TFB2M - TFB2M

TFB2M
Идентификаторы
Псевдонимы	TFB2M, Hkp1, mtTFB2, фактор транскрипции B2, митохондриальный
Внешние идентификаторы	OMIM: 607055 MGI: 107937 ГомолоГен: 7362 Генные карты: TFB2M
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q44 Начинать 246,540,561 бп[1] Конец 246,566,261 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 H4 | 1 83,56 см Начинать 179,528,055 бп[2] Конец 179,546,267 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • рРНК-метилтрансферазная активность • рРНК (аденин-N6, N6 -) - диметилтрансферазная активность • Связывание РНК Сотовый компонент • соединение клеток • митохондриальный нуклеоид • митохондриальный матрикс • митохондрия Биологический процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • обработка рРНК • метилирование • митохондриальная организация • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • метилирование рРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция с митохондриального промотора • инициация транскрипции с митохондриального промотора • модификация рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64216	15278
Ансамбль	ENSG00000162851	ENSMUSG00000026492
UniProt	Q9H5Q4	Q3TL26
RefSeq (мРНК)	NM_022366	NM_008249 NM_001331054 NM_001331055
RefSeq (белок)	NP_071761	NP_001317983 NP_001317984 NP_032275
Расположение (UCSC)	Chr 1: 246,54 - 246,57 Мб	Chr 1: 179.53 - 179.55 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Диметиладенозинтрансфераза 2; фактор транскрипции B2, митохондриальный является фермент что у людей кодируется TFB2M ген.^[5]

Этот белок является фактором инициации транскрипции митохондриальной РНК-полимеразы, POLRMT. Его паралог TFB1M может выполнять аналогичную функцию, но только in vitro.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000162851 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026492 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор транскрипции B2 TFB2M, митохондриальный».
6. Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков, Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурные основы инициации митохондриальной транскрипции». Клетка. 171 (5): 1072–1081.e10. Дои:10.1016 / j.cell.2017.10.036. ЧВК  6590061. PMID  29149603.

дальнейшее чтение

• Фалькенберг М, Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Факторы митохондриальной транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet. 31 (3): 289–94. Дои:10,1038 / ng909. PMID  12068295.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Рантанен А., Гаспари М., Фалькенберг М. и др. (2003). «Характеристика мышиных генов митохондриальных факторов транскрипции B1 и B2». Мамм. Геном. 14 (1): 1–6. Дои:10.1007 / s00335-002-2218-z. PMID  12532263.
• Маккаллох V, Шадель Г.С. (2003). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 23 (16): 5816–24. Дои:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. ЧВК  166325. PMID  12897151.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Гаспари М., Фалькенберг М., Ларссон Н.Г., Густафссон С.М. (2005). «Митохондриальная РНК-полимераза играет решающую роль в специфичности промотора в клетках млекопитающих». EMBO J. 23 (23): 4606–14. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600465. ЧВК  533051. PMID  15526033.
• Глейзер Н., Веркаутерен К., Скарпулла Р.К. (2005). «Контроль факторов специфичности митохондриальной транскрипции (TFB1M и TFB2M) с помощью ядерных респираторных факторов (NRF-1 и NRF-2) и коактиваторов семейства PGC-1». Мол. Клетка. Биол. 25 (4): 1354–66. Дои:10.1128 / MCB.25.4.1354-1366.2005. ЧВК  548005. PMID  15684387.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Котни Дж., Шадель Г.С. (2007). «Доказательства раннего события дупликации генов в эволюции семейства митохондриального фактора транскрипции B и поддержание активности метилтрансферазы рРНК в mtTFB1 и mtTFB2 человека». J. Mol. Evol. 63 (5): 707–17. Дои:10.1007 / s00239-006-0075-1. PMID  17031457.
• Котни Дж., Ван З., Шадель Г.С. (2007). «Относительное количество митохондриальной транскрипционной системы человека и различные роли h-mtTFB1 и h-mtTFB2 в митохондриальном биогенезе и экспрессии генов». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (12): 4042–54. Дои:10.1093 / нар / гкм424. ЧВК  1919481. PMID  17557812.