TASP1 - TASP1

TASP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2A8I, 2A8J, 2A8L, 2А8М
Идентификаторы
Псевдонимы	TASP1, C20orf13, dJ585I14.2, таспаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608270 MGI: 1923062 ГомолоГен: 9795 Генные карты: TASP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p12.1 Начинать 13,389,392 бп[1] Конец 13,638,932 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 F3 Начинать 139,833,480 бп[2] Конец 140,066,805 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • гидролазная активность • активность эндопептидазы треонинового типа • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • протеолиз • созревание белка Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55617	75812
Ансамбль	ENSG00000089123	ENSMUSG00000039033
UniProt	Q9H6P5	Q8R1G1
RefSeq (мРНК)	NM_017714 NM_001323602 NM_001323603 NM_001323604	NM_001159640 NM_001159641 NM_001289611 NM_175225
RefSeq (белок)	NP_001310531 NP_001310532 NP_001310533 NP_060184	NP_001153112 NP_001153113 NP_001276540 NP_780434
Расположение (UCSC)	Chr 20: 13.39 - 13.64 Мб	Chr 2: 139,83 - 140,07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Треонин аспартаза 1 является фермент что у людей кодируется TASP1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует эндопептидаза который расщепляет определенные субстраты после аспартат остатки. Кодируемый белок подвергается посттрансляционной автопротеолитической обработке с образованием альфа- и бета-субъединиц, которые снова собираются в активный альфа2-бета2 гетеротетрамер. Требуется расколоть MLL, белок, необходимый для поддержания Ген HOX выражение, и TFIIA, базальный фактор транскрипции. Расщепление TFIIA был найден для вождения сперматогенез.^[7]

Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, но их биологическая ценность не была определена.^[6]

Клиническое значение

Taspase1 сверхэкспрессируется при первичном раке человека и функционирует как неонкоген протеаза зависимости, координирующая рак распространение клеток и апоптоз. Следовательно, Taspase1 может служить новой противораковой терапевтической мишенью.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000089123 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039033 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Се Дж. Дж., Ченг Э. Х., Корсмейер С. Дж. (Ноябрь 2003 г.). «Таспаза1: треониновая аспартаза, необходимая для расщепления MLL и правильной экспрессии гена HOX». Клетка. 115 (3): 293–303. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00816-X. PMID  14636557. S2CID  18952302.
6. «Ген Entrez: таспаза TASP1, треонин-аспартаза, 1».
7. Ояма, Т; Сасагава, S; Такеда, S; Hess, R.A .; Либерман, П. М .; Cheng, E.H .; Се, Дж. Дж. (2013). «Расщепление TFIIA с помощью Taspase1 активирует TRF2-специфические программы мужских половых клеток млекопитающих». Клетка развития. 27 (2): 188–200. Дои:10.1016 / j.devcel.2013.09.025. ЧВК  3947863. PMID  24176642.
8. Chen DY, Liu H, Takeda S, Tu HC, Sasagawa S, Van Tine BA, Lu D, Cheng EH, Hsieh JJ (июль 2010 г.). «Taspase1 действует как протеаза, не вызывающая онкогенной зависимости, которая координирует пролиферацию раковых клеток и апоптоз». Рак Res. 70 (13): 5358–67. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-10-0027. ЧВК  2909739. PMID  20516119.

дальнейшее чтение

• Zhou H, Spicuglia S, Hsieh JJ и др. (2006). «Нерасщепленная TFIIA является субстратом для таспазы 1 и активна при транскрипции». Мол. Клетка. Биол. 26 (7): 2728–35. Дои:10.1128 / MCB.26.7.2728-2735.2006. ЧВК  1430320. PMID  16537915.
• Хан Дж. А., Данн Б. М., Тонг Л. (2006). «Кристаллическая структура человеческой Taspase1, важнейшей протеазы, регулирующей функцию MLL». Структура. 13 (10): 1443–52. Дои:10.1016 / j.str.2005.07.006. PMID  16216576.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Сие Дж. Дж., Эрнст П., Эрдьюмент-Бромаж Х и др. (2003). «Протеолитическое расщепление MLL создает комплекс N- и C-концевых фрагментов, который обеспечивает стабильность белка и субядерную локализацию». Мол. Клетка. Биол. 23 (1): 186–94. Дои:10.1128 / MCB.23.1.186-194.2003. ЧВК  140678. PMID  12482972.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.