USP5 - USP5 - Wikipedia

USP5
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2DAG, 2ДАК, 2G43, 2G45, 3IHP
Идентификаторы
Псевдонимы	USP5, ISOT, убиквитинспецифическая пептидаза 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 601447 MGI: 1347343 ГомолоГен: 55758 Генные карты: USP5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12п13.31 Начинать 6,852,128 бп[1] Конец 6,866,632 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 F2 | 6 59,17 см Начинать 124,815,019 бп[2] Конец 124,829,484 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • активность пептидазы цистеинового типа • активность эндопептидазы цистеинового типа • связывание ионов цинка • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • гидролазная активность • связывание ионов металлов • тиол-зависимая убиквитин-специфическая протеазная активность Сотовый компонент • лизосома • цитозоль Биологический процесс • деубиквитинирование белка K48 • положительная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеолиз • деубиквитинирование белков • убиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8078	22225
Ансамбль	ENSG00000111667	ENSMUSG00000038429
UniProt	P45974	P56399
RefSeq (мРНК)	NM_001098536 NM_003481	NM_013700 NM_001326594
RefSeq (белок)	NP_001092006 NP_003472 NP_001369517 NP_001369518 NP_001369519 NP_001369520	NP_001313523 NP_038728
Расположение (UCSC)	Chr 12: 6,85 - 6,87 Мб	Chr 6: 124,82 - 124,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Убиквитинспецифическая пептидаза 5 является фермент что у людей кодируется USP5 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

USP5 был показан взаимодействовать с TADA3L.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111667 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038429 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пуэнте XS, Санчес Л.М., Общий CM, Лопес-Отин C (июль 2003 г.). «Протеазы человека и мыши: сравнительный геномный подход». Природа Обзоры Генетика. 4 (7): 544–58. Дои:10.1038 / nrg1111. PMID  12838346. S2CID  2856065.
6. Ансари-Лари М.А., Музны Д.М., Лу Дж., Лу Ф., Лилли С.Э., Спанос С., Малли Т., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Богатый генами кластер между генами CD4 и триозофосфат-изомеразы в хромосоме 12p13 человека». Геномные исследования. 6 (4): 314–26. Дои:10.1101 / гр.6.4.314. PMID  8723724.
7. «Ген Entrez: убиквитинспецифическая пептидаза 5 USP5 (изопептидаза Т)».
8. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

дальнейшее чтение

• Д'Андреа А., Пеллман Д. (1999). «Деубиквитинирующие ферменты: новый класс биологических регуляторов». Критические обзоры в биохимии и молекулярной биологии. 33 (5): 337–52. Дои:10.1080/10409239891204251. PMID  9827704.
• Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (декабрь 1995 г.). «Клонирование кДНК человеческого деубиквитинирующего фермента 100 кДа: человеческая деубиквитиназа 100 кДа принадлежит к семейству 2 убиквитиновых С-концевых гидролаз (UCH2)». Письма FEBS. 376 (3): 233–7. Дои:10.1016/0014-5793(95)01287-7. PMID  7498549. S2CID  19521632.
• Уилкинсон К.Д., Ташаев В.Л., О'Коннор Л.Б., Ларсен К.Н., Касперек Э., Пикарт С.М. (ноябрь 1995 г.). «Метаболизм сигнала деградации полиубиквитина: структура, механизм и роль изопептидазы Т». Биохимия. 34 (44): 14535–46. Дои:10.1021 / bi00044a032. PMID  7578059.
• Falquet L, Paquet N, Frutiger S, Hughes GJ, Hoang-Van K, Jaton JC (февраль 1995 г.). «Человеческий деубиквитинирующий фермент с изопептидазной и пептидазной активностями in vitro». Письма FEBS. 359 (1): 73–7. Дои:10.1016/0014-5793(94)01451-6. PMID  7851534. S2CID  39667023.
• Ансари-Лари М.А., Шен Й., Музны Д.М., Ли В., Гиббс Р.А. (март 1997 г.). «Крупномасштабное секвенирование хромосомы 12p13 человека: экспериментальное и расчетное определение структуры гена». Геномные исследования. 7 (3): 268–80. Дои:10.1101 / гр.7.3.268. PMID  9074930.
• Сузуки Й, Цунода Т, Сесе Дж, Тайра Х, Мидзусима-Сугано Дж, Хата Х, Ота Т, Исогай Т, Танака Т, Накамура Й, Суяма А, Сакаки Й, Моришита С., Окубо К., Сугано С. (май 2001 г.) . «Идентификация и характеристика потенциальных промоторных областей 1031 вида генов человека». Геномные исследования. 11 (5): 677–84. Дои:10.1101 / гр.гр-1640р. ЧВК  311086. PMID  11337467.
• Engidawork E, Juranville JF, Fountoulakis M, Dierssen M, Lubec G (2002). «Селективная регуляция белков убиквитин-протеасомного протеолитического пути, дзета-цепи протеасомы и изопептидазы Т при синдроме Дауна у плода». Экспрессия белка в мозге с синдромом Дауна. Журнал нейронной передачи. Дополнение. С. 117–30. Дои:10.1007/978-3-7091-6262-0_10. ISBN  978-3-211-83704-7. PMID  11771738.
• Габриэль Дж. М., Лакомб Т., Кароббио С., Паке Н., Бизиг Р., Кокс Дж. А., Джатон Дж. К. (ноябрь 2002 г.). «Цинк необходим для каталитической активности деубиквитинирующей изопептидазы Т человека». Биохимия. 41 (46): 13755–66. Дои:10.1021 / bi026096m. PMID  12427038.
• Лакомб Т., Габриэль Дж. М. (ноябрь 2002 г.). «Дальнейшая характеристика предполагаемого каталитического сайта изопептидазы Т человека». Письма FEBS. 531 (3): 469–74. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03586-X. PMID  12435595. S2CID  26832850.
• Андерсон Н.Л., Полански М., Пипер Р., Гатлин Т., Тирумалай Р.С., Конрадс Т.П., Винстра Т.Д., Адкинс Дж.Н., Паундс Дж. Г., Фаган Р., Лобли А. (апрель 2004 г.). «Протеом плазмы человека: неизбыточный список, составленный из четырех отдельных источников». Молекулярная и клеточная протеомика. 3 (4): 311–26. Дои:10.1074 / mcp.M300127-MCP200. PMID  14718574.
• Бранденбергер Р., Вэй Х, Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Природа Биотехнологии. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Смоляр А., Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Reyes-Turcu FE, Horton JR, Mullally JE, Heroux A, Cheng X, Wilkinson KD (март 2006 г.). «Убиквитин-связывающий домен ZnF UBP распознает С-концевой диглициновый мотив незакрепленного убиквитина». Клетка. 124 (6): 1197–208. Дои:10.1016 / j.cell.2006.02.038. PMID  16564012. S2CID  1312137.