMID  12235159.
• Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, Waelter S, Stroedicke M, Worm U, Droege A, Lindenberg KS, Knoblich M, Haenig C, Herbst M, Suopanki J, Scherzinger E, Abraham C, Bauer B, Hasenbank R, Fritzsche , Ludewig AH, Büssow K, Buessow K, Coleman SH, Gutekunst CA, Landwehrmeyer BG, Lehrach H, Wanker EE (сентябрь 2004 г.). «Сеть взаимодействия белков связывает GIT1, усилитель агрегации хантингтина, с болезнью Хантингтона». Молекулярная клетка. 15 (6): 853–65. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID  15383276.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мэн Г, Чжао Й, Наг А, Цзэн М., Димри Г, Гао Кью, Вазер ДЭ, Кумар Р., Бэнд Н, Бэнд V (декабрь 2004). «Человеческий ADA3 связывается с рецептором эстрогена (ER) и действует как коактиватор для ER-опосредованной трансактивации». Журнал биологической химии. 279 (52): 54230–40. Дои:10.1074 / jbc.M404482200. PMID  15496419.