TDRD7 - TDRD7

TDRD7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3RCO
Идентификаторы
Псевдонимы	TDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, tudor домен, содержащий 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 611258 MGI: 2140279 ГомолоГен: 8618 Генные карты: TDRD7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.33 Начинать 97,412,096 бп[1] Конец 97,496,125 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 B1 Начинать 45,965,334 бп[2] Конец 46,034,761 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание мРНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание с N-концом белка • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • хроматоидное тело • митохондриальный матрикс • гранула рибонуклеопротеина Биологический процесс • посттранскрипционная регуляция экспрессии генов • дифференциация клеток • дифференцировка клеток волокна хрусталика • морфогенез хрусталика в глазу камерного типа • сперматогенез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23424	100121
Ансамбль	ENSG00000196116	ENSMUSG00000035517
UniProt	Q8NHU6	Q8K1H1
RefSeq (мРНК)	NM_001302884 NM_014290	NM_001290475 NM_146142 NM_001355189
RefSeq (белок)	NP_001289813 NP_055105	NP_001277404 NP_666254 NP_001342118
Расположение (UCSC)	Chr 9: 97,41 - 97,5 Мб	Chr 4: 45.97 - 46.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий тюдоровский домен 7 это белок что у людей кодируется TDRD7 ген.^[5][6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена TDRD7 может регулироваться MITF.^[7]

Полиморфизм генов

Были идентифицированы различные однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) гена TDRD7, и для некоторых из них показана связь с более низкой восприимчивостью к возрастной катаракте.^[8]

Взаимодействия

TDRD7 был показан взаимодействовать с TACC1.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196116 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035517 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Э., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
6. "Entrez Gene: tudor домен TDRD7, содержащий 7".
7. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М., Видмер Д.С., Преториус К., Эйнарссон С.О., Валгейрсдоттир С., Бергстейнсдоттир К., Щепски А., Даммер Р., Штайнгримссон Э. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Пигментная клетка Melanoma Res. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
8. Чжэн Ц., Ву М., Хе Ц.Й., Ан XJ, Сун М., Чен Ц.Л., Е Дж. (Февраль 2014 г.) «Полиморфизмы гена TDRD7 компонента гранул РНК в популяции ханьских китайцев с возрастной катарактой». J. Int. Med. Res. 42 (1): 153–63. Дои:10.1177/0300060513504702. PMID  24435515.
9. Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (ноябрь 2003 г.). «Белковый комплекс TACC1-chTOG-Aurora A при раке груди». Онкоген. 22 (50): 8102–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID  14603251.

дальнейшее чтение

• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М. Зогби HY (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Конте Н., Делаваль Б., Жинестье С., Ферран А., Иснардон Д., Ларрок С., Приджент С., Серафин Б., Жакемье Дж., Бирнбаум Д. (2003). «Белковый комплекс TACC1-chTOG-Aurora A при раке груди». Онкоген. 22 (50): 8102–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID  14603251.
• Lauffart B, Howell SJ, Tasch JE, Cowell JK, Still IH (2002). «Взаимодействие трансформирующего белка кислой спиральной спирали 1 (TACC1) с ch-TOG и GAS41 / NuBI1 предполагает наличие множественных TACC1-содержащих белковых комплексов в клетках человека». Biochem. J. 363 (Pt 1): 195–200. Дои:10.1042/0264-6021:3630195. ЧВК  1222467. PMID  11903063.
• Ямочи Т., Нисимото И., Окуда Т., Мацуока М. (2001). «ik3-1 / Cables связан с Trap и Pctaire2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 286 (5): 1045–50. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5493. PMID  11527406.
• Хиросе Т., Кавабучи М., Тамару Т., Окумура Н., Нагаи К., Окада М. (2000). «Идентификация ассоциатора tudor-повторов с PCTAIRE 2 (Trap). Новый белок, который взаимодействует с N-концевым доменом PCTAIRE 2 в мозге крысы». Евро. J. Biochem. 267 (7): 2113–21. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01218.x. PMID  10727952.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8NHU6 (Белок 7, содержащий домен Tudor человека) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8K1H1 (Белок 7, содержащий Tudor-домен мыши) на PDBe-KB.